Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I1 R1 | 1696 | 279.3 | 15874187 | 97.8% | 15524954 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 99.7% | 1183.2 / NA | 368 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (175/192); total (175/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > NC_000913/3991449‑3991630 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 2:3780487/93‑1 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCCCtctc > 2:1515399/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:5447959/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:5287817/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:6255969/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:74623/1‑93 (MQ=255) ttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCa > 2:7430417/1‑93 (MQ=255) tCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTa > 1:7635228/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt > 2:1777909/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:6078134/93‑1 (MQ=255) aaaaTGATAGCCGCCCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:1294978/93‑1 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg > 2:2580544/1‑93 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 1:7745358/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 2:6413385/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:4865257/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt > 1:5857123/1‑93 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt > 1:1558259/1‑93 (MQ=255) tGGTAGCCGCCTTGTTTGGTTGCCAGCCATGCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:3035491/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTTCCAGGCATACCTGGTGCAGCTGCTCCTGGCGGTTGATTATGACTTTGCTGCCACTCTCTAAGTCTATGGTc > 2:619244/1‑93 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:3968956/93‑1 (MQ=255) aggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 1:749719/92‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCa > 2:3356212/1‑93 (MQ=255) gtcgccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg < 1:2613574/90‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg > 1:579998/1‑93 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 1:7270995/93‑1 (MQ=255) gccgccCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc < 1:1054560/93‑1 (MQ=255) cgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgc > 2:6678860/1‑93 (MQ=255) cgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgc < 1:5545768/93‑1 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 2:2546312/1‑93 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 1:2665445/1‑93 (MQ=255) cttGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccgc < 2:780180/91‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACgccgcc > 2:6500580/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 1:1967113/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGGCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 2:603147/1‑93 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt > 1:7351614/1‑93 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 2:720555/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGa < 2:836532/93‑1 (MQ=255) tGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGa < 1:24554/93‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt > 2:3878497/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:3982993/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:1389183/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 2:5648286/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 1:5694895/93‑1 (MQ=255) ccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc > 2:269353/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATTATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa > 1:4794465/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 2:4970061/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 1:6962333/93‑1 (MQ=255) ccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTc < 2:412664/93‑1 (MQ=255) caTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGCTTTCGCAGTCg > 1:6666897/1‑93 (MQ=255) aTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGa < 1:62935/93‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 1:2170115/1‑93 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:7007837/1‑93 (MQ=255) aCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGata > 2:437500/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:7579639/1‑93 (MQ=255) tGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCg < 2:2363919/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc < 2:545772/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc > 1:5063248/1‑93 (MQ=255) gCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGt < 1:6399452/93‑1 (MQ=255) aGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCg < 1:3199762/93‑1 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 1:4525289/1‑93 (MQ=255) cGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGcc < 1:444679/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:792096/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 2:3688533/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTAATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:1827530/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt > 1:4643681/1‑93 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt > 1:2313714/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 1:2937285/1‑93 (MQ=255) ccTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATccc < 2:4740954/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 2:6789927/1‑93 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 1:3585586/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg < 1:7115540/93‑1 (MQ=255) cGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtca < 2:5135644/93‑2 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:1969236/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 1:3712675/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:4188052/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:5773753/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:5372913/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg < 1:971082/93‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 1:2521524/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 2:2916088/1‑93 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg < 2:2823850/93‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg < 1:4046735/93‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg > 1:2393523/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 2:4436826/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 2:1625299/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTAAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 1:4131584/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt < 1:6749378/93‑1 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt > 2:3561919/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt > 2:3196609/1‑93 (MQ=255) tGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGtt > 1:4315896/1‑93 (MQ=255) tGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGtt > 1:7830595/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttct < 1:3275131/93‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttct > 1:3440804/1‑93 (MQ=255) ttttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttctt < 2:2171843/93‑1 (MQ=255) ttttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttctt > 1:6177133/1‑93 (MQ=255) ttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCa < 2:6565018/93‑1 (MQ=255) ctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATg < 2:490327/93‑1 (MQ=255) tccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGt < 2:1209844/92‑1 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGGAATGGTCAGCACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCCCTGTCGCCATCCCAGCTATCCGGGCGATCTTCAATGGta > 1:1326343/1‑92 (MQ=255) aTTCTCAAAGGTAATGCTCAGTAAGCATCCGTAGCTGTCGCATTCGATATCGCTGCCGCCACCCCAGTCTTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAg < 2:7677986/93‑1 (MQ=255) | CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > NC_000913/3991449‑3991630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
TCGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991446‑3991632 | TCGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCAC < SRR4302543.5092567/94‑1 (MQ=60)TCGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCAC < SRR4302543.2019428/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACT < SRR4302543.1088442/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACT > SRR4302543.2776463/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACT > SRR4302543.2681757/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACT < SRR4302543.6921464/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACT > SRR4302543.7805999/1‑94 (MQ=60) GCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGCTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTC > SRR4302543.5501618/1‑94 (MQ=60) CCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGGCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT > SRR4302543.3016115/1‑94 (MQ=60) CCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT > SRR4302543.2882077/1‑94 (MQ=60) CCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT < SRR4302543.5373726/94‑1 (MQ=60) CCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT > SRR4302543.6816958/1‑94 (MQ=60) CCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT < SRR4302543.7673314/94‑1 (MQ=60) CTTTCAAGGTCAAAATGTTAGCGGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCT < SRR4302543.5717627/94‑1 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.5335549/1‑94 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.5467132/1‑94 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.5497387/1‑94 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.3647515/1‑94 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.2617486/1‑94 (MQ=60) CTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTC > SRR4302543.5871119/1‑94 (MQ=60) C‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAG > SRR4302543.469672/1‑94 (MQ=60) GGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGT < SRR4302543.6437847/94‑1 (MQ=60) TCAAAATGGTAGCCGCCTTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAA < SRR4302543.2483350/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAAT < SRR4302543.489800/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAAT > SRR4302543.151185/1‑94 (MQ=60) AAAATGTTAGCCCCCCTTTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATG < SRR4302543.4343814/94‑1 (MQ=60) AAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATG < SRR4302543.3566711/94‑1 (MQ=60) AAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATG < SRR4302543.3404503/94‑1 (MQ=60) AAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATG < SRR4302543.7330467/94‑1 (MQ=60) AAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGG < SRR4302543.3829530/94‑1 (MQ=60) AAAGGGTAGCCGCCCTTTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGG < SRR4302543.4458621/94‑1 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT < SRR4302543.7818515/94‑1 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT > SRR4302543.1572184/1‑94 (MQ=60) AATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGT > SRR4302543.5910438/1‑94 (MQ=60) ATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302543.4909608/94‑1 (MQ=60) ATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC > SRR4302543.1884453/1‑94 (MQ=60) TGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCA < SRR4302543.4465806/94‑1 (MQ=60) AGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCA < SRR4302543.756374/94‑1 (MQ=60) gggagcgtCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.3809817/86‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTTTTTGGTTGCCAGCCATACCTTGTGCAGCGGCTCCTGGGGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.3196832/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.6785153/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTTGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATCATTATTTTG‑CTGCCACTCTCCAAGGTAATGGACAG > SRR4302543.585299/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.152123/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.4193516/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.3809818/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCATGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.92379/94‑1 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG > SRR4302543.585298/1‑94 (MQ=60) GGTAGCCGCCCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAG < SRR4302543.4824041/94‑1 (MQ=60) GTCGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGT < SRR4302543.2637281/94‑1 (MQ=60) tatctgccttgtttgttgcCCAGCCATACCTGTGGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA < SRR4302543.7278167/75‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTC > SRR4302543.6715282/1‑94 (MQ=60) GGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.2206117/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.2671082/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.2667576/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.3757069/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.4757692/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.7495762/94‑1 (MQ=60) AGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302543.7341235/94‑1 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAAG > SRR4302543.3060927/1‑94 (MQ=60) GCCGCCCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302543.1064021/94‑1 (MQ=60) CCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGC < SRR4302543.4145326/94‑1 (MQ=60) CGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCC > SRR4302543.7843542/1‑94 (MQ=60) CGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCC > SRR4302543.5010387/1‑94 (MQ=60) CGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCC < SRR4302543.6680481/94‑1 (MQ=60) CGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCC < SRR4302543.5596198/94‑1 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG > SRR4302543.2689612/1‑94 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG > SRR4302543.846381/1‑94 (MQ=60) CCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGC > SRR4302543.5802607/1‑94 (MQ=60) CCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTATCCCGCC > SRR4302543.2063487/1‑94 (MQ=60) CCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCC > SRR4302543.4580831/1‑94 (MQ=60) CCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCC > SRR4302543.6742093/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATTGCCAGTACGCCGCCG > SRR4302543.5649998/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302543.1984746/1‑94 (MQ=60) TGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGT > SRR4302543.7422329/1‑94 (MQ=60) TTTGGTTCCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTG < SRR4302543.6322368/94‑1 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT < SRR4302543.24776/94‑1 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT < SRR4302543.2647996/94‑1 (MQ=60) GGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATT > SRR4302543.7794957/1‑94 (MQ=60) GTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT > SRR4302543.5071016/1‑94 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302543.36991/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCGGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302543.428727/94‑1 (MQ=60) TGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCG < SRR4302543.5746854/94‑1 (MQ=60) CCAGCCATAGCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302543.6823967/1‑94 (MQ=60) CCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATTATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302543.4838287/1‑94 (MQ=60) CAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302543.176315/94‑1 (MQ=60) CAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302543.6221881/94‑1 (MQ=60) CAGCCATACCTGGGGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATAATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302543.4604209/94‑1 (MQ=60) CAGCCACCCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302543.4522408/94‑1 (MQ=60) AGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGT < SRR4302543.780106/94‑1 (MQ=60) AGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGT < SRR4302543.7027845/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302543.2022730/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGTGCACCCGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCTCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302543.2571811/94‑1 (MQ=60) CATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGA > SRR4302543.2925109/1‑94 (MQ=60) CATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGA > SRR4302543.5656836/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT < SRR4302543.63488/94‑1 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302543.2189558/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302543.5844651/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302543.7802516/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302543.524406/1‑94 (MQ=60) gcctgttggcGCGGCTGCTGTCGGTTGATAATTATTTGT‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT < SRR4302543.2406559/84‑1 (MQ=60) TCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT < SRR4302543.5928671/94‑1 (MQ=60) ACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT > SRR4302543.5748150/1‑94 (MQ=60) ACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT < SRR4302543.946547/94‑1 (MQ=60) CCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC > SRR4302543.5151518/1‑94 (MQ=60) CTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG < SRR4302543.3423007/94‑1 (MQ=60) CTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG > SRR4302543.1308590/1‑94 (MQ=60) TGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGC > SRR4302543.6396245/1‑94 (MQ=60) TGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGC > SRR4302543.5109234/1‑94 (MQ=60) GGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTTATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT > SRR4302543.762635/1‑94 (MQ=60) GGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT < SRR4302543.6736161/94‑1 (MQ=60) CGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT < SRR4302543.281457/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302543.2515514/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302543.6459701/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302543.4483828/94‑1 (MQ=60) CAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCG > SRR4302543.6274336/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302543.3548709/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC > SRR4302543.4566462/1‑94 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGC < SRR4302543.3228614/94‑1 (MQ=60) AGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGGCGATCTCGCTGTCGC > SRR4302543.1864913/1‑94 (MQ=60) GCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCC > SRR4302543.3374544/1‑94 (MQ=60) CGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCA < SRR4302543.448843/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGGCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302543.4889655/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302543.799057/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302543.5884458/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302543.2334757/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302543.7365227/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302543.4685931/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302543.3292218/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTAATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302543.1843940/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATC > SRR4302543.5525255/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC < SRR4302543.3278788/94‑1 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302543.6488625/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302543.2429538/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302543.2389764/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302543.2963959/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA > SRR4302543.3617258/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA < SRR4302543.1716756/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGTTTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302543.7106820/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG > SRR4302543.2471870/1‑94 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT < SRR4302543.7568431/94‑1 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT < SRR4302543.7568430/94‑1 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT > SRR4302543.2228446/1‑94 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT < SRR4302543.7184661/94‑1 (MQ=60) TGGCGGGTGATAATTATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT < SRR4302543.7184662/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302543.7393209/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302543.2552702/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT > SRR4302543.7857443/1‑94 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT < SRR4302543.4166375/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT < SRR4302543.7095147/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT < SRR4302543.7402737/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT < SRR4302543.7918298/94‑1 (MQ=60) GGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATC > SRR4302543.3745322/1‑94 (MQ=60) GGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATC > SRR4302543.1213986/1‑94 (MQ=60) GGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATACCAGTCATC > SRR4302543.3718612/1‑94 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC < SRR4302543.1422489/94‑1 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC < SRR4302543.5440049/94‑1 (MQ=60) TTGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA > SRR4302543.4020816/1‑94 (MQ=60) TGATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAG > SRR4302543.2544445/1‑94 (MQ=60) TATAATTATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGG < SRR4302543.2368577/94‑1 (MQ=60) GATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGG > SRR4302543.2415180/1‑94 (MQ=60) ATAGTTATTTTG‑CTGCCCCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC < SRR4302543.7423303/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC < SRR4302543.3173592/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC < SRR4302543.4082949/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC > SRR4302543.7846892/1‑94 (MQ=60) TAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG > SRR4302543.408695/1‑94 (MQ=60) TAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG < SRR4302543.3281962/94‑1 (MQ=60) TAATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTAAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG > SRR4302543.4168847/1‑94 (MQ=60) ATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT < SRR4302543.6813118/94‑1 (MQ=60) ATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302543.7904328/1‑94 (MQ=60) ATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302543.4045333/1‑94 (MQ=60) ATGATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302543.4355099/1‑94 (MQ=60) GATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCT > SRR4302543.3471607/1‑94 (MQ=60) ATTTTG‑CTGCCCCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT < SRR4302543.6252651/94‑1 (MQ=60) ATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT > SRR4302543.2143379/1‑94 (MQ=60) ATTTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT > SRR4302543.6235537/1‑94 (MQ=60) ATTTTG‑CTGCCACTCACAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT < SRR4302543.7066708/94‑1 (MQ=60) TTTGCCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTC < SRR4302543.2053130/94‑1 (MQ=60) TTTG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCA < SRR4302543.4508713/94‑1 (MQ=60) TG‑CTGCCCCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT < SRR4302543.7649991/94‑1 (MQ=60) TG‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT > SRR4302543.5239959/1‑94 (MQ=60) G‑CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATG < SRR4302543.4030327/94‑1 (MQ=60) CTGCCCCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGG < SRR4302543.2238338/94‑1 (MQ=60) CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGT > SRR4302543.6442124/1‑94 (MQ=60) CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGG < SRR4302543.184117/94‑1 (MQ=60) TGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGT > SRR4302543.7929728/1‑94 (MQ=60) GCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTC < SRR4302543.4843412/94‑1 (MQ=60) GCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > SRR4302543.2493174/1‑94 (MQ=60) GCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGCACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCCCTGTCGCCATCCCAGctatccgggcgatcttcaatggta > SRR4302543.1338120/1‑70 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG < SRR4302543.7117206/94‑1 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG < SRR4302543.6141592/94‑1 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > SRR4302543.5593237/1‑94 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > SRR4302543.5293657/1‑94 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG < SRR4302543.4969937/94‑1 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC > SRR4302543.1794927/1‑94 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC < SRR4302543.6834847/94‑1 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC > SRR4302543.6798305/1‑94 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC > SRR4302543.1162317/1‑94 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGCCGTTCTTCActggcaagc > SRR4302543.4735491/1‑85 (MQ=60) CTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > SRR4302543.2473907/1‑94 (MQ=60) CTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > SRR4302543.6681556/1‑94 (MQ=60) | TCGCCTTTC‑AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTG‑CTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991446‑3991632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |