Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,989,898 |
A→G |
Q378R (CAG→CGG) |
cyaA → |
adenylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,989,898 | 0 | A | G | 99.6%
| 734.9
/ ‑5.2
| 235 | Q378R (CAG→CGG) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (108/126); total (109/126) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.66e-01 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989808‑3989987
|
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTTGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAgg > 2:665924/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg > 1:1018204/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg > 1:2746504/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg > 2:2485449/1‑93 (MQ=255)
cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCgggg > 2:2965723/1‑92 (MQ=255)
cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGt < 2:288193/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGt < 2:3336862/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGt < 2:1627126/93‑1 (MQ=255)
gcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTg > 2:2817663/1‑93 (MQ=255)
gcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTg > 1:1666789/1‑93 (MQ=255)
cAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGc < 2:53777/93‑1 (MQ=255)
cAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGc < 2:326536/93‑1 (MQ=255)
aGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCg > 2:4012156/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATGACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGGGCgg > 2:1212349/1‑92 (MQ=255)
gtgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCgg > 1:4347107/1‑92 (MQ=255)
tgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTg < 1:4048471/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 1:3458950/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAg < 1:2243800/93‑1 (MQ=255)
gAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGgc < 1:1777896/93‑1 (MQ=255)
gAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGgc < 2:3553699/93‑1 (MQ=255)
cAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcac < 2:3880863/93‑1 (MQ=255)
aGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcaca > 2:2151071/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTGAGCGAGTGGGTTTGGGACGACGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAATTGTAAGAGTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACaa < 2:1396897/93‑1 (MQ=255)
ttAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAc > 2:2544103/1‑93 (MQ=255)
aGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGa < 2:1091535/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCCCAACGAGt < 2:4549753/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGt < 2:2106734/93‑1 (MQ=255)
aGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCCCAACGAGTTg > 2:2943753/1‑93 (MQ=255)
aGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTg > 2:603649/1‑93 (MQ=255)
cGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCt < 2:1562906/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCg > 2:2674818/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCg < 1:451353/93‑1 (MQ=255)
gTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGa < 2:2602088/93‑1 (MQ=255)
ggggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg < 2:3646333/93‑1 (MQ=255)
ggggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg > 2:2079409/1‑93 (MQ=255)
gggTTTGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgc < 1:2480794/93‑1 (MQ=255)
gggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgc < 1:3845087/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgcg > 1:167032/1‑93 (MQ=255)
ggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgcg < 1:3269550/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 2:3996665/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga > 1:4489279/1‑93 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 2:3396321/93‑1 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat > 2:85703/1‑93 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat < 1:1199094/93‑1 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat > 1:2505788/1‑93 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat > 1:649087/1‑93 (MQ=255)
ggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatgat < 2:1033156/93‑1 (MQ=255)
ggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatgat < 1:3025224/93‑1 (MQ=255)
ggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatgat < 1:3524732/93‑1 (MQ=255)
gACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGatgatg < 2:4224035/93‑1 (MQ=255)
gACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGatgatg > 1:3302955/1‑93 (MQ=255)
gACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGatgatg > 2:1714789/1‑93 (MQ=255)
gAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCag < 2:1506445/93‑1 (MQ=255)
aGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag > 2:4315358/1‑93 (MQ=255)
aGCTCGTCTGGCAATGCGCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCAATGATGCagag < 1:808177/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc > 1:3414771/1‑93 (MQ=255)
cTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCt < 2:3898274/93‑1 (MQ=255)
cTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCt > 1:362060/1‑93 (MQ=255)
cGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAc > 1:2141179/1‑93 (MQ=255)
tGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTa > 2:4150464/1‑93 (MQ=255)
cAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATc < 2:1174652/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCt < 1:3709334/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCt < 1:3132800/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATATGa > 1:194741/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc > 1:3543250/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc > 1:1962652/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc < 2:706818/93‑1 (MQ=255)
cGATAACCTCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCg > 2:4577767/1‑93 (MQ=255)
cGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCg > 1:853736/1‑93 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt > 1:4434472/1‑93 (MQ=255)
aaCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCttt < 2:911936/93‑1 (MQ=255)
aCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTg < 1:143052/93‑1 (MQ=255)
cgcgCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGGAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcg > 2:737213/1‑93 (MQ=255)
ccgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcgc < 1:2693639/92‑1 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 1:2959316/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt < 2:4441268/93‑1 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 2:5016/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 2:3794102/1‑93 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc > 2:1889213/1‑93 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc < 1:3115465/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCaa < 1:319037/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAt < 1:2104878/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAt > 1:569145/1‑93 (MQ=255)
ggAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATa < 2:4684187/93‑1 (MQ=255)
gAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa > 2:3762958/1‑93 (MQ=255)
gAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa > 2:817212/1‑93 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc > 1:4260360/1‑93 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc > 2:1600953/1‑93 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt < 2:2434890/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt < 1:149580/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt < 1:1380404/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt < 1:1282289/93‑1 (MQ=255)
tGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAg < 1:2357472/93‑1 (MQ=255)
tGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAg < 2:988424/93‑1 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc < 2:309493/93‑1 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc < 1:3833080/93‑1 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc > 2:1960492/1‑93 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc > 2:1289271/1‑93 (MQ=255)
gATCGGGTGCGGGAGGCGCACAAAGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc < 1:1878530/93‑1 (MQ=255)
aTCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCg > 2:3134255/1‑93 (MQ=255)
|
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989808‑3989987
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCT > NC_000913/3989805‑3989990
|
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG > SRR4302535.1135793/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG < SRR4302535.2212312/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG < SRR4302535.1479039/94‑1 (MQ=60)
CGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGG < SRR4302535.2425383/94‑1 (MQ=60)
CGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGG > SRR4302535.2766080/1‑94 (MQ=60)
CGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGG > SRR4302535.1025440/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302535.2083449/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302535.1678848/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302535.3521527/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302535.4532807/1‑94 (MQ=60)
CAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCG < SRR4302535.1405870/94‑1 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT > SRR4302535.1938129/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT > SRR4302535.2256352/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT > SRR4302535.4312609/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGG > SRR4302535.4376849/1‑94 (MQ=60)
TGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGA < SRR4302535.4076182/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302535.3482998/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302535.4057396/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302535.2259756/94‑1 (MQ=60)
GAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCG > SRR4302535.1230308/1‑94 (MQ=60)
GAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCG < SRR4302535.1790772/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCAC > SRR4302535.1860541/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCAC > SRR4302535.386575/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA > SRR4302535.486301/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAAC > SRR4302535.1453075/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG < SRR4302535.337038/94‑1 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG < SRR4302535.3316034/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT < SRR4302535.2160581/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT < SRR4302535.1426561/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGC > SRR4302535.3195989/1‑94 (MQ=60)
GAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCG < SRR4302535.3091163/94‑1 (MQ=60)
GAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCG > SRR4302535.1669432/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTTACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGA < SRR4302535.3062543/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGA < SRR4302535.454513/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACG < SRR4302535.3819937/94‑1 (MQ=60)
TGAGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACG < SRR4302535.3468164/94‑1 (MQ=60)
GGGTTTGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCG < SRR4302535.2498682/94‑1 (MQ=60)
GGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCG > SRR4302535.168193/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCG < SRR4302535.3871564/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGA < SRR4302535.3292262/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGA > SRR4302535.4520096/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT > SRR4302535.4515429/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT > SRR4302535.653612/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT > SRR4302535.2523852/1‑94 (MQ=60)
TTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATG < SRR4302535.1207685/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302535.3659571/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302535.2995337/94‑1 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG < SRR4302535.3549210/94‑1 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG > SRR4302535.3325923/1‑94 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG < SRR4302535.3046401/94‑1 (MQ=60)
GACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGC < SRR4302535.315241/94‑1 (MQ=60)
GACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGC > SRR4302535.938178/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG < SRR4302535.839701/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG > SRR4302535.2078408/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG < SRR4302535.4149635/94‑1 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302535.1760161/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302535.4402557/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302535.1182161/1‑94 (MQ=60)
AGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGC > SRR4302535.3438526/1‑94 (MQ=60)
AGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGC < SRR4302535.2495799/94‑1 (MQ=60)
AGCTCGTCTGGCAATGCGCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCAATGATGCAGAGC < SRR4302535.813837/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCT > SRR4302535.364559/1‑94 (MQ=60)
TCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAC > SRR4302535.2156590/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACC > SRR4302535.1779447/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACC < SRR4302535.3255285/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG > SRR4302535.1680762/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG > SRR4302535.472084/1‑94 (MQ=60)
GGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAAT < SRR4302535.2972542/94‑1 (MQ=60)
GAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302535.1337902/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATACCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302535.63045/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT > SRR4302535.213658/1‑94 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302535.3735819/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT > SRR4302535.2320804/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG < SRR4302535.3735024/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG > SRR4302535.357793/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG < SRR4302535.3154616/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCCGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302535.1542658/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATATGA > SRR4302535.196081/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT > SRR4302535.3428433/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT < SRR4302535.2507015/94‑1 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC > SRR4302535.193611/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC < SRR4302535.4334539/94‑1 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC > SRR4302535.1976803/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC > SRR4302535.3567864/1‑94 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG > SRR4302535.859749/1‑94 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC > SRR4302535.3237925/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT > SRR4302535.4464861/1‑94 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTT > SRR4302535.3907688/1‑94 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATATGATCCGCTT > SRR4302535.1556188/1‑94 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC > SRR4302535.3629182/1‑94 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC < SRR4302535.144049/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTTGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGC > SRR4302535.2703641/1‑94 (MQ=60)
CCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCG < SRR4302535.2712888/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGT > SRR4302535.2980097/1‑94 (MQ=60)
GCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTC > SRR4302535.760376/1‑94 (MQ=60)
GCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTC < SRR4302535.1975494/94‑1 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCG < SRR4302535.3137155/94‑1 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCATCG > SRR4302535.782507/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT > SRR4302535.573141/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT < SRR4302535.321245/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT < SRR4302535.3155917/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATA > SRR4302535.927177/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATA < SRR4302535.2120059/94‑1 (MQ=60)
GAAGATTGAGCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAC < SRR4302535.2714778/94‑1 (MQ=60)
AAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACC > SRR4302535.4289540/1‑94 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT < SRR4302535.2855087/94‑1 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT > SRR4302535.798993/1‑94 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT < SRR4302535.1219985/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302535.4474742/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302535.150623/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302535.1291437/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302535.1390249/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCTCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302535.3547569/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302535.3556877/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG < SRR4302535.2650098/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGACGCACAACGAGTTTCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG < SRR4302535.2437358/94‑1 (MQ=60)
TGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGC < SRR4302535.2374380/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG < SRR4302535.3859513/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGGGAGGCGCACAAAGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG < SRR4302535.1892067/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT > SRR4302535.3797840/1‑94 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT > SRR4302535.1592379/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCT < SRR4302535.2474122/94‑1 (MQ=60)
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GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCT > NC_000913/3989805‑3989990
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
