Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,806,842 |
C→T |
R226C (CGC→TGC) |
kdtA → |
3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,806,842 | 0 | C | T | 100.0%
| 938.4
/ NA
| 256 | R226C (CGC→TGC) | kdtA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (133/123); total (133/123) |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > NC_000913/3806752‑3806934
|
cAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCgctgcc > 2:4024901/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCa < 2:1407443/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAg > 2:570047/1‑93 (MQ=255)
aaaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGt > 1:3954942/1‑93 (MQ=255)
aaaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGt < 1:1766387/93‑1 (MQ=255)
aaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTg < 1:3724874/93‑1 (MQ=255)
aaaTAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTg < 1:1876928/93‑1 (MQ=255)
aataatCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTgg < 2:3049534/93‑1 (MQ=255)
aataatCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTgg < 2:1024678/93‑1 (MQ=255)
taatCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGc > 1:3069142/1‑93 (MQ=255)
atCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGcac < 2:704171/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGcacc > 1:2533610/1‑93 (MQ=255)
ggTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACcaca > 1:3194488/1‑93 (MQ=255)
gTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCacac < 2:2163485/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGc < 2:3154223/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGc > 1:4657151/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGc > 2:208754/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGc > 1:2781801/1‑93 (MQ=255)
ccGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGcc < 2:3710561/93‑1 (MQ=255)
ccGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGcc < 1:223608/93‑1 (MQ=255)
cGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGccc < 1:2408082/93‑1 (MQ=255)
cGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGccc < 2:1461818/93‑1 (MQ=255)
gTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCg > 1:1130587/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCgg > 2:1677335/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCgg > 1:3338487/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGCAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACcccgcccgt > 2:152412/1‑92 (MQ=255)
ggTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATgg < 2:3419165/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATgg > 2:3639913/1‑93 (MQ=255)
tAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGAt > 1:2264671/1‑93 (MQ=255)
tAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGAt > 2:112526/1‑93 (MQ=255)
tAGCCTGAAATTCGACATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACTGCCCGGTATGGAt < 2:4605166/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGAtt > 2:2251237/1‑93 (MQ=255)
gCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTg < 2:3365368/93‑1 (MQ=255)
ccTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGc < 1:9271/93‑1 (MQ=255)
cTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGcc < 2:1182012/93‑1 (MQ=255)
tGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGcca > 1:1638942/1‑93 (MQ=255)
tGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGcca > 1:2708971/1‑93 (MQ=255)
gAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGccac > 2:3387312/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGccacca > 1:367179/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGccacca > 2:1877232/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGccacca > 1:260169/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGccacca > 1:315254/1‑93 (MQ=255)
ttCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGGACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCCCCAGc > 2:423682/1‑93 (MQ=255)
ttCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTTCcagcagg > 2:4297093/1‑92 (MQ=255)
tCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCa < 2:622544/93‑1 (MQ=255)
cGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGCCTTCTAAAGCCTGTACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCCCGCCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCAc < 1:2896912/93‑1 (MQ=255)
atatTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTc > 2:746821/1‑93 (MQ=255)
atatTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTc > 1:762311/1‑93 (MQ=255)
tCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGaa < 1:1320164/93‑1 (MQ=255)
tCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGaa < 1:3240089/93‑1 (MQ=255)
tCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGaa < 2:68699/93‑1 (MQ=255)
tCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGaa < 1:4083157/93‑1 (MQ=255)
tGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAgg > 1:2077958/1‑93 (MQ=255)
tGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAgg < 2:2061083/93‑1 (MQ=255)
gTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGc > 1:2549089/1‑93 (MQ=255)
tAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCg < 2:2568221/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGa > 1:427535/1‑93 (MQ=255)
gccgcAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAaga < 2:2358119/93‑1 (MQ=255)
ccgcAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAagag > 2:1213386/1‑93 (MQ=255)
ccgcAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAagag > 1:1223832/1‑93 (MQ=255)
cgcAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAagaga < 1:1252781/93‑1 (MQ=255)
cgcACTAGGCTGTTGAAGCTGGGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCAATCACGAAGGCGAagaga < 2:802573/93‑1 (MQ=255)
gcAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAagagag > 1:4000767/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCTCTGCCAGTGGGCACCACCCCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgt < 2:3779079/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgt < 2:3099078/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgt < 1:1352986/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgt > 2:3456920/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgtg < 2:4654939/93‑1 (MQ=255)
gTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgtgt < 1:4408516/93‑1 (MQ=255)
gTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgtgt > 1:728855/1‑93 (MQ=255)
gTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAgtgg > 1:503512/1‑92 (MQ=255)
ttGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGtgtg > 1:559408/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTgtgg < 2:2025041/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTgtggg > 1:4477642/1‑92 (MQ=255)
ctgctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGa < 1:151550/93‑1 (MQ=255)
tgctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGGACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGGGGTGAt > 2:12803/1‑93 (MQ=255)
tgctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGAt < 1:3419691/93‑1 (MQ=255)
tgctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGAt > 2:3231339/1‑93 (MQ=255)
tgctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGAt > 1:2947740/1‑93 (MQ=255)
gctAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGCGTGTGGTGATc > 2:300000/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgc > 1:3780142/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgc < 1:82327/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgcc < 1:641493/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgccg > 1:1397851/1‑93 (MQ=255)
aGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgccgc > 1:1036519/1‑93 (MQ=255)
aGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATcgccgc > 1:1443531/1‑93 (MQ=255)
gTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACAt < 1:283215/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATc < 1:1581687/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATc < 1:948620/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATc < 2:4683571/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATc > 2:3965672/1‑93 (MQ=255)
tGACGCTCCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATc < 1:2021469/93‑1 (MQ=255)
gACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCa < 1:2294569/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAg < 1:1282183/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAg < 2:2911151/93‑1 (MQ=255)
gctgcgctgcCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGc < 2:2458021/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCAt < 2:268798/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCAtt < 2:4435800/93‑1 (MQ=255)
cgctgcGAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTg < 2:1664338/93‑1 (MQ=255)
cgcggcCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTg < 2:2197319/93‑1 (MQ=255)
|
GCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > NC_000913/3806752‑3806934
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTAC > NC_000913/3806749‑3806935
|
GGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCT < SRR4302535.2498189/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTG < SRR4302535.1488118/94‑1 (MQ=60)
CGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGC > SRR4302535.753186/1‑94 (MQ=60)
CAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCA > SRR4302535.682634/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAG > SRR4302535.1239206/1‑94 (MQ=60)
AAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGT < SRR4302535.3298533/94‑1 (MQ=60)
AAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGT > SRR4302535.3734796/1‑94 (MQ=60)
AAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGT > SRR4302535.3981944/1‑94 (MQ=60)
AAAATAATCAGGTTGCCGTGACGGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTG < SRR4302535.118366/94‑1 (MQ=60)
AAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTG < SRR4302535.1779194/94‑1 (MQ=60)
AAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGG < SRR4302535.412324/94‑1 (MQ=60)
AAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGG < SRR4302535.3750680/94‑1 (MQ=60)
AAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGG < SRR4302535.1890444/94‑1 (MQ=60)
AATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGG < SRR4302535.492685/94‑1 (MQ=60)
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ATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGC > SRR4302535.3090578/1‑94 (MQ=60)
TAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCC > SRR4302535.377555/1‑94 (MQ=60)
TAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCA < SRR4302535.3382259/94‑1 (MQ=60)
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ATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACC > SRR4302535.2551860/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCAC > SRR4302535.1297662/1‑94 (MQ=60)
AGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACA > SRR4302535.3216589/1‑94 (MQ=60)
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GACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGC > SRR4302535.2801605/1‑94 (MQ=60)
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GTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGG > SRR4302535.2304818/1‑94 (MQ=60)
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GGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGA > SRR4302535.4185677/1‑94 (MQ=60)
GTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGAT < SRR4302535.3634443/94‑1 (MQ=60)
GTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGAT > SRR4302535.2280806/1‑94 (MQ=60)
TAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATT < SRR4302535.2740456/94‑1 (MQ=60)
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agcattaacgTCGATATTTCTTTAACGCCGTAGTTGGGTTCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTG < SRR4302535.3117021/84‑1 (MQ=60)
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AGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTG > SRR4302535.2915857/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGC > SRR4302535.2801755/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGCGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGC > SRR4302535.1459639/1‑94 (MQ=60)
CCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCC < SRR4302535.9344/94‑1 (MQ=60)
CTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCA > SRR4302535.2728332/1‑94 (MQ=60)
CTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCA < SRR4302535.2011568/94‑1 (MQ=60)
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TGAAATTCGATATCTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCAC < SRR4302535.2198760/94‑1 (MQ=60)
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AAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGGCACCC > SRR4302535.3275803/1‑94 (MQ=60)
AAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCA > SRR4302535.369711/1‑94 (MQ=60)
AAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCA > SRR4302535.317432/1‑94 (MQ=60)
AAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCA > SRR4302535.261971/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGC > SRR4302535.2078533/1‑94 (MQ=60)
TTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCA > SRR4302535.1247994/1‑94 (MQ=60)
CGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGCCTTCTAAAGCCTGTACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCCCGCCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACT < SRR4302535.2917398/94‑1 (MQ=60)
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ATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCC > SRR4302535.3670314/1‑94 (MQ=60)
ATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCA < SRR4302535.4033391/94‑1 (MQ=60)
ATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGCGGGCACCGCACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCA > SRR4302535.1420998/1‑94 (MQ=60)
TATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCAC < SRR4302535.50045/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACG > SRR4302535.4469667/1‑94 (MQ=60)
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TCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAG < SRR4302535.1329596/94‑1 (MQ=60)
TCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAG < SRR4302535.4111082/94‑1 (MQ=60)
CTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGG < SRR4302535.2861654/94‑1 (MQ=60)
CTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGG > SRR4302535.2092926/1‑94 (MQ=60)
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TGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGC > SRR4302535.740518/1‑94 (MQ=60)
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GTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTG < SRR4302535.4438684/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTG < SRR4302535.1098194/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCAACACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCCGCACTCACGAAGGtgataagagagag > SRR4302535.2480248/1‑81 (MQ=60)
TGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGG > SRR4302535.4508386/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGAGA > SRR4302535.318903/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGGGTGGTGA > SRR4302535.897278/1‑94 (MQ=60)
CTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGAT < SRR4302535.152611/94‑1 (MQ=60)
CTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGAT > SRR4302535.2968452/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATC > SRR4302535.4415722/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATC < SRR4302535.1593946/94‑1 (MQ=60)
TGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATC < SRR4302535.3443477/94‑1 (MQ=60)
TGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATC < SRR4302535.3116018/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCG > SRR4302535.1414041/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCG > SRR4302535.545759/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCG < SRR4302535.1335359/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGAGATCG > SRR4302535.2070452/1‑94 (MQ=60)
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CTAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGC > SRR4302535.175451/1‑94 (MQ=60)
TAAAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCC < SRR4302535.82911/94‑1 (MQ=60)
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AAGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGC > SRR4302535.1043879/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCA < SRR4302535.3175170/94‑1 (MQ=60)
AGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCA > SRR4302535.1953851/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCA > SRR4302535.18623/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCA < SRR4302535.1582570/94‑1 (MQ=60)
GCCGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCAC > SRR4302535.4505958/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACAT > SRR4302535.229805/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACAT < SRR4302535.1351685/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATC < SRR4302535.285190/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCA < SRR4302535.955341/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCA < SRR4302535.2586091/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCA < SRR4302535.1593105/94‑1 (MQ=60)
TGACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCA > SRR4302535.632785/1‑94 (MQ=60)
TGACGCTCCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCA < SRR4302535.2036043/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAG < SRR4302535.2452013/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAG < SRR4302535.2310978/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGG < SRR4302535.3236082/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGG < SRR4302535.1601628/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGG < SRR4302535.1291331/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGC > SRR4302535.1573311/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGC < SRR4302535.2557059/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGC < SRR4302535.2726286/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGC < SRR4302535.713338/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGGATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGC > SRR4302535.855384/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTG < SRR4302535.3727924/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGT < SRR4302535.1397159/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGT < SRR4302535.960261/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTT < SRR4302535.215303/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA < SRR4302535.2946845/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > SRR4302535.4176000/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGGGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > SRR4302535.3044055/1‑94 (MQ=60)
TGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTAC > SRR4302535.3529058/1‑94 (MQ=60)
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GGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTAC > NC_000913/3806749‑3806935
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
