Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,948,221 |
A→G |
A13A (GCA→GCG) |
ilvG → |
acetolactate synthase II large subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,948,221 | 0 | A | G | 100.0%
| 741.4
/ NA
| 237 | A13A (GCA→GCG) | ilvG | acetolactate synthase II large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (114/123); total (114/123) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCT > NC_000913/3948132‑3948310
|
gAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAg > 1:418902/1‑93 (MQ=255)
aaTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAgg < 1:1227300/93‑1 (MQ=255)
aaTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAgg < 1:2297920/93‑1 (MQ=255)
aTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAggg > 1:3357309/1‑93 (MQ=255)
aTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAggg > 1:662929/1‑93 (MQ=255)
tAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGgt > 2:289564/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGTAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGCGGGGTACATGCGATGCGGGCGCAgtgcg > 2:4673642/1‑89 (MQ=255)
aaCAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGgtg < 1:2880502/93‑1 (MQ=255)
cAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGtgtg > 2:550964/1‑93 (MQ=255)
cAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGtgtg < 2:1968640/93‑1 (MQ=255)
gCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGaa > 2:3749124/1‑93 (MQ=255)
caAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAacac > 2:3456073/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACAcc < 1:4254396/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACAcc > 2:3297394/1‑93 (MQ=255)
aaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGt < 1:245180/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGtt < 2:4372678/93‑1 (MQ=255)
tCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGtttt < 2:117128/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTc > 1:1131242/1‑93 (MQ=255)
tGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCg > 2:1842696/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCgg > 2:103523/1‑93 (MQ=255)
tttCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGt < 2:3084337/93‑1 (MQ=255)
tctcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTa < 2:1165778/93‑1 (MQ=255)
tctcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTa > 1:3695163/1‑93 (MQ=255)
tctcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTa < 1:3919366/93‑1 (MQ=255)
tctcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTa < 1:155443/93‑1 (MQ=255)
tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATc < 1:4388012/93‑1 (MQ=255)
tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATc > 2:2964192/1‑93 (MQ=255)
tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATc > 1:2179473/1‑93 (MQ=255)
tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGGTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATc > 1:70736/1‑93 (MQ=255)
aaGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCg < 2:2423826/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCggg > 1:1340194/1‑93 (MQ=255)
gATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCggg > 2:3656852/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGt < 2:4541062/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGt < 2:2563053/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTg < 2:1958702/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTg > 1:544520/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTg > 1:4066517/1‑93 (MQ=255)
tCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTgg < 1:1019706/93‑1 (MQ=255)
cGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAAt < 2:1584246/93‑1 (MQ=255)
gggAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTa < 1:2472431/93‑1 (MQ=255)
gggAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTa < 1:1431016/93‑1 (MQ=255)
gggAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTa < 2:4089166/93‑1 (MQ=255)
gggAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTa > 2:2748361/1‑93 (MQ=255)
gAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATg > 1:3167179/1‑93 (MQ=255)
gAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATg < 1:3424285/93‑1 (MQ=255)
actaactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGcg > 1:548553/1‑92 (MQ=255)
actaactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGcc < 2:4153297/93‑1 (MQ=255)
ctaactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCg > 1:3214880/1‑93 (MQ=255)
taactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCgg > 1:2389564/1‑93 (MQ=255)
taactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACAGGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCgg > 1:914540/1‑93 (MQ=255)
aactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGt < 1:1482131/93‑1 (MQ=255)
actaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGtt < 1:448318/93‑1 (MQ=255)
ctaTGAATGGCGCACAGGGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGgtt > 2:1715301/1‑93 (MQ=255)
taTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTa > 1:2201757/1‑93 (MQ=255)
taTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTa < 2:3506915/93‑1 (MQ=255)
aTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTAc < 2:2783848/93‑1 (MQ=255)
aTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTAc < 1:2914274/93‑1 (MQ=255)
tGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACg > 1:3685085/1‑93 (MQ=255)
tGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGCGGCGCAATTATGCCGGTTTACg > 1:1828701/1‑93 (MQ=255)
gAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGa < 1:2714143/93‑1 (MQ=255)
gAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGa < 1:3815867/93‑1 (MQ=255)
gAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGa > 1:4579785/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAt > 1:3574987/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAt < 2:503786/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATg < 1:1966493/93‑1 (MQ=255)
ggCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCa < 1:1720464/93‑1 (MQ=255)
gcgcACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAt < 2:3374539/93‑1 (MQ=255)
gcgcACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAt < 1:4121323/93‑1 (MQ=255)
cgcACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAtt < 1:1388195/93‑1 (MQ=255)
gcACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTg < 1:2777225/93‑1 (MQ=255)
cacaGTGGGTGGTACATTCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGt > 1:3653236/1‑93 (MQ=255)
cacaGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGt < 2:2144953/93‑1 (MQ=255)
acaGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTa < 2:828855/93‑1 (MQ=255)
acaGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTa < 2:1308847/93‑1 (MQ=255)
caGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTAt < 2:2199832/93‑1 (MQ=255)
caGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTAt < 2:695089/93‑1 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGTAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGa < 1:4130644/93‑1 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATgg > 2:3243703/1‑92 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGa < 2:1365485/93‑1 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGa < 2:743429/93‑1 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGa < 2:3770535/93‑1 (MQ=255)
gtgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGCTTACGATGCATTGTATGa > 2:3693395/1‑93 (MQ=255)
tgggtggTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAc < 2:3069991/93‑1 (MQ=255)
cgggtggTACCTGCGTTGCGGGCCCAGGGGGCTCACACCGTTTTCGGATATCCGGGTGTTGCAATTATGCCGGTTTACGATTCTTTTTAtatc > 2:2478024/2‑90 (MQ=255)
ggtggtACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcgg > 2:4273845/1‑93 (MQ=255)
gtggtACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggc > 1:872320/1‑93 (MQ=255)
tggtACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcg < 1:3202453/93‑1 (MQ=255)
gtACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACggcggc < 2:2128325/93‑1 (MQ=255)
cATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGTGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGAGGCGTg > 2:823172/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGa < 2:1614996/93‑1 (MQ=255)
tGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGa < 1:4424224/93‑1 (MQ=255)
gCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAg > 2:392146/1‑93 (MQ=255)
gCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCAGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAg > 2:1790496/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCa > 1:1057286/1‑93 (MQ=255)
ttGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCAc > 2:2277703/1‑93 (MQ=255)
ttGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCAc < 1:3021869/93‑1 (MQ=255)
tGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACt < 1:2758955/93‑1 (MQ=255)
gggCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGc > 1:3757036/1‑93 (MQ=255)
ggCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCt > 2:3937970/1‑93 (MQ=255)
ggCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCt > 1:2040222/1‑93 (MQ=255)
|
GAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCT > NC_000913/3948132‑3948310
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGC > NC_000913/3948128‑3948314
|
CAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCG > SRR4302535.2949405/1‑94 (MQ=60)
CAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCG > SRR4302535.2167903/1‑94 (MQ=60)
CAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTAAATGCGTTGCGGGCG > SRR4302535.3911683/1‑94 (MQ=60)
AATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGAGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGC > SRR4302535.3323981/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAG > SRR4302535.47966/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAG > SRR4302535.421835/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAG > SRR4302535.2159728/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG > SRR4302535.1666529/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG < SRR4302535.2036350/94‑1 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG > SRR4302535.667560/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG > SRR4302535.3380682/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG < SRR4302535.1236075/94‑1 (MQ=60)
AATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGG < SRR4302535.2314363/94‑1 (MQ=60)
TAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTG < SRR4302535.4108039/94‑1 (MQ=60)
AACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGT < SRR4302535.2900893/94‑1 (MQ=60)
AACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGT > SRR4302535.459488/1‑94 (MQ=60)
AACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGT < SRR4302535.4249898/94‑1 (MQ=60)
CAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGA > SRR4302535.1855883/1‑94 (MQ=60)
GCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGTGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAAC < SRR4302535.1328252/94‑1 (MQ=60)
GCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGT‑GTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACA < SRR4302535.1366368/94‑1 (MQ=60)
CACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACC > SRR4302535.3646898/1‑94 (MQ=60)
ACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAAAAC > SRR4302535.3858565/1‑94 (MQ=60)
CAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGGGTGAACACC > SRR4302535.3140146/1‑94 (MQ=60)
AAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTGACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCG < SRR4302535.3696415/94‑1 (MQ=60)
AAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCG < SRR4302535.4283543/94‑1 (MQ=60)
AAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGT > SRR4302535.878868/1‑94 (MQ=60)
AATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTT < SRR4302535.246859/94‑1 (MQ=60)
AATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTT > SRR4302535.4424988/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTT < SRR4302535.2933400/94‑1 (MQ=60)
TCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTC > SRR4302535.1139317/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTC < SRR4302535.2165755/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCG < SRR4302535.2481555/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGG < SRR4302535.755331/94‑1 (MQ=60)
TGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGG < SRR4302535.755332/94‑1 (MQ=60)
TTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTA > SRR4302535.3720741/1‑94 (MQ=60)
TTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTA > SRR4302535.1503393/1‑94 (MQ=60)
TTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTA > SRR4302535.3720740/1‑94 (MQ=60)
TCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTAT < SRR4302535.156542/94‑1 (MQ=60)
TCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTAT < SRR4302535.3946170/94‑1 (MQ=60)
CTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATC > SRR4302535.2195033/1‑94 (MQ=60)
CTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGGTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATC > SRR4302535.71254/1‑94 (MQ=60)
TCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCC < SRR4302535.4418027/94‑1 (MQ=60)
CAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCG > SRR4302535.3831633/1‑94 (MQ=60)
CAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCG > SRR4302535.3750235/1‑94 (MQ=60)
CAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCG > SRR4302535.43345/1‑94 (MQ=60)
AAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGG < SRR4302535.4118658/94‑1 (MQ=60)
AGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGG > SRR4302535.1349756/1‑94 (MQ=60)
AGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGG > SRR4302535.2929299/1‑94 (MQ=60)
AGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGG > SRR4302535.2773734/1‑94 (MQ=60)
GAATCAGGACGGGGAACTACCTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGCTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGT < SRR4302535.441413/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTG > SRR4302535.548324/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTG < SRR4302535.4508023/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTG > SRR4302535.4094344/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGG > SRR4302535.279462/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGACGGGGAACTAACTATGAAGGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGG < SRR4302535.3249009/94‑1 (MQ=60)
TCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGC < SRR4302535.4215338/94‑1 (MQ=60)
TCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGC < SRR4302535.1026950/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCG < SRR4302535.3482791/94‑1 (MQ=60)
ACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAAT > SRR4302535.2426476/1‑94 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATTCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT > SRR4302535.2802688/1‑94 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT < SRR4302535.3697057/94‑1 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT < SRR4302535.2490258/94‑1 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT < SRR4302535.279347/94‑1 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT < SRR4302535.1441226/94‑1 (MQ=60)
GGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAT < SRR4302535.1463459/94‑1 (MQ=60)
GGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATG > SRR4302535.3189123/1‑94 (MQ=60)
GGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATG < SRR4302535.2422731/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTTCGGGCGCAGGGTGTGAACACCTTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGC < SRR4302535.1192167/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGC < SRR4302535.3448099/94‑1 (MQ=60)
AACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCG > SRR4302535.552385/1‑94 (MQ=60)
AACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCC < SRR4302535.3339370/94‑1 (MQ=60)
ACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCG > SRR4302535.3237147/1‑94 (MQ=60)
CTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGG > SRR4302535.2406742/1‑94 (MQ=60)
CTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACAGGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGG > SRR4302535.921035/1‑94 (MQ=60)
TAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGT > SRR4302535.357823/1‑94 (MQ=60)
AACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTT > SRR4302535.3136525/1‑94 (MQ=60)
AACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTT < SRR4302535.1492730/94‑1 (MQ=60)
ACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTT < SRR4302535.451460/94‑1 (MQ=60)
ACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTT < SRR4302535.2231232/94‑1 (MQ=60)
CTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTA > SRR4302535.2217448/1‑94 (MQ=60)
CTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTA > SRR4302535.1360010/1‑94 (MQ=60)
ATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACG < SRR4302535.2934860/94‑1 (MQ=60)
ATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACG > SRR4302535.2216679/1‑94 (MQ=60)
ATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACG > SRR4302535.3710582/1‑94 (MQ=60)
ATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACG < SRR4302535.2934859/94‑1 (MQ=60)
ATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGCGGCGCAATTATGCCGGTTTACG > SRR4302535.1841903/1‑94 (MQ=60)
TGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGA > SRR4302535.4610979/1‑94 (MQ=60)
TGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGA > SRR4302535.4330307/1‑94 (MQ=60)
GAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAT > SRR4302535.3599773/1‑94 (MQ=60)
GAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAT > SRR4302535.546266/1‑94 (MQ=60)
GAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAT < SRR4302535.2733534/94‑1 (MQ=60)
GAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAT < SRR4302535.3842194/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGC < SRR4302535.1980667/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGGGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGC > SRR4302535.3224483/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCA < SRR4302535.1149400/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAT < SRR4302535.549686/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAT < SRR4302535.664140/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAT < SRR4302535.1732906/94‑1 (MQ=60)
GCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATT < SRR4302535.4149526/94‑1 (MQ=60)
GCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATT < SRR4302535.4149527/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTG < SRR4302535.4019459/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTG < SRR4302535.1398102/94‑1 (MQ=60)
GCACAGTGGGTGGTACATTCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGT > SRR4302535.3678531/1‑94 (MQ=60)
GCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGT < SRR4302535.2796995/94‑1 (MQ=60)
CACAGTGGGTGGTACCTGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTA < SRR4302535.2406611/94‑1 (MQ=60)
CACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTA > SRR4302535.1783485/1‑94 (MQ=60)
CACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTA > SRR4302535.3892761/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATG < SRR4302535.1133250/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGTAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAC < SRR4302535.4158905/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAC < SRR4302535.1412442/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACG < SRR4302535.2270157/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGG > SRR4302535.3236339/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGC > SRR4302535.878501/1‑94 (MQ=60)
GTGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCG > SRR4302535.688719/1‑94 (MQ=60)
TGGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGG < SRR4302535.3224624/94‑1 (MQ=60)
GGTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGC < SRR4302535.2563181/94‑1 (MQ=60)
GTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCG > SRR4302535.4480648/1‑94 (MQ=60)
GTACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCG < SRR4302535.554820/94‑1 (MQ=60)
ACATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTG > SRR4302535.1034590/1‑94 (MQ=60)
CATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGG < SRR4302535.1457467/94‑1 (MQ=60)
CATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGG > SRR4302535.1621691/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGA > SRR4302535.1852514/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGA < SRR4302535.4212134/94‑1 (MQ=60)
TGCGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAG < SRR4302535.4454524/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCA > SRR4302535.371845/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCA > SRR4302535.1064804/1‑94 (MQ=60)
TTGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACT < SRR4302535.3043029/94‑1 (MQ=60)
TGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTT < SRR4302535.2778614/94‑1 (MQ=60)
TGCGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTT < SRR4302535.3421270/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGC > SRR4302535.3783018/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCT > SRR4302535.2054916/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCT < SRR4302535.252930/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCACTTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTA > SRR4302535.3328008/1‑94 (MQ=60)
GCGCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTAT < SRR4302535.2071277/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGC < SRR4302535.2026024/94‑1 (MQ=60)
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CAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGC > NC_000913/3948128‑3948314
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
