Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,851,757 |
T→C |
V72A (GTG→GCG) |
emrD → |
2‑module integral membrane pump |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,851,757 | 0 | T | C | 100.0%
| 636.6
/ NA
| 203 | V72A (GTG→GCG) | emrD | 2‑module integral membrane pump |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (125/78); total (125/78) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGA > NC_000913/3851667‑3851846
|
tCCGTGAAGGGGCGGTGCAGCGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCgg > 1:3711286/1‑93 (MQ=255)
tCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCgg > 1:4602354/1‑93 (MQ=255)
tCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCgg < 1:3789674/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGgcc > 2:3500922/1‑93 (MQ=255)
gTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGgcc < 2:448955/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGgcc < 2:406986/93‑1 (MQ=255)
tGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACATACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGgccg > 1:2509322/1‑93 (MQ=255)
aaGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGgccgcc > 2:4116121/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGccgccg > 2:1937550/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGccgccg > 2:230095/1‑93 (MQ=255)
ggggCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGa > 2:310277/1‑93 (MQ=255)
ggggCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGa > 1:1709176/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGAcc > 1:3200690/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCg > 1:1988220/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCgg < 1:1835799/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGt < 2:886156/93‑1 (MQ=255)
tGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGa < 2:3672054/93‑1 (MQ=255)
gCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGAt > 1:387386/1‑93 (MQ=255)
gCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGAt < 2:700583/93‑1 (MQ=255)
agagCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATcc < 2:2510780/93‑1 (MQ=255)
agagCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATcc > 2:3459459/1‑93 (MQ=255)
aggCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCt < 1:600097/91‑1 (MQ=255)
agCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCtc > 1:830082/1‑93 (MQ=255)
gTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCtcgtc < 2:2953182/93‑1 (MQ=255)
gTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCACGCGGGCCGCCGACCTGTGATCCtcgtg > 2:2146163/1‑92 (MQ=255)
aaTGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCgg > 1:1567181/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGaa > 1:1316818/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGaa > 2:1476094/1‑93 (MQ=255)
gggCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAAt < 2:3027906/93‑1 (MQ=255)
gggCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAAt < 2:713074/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGt < 1:4597861/93‑1 (MQ=255)
cTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCa < 2:376012/93‑1 (MQ=255)
ttATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAt > 1:764849/1‑93 (MQ=255)
ttATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAt > 2:236070/1‑93 (MQ=255)
tgttCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAt < 1:1204020/90‑1 (MQ=255)
tATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtt > 2:4633810/1‑93 (MQ=255)
tATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtt > 1:793471/1‑93 (MQ=255)
tATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtt < 1:2197359/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAttt < 2:2021002/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtttt > 1:3990314/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtttt > 2:2387566/1‑93 (MQ=255)
gctgACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTAt < 1:4490919/93‑1 (MQ=255)
gctgACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTAt < 2:37006/93‑1 (MQ=255)
tgACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGc > 2:2325115/1‑93 (MQ=255)
tgACTTACCGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGGCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGc < 1:1377345/93‑1 (MQ=255)
gACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCt < 1:734053/93‑1 (MQ=255)
gACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCt > 1:3539001/1‑93 (MQ=255)
aCTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTg > 2:2481316/1‑93 (MQ=255)
aCTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTg > 2:1707067/1‑93 (MQ=255)
aCTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTg > 2:3847409/1‑93 (MQ=255)
cTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTgg > 1:2012288/1‑93 (MQ=255)
ttACGGTGTCTCACGGTTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGc < 2:2697920/93‑1 (MQ=255)
ttACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGc > 2:1261847/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGGATGTCCATTTTTATGGTGGCa > 2:560258/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCa > 1:2112297/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCaa > 2:1320886/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCaa > 1:3333439/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCaa > 2:3540236/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCaa < 2:558849/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAAc < 2:3159611/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAAc > 1:230643/1‑93 (MQ=255)
gtgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACgg > 1:4530831/1‑92 (MQ=255)
gtgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGc > 1:519275/1‑93 (MQ=255)
gtgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGc < 2:1405771/93‑1 (MQ=255)
gtgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGc > 2:1845484/1‑93 (MQ=255)
gtgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGc > 1:1123811/1‑93 (MQ=255)
tgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCt > 1:554405/1‑93 (MQ=255)
tgtCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCt < 1:2597414/93‑1 (MQ=255)
tctcACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGATGGCAACGCTgg < 1:1440721/93‑1 (MQ=255)
tcACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTc > 1:2728597/1‑93 (MQ=255)
ccaGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTcgc < 1:140476/92‑1 (MQ=255)
acaGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTcgc < 2:3969461/93‑1 (MQ=255)
aGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCCACGCTGGTCGCgg > 2:1016494/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCgg < 2:43040/93‑1 (MQ=255)
aGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCgg > 2:4262732/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGt < 1:703529/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGGGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATTCTTGCAACGCTGGTCGCGGt > 2:1646151/1‑93 (MQ=255)
gTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCAc > 1:3097292/1‑93 (MQ=255)
ttttATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACg < 1:1017438/93‑1 (MQ=255)
tttATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGa < 2:2203958/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGAc < 2:2416582/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGAcc > 1:1784316/1‑93 (MQ=255)
tGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCTCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTc < 2:3754307/93‑1 (MQ=255)
gCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCa > 1:284373/1‑93 (MQ=255)
gCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCa > 1:1599295/1‑93 (MQ=255)
gCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCa < 1:1908130/93‑1 (MQ=255)
ccGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGt > 1:2219631/1‑93 (MQ=255)
cGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGtt < 1:3140023/93‑1 (MQ=255)
gATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGttt > 2:2116942/1‑93 (MQ=255)
tttCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGa < 2:1517473/93‑1 (MQ=255)
tttCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGa > 2:2441140/1‑93 (MQ=255)
tttCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGa > 1:4204101/1‑93 (MQ=255)
ttCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGAc < 2:2576165/93‑1 (MQ=255)
tCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACg < 2:1057702/93‑1 (MQ=255)
gccGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGgtgt < 1:3908508/92‑1 (MQ=255)
aCCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGgtgt < 1:2447956/93‑1 (MQ=255)
aCCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGgtgt > 2:2844456/1‑93 (MQ=255)
ccGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGtt < 2:778274/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAGCGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGa < 1:3497106/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGa > 2:4570426/1‑93 (MQ=255)
|
TCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGA > NC_000913/3851667‑3851846
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTG > NC_000913/3851666‑3851849
|
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGCGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGG > SRR4302535.3736993/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGG > SRR4302535.4633652/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGG > SRR4302535.3427950/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGG > SRR4302535.3736995/1‑94 (MQ=60)
TCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGG < SRR4302535.4444404/94‑1 (MQ=60)
TCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGG < SRR4302535.3815810/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCG > SRR4302535.2796688/1‑94 (MQ=60)
GTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACATACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCG > SRR4302535.2527411/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGC > SRR4302535.240189/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGA > SRR4302535.1721532/1‑94 (MQ=60)
GGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGAC > SRR4302535.1134460/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACC > SRR4302535.3222851/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACC > SRR4302535.1423777/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCG > SRR4302535.2002539/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGT < SRR4302535.1849042/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTG < SRR4302535.4035854/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTG > SRR4302535.853557/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGAT > SRR4302535.390077/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGAT > SRR4302535.390078/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCT < SRR4302535.592451/94‑1 (MQ=60)
agGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTC < SRR4302535.604295/92‑1 (MQ=60)
GAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTC > SRR4302535.835895/1‑94 (MQ=60)
AGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCG > SRR4302535.3121725/1‑94 (MQ=60)
GCGTAATGGGCGCTTATCTTCTGACTTACGTTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGT < SRR4302535.1901261/94‑1 (MQ=60)
GCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGT < SRR4302535.1587852/94‑1 (MQ=60)
GTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCG < SRR4302535.3094217/94‑1 (MQ=60)
GTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCG > SRR4302535.1397733/1‑94 (MQ=60)
TAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGG > SRR4302535.1578490/1‑94 (MQ=60)
TAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGG > SRR4302535.758892/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAA > SRR4302535.1326226/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAA > SRR4302535.2155655/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAAT < SRR4302535.835767/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGT < SRR4302535.2572228/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTC < SRR4302535.4629138/94‑1 (MQ=60)
CGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCC > SRR4302535.3523697/1‑94 (MQ=60)
CGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCC > SRR4302535.2006219/1‑94 (MQ=60)
CTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAT > SRR4302535.770237/1‑94 (MQ=60)
CTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAT > SRR4302535.222031/1‑94 (MQ=60)
tgtTCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATT < SRR4302535.1212661/91‑1 (MQ=60)
TTATCTGCTGTCTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATT < SRR4302535.3232620/94‑1 (MQ=60)
TTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATT > SRR4302535.799045/1‑94 (MQ=60)
TTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATT > SRR4302535.3855227/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTT < SRR4302535.2213020/94‑1 (MQ=60)
TATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTT > SRR4302535.2522281/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCTGAATGTCCATTTT > SRR4302535.355073/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTT > SRR4302535.4017605/1‑94 (MQ=60)
TCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTT < SRR4302535.3724587/94‑1 (MQ=60)
TCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTT < SRR4302535.2070874/94‑1 (MQ=60)
GCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATG < SRR4302535.4521747/94‑1 (MQ=60)
CTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGC > SRR4302535.644866/1‑94 (MQ=60)
CTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGC > SRR4302535.274561/1‑94 (MQ=60)
CTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGC > SRR4302535.1627330/1‑94 (MQ=60)
CTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGC > SRR4302535.495364/1‑94 (MQ=60)
TGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCT > SRR4302535.3563569/1‑94 (MQ=60)
TGACTTACCGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGGCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCT < SRR4302535.1387174/94‑1 (MQ=60)
GACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTG > SRR4302535.797096/1‑94 (MQ=60)
GACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTG < SRR4302535.4617976/94‑1 (MQ=60)
GACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTG < SRR4302535.739211/94‑1 (MQ=60)
GACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTG > SRR4302535.1040799/1‑94 (MQ=60)
ACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGG > SRR4302535.2026784/1‑94 (MQ=60)
TTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCA > SRR4302535.2127544/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAA > SRR4302535.3356639/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAA < SRR4302535.19249/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAAC > SRR4302535.232232/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACG < SRR4302535.2638082/94‑1 (MQ=60)
GGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGG > SRR4302535.4561845/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGC > SRR4302535.522909/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGC > SRR4302535.1131830/1‑94 (MQ=60)
GTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCT > SRR4302535.558291/1‑94 (MQ=60)
GTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCT > SRR4302535.2254345/1‑94 (MQ=60)
GTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCT < SRR4302535.2084024/94‑1 (MQ=60)
TGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTG < SRR4302535.2616069/94‑1 (MQ=60)
GTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGG > SRR4302535.4270914/1‑94 (MQ=60)
TCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGATGGCAACGCTGGT < SRR4302535.1451027/94‑1 (MQ=60)
CTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTC > SRR4302535.123121/1‑94 (MQ=60)
CTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTC > SRR4302535.4630833/1‑94 (MQ=60)
CTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTC > SRR4302535.2748080/1‑94 (MQ=60)
CTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTC > SRR4302535.1819903/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGC > SRR4302535.711345/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGC > SRR4302535.681461/1‑94 (MQ=60)
CCAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCG < SRR4302535.141462/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTC < SRR4302535.708463/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCAC > SRR4302535.3118859/1‑94 (MQ=60)
TTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGA < SRR4302535.1024669/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACC > SRR4302535.1797232/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCA > SRR4302535.4012559/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCA > SRR4302535.1610828/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCA > SRR4302535.286359/1‑94 (MQ=60)
GCCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAG < SRR4302535.1921888/94‑1 (MQ=60)
CCCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGT > SRR4302535.2235425/1‑94 (MQ=60)
CCGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTT > SRR4302535.173430/1‑94 (MQ=60)
CGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTT < SRR4302535.3161872/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTT > SRR4302535.533471/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGA > SRR4302535.4232875/1‑94 (MQ=60)
CGACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTG > SRR4302535.4530412/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTT < SRR4302535.3935279/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTT < SRR4302535.2465594/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTT > SRR4302535.1532697/1‑94 (MQ=60)
CCGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTG < SRR4302535.1599987/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGA > SRR4302535.3190563/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAGCGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGAT < SRR4302535.3521408/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGAT > SRR4302535.3383424/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGAT < SRR4302535.1351095/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATT < SRR4302535.1767164/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATT > SRR4302535.80503/1‑94 (MQ=60)
GCGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTG < SRR4302535.4382213/94‑1 (MQ=60)
|
GTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTG > NC_000913/3851666‑3851849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
