Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,929,460 |
T→C |
M173T (ATG→ACG) |
kup → |
low affinity potassium transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,929,460 | 0 | T | C | 100.0%
| 764.6
/ NA
| 237 | M173T (ATG→ACG) | kup | low affinity potassium transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (133/104); total (133/104) |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG > NC_000913/3929370‑3929549
|
gTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTg > 2:302765/1‑93 (MQ=255)
ttCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGa > 1:3027911/1‑93 (MQ=255)
ttCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGa < 1:1838696/93‑1 (MQ=255)
ccccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAcc < 1:632748/93‑1 (MQ=255)
cccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCt > 2:3665614/1‑93 (MQ=255)
ccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTg > 2:2238329/1‑93 (MQ=255)
ctcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtt > 1:3112108/1‑93 (MQ=255)
tcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttt > 2:274636/1‑93 (MQ=255)
tcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttt > 1:1688457/1‑93 (MQ=255)
tcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttt > 1:391985/1‑93 (MQ=255)
cAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtttt < 2:2181451/93‑1 (MQ=255)
cAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtttt < 2:121527/93‑1 (MQ=255)
cAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtttt > 1:4098243/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt < 2:4179308/93‑1 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt < 1:446032/93‑1 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt < 2:2366572/93‑1 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa < 1:3541940/93‑1 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa > 1:468424/1‑93 (MQ=255)
tATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAt < 1:3006663/93‑1 (MQ=255)
tATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAt < 1:1050730/93‑1 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAtt > 1:2753714/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAtt > 2:440071/1‑93 (MQ=255)
tCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGGTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTc > 2:496177/1‑93 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg > 2:1129695/1‑93 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg > 2:54107/1‑93 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg > 1:4182337/1‑93 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGc > 1:1519029/1‑93 (MQ=255)
ctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCa < 2:3392274/93‑1 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg > 2:1475241/1‑93 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg > 1:3221136/1‑93 (MQ=255)
cACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAgg < 1:4273868/93‑1 (MQ=255)
aCTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGa < 1:2530057/93‑1 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACt < 1:1670703/93‑1 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACt > 2:3479325/1‑93 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg > 1:2385556/1‑93 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg > 1:465561/1‑93 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg > 1:2167565/1‑93 (MQ=255)
attattTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTggg > 2:1574358/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg < 2:1348839/93‑1 (MQ=255)
atttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGtt > 2:2583259/1‑93 (MQ=255)
atttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGtt > 1:2069565/1‑93 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTa > 1:2734674/1‑93 (MQ=255)
ttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTAc > 2:2876166/1‑93 (MQ=255)
tatGATTCAAAAACATGGCACTGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACg > 1:2912231/1‑93 (MQ=255)
gATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAg > 1:2223768/1‑93 (MQ=255)
gATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAg > 2:4130984/1‑93 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGATTGGGGGTACGTAga > 1:1969240/1‑92 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGc > 1:1855284/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAgaa > 2:409010/1‑91 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa < 2:3615557/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa > 2:4360505/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa < 1:46055/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGGTACGTAGCa > 2:1075090/1‑93 (MQ=255)
cAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatt > 2:294329/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta > 2:789341/1‑93 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattat > 1:1171790/1‑93 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattat > 1:2354838/1‑93 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattat < 1:1326996/93‑1 (MQ=255)
aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattatt < 1:877068/93‑1 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 2:2791848/93‑1 (MQ=255)
cATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCt > 1:2087381/1‑93 (MQ=255)
gCACGTCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAcc < 2:185144/93‑1 (MQ=255)
gCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAcc < 2:3196067/93‑1 (MQ=255)
cACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAccc < 1:3771405/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa > 2:4613474/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa < 2:3324231/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa > 1:1123636/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa < 2:1093352/93‑1 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg > 2:3530668/1‑93 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg > 1:4294427/1‑93 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg > 2:2861907/1‑93 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 1:1789330/93‑1 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 2:2512729/93‑1 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt > 1:3609819/1‑93 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 1:3949219/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc < 1:1134205/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc < 1:2574982/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc > 1:687472/1‑93 (MQ=255)
aggTCGGTAAGCGGGTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATGATTGCTAACCCGGAAGtgc < 1:2050581/92‑1 (MQ=255)
cGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCa < 1:4632961/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt < 1:1535107/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt > 2:4035137/1‑93 (MQ=255)
tAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgc > 1:1585402/1‑93 (MQ=255)
aaGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcg > 2:2403408/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCt > 2:2594288/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTg > 1:4044429/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGGAGTGCTGCATGCGCTGa > 2:2003891/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGa > 1:1928074/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAt < 1:3075793/93‑1 (MQ=255)
cgcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAGCCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCaa < 2:3098523/93‑1 (MQ=255)
gcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAt < 2:836644/93‑1 (MQ=255)
gcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAt < 1:3337002/93‑1 (MQ=255)
ccGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg > 2:4023087/1‑93 (MQ=255)
cGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 1:2439177/93‑1 (MQ=255)
cGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 2:1392526/93‑1 (MQ=255)
cGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 2:2267398/93‑1 (MQ=255)
gATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgtg > 1:280908/1‑93 (MQ=255)
gATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgtg > 2:1694769/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg < 2:3737924/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg > 2:2108999/1‑93 (MQ=255)
|
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG > NC_000913/3929370‑3929549
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > NC_000913/3929368‑3929551
|
GATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACG > SRR4302535.4562628/1‑94 (MQ=60)
ATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGC < SRR4302535.2914791/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCT < SRR4302535.4494404/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCT > SRR4302535.4273274/1‑94 (MQ=60)
GTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGA > SRR4302535.3049106/1‑94 (MQ=60)
GTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGA < SRR4302535.4071027/94‑1 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC > SRR4302535.979357/1‑94 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC < SRR4302535.1851958/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT < SRR4302535.637156/94‑1 (MQ=60)
CCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTG > SRR4302535.3128355/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT > SRR4302535.2397679/1‑94 (MQ=60)
TCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTT > SRR4302535.3133772/1‑94 (MQ=60)
CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTT > SRR4302535.394719/1‑94 (MQ=60)
CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTT < SRR4302535.2806166/94‑1 (MQ=60)
CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTT > SRR4302535.1700680/1‑94 (MQ=60)
TCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTT > SRR4302535.4126298/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302535.3029886/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT < SRR4302535.4110512/94‑1 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT < SRR4302535.4648549/94‑1 (MQ=60)
AATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTG < SRR4302535.449151/94‑1 (MQ=60)
AATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTG < SRR4302535.1563427/94‑1 (MQ=60)
AATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTG > SRR4302535.1142286/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302535.4439363/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302535.471699/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302535.3566548/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302535.1829582/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT < SRR4302535.3027726/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT < SRR4302535.1058202/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT < SRR4302535.185549/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT > SRR4302535.2773339/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTC < SRR4302535.326997/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTC < SRR4302535.2591491/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTC > SRR4302535.1776572/1‑94 (MQ=60)
TCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCT < SRR4302535.3243722/94‑1 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.4210954/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.2320101/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.1624078/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.4711684/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG < SRR4302535.2768035/94‑1 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.1463427/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGCAAGCTGCTTGCGCCGATCACGCTGACCTGCTTTTTGATTCTGG > SRR4302535.2069732/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATAGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG < SRR4302535.397812/94‑1 (MQ=60)
TTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGC > SRR4302535.1529970/1‑94 (MQ=60)
CTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAG > SRR4302535.3243458/1‑94 (MQ=60)
TCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGG < SRR4302535.852489/94‑1 (MQ=60)
CACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGA < SRR4302535.4303124/94‑1 (MQ=60)
ACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGAC < SRR4302535.2548287/94‑1 (MQ=60)
CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT > SRR4302535.3897798/1‑94 (MQ=60)
TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG > SRR4302535.2402698/1‑94 (MQ=60)
TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG > SRR4302535.2183099/1‑94 (MQ=60)
TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG < SRR4302535.1682797/94‑1 (MQ=60)
TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG > SRR4302535.468817/1‑94 (MQ=60)
ATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGG < SRR4302535.163475/94‑1 (MQ=60)
TTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGT < SRR4302535.3069613/94‑1 (MQ=60)
TATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTT > SRR4302535.1960630/1‑94 (MQ=60)
TATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTT > SRR4302535.2084482/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTA > SRR4302535.2754186/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACTGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG > SRR4302535.2932805/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG < SRR4302535.2747472/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG < SRR4302535.1146931/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG < SRR4302535.3361108/94‑1 (MQ=60)
ATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTA > SRR4302535.2084826/1‑94 (MQ=60)
ATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTA < SRR4302535.4670000/94‑1 (MQ=60)
ATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTA > SRR4302535.3587093/1‑94 (MQ=60)
TGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAG > SRR4302535.1102424/1‑94 (MQ=60)
TGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAG > SRR4302535.2239596/1‑94 (MQ=60)
GATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGATTGGGGGTACGTAGA > SRR4302535.1983427/1‑94 (MQ=60)
GATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGC > SRR4302535.1868650/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCA < SRR4302535.3201195/94‑1 (MQ=60)
TTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCAT < SRR4302535.46404/94‑1 (MQ=60)
TCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATT < SRR4302535.2897066/94‑1 (MQ=60)
TCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTCGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATT < SRR4302535.1538673/94‑1 (MQ=60)
CAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTA > SRR4302535.2349296/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTA > SRR4302535.666484/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGATTACGTAGCATTT > SRR4302535.2698743/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT > SRR4302535.1180158/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT > SRR4302535.3150589/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT > SRR4302535.2371723/1‑94 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT < SRR4302535.1336466/94‑1 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG < SRR4302535.3032792/94‑1 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG < SRR4302535.883278/94‑1 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG < SRR4302535.1889521/94‑1 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG > SRR4302535.4323515/1‑94 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGC > SRR4302535.4415988/1‑94 (MQ=60)
ACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGTGTTACGTAGCATTATTGCT < SRR4302535.1389970/94‑1 (MQ=60)
ACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCT > SRR4302535.2102413/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA < SRR4302535.2510266/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA > SRR4302535.213447/1‑94 (MQ=60)
GGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACC < SRR4302535.4175060/94‑1 (MQ=60)
GCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCC < SRR4302535.4672490/94‑1 (MQ=60)
GCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCC > SRR4302535.2060945/1‑94 (MQ=60)
CACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCG < SRR4302535.3797424/94‑1 (MQ=60)
ACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGG > SRR4302535.1897712/1‑94 (MQ=60)
GGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAA < SRR4302535.2911276/94‑1 (MQ=60)
GGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAA > SRR4302535.3955642/1‑94 (MQ=60)
GGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAA > SRR4302535.1131653/1‑94 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG > SRR4302535.4323811/1‑94 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG > SRR4302535.428725/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302535.3634855/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302535.115241/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT < SRR4302535.2418281/94‑1 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302535.2194158/1‑94 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG < SRR4302535.3976183/94‑1 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG < SRR4302535.1802272/94‑1 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTACGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG > SRR4302535.2132286/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302535.3534012/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302535.692287/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCT < SRR4302535.1142299/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCT < SRR4302535.2593489/94‑1 (MQ=60)
AGGTCGGTAAGCGGGTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATGATTGCTAACCCGGAAGTGCT < SRR4302535.2065347/94‑1 (MQ=60)
GGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTG > SRR4302535.2522249/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAT < SRR4302535.518835/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAT < SRR4302535.4664392/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG > SRR4302535.1236367/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG < SRR4302535.1546165/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGC > SRR4302535.1596841/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTG > SRR4302535.4072120/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGA > SRR4302535.1941971/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGA > SRR4302535.3879727/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT < SRR4302535.2013965/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT < SRR4302535.3751727/94‑1 (MQ=60)
TTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATC < SRR4302535.2969304/94‑1 (MQ=60)
TTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATC < SRR4302535.3097254/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATG < SRR4302535.3360241/94‑1 (MQ=60)
CGATCACGCTGACCTGTTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG < SRR4302535.958237/94‑1 (MQ=60)
CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG < SRR4302535.1696030/94‑1 (MQ=60)
CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG < SRR4302535.2456748/94‑1 (MQ=60)
CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG > SRR4302535.282867/1‑94 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG < SRR4302535.1774802/94‑1 (MQ=60)
ATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG > SRR4302535.490893/1‑94 (MQ=60)
CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > SRR4302535.3597584/1‑94 (MQ=60)
CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > SRR4302535.1080215/1‑94 (MQ=60)
|
GATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > NC_000913/3929368‑3929551
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
