Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,772,157 |
T→C |
V36A (GTA→GCA) |
mtlD → |
mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,772,157 | 0 | T | C | 100.0%
| 1428.7
/ NA
| 450 | V36A (GTA→GCA) | mtlD | mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (230/220); total (230/220) |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
ttGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAc < 1:4655852/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACt < 1:4319814/93‑1 (MQ=255)
ggCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACtt > 1:2424472/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTg < 2:6144852/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa < 2:7751285/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa < 1:4835989/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa < 2:1404885/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa > 1:1058462/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa < 2:3316586/93‑1 (MQ=255)
cgcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGa < 2:4481433/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt > 2:6680497/1‑93 (MQ=255)
cAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATg > 1:799075/1‑93 (MQ=255)
aGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGc < 2:5939867/93‑1 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATgac > 2:5464846/1‑91 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 1:6703680/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc < 2:2244470/93‑1 (MQ=255)
gTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGccc > 2:5208290/1‑93 (MQ=255)
tAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcccg < 2:3769597/93‑2 (MQ=255)
atatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGa > 2:4847496/1‑93 (MQ=255)
atatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGa > 1:6586928/1‑93 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa > 1:6022528/1‑93 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:2890762/93‑1 (MQ=255)
tCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATg > 2:1118880/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGcc < 2:3040042/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGccc < 2:252776/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGccc < 1:2993946/93‑1 (MQ=255)
gTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTc > 2:7354385/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCa > 1:359910/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCa < 1:2719311/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTCTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCa > 1:5233000/1‑93 (MQ=255)
gCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATa > 1:7264825/1‑93 (MQ=255)
gCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATa > 1:2620428/1‑93 (MQ=255)
cTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAg < 2:5132247/93‑1 (MQ=255)
tttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGc > 2:6585773/1‑93 (MQ=255)
tttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGc < 1:6963354/93‑1 (MQ=255)
ttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCt > 1:5911857/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTa > 2:6483395/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTa < 1:1742853/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCa < 1:7761652/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGt < 1:6194086/93‑1 (MQ=255)
aaaCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTa > 2:5719296/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAc < 1:3943756/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAc > 2:2667077/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAc < 2:3851897/93‑1 (MQ=255)
gctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtgt < 2:6379861/93‑1 (MQ=255)
ctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtgtg < 2:1618037/93‑1 (MQ=255)
ctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtgtg < 1:6342029/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtgg > 2:7838777/1‑93 (MQ=255)
tgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtgg > 2:6984023/1‑93 (MQ=255)
tgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGCCATAGCTATCAGGTACATGtgg > 1:3170443/1‑93 (MQ=255)
ggCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggt > 1:5099236/1‑93 (MQ=255)
gCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggtt < 1:5306134/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt > 2:6245775/1‑93 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt < 1:4114124/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTg < 2:6869063/93‑1 (MQ=255)
gcgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaa < 1:4426429/93‑1 (MQ=255)
gcgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGGGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCTGGTACATGTGCTTGGTGaa > 1:4147788/1‑93 (MQ=255)
cgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaaa < 2:4663197/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaaa < 2:4038837/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaaa < 1:3723014/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGCTGAAAc < 2:7679574/93‑1 (MQ=255)
gTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGGCCTGAATGGCCGTCATAGCTATCAGGAACATGTGGTTGGTGAAACCg > 2:4467036/1‑93 (MQ=255)
gTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCg > 2:5820577/1‑93 (MQ=255)
gTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCg < 2:2406363/93‑1 (MQ=255)
tATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGa < 1:5181293/93‑1 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa > 2:7237497/1‑93 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa < 1:335746/93‑1 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATACCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa > 2:1037107/1‑93 (MQ=255)
aaCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAgg > 1:1813377/1‑93 (MQ=255)
aCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGt < 2:1993589/93‑1 (MQ=255)
cTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTa > 2:1770774/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAt > 1:3277292/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCAGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATa < 1:5023313/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc < 1:5477808/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc > 1:3407815/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc < 1:7409108/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc < 2:7415362/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc > 1:1941918/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc > 2:4246672/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAAAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAc < 2:5326274/93‑1 (MQ=255)
ccGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGttt > 1:2320358/1‑93 (MQ=255)
caTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTcc < 1:6118799/92‑1 (MQ=255)
aTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCg < 2:4141114/93‑1 (MQ=255)
aTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCg > 1:347060/1‑93 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg < 1:459589/93‑1 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg > 1:2462842/1‑93 (MQ=255)
tCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCg > 2:2067684/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTc < 1:7294939/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTc > 1:5768565/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCaa < 1:6836579/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCaa < 1:1192962/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAt < 2:3568347/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAt < 1:2039843/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAt < 1:1389369/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATg > 1:143167/1‑93 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc > 2:1325599/1‑93 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc > 1:4218877/1‑93 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:2133813/93‑1 (MQ=255)
tggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTg < 1:2175116/93‑1 (MQ=255)
tggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTg < 1:1554374/93‑1 (MQ=255)
|
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 266 total aligned reads displayed.
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG > NC_000913/3772064‑3772250
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC < SRR4302543.5733203/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC > SRR4302543.465462/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCA < SRR4302543.11261/94‑1 (MQ=60)
TTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCA < SRR4302543.1379528/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAC < SRR4302543.7224334/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACT < SRR4302543.3794792/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTT < SRR4302543.4359039/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCACTCAGGTGGCACTTG > SRR4302543.66877/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTG < SRR4302543.622478/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTG > SRR4302543.1826119/1‑94 (MQ=60)
GCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGA > SRR4302543.1067953/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT < SRR4302543.4880095/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT < SRR4302543.1466543/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG > SRR4302543.806101/1‑94 (MQ=60)
CAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGC > SRR4302543.2664237/1‑94 (MQ=60)
CAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGC > SRR4302543.5864055/1‑94 (MQ=60)
CAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGC > SRR4302543.1826716/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302543.2579560/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302543.6614245/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302543.4684169/1‑94 (MQ=60)
GGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCC > SRR4302543.184440/1‑94 (MQ=60)
GTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCT < SRR4302543.6799008/94‑1 (MQ=60)
GTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCT > SRR4302543.2611916/1‑94 (MQ=60)
GTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCT > SRR4302543.1605262/1‑94 (MQ=60)
TAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTG > SRR4302543.3375907/1‑94 (MQ=60)
TAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTG > SRR4302543.1735652/1‑94 (MQ=60)
AATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGA > SRR4302543.3817810/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAGACTGCGGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAA < SRR4302543.6249956/94‑1 (MQ=60)
ATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAA > SRR4302543.6078464/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAA > SRR4302543.1408572/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.1792926/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.4254138/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.5897264/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.6760441/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.4734153/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302543.4734152/1‑94 (MQ=60)
TCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGC < SRR4302543.2741920/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCC > SRR4302543.2315629/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC > SRR4302543.6014737/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC > SRR4302543.3629154/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC < SRR4302543.3611004/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC > SRR4302543.1134404/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATACAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC > SRR4302543.3213877/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG < SRR4302543.3021118/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG > SRR4302543.5207313/1‑94 (MQ=60)
TCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGT < SRR4302543.1472329/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302543.6946159/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302543.6883050/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGAGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTC > SRR4302543.3712160/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.4640280/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.4293252/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.363237/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.7530042/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.8004486/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.7260790/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCA > SRR4302543.2404337/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGGATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGGATGCCCGTCA > SRR4302543.4929394/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT > SRR4302543.3683736/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT < SRR4302543.1929921/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT < SRR4302543.2744031/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT < SRR4302543.1929922/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT > SRR4302543.3453732/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAT < SRR4302543.6332533/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302543.5269512/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302543.2644171/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302543.2189548/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302543.3788617/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302543.5269511/1‑94 (MQ=60)
GCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAG < SRR4302543.4741587/94‑1 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC > SRR4302543.7338978/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC > SRR4302543.7338977/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT > SRR4302543.5965845/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302543.2174046/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302543.7028882/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTA > SRR4302543.1418049/1‑94 (MQ=60)
TTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTA < SRR4302543.5408554/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAT < SRR4302543.1758404/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAT < SRR4302543.4444043/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAT < SRR4302543.1330334/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATC < SRR4302543.7969984/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCA < SRR4302543.7402656/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCA < SRR4302543.6118640/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG > SRR4302543.3998966/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302543.7834902/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302543.6189031/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302543.2767605/1‑94 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302543.4077218/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302543.5781864/94‑1 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302543.6468724/94‑1 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302543.2977342/94‑1 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302543.6252601/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA < SRR4302543.3978627/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA < SRR4302543.5226406/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGCCATAGCTATCAGGTACAT < SRR4302543.4492088/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGT < SRR4302543.1451619/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGT < SRR4302543.1983358/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGT < SRR4302543.3365750/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTG > SRR4302543.5968517/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG < SRR4302543.1370302/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG < SRR4302543.6401662/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG < SRR4302543.2886476/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGCCATAGCTATCAGGTACATGTGG > SRR4302543.3199000/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGT > SRR4302543.5145405/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGT < SRR4302543.7489749/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAAGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGT < SRR4302543.6093767/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCTATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT < SRR4302543.4949327/94‑1 (MQ=60)
GCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGTCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTG > SRR4302543.4676260/1‑94 (MQ=60)
GCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTG < SRR4302543.2082536/94‑1 (MQ=60)
GCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTG < SRR4302543.5354051/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGG > SRR4302543.6714058/1‑94 (MQ=60)
CAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGG < SRR4302543.7026724/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGG < SRR4302543.5312596/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGG < SRR4302543.5312594/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT < SRR4302543.1245796/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT > SRR4302543.4256700/1‑94 (MQ=60)
GACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTG < SRR4302543.2436740/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTG < SRR4302543.4151179/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGA < SRR4302543.3248677/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGA < SRR4302543.456235/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAA > SRR4302543.4185283/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGGGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCTGGTACATGTGCTTGGTGAA > SRR4302543.4185282/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAA > SRR4302543.6785355/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAA < SRR4302543.4466535/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGGACATGTGGTTGGTGAAC > SRR4302543.6593587/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCG < SRR4302543.2153323/94‑1 (MQ=60)
GTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGA < SRR4302543.6315506/94‑1 (MQ=60)
GTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGA > SRR4302543.2034260/1‑94 (MQ=60)
TATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302543.4308935/94‑1 (MQ=60)
TATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302543.6002954/94‑1 (MQ=60)
TATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302543.5228055/94‑1 (MQ=60)
GATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302543.2451766/94‑1 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302543.3426098/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302543.3484362/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302543.5232561/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302543.5156948/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302543.2410820/1‑94 (MQ=60)
TCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCA > SRR4302543.4342732/1‑94 (MQ=60)
CCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAG < SRR4302543.338832/94‑1 (MQ=60)
CCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAG < SRR4302543.4633981/94‑1 (MQ=60)
CCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAG < SRR4302543.4159034/94‑1 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG > SRR4302543.1829638/1‑94 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG < SRR4302543.5142241/94‑1 (MQ=60)
AACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGT < SRR4302543.5059426/94‑1 (MQ=60)
ACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTA > SRR4302543.208744/1‑94 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAG < SRR4302543.3280290/94‑1 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGATGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAG > SRR4302543.6376612/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGA > SRR4302543.2324848/1‑94 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT > SRR4302543.1432971/1‑94 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT < SRR4302543.3335221/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAC > SRR4302543.3744557/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAC < SRR4302543.5077411/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAC > SRR4302543.3438327/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCAGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATAC < SRR4302543.5069027/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC < SRR4302543.4160587/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC < SRR4302543.2476050/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC < SRR4302543.7480206/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC < SRR4302543.5527450/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGT > SRR4302543.2448311/1‑94 (MQ=60)
GCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTT > SRR4302543.313063/1‑94 (MQ=60)
GCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTT < SRR4302543.7029002/94‑1 (MQ=60)
GCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTT > SRR4302543.2341448/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302543.6996408/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302543.3152064/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302543.594770/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302543.4112341/1‑94 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302543.1963105/94‑1 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG > SRR4302543.350265/1‑94 (MQ=60)
CATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302543.6176754/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG > SRR4302543.5286646/1‑94 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC < SRR4302543.2662122/94‑1 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC < SRR4302543.463861/94‑1 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC > SRR4302543.5734558/1‑94 (MQ=60)
GTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTGCGGCG > SRR4302543.5557715/1‑94 (MQ=60)
TCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGT > SRR4302543.4439133/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC > SRR4302543.2216119/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC < SRR4302543.777902/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC > SRR4302543.5384678/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC > SRR4302543.7202691/1‑94 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA < SRR4302543.7365331/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA > SRR4302543.1188813/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAT < SRR4302543.1203723/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAT < SRR4302543.6901113/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG > SRR4302543.144412/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG < SRR4302543.2058144/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG < SRR4302543.3559579/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG > SRR4302543.2580204/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGC > SRR4302543.4257125/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTCGATACCGTTTCCGGCGTCCATGCT > SRR4302543.7405722/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302543.7347487/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302543.7852843/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302543.2152913/94‑1 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > SRR4302543.5525329/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT > SRR4302543.628173/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302543.1568266/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302543.2194603/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302543.3389115/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302543.3408112/94‑1 (MQ=60)
GGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTC < SRR4302543.4428453/94‑1 (MQ=60)
GCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCA < SRR4302543.6554829/94‑1 (MQ=60)
CACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG > SRR4302543.1019434/1‑94 (MQ=60)
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG > NC_000913/3772064‑3772250
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
