Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,772,157 |
T→C |
V36A (GTA→GCA) |
mtlD → |
mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,772,157 | 0 | T | C | 100.0%
| 739.4
/ NA
| 230 | V36A (GTA→GCA) | mtlD | mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (121/109); total (121/109) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
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gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt < 1:3743619/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt > 2:1083034/1‑93 (MQ=255)
gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt < 2:104450/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt > 1:597134/1‑93 (MQ=255)
cAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATg > 1:1698075/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 1:2823531/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 2:3413274/1‑93 (MQ=255)
tAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCt > 2:2920650/1‑93 (MQ=255)
atatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGa > 2:2084840/1‑93 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 1:4426820/93‑1 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:3865152/93‑1 (MQ=255)
atCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAt < 1:1010226/93‑1 (MQ=255)
atCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAt < 2:2202457/93‑1 (MQ=255)
atCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAt > 1:908344/1‑93 (MQ=255)
tCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATg > 2:844462/1‑93 (MQ=255)
tCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATg > 1:2996403/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTCAATGc > 1:393907/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGccc > 2:3537017/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCg > 1:810301/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCg > 2:1543809/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCg < 1:3370944/93‑1 (MQ=255)
gTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTc > 1:4682946/1‑93 (MQ=255)
gTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTc > 2:3759153/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCa < 2:1946879/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAt < 2:765138/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAt > 2:2309903/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAt < 2:3643477/93‑1 (MQ=255)
cTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAg < 1:4379140/93‑1 (MQ=255)
tttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGc > 1:482023/1‑93 (MQ=255)
ttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCt < 2:1669971/93‑1 (MQ=255)
tATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTa > 2:4116501/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATc < 2:2759776/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCa < 2:494679/93‑1 (MQ=255)
ggTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGGCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAg > 1:4078614/1‑93 (MQ=255)
ggTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAg < 1:964550/93‑1 (MQ=255)
ggTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAg > 2:1304602/1‑93 (MQ=255)
gTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAgg > 1:3496669/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGt > 1:2258628/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGt < 1:1400451/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGt > 1:2169178/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAc > 2:55117/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACa > 1:2750179/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtg < 2:2466776/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtg < 2:3251421/93‑1 (MQ=255)
gctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtgt < 2:1971637/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtgg > 2:246084/1‑93 (MQ=255)
ggCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggt < 1:1290385/93‑1 (MQ=255)
ggCAGACGCGGGAATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggt > 2:177668/1‑93 (MQ=255)
cAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttg < 2:865046/93‑1 (MQ=255)
aGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttgg < 1:118240/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt > 1:194811/1‑93 (MQ=255)
gcgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaa > 1:762783/1‑93 (MQ=255)
cgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaaa < 1:645633/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCAACTGACGTTGGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaaa < 1:1070183/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAc > 1:1975641/1‑93 (MQ=255)
gTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCg < 2:381122/93‑1 (MQ=255)
gTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCg > 1:2034504/1‑93 (MQ=255)
tATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGa < 1:4230980/93‑1 (MQ=255)
tCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGc > 1:136136/1‑93 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCGGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa < 2:422589/93‑1 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa > 1:2425317/1‑93 (MQ=255)
cAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAg < 2:4365204/93‑1 (MQ=255)
aaCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAgg < 2:2248531/93‑1 (MQ=255)
aaCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAgg > 2:3882794/1‑93 (MQ=255)
aCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGt < 2:2722281/93‑1 (MQ=255)
cTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTa < 2:1138619/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATa > 1:290086/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATa > 2:1206283/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc > 2:1255487/1‑93 (MQ=255)
tttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAcc > 1:4154762/1‑93 (MQ=255)
tttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAcc > 2:913297/1‑93 (MQ=255)
tttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAcc > 1:2376836/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCg > 2:2151728/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCg < 1:4584383/93‑1 (MQ=255)
gCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGtt < 2:1439361/93‑1 (MQ=255)
ccGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGttt < 2:1195185/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc < 2:3114611/93‑1 (MQ=255)
gATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTcc < 1:3545491/93‑1 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg > 2:2999331/1‑93 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg > 1:2136095/1‑93 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg > 1:2598784/1‑93 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg > 2:2903541/1‑93 (MQ=255)
gTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGc < 1:1488300/93‑1 (MQ=255)
gTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGc > 2:7242/1‑93 (MQ=255)
tCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCg > 2:4040761/1‑93 (MQ=255)
cAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGt < 1:324621/93‑1 (MQ=255)
cAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGt > 1:3282593/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTc > 2:3382624/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTc > 1:1800571/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGTGTCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCa > 2:4568444/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCaa < 1:2555079/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAt < 2:4455760/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc > 2:4169204/1‑93 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:268606/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:206969/93‑1 (MQ=255)
gtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCt < 1:1525629/93‑1 (MQ=255)
gtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCt > 1:464362/1‑93 (MQ=255)
tggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTg < 1:2304173/93‑1 (MQ=255)
|
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTC > NC_000913/3772064‑3772248
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC > SRR4302535.3405196/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC > SRR4302535.3628997/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC > SRR4302535.454889/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCA > SRR4302535.2664810/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAC > SRR4302535.2855503/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAC > SRR4302535.3452505/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCTGATGTCAATCAGGTGGCACTTG < SRR4302535.4056215/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTG > SRR4302535.2233145/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTG < SRR4302535.1921584/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT > SRR4302535.1937601/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT > SRR4302535.601314/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG > SRR4302535.1710347/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG < SRR4302535.3769519/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGC > SRR4302535.2178427/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302535.2843572/1‑94 (MQ=60)
TAATATCGGACGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTG > SRR4302535.1021911/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302535.4457144/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302535.2143110/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT > SRR4302535.914792/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302535.1865183/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGCTGTCAATCAGGTGGCACTTCATGCCCTGAATG > SRR4302535.423311/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG < SRR4302535.1017403/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302535.3017412/1‑94 (MQ=60)
TCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTCAATGC > SRR4302535.396655/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCC > SRR4302535.4704258/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG < SRR4302535.2322196/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG > SRR4302535.815968/1‑94 (MQ=60)
TCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGT < SRR4302535.3394396/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTCTCCCACTGACGTTTGCCGAAGCCACTCAGCCGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302535.930804/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302535.4714608/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302535.1602920/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT < SRR4302535.2048591/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA < SRR4302535.3392131/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302535.1924811/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA < SRR4302535.4578541/94‑1 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC > SRR4302535.485406/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC < SRR4302535.4409105/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT > SRR4302535.781736/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302535.284773/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302535.2234100/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT > SRR4302535.4183221/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAT < SRR4302535.1399935/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATC > SRR4302535.2726939/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATC > SRR4302535.2610088/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCA < SRR4302535.762208/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGGCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG > SRR4302535.4106520/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302535.4508403/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302535.1411770/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG < SRR4302535.971405/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302535.3520970/1‑94 (MQ=60)
GTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGT > SRR4302535.2184717/1‑94 (MQ=60)
GTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGT > SRR4302535.2274709/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302535.1410447/94‑1 (MQ=60)
AAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAC > SRR4302535.2432795/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA < SRR4302535.1087663/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA > SRR4302535.2769786/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA < SRR4302535.3376275/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCGCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG > SRR4302535.2101419/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG < SRR4302535.2453684/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG < SRR4302535.4140878/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG > SRR4302535.594548/1‑94 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT < SRR4302535.4414982/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT < SRR4302535.1299582/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT > SRR4302535.1203277/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT > SRR4302535.196151/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT > SRR4302535.1860668/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT < SRR4302535.119070/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAA > SRR4302535.768158/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAA > SRR4302535.3591396/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC > SRR4302535.1989871/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC < SRR4302535.650138/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC < SRR4302535.1976165/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTGGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC < SRR4302535.1077790/94‑1 (MQ=60)
GGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCG > SRR4302535.2049162/1‑94 (MQ=60)
TATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302535.4259933/94‑1 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302535.2759588/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302535.137086/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302535.4450106/1‑94 (MQ=60)
TCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCA > SRR4302535.2442791/1‑94 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG > SRR4302535.602155/1‑94 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG < SRR4302535.4623063/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGT < SRR4302535.4681492/94‑1 (MQ=60)
AACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGT < SRR4302535.3430222/94‑1 (MQ=60)
ACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTA < SRR4302535.3110568/94‑1 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAG < SRR4302535.495767/94‑1 (MQ=60)
TGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGA > SRR4302535.2060873/1‑94 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT > SRR4302535.1412322/1‑94 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT < SRR4302535.1551091/94‑1 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT > SRR4302535.4036982/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATA > SRR4302535.292119/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATA < SRR4302535.1522931/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC > SRR4302535.4183207/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC > SRR4302535.2393908/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCG > SRR4302535.3529919/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGT < SRR4302535.4615601/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCGGTCATAGCGATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGGAGATACCGTT > SRR4302535.2291837/1‑94 (MQ=60)
TGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTT > SRR4302535.2936689/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302535.2607980/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302535.1334322/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302535.2397271/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302535.2355785/1‑94 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302535.3570109/94‑1 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302535.2843059/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG > SRR4302535.2151484/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG < SRR4302535.4391009/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG > SRR4302535.2617445/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGGTTCCGG > SRR4302535.322674/1‑94 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC < SRR4302535.1995645/94‑1 (MQ=60)
GTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCG < SRR4302535.1498970/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGT > SRR4302535.3305391/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC < SRR4302535.856261/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC > SRR4302535.1813587/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC < SRR4302535.326868/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA > SRR4302535.3278421/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAA > SRR4302535.823657/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAA > SRR4302535.694997/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAT < SRR4302535.2573480/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG < SRR4302535.2662338/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.3806320/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.208389/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.270474/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT > SRR4302535.467607/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.478422/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.3611374/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302535.1812423/94‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG < SRR4302535.135750/94‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG < SRR4302535.1536620/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCGCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302535.1097278/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302535.2320652/94‑1 (MQ=60)
GGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTC > SRR4302535.754176/1‑94 (MQ=60)
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTC > NC_000913/3772064‑3772248
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
