Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,929,460 |
T→C |
M173T (ATG→ACG) |
kup → |
low affinity potassium transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,929,460 | 0 | T | C | 99.3%
| 1285.9
/ ‑3.1
| 407 | M173T (ATG→ACG) | kup | low affinity potassium transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (207/197); total (208/199) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
ATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > NC_000913/3929369‑3929551
|
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc < 2:3826579/93‑1 (MQ=255)
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc > 2:7052538/1‑93 (MQ=255)
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc < 2:1836976/93‑1 (MQ=255)
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc > 1:5028121/1‑93 (MQ=255)
aGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCt < 1:3805426/93‑1 (MQ=255)
aGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCt > 2:868715/1‑93 (MQ=255)
gTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTg > 2:6944909/1‑93 (MQ=255)
tcccccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGa < 2:5602391/91‑1 (MQ=255)
ccccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAcc < 1:1445577/93‑1 (MQ=255)
cccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCt < 2:6790254/93‑1 (MQ=255)
ccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTg < 2:6722817/93‑1 (MQ=255)
tctcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGt > 2:2311532/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTg > 2:2089045/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTgt > 2:1613019/1‑92 (MQ=255)
tATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAt > 1:4713137/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAtt < 1:2078003/93‑1 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAtt < 2:6101502/93‑1 (MQ=255)
tCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTc < 1:1082717/93‑1 (MQ=255)
tCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGAACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGATCTGGTTTTTGATTc > 1:405013/1‑93 (MQ=255)
cGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCt > 1:1559978/1‑93 (MQ=255)
gTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTg < 2:3292649/93‑1 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg < 2:2375417/93‑1 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg > 1:4945487/1‑93 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGc > 2:583354/1‑93 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGc < 1:947099/93‑1 (MQ=255)
ctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCa < 1:2551364/93‑1 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg > 2:2681364/1‑93 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg > 1:6169605/1‑93 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg > 2:1914659/1‑93 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAg < 1:2134345/93‑1 (MQ=255)
cACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAgg > 1:3893454/1‑93 (MQ=255)
aCTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGa > 2:7751622/1‑93 (MQ=255)
cTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGAc < 2:4222039/93‑1 (MQ=255)
cTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGAc > 1:714306/1‑93 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACt < 1:3581150/93‑1 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACt < 2:465543/93‑1 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg < 1:7236582/93‑1 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg > 1:116829/1‑93 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg > 1:5825197/1‑93 (MQ=255)
ttattaTTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTg < 1:3491065/93‑1 (MQ=255)
attattTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTggg < 1:3983473/93‑1 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTtggg > 1:3127754/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 1:860185/1‑93 (MQ=255)
tatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGt < 2:7192540/93‑1 (MQ=255)
atttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGtt > 2:6318104/1‑93 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTa > 1:5794617/1‑93 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTa < 1:1935264/93‑1 (MQ=255)
tGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTa > 1:2772705/1‑93 (MQ=255)
tGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTa < 2:4490563/93‑1 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGc < 1:6566963/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa < 1:5250025/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa < 1:6509523/93‑1 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta > 1:3264533/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta < 1:4183967/93‑1 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta > 1:6315361/1‑93 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattat < 1:1273650/93‑1 (MQ=255)
aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattatt > 1:479192/1‑93 (MQ=255)
aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattatt < 2:5147389/93‑1 (MQ=255)
aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGCACTGGGGTTACGTAGCattatt < 1:3664338/93‑1 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCTATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 1:2343495/93‑1 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTgt > 1:2210358/1‑92 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 1:2663957/93‑1 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 2:6646777/93‑1 (MQ=255)
aTGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTa > 1:5646868/1‑93 (MQ=255)
tGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTaa < 2:3014844/93‑1 (MQ=255)
cACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAccc > 2:4073544/1‑93 (MQ=255)
cGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCgg < 2:479150/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTACGCTGTTTGCGCCGCTCGCGCTGACCTGGTTTTTGCTTCTGGCAGGTCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa < 1:7028332/93‑1 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa > 2:1336171/1‑93 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGGTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa > 2:5502862/1‑93 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg > 2:2536044/1‑93 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt > 2:589174/1‑93 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 1:1261649/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGCAGtgc > 2:7518956/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc > 1:3396112/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc < 1:5515419/93‑1 (MQ=255)
ggTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgct < 2:215297/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgctg < 1:5374643/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGcgctgc > 1:6867863/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt > 2:3509247/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt < 2:5256804/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt < 1:4564810/93‑1 (MQ=255)
tAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgc > 2:1693746/1‑93 (MQ=255)
aggtGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcgc < 2:6232411/90‑1 (MQ=255)
aGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcgc < 1:7929317/93‑1 (MQ=255)
aGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcgc > 1:2000259/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTg < 2:3116535/93‑1 (MQ=255)
tGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGa > 2:1221922/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGaa > 1:6717933/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGat > 1:7397490/1‑92 (MQ=255)
cgcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCaa < 1:7721934/93‑1 (MQ=255)
gcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAt < 2:4383756/93‑1 (MQ=255)
ccGATTACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATGGCTAAACCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg > 2:639423/1‑93 (MQ=255)
ccGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg < 1:431451/93‑1 (MQ=255)
ccGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg < 1:5779440/93‑1 (MQ=255)
cGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 1:2903859/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCATTGTgg < 2:7857393/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg < 1:6403521/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 2:4116880/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 2:7463184/93‑1 (MQ=255)
|
ATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > NC_000913/3929369‑3929551
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 236 total aligned reads displayed.
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT > NC_000913/3929367‑3929553
|
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCTATTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAC < SRR4302543.5439424/94‑1 (MQ=60)
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAC < SRR4302543.7863283/94‑1 (MQ=60)
GATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACG < SRR4302543.5460586/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGC > SRR4302543.4606734/1‑94 (MQ=60)
ATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGC > SRR4302543.5073877/1‑94 (MQ=60)
AGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTG > SRR4302543.2575314/1‑94 (MQ=60)
AGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTG < SRR4302543.4826377/94‑1 (MQ=60)
GTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGA > SRR4302543.3583613/1‑94 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC > SRR4302543.6583358/1‑94 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC > SRR4302543.7519728/1‑94 (MQ=60)
TCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACC > SRR4302543.1846940/1‑94 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT < SRR4302543.1458637/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT > SRR4302543.6121306/1‑94 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT < SRR4302543.114710/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTGATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT < SRR4302543.3482789/94‑1 (MQ=60)
CCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTG > SRR4302543.7228778/1‑94 (MQ=60)
CCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTG > SRR4302543.5866996/1‑94 (MQ=60)
CCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTG > SRR4302543.2533873/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT > SRR4302543.914507/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT < SRR4302543.1294033/94‑1 (MQ=60)
TCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTT < SRR4302543.4903305/94‑1 (MQ=60)
TCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTT > SRR4302543.6594801/1‑94 (MQ=60)
CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTT > SRR4302543.3576843/1‑94 (MQ=60)
CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTGT > SRR4302543.6412525/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302543.4005399/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302543.1968456/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302543.8009164/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT < SRR4302543.2033151/94‑1 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTCGTTTTT > SRR4302543.4130202/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGATCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT < SRR4302543.5657221/94‑1 (MQ=60)
AATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTG > SRR4302543.7203288/1‑94 (MQ=60)
AATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTG < SRR4302543.6875316/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302543.4554855/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGCTCACGCTGACCTGGTTTTTGAT > SRR4302543.5598199/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT > SRR4302543.5597977/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT > SRR4302543.3697947/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT > SRR4302543.816707/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT > SRR4302543.4756207/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302543.6512602/94‑1 (MQ=60)
ATATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302543.5673953/94‑1 (MQ=60)
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GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302543.4990527/1‑94 (MQ=60)
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CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT > SRR4302543.3203733/1‑94 (MQ=60)
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TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG < SRR4302543.3874552/94‑1 (MQ=60)
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ATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTTGGG > SRR4302543.3155887/1‑94 (MQ=60)
ATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGG < SRR4302543.4286793/94‑1 (MQ=60)
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ATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTA > SRR4302543.2082067/1‑94 (MQ=60)
TTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTAC < SRR4302543.1952664/94‑1 (MQ=60)
TTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTAC < SRR4302543.2722479/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG > SRR4302543.6951058/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACG > SRR4302543.1098873/1‑94 (MQ=60)
TATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGT > SRR4302543.2898929/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCA < SRR4302543.6628763/94‑1 (MQ=60)
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TCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATAACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGGTACGTGGCATT > SRR4302543.2607351/1‑94 (MQ=60)
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CAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTA > SRR4302543.3294038/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGTCTATTGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT < SRR4302543.2725543/94‑1 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT > SRR4302543.1469286/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT < SRR4302543.4221883/94‑1 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT < SRR4302543.4571042/94‑1 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCGATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATGCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT < SRR4302543.5316555/94‑1 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTTAGCTGTTGGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTGTGATTCTGGGAGGACGCGGGTTACGTAtacttatc > SRR4302543.4288106/1‑86 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT < SRR4302543.1285024/94‑1 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT < SRR4302543.2112608/94‑1 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT < SRR4302543.2651374/94‑1 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT > SRR4302543.483620/1‑94 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGCACTGGGGTTACGTAGCATTATTG < SRR4302543.3696511/94‑1 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTATTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG < SRR4302543.5195110/94‑1 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGT > SRR4302543.2230271/1‑94 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGC < SRR4302543.1277278/94‑1 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGC > SRR4302543.3936419/1‑94 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGC > SRR4302543.5389397/1‑94 (MQ=60)
ACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCTATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCT < SRR4302543.2364754/94‑1 (MQ=60)
ACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCT < SRR4302543.2688110/94‑1 (MQ=60)
CATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTA > SRR4302543.5893766/1‑94 (MQ=60)
CATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTA > SRR4302543.5698348/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA > SRR4302543.3913259/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA < SRR4302543.4749571/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA > SRR4302543.2964967/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGGGTGTGATGCTGGCAGGACTGGGGTgacggagcaggagtgcgaa > SRR4302543.7076530/1‑75 (MQ=60)
TGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAC > SRR4302543.1509236/1‑94 (MQ=60)
TGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAC > SRR4302543.4052303/1‑94 (MQ=60)
TGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAC > SRR4302543.3238947/1‑94 (MQ=60)
GCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCC < SRR4302543.7347840/94‑1 (MQ=60)
GCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCC < SRR4302543.4293986/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCG < SRR4302543.2145727/94‑1 (MQ=60)
GGCTATTGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAA < SRR4302543.2307868/94‑1 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTACGCTGTTTGCGCCGCTCGCGCTGACCTGGTTTTTGCTTCTGGCAGGTCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG < SRR4302543.7095824/94‑1 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG < SRR4302543.6428529/94‑1 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCAGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG < SRR4302543.2447958/94‑1 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302543.873898/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302543.2210234/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGG > SRR4302543.5463809/1‑94 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG < SRR4302543.1272941/94‑1 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG > SRR4302543.4079050/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302543.7940829/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302543.3426550/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302543.3426551/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCT < SRR4302543.5565512/94‑1 (MQ=60)
GGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTG < SRR4302543.5793048/94‑1 (MQ=60)
GGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTG > SRR4302543.7779844/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGC < SRR4302543.5423327/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGC > SRR4302543.3464528/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGCGCTGC > SRR4302543.6932553/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAT > SRR4302543.5034948/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAT < SRR4302543.3839000/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG < SRR4302543.4606349/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG > SRR4302543.2922111/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGCTATTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG < SRR4302543.4208453/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGC > SRR4302543.4833956/1‑94 (MQ=60)
AAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCGTTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGC < SRR4302543.7273118/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGC > SRR4302543.2018217/1‑94 (MQ=60)
AGGTGTTTTCGCCGGTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGTGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCT < SRR4302543.2276148/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCT < SRR4302543.2276145/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCT < SRR4302543.8003764/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCT < SRR4302543.8003763/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGTATTATTGCTAACCAGGAAGTGCTGCATGCGCTGA < SRR4302543.5003109/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGA > SRR4302543.585653/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGATACGTAGCATTATTGCTAACCCtgatatgttgcatgtgctga > SRR4302543.7044688/1‑74 (MQ=60)
TGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAA > SRR4302543.6781428/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCCTTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAA > SRR4302543.1558448/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT > SRR4302543.3193758/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT > SRR4302543.3535537/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT < SRR4302543.173230/94‑1 (MQ=60)
TTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATC < SRR4302543.5843974/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATC < SRR4302543.6448918/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCA < SRR4302543.6687631/94‑1 (MQ=60)
GCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAA < SRR4302543.298251/94‑1 (MQ=60)
CGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAT < SRR4302543.7794945/94‑1 (MQ=60)
CGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAT > SRR4302543.3732316/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATG > SRR4302543.2859302/1‑94 (MQ=60)
CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT < SRR4302543.435493/94‑1 (MQ=60)
CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT < SRR4302543.2463362/94‑1 (MQ=60)
CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT > SRR4302543.6336024/1‑94 (MQ=60)
CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT < SRR4302543.5832042/94‑1 (MQ=60)
CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT < SRR4302543.5832041/94‑1 (MQ=60)
CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG < SRR4302543.1427806/94‑1 (MQ=60)
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CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG < SRR4302543.2930258/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG < SRR4302543.1134869/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG < SRR4302543.2205552/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG < SRR4302543.6557030/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG > SRR4302543.3338479/1‑94 (MQ=60)
ATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG < SRR4302543.6463815/94‑1 (MQ=60)
CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG > SRR4302543.4338522/1‑94 (MQ=60)
CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG < SRR4302543.4569304/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGG < SRR4302543.5243883/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT < SRR4302543.7403719/94‑1 (MQ=60)
|
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT > NC_000913/3929367‑3929553
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
