Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,951,170 |
Δ1 bp |
coding (39/1818 nt) |
ilvD → |
dihydroxyacid dehydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,951,168 | 0 | C | . | 99.1%
| 508.6
/ ‑3.3
| 114 | coding (37/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (12/101); total (12/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGTGG‑GC‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC > NC_000913/3951080‑3951252
|
gacactgggagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcGc‑c < 2:168094‑M2/3‑1 (MQ=255)
cactgggagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcgc‑cac < 2:2359060‑M2/5‑3 (MQ=255)
ctgggagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgcggcgtggggcgc‑cgccg > 1:4101370‑M2/87‑89 (MQ=255)
ggagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGaa < 1:2016868‑M2/10‑1 (MQ=255)
ggagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgttgggtgtggcgcGC‑C‑‑CCCCGGa > 2:818375‑M2/84‑93 (MQ=255)
gagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgggccgtggggcG‑‑G‑‑CACCGGAAt > 1:577319‑M2/83‑93 (MQ=255)
gagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAAt < 2:2733213‑M2/11‑1 (MQ=255)
gagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAAt < 1:1710014‑M2/11‑1 (MQ=255)
gagtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAAt < 1:270892‑M2/11‑1 (MQ=255)
gtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgttatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGa < 1:2514428‑M2/13‑1 (MQ=255)
gtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGa < 1:1461103‑M2/13‑1 (MQ=255)
gtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGa < 2:2532184‑M2/13‑1 (MQ=255)
gtaaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgcgctgtggggcGC‑C‑‑acccgggcga > 2:3198068‑M2/81‑89 (MQ=255)
aaataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGAcc < 1:2580357‑M2/15‑1 (MQ=255)
ataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGa < 1:3774570‑M2/17‑1 (MQ=255)
ataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGa < 2:4441387‑M2/17‑1 (MQ=255)
ataaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGa < 2:2552032‑M2/17‑1 (MQ=255)
taaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGAc < 2:150120‑M2/18‑1 (MQ=255)
taaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcggggggtcgtgggctgtggggcGG‑C‑‑CCCCGAACGGACCGa > 2:521145‑M2/76‑93 (MQ=255)
aaagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACg < 1:426568‑M2/19‑1 (MQ=255)
aagtatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGc < 1:2597083‑M2/20‑1 (MQ=255)
tatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGa < 2:1844005‑M2/23‑1 (MQ=255)
tatgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgcgctgtgggggGC‑C‑‑CCCCGCAA‑GAACGACGCCGa > 1:4650084‑M2/71‑93 (MQ=255)
atgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 1:850979‑M2/24‑1 (MQ=255)
atgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 1:2956675‑M2/24‑1 (MQ=255)
tgcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:3456526‑M2/25‑1 (MQ=255)
gcctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAttt < 1:4442782‑M2/26‑1 (MQ=255)
cctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:2078426‑M2/27‑1 (MQ=255)
cctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 2:3832188‑M2/27‑1 (MQ=255)
cctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 2:2311479‑M2/27‑1 (MQ=255)
cctaagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:568542‑M2/27‑1 (MQ=255)
taagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgggctgtggggcGC‑C‑‑CCCCGGAA‑GACCGGCGCcgcttttcg > 2:3879453‑M2/65‑90 (MQ=255)
aagtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGt < 1:653542‑M2/30‑1 (MQ=255)
agtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:2376422‑M2/31‑1 (MQ=255)
aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGCCCTGCGC‑‑TGTGG‑GG‑CGGCACCCGGATGACCGACGGCGACTTCggga > 2:3732635/1‑91 (MQ=255)
gtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 1:1285815‑M2/32‑1 (MQ=255)
gtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 1:3603841‑M2/32‑1 (MQ=255)
gtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:3576927‑M2/32‑1 (MQ=255)
gtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:2820909‑M2/32‑1 (MQ=255)
gtaccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgcgctgtggggcGC‑C‑‑C‑CCGGAATGACCCACCCCCATTTTggtta > 1:1810284‑M2/62‑91 (MQ=255)
gtaccattccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:713075‑M2/32‑1 (MQ=255)
taccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:24522‑M2/33‑1 (MQ=255)
taccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:2253934‑M2/33‑1 (MQ=255)
tccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 2:4324567‑M2/34‑1 (MQ=255)
accgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:4454120‑M2/34‑1 (MQ=255)
accgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:914741‑M2/34‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGC‑‑CGTGGCGCGC‑‑CCCCCGGATGACCCACGCCGGTTTCGGTGAgg > 2:4016092/1‑92 (MQ=255)
ccgttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGcc < 1:3007236‑M2/35‑1 (MQ=255)
cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCGG‑‑TGTGGCGCGC‑‑CCCCCGGATGAACCACCCCGCTTTCGGTAAACCg > 2:1766926/1‑93 (MQ=255)
gttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:1617350‑M2/37‑1 (MQ=255)
gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGCGCGC‑‑CACCGGAAAGAAACACGCCGATTTTGGTAAACCGa > 1:3429529/1‑93 (MQ=255)
ttccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 1:3361877‑M2/38‑1 (MQ=255)
ccgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTa < 2:4225999‑M2/40‑1 (MQ=255)
cgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:4628964‑M2/41‑1 (MQ=255)
cgccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 1:3822688‑M2/41‑1 (MQ=255)
gccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 1:2298397‑M2/42‑1 (MQ=255)
gccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:675469‑M2/42‑1 (MQ=255)
cccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:4027101‑M2/42‑1 (MQ=255)
ccaccaccactcatggtcgtaatatggcgggggctcgtgcgccgtggggcGC‑C‑‑C‑CCGGGATGACCGACCCCCATTTCGGGAAGCCGAATAtcc > 2:685114‑M2/51‑92 (MQ=255)
caccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 2:4047806‑M2/44‑1 (MQ=255)
caccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 2:2770848‑M2/44‑1 (MQ=255)
ccaccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCgg < 2:2466285‑M2/46‑1 (MQ=255)
caccactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:342621‑M2/47‑1 (MQ=255)
accactcatggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGtt < 2:575273‑M2/48‑1 (MQ=255)
cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGTTCCTGCGCCTTGGGG‑GG‑C‑‑CCCCCGGATGACCCACCCCGCTTTTGGTTAGCCGGTTATCGCCGGtgtgt > 2:121679/1‑92 (MQ=255)
tcatggtcgtaatatggcgggttctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 2:1564162‑M2/53‑1 (MQ=255)
catggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAc < 1:913430‑M2/54‑1 (MQ=255)
tggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:813042‑M2/56‑1 (MQ=255)
tGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑CGTGGCGCGC‑‑CACCCGGATGACCGACCCCGATTTTGGTAAGGCGATTATTGCGGTTGTGGACtt > 2:4557033/1‑92 (MQ=255)
ggtcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 2:1971165‑M2/57‑1 (MQ=255)
tcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 1:605988‑M2/59‑1 (MQ=255)
tcgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:4362260‑M2/59‑1 (MQ=255)
cgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 2:1230502‑M2/60‑1 (MQ=255)
cgtaatatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:4295431‑M2/60‑1 (MQ=255)
gtaatatggcgggtgcgcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCa < 1:1247479‑M2/61‑1 (MQ=255)
taatatggccggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACTGGAATGACCGACGCTGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGttctc < 2:4386900‑M2/62‑3 (MQ=255)
tatggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCa > 1:3727332‑M2/29‑93 (MQ=255)
atggcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 2:302894‑M2/66‑1 (MQ=255)
ggcgggtgctcgtgcgctggggcgcG‑‑C‑‑CACCGGGATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAACTCGTTCACccaact > 2:2205896‑M2/26‑91 (MQ=255)
gcgggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt > 2:424934‑M2/25‑93 (MQ=255)
ggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa < 1:1527600‑M2/72‑1 (MQ=255)
ggtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa > 1:3944938‑M2/22‑93 (MQ=255)
gtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:2098270‑M2/73‑1 (MQ=255)
gtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:1293473‑M2/73‑1 (MQ=255)
gtgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:2943917‑M2/73‑1 (MQ=255)
tgctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:1804770‑M2/74‑1 (MQ=255)
gctcgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg > 2:400363‑M2/19‑93 (MQ=255)
cgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 1:2555395‑M2/78‑1 (MQ=255)
cgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 2:1053976‑M2/78‑1 (MQ=255)
cgtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 1:4403856‑M2/78‑1 (MQ=255)
gtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 2:738465‑M2/79‑1 (MQ=255)
gtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc > 1:468030‑M2/15‑93 (MQ=255)
gtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 2:10696‑M2/79‑1 (MQ=255)
gtgcgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc > 2:139076‑M2/15‑93 (MQ=255)
cgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGCTTATCGCGGTTGTGATCTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACg < 2:346280‑M2/82‑1 (MQ=255)
cgctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACg < 2:3186717‑M2/82‑1 (MQ=255)
gctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGt > 1:3303307‑M2/11‑93 (MQ=255)
ctgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCTTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTc < 1:1656004‑M2/84‑1 (MQ=255)
tgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGCACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTcc > 1:1091047‑M2/9‑93 (MQ=255)
tgtggcgcG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTcc < 2:368193‑M2/85‑1 (MQ=255)
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GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGTGG‑GC‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC > NC_000913/3951080‑3951252
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
