Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 1873 | 183.1 | 9376148 | 98.2% | 9207377 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,500 | T→C | H58R (CAC→CGC) V13A (GTG→GCG) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,500 | 0 | T | C | 98.7% | 738.4 / ‑1.4 | 238 | H58R (CAC→CGC) V13A (GTG→GCG) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (107/128); total (109/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG > NC_000913/3991411‑3991589 | gAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAg > 1:3767478/1‑93 (MQ=255) gAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGCTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAg > 2:314257/1‑93 (MQ=255) aGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCg > 2:3843253/1‑93 (MQ=255) ttCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTc > 2:2473500/1‑93 (MQ=255) ttCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTc > 2:2119241/1‑93 (MQ=255) cgccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCt < 2:1727556/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCt < 2:1359903/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCt < 2:1089258/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTg < 1:2356931/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTg < 1:707018/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTg < 1:3113819/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTg < 1:1395677/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTg < 1:1237322/93‑1 (MQ=255) cgcTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGc < 2:4597901/93‑1 (MQ=255) cTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCgg < 1:4598431/93‑1 (MQ=255) tGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGt > 1:1674831/1‑93 (MQ=255) aTCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAt < 1:292290/93‑1 (MQ=255) aTCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAt > 2:3210034/1‑93 (MQ=255) tCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATa > 2:4558065/1‑93 (MQ=255) cacaAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATaa < 2:1202669/93‑1 (MQ=255) acaAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAAt > 2:2030626/1‑93 (MQ=255) acaAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAAt < 2:3793684/93‑1 (MQ=255) caAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATg < 1:4231736/93‑1 (MQ=255) caaTCCGCTCATCGCTTCTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGa < 2:1806732/92‑1 (MQ=255) aaaTCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGa < 2:1857415/93‑1 (MQ=255) aaaTCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGa > 2:3658429/1‑93 (MQ=255) aaTCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGAGGCTCCTGGCGGTTGATAATGAt > 2:3355161/1‑93 (MQ=255) tCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGAttt < 2:3171337/93‑1 (MQ=255) ccACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGAtttt < 1:3685317/93‑1 (MQ=255) cACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTtg > 1:1005909/1‑93 (MQ=255) cACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTtg > 1:4095828/1‑93 (MQ=255) ccccATCCCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTTTTTGGTTGCCAGCCATTCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATTATGATTTtgc < 2:4123627/90‑1 (MQ=255) aCTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTtgc < 1:3628407/93‑1 (MQ=255) aCTCACCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTtgc < 2:1677473/93‑1 (MQ=255) cTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTtgct > 2:1474177/1‑93 (MQ=255) aTCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGcc < 1:2462491/93‑1 (MQ=255) tCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCa > 2:2653085/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCac < 2:4071127/93‑2 (MQ=255) cGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCac < 1:2220113/93‑2 (MQ=255) gCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCAtt > 2:4493852/1‑93 (MQ=255) gCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCact > 1:2138853/1‑91 (MQ=255) ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc > 1:3727945/1‑93 (MQ=255) ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 2:2059560/93‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 1:2748784/93‑1 (MQ=255) cTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCActct > 1:1330681/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCActct > 1:3176060/1‑93 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa > 1:3847940/1‑93 (MQ=255) cAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaaa < 1:3438296/93‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 2:4292272/1‑93 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 2:4376462/1‑93 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 1:4377172/1‑93 (MQ=255) ggTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAgg < 2:3467431/93‑1 (MQ=255) gTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt < 1:3751732/93‑1 (MQ=255) gTCAAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt < 1:4653401/93‑1 (MQ=255) cAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTaa < 2:457389/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCTTGTTTGTTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:3000796/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGTGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt > 2:158344/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCATGGCGGTTGATACTGATTATGATGCCACTCTCAAAGGTAAt > 2:743133/1‑93 (MQ=255) agggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:684387/91‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:3376733/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCCCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:2590920/93‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg < 1:1165322/93‑1 (MQ=255) tacccgccCTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGCCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGt < 2:4043439/90‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGt < 2:483734/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa > 1:4649335/1‑93 (MQ=255) gccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc < 1:1752662/93‑1 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 2:4239391/1‑93 (MQ=255) ttttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 2:2257853/92‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 1:1988551/93‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAAGCCGCCGt > 1:4548478/1‑93 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt < 1:574494/93‑1 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 1:892682/1‑93 (MQ=255) ttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTg > 2:3606904/1‑93 (MQ=255) ggTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAt < 1:3275844/93‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:3703567/93‑1 (MQ=255) gTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTACTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:2512951/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 1:1024537/93‑1 (MQ=255) gtGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:2869594/92‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 1:333139/93‑1 (MQ=255) gccagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCg > 1:227465/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGTCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 2:4651105/93‑1 (MQ=255) cagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 1:4173255/93‑1 (MQ=255) cagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 1:109415/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 2:719670/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg > 2:257001/1‑93 (MQ=255) gccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGt < 2:3482310/93‑1 (MQ=255) ccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTc < 1:1583451/93‑1 (MQ=255) caTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCg > 1:854493/1‑93 (MQ=255) caTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCg > 1:1762142/1‑93 (MQ=255) aTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGa > 1:404755/1‑93 (MQ=255) aTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGa < 2:2305155/93‑1 (MQ=255) tACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:2169150/1‑93 (MQ=255) tACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:680957/1‑93 (MQ=255) aCCGGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGata < 2:4175588/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 1:4493043/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat > 1:741269/1‑93 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGCCGATTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 1:3580480/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:2494039/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 1:1855586/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 2:1349481/93‑1 (MQ=255) | AGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG > NC_000913/3991411‑3991589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > NC_000913/3991407‑3991593 | TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCGAGCCATACCTGGC > SRR4302535.1770534/1‑94 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC < SRR4302535.3523540/94‑1 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC > SRR4302535.1051663/1‑94 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC < SRR4302535.3811769/94‑1 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC < SRR4302535.3039573/94‑1 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC < SRR4302535.4647316/94‑1 (MQ=60)TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGC < SRR4302535.3991743/94‑1 (MQ=60) CAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCA > SRR4302535.1396474/1‑94 (MQ=60) CAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCA > SRR4302535.3992471/1‑94 (MQ=60) AGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAG > SRR4302535.2639150/1‑94 (MQ=60) AGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAG < SRR4302535.1487630/94‑1 (MQ=60) AGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAG > SRR4302535.3793490/1‑94 (MQ=60) AAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCG < SRR4302535.2341504/94‑1 (MQ=60) AGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGG < SRR4302535.762630/94‑1 (MQ=60) GGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGC < SRR4302535.3751969/94‑1 (MQ=60) TTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTC < SRR4302535.1015758/94‑1 (MQ=60) TCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCT < SRR4302535.3740208/94‑1 (MQ=60) CGCCGCGGCGATCACAAACCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTG < SRR4302535.2444191/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.2373835/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.711982/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.1246158/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.864693/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.3135494/94‑1 (MQ=60) GCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGG < SRR4302535.1405646/94‑1 (MQ=60) GCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGC < SRR4302535.165357/94‑1 (MQ=60) CCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGC < SRR4302535.3260506/94‑1 (MQ=60) CCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGC < SRR4302535.165979/94‑1 (MQ=60) CGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCG < SRR4302535.3018377/94‑1 (MQ=60) CTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGT < SRR4302535.4629713/94‑1 (MQ=60) CTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGT < SRR4302535.1927235/94‑1 (MQ=60) CTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGT > SRR4302535.1686957/1‑94 (MQ=60) TGCGATCACAAATCCCCTCATCGCCTTTCAGGTCAAAAGGGTAGCCGCCCAGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTT < SRR4302535.3317767/94‑1 (MQ=60) GATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAT < SRR4302535.3411853/94‑1 (MQ=60) ATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATA < SRR4302535.294334/94‑1 (MQ=60) ATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATA > SRR4302535.1385390/1‑94 (MQ=60) TCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAA < SRR4302535.3696883/94‑1 (MQ=60) CACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAAT > SRR4302535.69610/1‑94 (MQ=60) ACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATG > SRR4302535.3142565/1‑94 (MQ=60) CAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA < SRR4302535.4260697/94‑1 (MQ=60) AAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCTGCTCCTGGCGGTTGATAATGAT > SRR4302535.3986529/1‑94 (MQ=60) AAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGAT < SRR4302535.1250017/94‑1 (MQ=60) AAACCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGAT < SRR4302535.4652878/94‑1 (MQ=60) AATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATT > SRR4302535.3700535/1‑94 (MQ=60) ATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTT < SRR4302535.4079599/94‑1 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG < SRR4302535.856027/94‑1 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG < SRR4302535.3710814/94‑1 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG > SRR4302535.2622896/1‑94 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG > SRR4302535.4123862/1‑94 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG < SRR4302535.382374/94‑1 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG < SRR4302535.71044/94‑1 (MQ=60) CCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG > SRR4302535.1013056/1‑94 (MQ=60) CACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGCTAGCCGCCGTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGC < SRR4302535.4138569/94‑1 (MQ=60) CCTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCT < SRR4302535.3491938/94‑1 (MQ=60) ACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCT < SRR4302535.3653554/94‑1 (MQ=60) ACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCT > SRR4302535.4216277/1‑94 (MQ=60) TCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGC < SRR4302535.2196246/94‑1 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC > SRR4302535.3793127/1‑94 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC > SRR4302535.3793126/1‑94 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC > SRR4302535.1229498/1‑94 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC > SRR4302535.1990863/1‑94 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC > SRR4302535.3760055/1‑94 (MQ=60) CATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCC < SRR4302535.1741941/94‑1 (MQ=60) ATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCA < SRR4302535.2480244/94‑1 (MQ=60) ATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCA > SRR4302535.4268853/1‑94 (MQ=60) TCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCAC < SRR4302535.3216847/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.715074/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.2842650/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT < SRR4302535.2235911/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.2154255/1‑94 (MQ=60) GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTC > SRR4302535.3753767/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302535.1050380/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302535.2768379/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT > SRR4302535.1340172/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT > SRR4302535.3198036/1‑94 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC < SRR4302535.1150658/94‑1 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC > SRR4302535.1005336/1‑94 (MQ=60) TTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCA > SRR4302535.1795482/1‑94 (MQ=60) TTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAA > SRR4302535.3874425/1‑94 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG > SRR4302535.4407120/1‑94 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG < SRR4302535.3462209/94‑1 (MQ=60) AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAGAGG > SRR4302535.681128/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302535.536253/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.3777698/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.928186/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302535.3395508/1‑94 (MQ=60) GTCAAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.4684906/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGTCGCCACTCTCAAAGGTAAT > SRR4302535.4135146/1‑94 (MQ=60) ATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.3400213/94‑1 (MQ=60) ATGGTAGCCCCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.2609522/94‑1 (MQ=60) ATGGTACCCGCCCTGTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.2609521/94‑1 (MQ=60) AGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.689178/94‑1 (MQ=60) GGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCA < SRR4302535.2506207/94‑1 (MQ=60) GTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGT < SRR4302535.1173646/94‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA < SRR4302535.2134789/94‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA > SRR4302535.4680824/1‑94 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA > SRR4302535.4676267/1‑94 (MQ=60) CGCCGCCCTTTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302535.3651191/94‑1 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302535.4489155/94‑1 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302535.1765328/94‑1 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG < SRR4302535.457542/94‑1 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.4626952/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.2509520/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.1766372/1‑94 (MQ=60) TGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAGAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGT > SRR4302535.3063955/1‑94 (MQ=60) TGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAAGCCGCCGT > SRR4302535.4579577/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT > SRR4302535.1772903/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT > SRR4302535.899007/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT < SRR4302535.2002870/94‑1 (MQ=60) GTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT < SRR4302535.2233896/94‑1 (MQ=60) TTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTG < SRR4302535.578525/94‑1 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT > SRR4302535.1197582/1‑94 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT > SRR4302535.3522073/1‑94 (MQ=60) GGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATT < SRR4302535.3298598/94‑1 (MQ=60) GTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.4694767/94‑1 (MQ=60) GTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.3729214/94‑1 (MQ=60) GTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTACTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.2531069/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302535.3718046/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302535.1031816/94‑1 (MQ=60) TGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCG < SRR4302535.335446/94‑1 (MQ=60) TGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCG > SRR4302535.229030/1‑94 (MQ=60) CCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302535.4683875/1‑94 (MQ=60) CAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302535.110190/94‑1 (MQ=60) CAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302535.4201819/94‑1 (MQ=60) AGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGT < SRR4302535.1052537/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302535.1594879/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG > SRR4302535.860515/1‑94 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG > SRR4302535.1774906/1‑94 (MQ=60) CATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGA > SRR4302535.407589/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302535.2258189/1‑94 (MQ=60) TACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATA > SRR4302535.3362006/1‑94 (MQ=60) ACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT > SRR4302535.746476/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGCCGCGGCTCCTGGCGTTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.2766275/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.429630/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.4523883/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.4532025/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGCCGATTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.3605295/94‑1 (MQ=60) CTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG < SRR4302535.1868954/94‑1 (MQ=60) TGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGC < SRR4302535.2333369/94‑1 (MQ=60) GGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302535.4686746/94‑1 (MQ=60) GGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302535.4431387/94‑1 (MQ=60) CGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > SRR4302535.2599970/1‑94 (MQ=60) CGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > SRR4302535.60623/1‑94 (MQ=60) | TCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > NC_000913/3991407‑3991593 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |