Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 1873 | 183.1 | 9376148 | 98.2% | 9207377 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 100.0% | 711.5 / NA | 219 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (100/119); total (100/119) | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991448‑3991628 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc > 1:3727945/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCActct > 1:3176060/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:998254/1‑93 (MQ=255) ttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCa > 1:1782581/1‑93 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa > 2:818274/1‑93 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa < 2:3470988/93‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 1:4377172/1‑93 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 2:4292272/1‑93 (MQ=255) gTCAAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt < 1:4653401/93‑1 (MQ=255) tCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTa > 1:532526/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:4182934/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGTCGCCACTCTCAAAGGTAAt > 1:4107025/1‑93 (MQ=255) aaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATg > 2:4569268/1‑93 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 2:3559466/93‑1 (MQ=255) agggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:684387/91‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:3376733/93‑1 (MQ=255) aTGGTACCCGCCCTGTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:2590919/93‑1 (MQ=255) gggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 1:2488263/92‑1 (MQ=255) ggcggccgtcGTGTTTGTTTTCCAGCCATACCGGGCGGGGCGTATCCTGGCGGTTCATAATGATTTTGCCGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCa < 2:3831155/89‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCCCGGTTTGGTTGCCAGCCAAACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGACACTCTCAAAGGTAATGGTCa < 2:319570/93‑1 (MQ=255) tacccgccCTGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGCCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGt < 2:4043439/90‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGt < 1:2119502/93‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGt < 2:483734/93‑1 (MQ=255) ggcccccCTCTGTGGTTACCAGCATTGCCTGGCGCAGCGGGTGCTGGCGCTTGATAATCATTTTGCTGCCTCTCTCAAAGGTAATGGTCAgga < 2:451729/92‑3 (MQ=255) cgccgccCTTTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 1:3626062/92‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa > 1:4644789/1‑93 (MQ=255) gccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc < 1:1752662/93‑1 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc < 1:454359/93‑1 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 2:135147/1‑93 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 2:1593948/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 2:4239391/1‑93 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt > 2:211723/1‑93 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 1:1988551/93‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAGAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt > 1:3042636/1‑93 (MQ=255) gTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 1:2218112/93‑1 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 1:892682/1‑93 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 1:1760160/1‑93 (MQ=255) ggTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAt > 1:1189065/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:4663235/93‑1 (MQ=255) gTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTACTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:2512951/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:2371240/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 1:1024537/93‑1 (MQ=255) gtGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:2869594/92‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 2:4483244/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 1:333139/93‑1 (MQ=255) gccagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCg > 2:3629935/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGTCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 2:4651105/93‑1 (MQ=255) cagccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 1:109415/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg > 2:4307755/1‑93 (MQ=255) agccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 2:719670/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 1:1045131/93‑1 (MQ=255) tACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGCAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:304412/1‑93 (MQ=255) aCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGata < 2:2572922/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 2:2566497/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 1:426659/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 1:4501115/93‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 1:4493043/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 1:1855586/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:223835/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:681296/1‑93 (MQ=255) tGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCg < 1:2316791/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt < 2:668502/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATCTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt < 2:1565571/93‑1 (MQ=255) cTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATc > 2:2539585/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 1:131705/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc < 1:634091/93‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGACGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 1:1553012/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGCAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 1:4069240/1‑93 (MQ=255) ccTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATccc < 1:4138091/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTTATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa < 2:1118672/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 1:335729/1‑93 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 2:1206070/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg > 2:1984149/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg > 2:2467296/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTTGATAATGATTTGGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg < 1:3477582/93‑1 (MQ=255) tgCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgt < 1:2697319/92‑1 (MQ=255) gCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtc < 1:3223600/93‑1 (MQ=255) gggTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtca < 2:3414151/92‑2 (MQ=255) ggTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcat > 1:3821735/1‑91 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 1:2249849/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc < 1:2885126/93‑1 (MQ=255) ttGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATcc < 2:1488558/93‑1 (MQ=255) ttGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATcc < 2:4677206/93‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg < 1:2429563/93‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 2:4139664/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 2:396518/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 1:3538467/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg < 2:1875354/93‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg < 2:1895026/93‑1 (MQ=255) tAATGATTTTTCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGc < 2:761806/93‑1 (MQ=255) tAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGc > 2:3454508/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 1:4320414/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt > 2:2684227/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt < 2:2181508/93‑1 (MQ=255) gATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttc > 1:4015044/1‑93 (MQ=255) gATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttc < 2:4257420/93‑1 (MQ=255) gATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttc < 1:4613747/93‑1 (MQ=255) ttttGCTGCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCACGCGttcct > 2:4087310/1‑91 (MQ=255) ttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCa > 1:907098/1‑93 (MQ=255) gctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAt > 1:4586159/1‑93 (MQ=255) | GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991448‑3991628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
TCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991446‑3991632 | TCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCAC < SRR4302535.3216847/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.2154255/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.715074/1‑94 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT < SRR4302535.2235911/94‑1 (MQ=60) CGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACT > SRR4302535.2842650/1‑94 (MQ=60) GCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTC > SRR4302535.3753767/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302535.1050380/94‑1 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT > SRR4302535.3198036/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT > SRR4302535.1340172/1‑94 (MQ=60) CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCT < SRR4302535.2768379/94‑1 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC < SRR4302535.1150658/94‑1 (MQ=60) CTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTC > SRR4302535.1005336/1‑94 (MQ=60) TTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCA > SRR4302535.1795482/1‑94 (MQ=60) TTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAA > SRR4302535.3874425/1‑94 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG > SRR4302535.4407120/1‑94 (MQ=60) CAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAG < SRR4302535.3462209/94‑1 (MQ=60) AGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAGAGG > SRR4302535.681128/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302535.3395508/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA > SRR4302535.536253/1‑94 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.3777698/94‑1 (MQ=60) GTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.928186/94‑1 (MQ=60) GTCAAAAGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTA < SRR4302535.4684906/94‑1 (MQ=60) CAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGTCGCCACTCTCAAAGGTAAT > SRR4302535.4135146/1‑94 (MQ=60) ATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.3400213/94‑1 (MQ=60) ATGGTAGCCCCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.2609522/94‑1 (MQ=60) ATGGTACCCGCCCTGTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.2609521/94‑1 (MQ=60) AGGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTC < SRR4302535.689178/94‑1 (MQ=60) GGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCA < SRR4302535.2506207/94‑1 (MQ=60) GTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGT < SRR4302535.1173646/94‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA < SRR4302535.2134789/94‑1 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA > SRR4302535.4680824/1‑94 (MQ=60) TAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTA > SRR4302535.4676267/1‑94 (MQ=60) CGCCGCCCTTTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAC < SRR4302535.3651191/94‑1 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302535.1765328/94‑1 (MQ=60) GCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACG < SRR4302535.4489155/94‑1 (MQ=60) GCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCG < SRR4302535.457542/94‑1 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.1766372/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.2509520/1‑94 (MQ=60) CTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCG > SRR4302535.4626952/1‑94 (MQ=60) TGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGAGAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGT > SRR4302535.3063955/1‑94 (MQ=60) TGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAAGCCGCCGT > SRR4302535.4579577/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT > SRR4302535.1772903/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT < SRR4302535.2002870/94‑1 (MQ=60) GTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT > SRR4302535.899007/1‑94 (MQ=60) GTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTT < SRR4302535.2233896/94‑1 (MQ=60) TTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTG < SRR4302535.578525/94‑1 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT > SRR4302535.3522073/1‑94 (MQ=60) TGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAT > SRR4302535.1197582/1‑94 (MQ=60) GGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATT < SRR4302535.3298598/94‑1 (MQ=60) GTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.3729214/94‑1 (MQ=60) GTTGCCAGCCATCCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.4694767/94‑1 (MQ=60) GTTCCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTACTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTT < SRR4302535.2531069/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302535.3718046/94‑1 (MQ=60) TTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTC < SRR4302535.1031816/94‑1 (MQ=60) TGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCG > SRR4302535.229030/1‑94 (MQ=60) TGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCG < SRR4302535.335446/94‑1 (MQ=60) CCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCA > SRR4302535.4683875/1‑94 (MQ=60) CAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302535.4201819/94‑1 (MQ=60) CAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAG < SRR4302535.110190/94‑1 (MQ=60) AGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGT < SRR4302535.1052537/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG < SRR4302535.1594879/94‑1 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG > SRR4302535.860515/1‑94 (MQ=60) CCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGGAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCG > SRR4302535.1774906/1‑94 (MQ=60) CATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGA > SRR4302535.407589/1‑94 (MQ=60) ATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGAT > SRR4302535.2258189/1‑94 (MQ=60) TACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATA > SRR4302535.3362006/1‑94 (MQ=60) ACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATAT > SRR4302535.746476/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGCCGCGGCTCCTGGCGTTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.2766275/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.4532025/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.4523883/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.429630/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGCAGCGGCTCCTGCCGATTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATC < SRR4302535.3605295/94‑1 (MQ=60) CTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCG < SRR4302535.1868954/94‑1 (MQ=60) TGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGC < SRR4302535.2333369/94‑1 (MQ=60) GGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302535.4431387/94‑1 (MQ=60) GGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCT < SRR4302535.4686746/94‑1 (MQ=60) CGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > SRR4302535.2599970/1‑94 (MQ=60) CGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGT > SRR4302535.60623/1‑94 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302535.1271386/94‑1 (MQ=60) GCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTC < SRR4302535.1844151/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT > SRR4302535.4359853/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302535.4649608/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAT < SRR4302535.1611278/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATC > SRR4302535.4612463/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302535.2979494/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302535.132625/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGACGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302535.1564202/1‑94 (MQ=60) CTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGCAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCC > SRR4302535.4097088/1‑94 (MQ=60) TCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCC < SRR4302535.1955031/94‑1 (MQ=60) TCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCC < SRR4302535.638511/94‑1 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA > SRR4302535.338052/1‑94 (MQ=60) CCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCA < SRR4302535.4166429/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG < SRR4302535.452935/94‑1 (MQ=60) CTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAG > SRR4302535.2073957/1‑94 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT > SRR4302535.2927875/1‑94 (MQ=60) TGGCGGTTGATAATGATTTGGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGT < SRR4302535.3501748/94‑1 (MQ=60) TGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTC < SRR4302535.2716595/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302535.3245946/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCA < SRR4302535.4134483/94‑1 (MQ=60) CGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCAT > SRR4302535.3848101/1‑94 (MQ=60) GGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATC > SRR4302535.2265868/1‑94 (MQ=60) GTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCC < SRR4302535.2905537/94‑1 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA < SRR4302535.2497620/94‑1 (MQ=60) TTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCA > SRR4302535.3425956/1‑94 (MQ=60) TGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAG > SRR4302535.3563032/1‑94 (MQ=60) TGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAG < SRR4302535.4250634/94‑1 (MQ=60) GATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGG < SRR4302535.2447068/94‑1 (MQ=60) ATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGC > SRR4302535.1853010/1‑94 (MQ=60) TAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG < SRR4302535.4567636/94‑1 (MQ=60) TAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCG > SRR4302535.4349969/1‑94 (MQ=60) AATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGT < SRR4302535.48507/94‑1 (MQ=60) ATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT < SRR4302535.430829/94‑1 (MQ=60) ATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302535.2188512/1‑94 (MQ=60) ATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT > SRR4302535.2591231/1‑94 (MQ=60) ATAATTTTGCTGCCTCTCTCAAATGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTT < SRR4302535.2440838/94‑1 (MQ=60) TGATTTTGCTGCCCGTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTC < SRR4302535.3220183/94‑1 (MQ=60) TGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTC > SRR4302535.4042504/1‑94 (MQ=60) GATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCT < SRR4302535.4645093/94‑1 (MQ=60) GATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCT < SRR4302535.1097132/94‑1 (MQ=60) ATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTT < SRR4302535.3155300/94‑1 (MQ=60) TTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCA > SRR4302535.913538/1‑94 (MQ=60) TGCTGCCCCTCTCAAAGGTAATGGTCAGTGCGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT < SRR4302535.905702/94‑1 (MQ=60) TGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAAT > SRR4302535.4617386/1‑94 (MQ=60) GCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATG < SRR4302535.414580/94‑1 (MQ=60) GCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATG > SRR4302535.4087538/1‑94 (MQ=60) CTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGG < SRR4302535.3258722/94‑1 (MQ=60) TGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGT < SRR4302535.2203117/94‑1 (MQ=60) CCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTTATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCA < SRR4302535.2442783/94‑1 (MQ=60) CACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > SRR4302535.3387906/1‑94 (MQ=60) ACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGC > SRR4302535.1349165/1‑94 (MQ=60) CTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > SRR4302535.53267/1‑94 (MQ=60) | TCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCC > NC_000913/3991446‑3991632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |