Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 98.6%
| 660.7
/ 1.4
| 210 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (122/85); total (124/86) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT > NC_000913/4005509‑4005686
|
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑G‑cc > 1:2758048/1‑92 (MQ=255)
aTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑G‑cctg > 2:40177/1‑90 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑G‑cctgt < 1:3692418/93‑5 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTAtc > 2:2731667/1‑93 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTAtc < 2:4591410/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTAtctc < 1:4416891/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTAtctc < 2:3058129/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGTCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGTCGGCGG‑G‑CTGGATctct > 2:4487259/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TGAC‑CTGTATCTctgc > 2:359421/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTctgc < 2:1942111/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTctgctg > 1:1707122/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTctgctg < 1:1002317/93‑1 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTgg < 2:4632469/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGa > 1:1651102/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGa > 1:321128/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGa < 1:4529405/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGAATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGa < 1:4314411/93‑1 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGTCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGAt < 1:1586664/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGTTg > 1:491787/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATg < 1:2696223/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATgg < 2:4113172/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 1:642497/93‑1 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:3156086/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:3734096/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTa > 2:3011818/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAc > 1:3036038/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAc < 1:133345/93‑1 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 2:369410/1‑93 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAg > 1:1636543/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa > 1:2100722/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 2:110511/93‑1 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGATGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAgctgct > 1:4351681/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:1669105/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAAAGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCATATGCTa > 2:698806/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:1118451/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:2649228/1‑93 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgg > 2:145885/1‑92 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 1:3394862/1‑93 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg < 1:2568917/93‑1 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 2:4287061/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg < 2:2931835/93‑1 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 2:854012/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 1:3995372/1‑93 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggt < 2:2078848/93‑1 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggt < 1:2591597/93‑1 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc < 1:2064118/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa < 2:3260454/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa > 1:4227350/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 1:2048387/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 1:3152473/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 1:638223/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 1:2311541/1‑93 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa > 1:3533701/1‑93 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa > 1:701957/1‑93 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa > 1:4069757/1‑93 (MQ=255)
cGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaa > 2:3421150/1‑93 (MQ=255)
cGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaa < 2:1262684/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa < 1:3137195/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa > 2:1537641/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag > 1:776222/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAACaga > 1:1487450/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:532021/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag < 1:2852546/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc < 2:1493065/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgg > 1:1266064/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 1:2971107/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 1:1499725/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 1:3492343/1‑93 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt < 1:74532/93‑1 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 2:2501206/93‑1 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc < 1:2400468/93‑1 (MQ=255)
aTACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAc > 2:1814384/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc < 1:1402481/93‑1 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:2369459/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTACTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:2228199/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt > 2:2112690/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTg > 1:975195/1‑93 (MQ=255)
gCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGGGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc > 2:3132276/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcg > 2:3513575/1‑93 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgc > 2:2262612/1‑93 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATTTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGcc < 2:4150414/93‑1 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGcc > 2:773909/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:2876685/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:3771032/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:1531829/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGA‑TGTC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac < 2:321651/93‑1 (MQ=255)
tATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca < 1:1995210/93‑1 (MQ=255)
tATGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca > 2:589254/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 2:1718252/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGGGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 1:3577316/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:4278062/1‑93 (MQ=255)
tggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:4479676/1‑93 (MQ=255)
tggtggGCGG‑GG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:3631573/1‑93 (MQ=255)
ggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAggc > 2:2299866/1‑92 (MQ=255)
ggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 1:3588623/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 2:4423123/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCGGCTGGAGGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCCCCTGCGCCACAGGt < 2:619615/93‑1 (MQ=255)
gtggGCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 1:3813073/93‑1 (MQ=255)
gCGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc < 1:2454980/93‑1 (MQ=255)
cGG‑TG‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt > 1:219485/1‑93 (MQ=255)
|
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑TG‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT > NC_000913/4005509‑4005686
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑C > SRR4302535.1608544/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑C > SRR4302535.3663825/1‑94 (MQ=60)
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CC > SRR4302535.2777701/1‑94 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑Cct > SRR4302535.2878102/1‑92 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTA < SRR4302535.3717975/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTAT < SRR4302535.2148186/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATC > SRR4302535.1569501/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATC > SRR4302535.643146/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTC < SRR4302535.355365/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCT < SRR4302535.4447128/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCT < SRR4302535.1350451/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302535.1719465/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG < SRR4302535.1009435/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302535.762261/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302535.4451039/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGA > SRR4302535.1663041/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGA > SRR4302535.323351/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGA > SRR4302535.4489461/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGCGTGCATACGCTGAGTATGCTGGGCGGT‑GG‑Cctggatctcggctggg > SRR4302535.323350/1‑78 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302535.2095692/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302535.2684731/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302535.3096622/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302535.4560417/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGAATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302535.4343925/94‑1 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGTCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302535.1598112/94‑1 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGTTG > SRR4302535.495235/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302535.3603701/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGG < SRR4302535.2715496/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGG < SRR4302535.1665418/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGG < SRR4302535.3560774/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302535.646985/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTT > SRR4302535.504347/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302535.4375514/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302535.397198/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302535.3057298/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC > SRR4302535.2491897/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC < SRR4302535.134279/94‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302535.3535318/94‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG > SRR4302535.1648366/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302535.2115870/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302535.2115871/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGATGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGCTGCT > SRR4302535.4381456/1‑94 (MQ=60)
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CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTAGCAGATGCTAC > SRR4302535.4230153/1‑94 (MQ=60)
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CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302535.3418480/1‑94 (MQ=60)
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ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302535.4022708/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302535.737013/1‑94 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG > SRR4302535.2770343/1‑94 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302535.2610206/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG > SRR4302535.3479823/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302535.1492600/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302535.1181201/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA > SRR4302535.4256278/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA < SRR4302535.2078997/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302535.3174380/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302535.642684/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302535.2063136/1‑94 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT > SRR4302535.2328086/1‑94 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG < SRR4302535.2687757/94‑1 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302535.2362492/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302535.3558234/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302535.2993591/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302535.706878/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302535.383929/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302535.4097608/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA > SRR4302535.393657/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302535.4318588/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302535.2236287/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA < SRR4302535.3159027/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302535.3167313/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG > SRR4302535.781678/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAACAGA > SRR4302535.1498104/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302535.1562707/94‑1 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302535.2409660/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302535.3681808/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302535.2872756/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302535.2975099/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG < SRR4302535.3654319/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG > SRR4302535.1275119/1‑94 (MQ=60)
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GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302535.75078/94‑1 (MQ=60)
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TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302535.2475501/1‑94 (MQ=60)
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TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGCTTCTGC > SRR4302535.152008/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA > SRR4302535.132171/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302535.2417731/94‑1 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302535.1386947/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302535.2386471/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTACTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302535.2244049/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302535.1412488/94‑1 (MQ=60)
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GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302535.4282744/1‑94 (MQ=60)
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CTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGC > SRR4302535.1694494/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC > SRR4302535.4417716/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302535.2436242/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302535.3797051/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302535.1542865/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302535.2897060/1‑94 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG < SRR4302535.2009576/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302535.681271/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302535.783878/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302535.3602115/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302535.374606/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302535.4307338/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302535.4510429/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGG‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302535.3656747/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302535.3613515/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302535.2667202/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302535.2284646/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302535.2284645/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC > SRR4302535.2115359/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302535.3839387/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG > SRR4302535.2908227/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGA > SRR4302535.642877/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG < SRR4302535.2077127/94‑1 (MQ=60)
GCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT < SRR4302535.2472680/94‑1 (MQ=60)
GCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT > SRR4302535.220996/1‑94 (MQ=60)
CGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302535.4326213/94‑1 (MQ=60)
CGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302535.1502366/94‑1 (MQ=60)
GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302535.1020153/1‑94 (MQ=60)
GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302535.470078/1‑94 (MQ=60)
ggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA > SRR4302535.750754/4‑94 (MQ=60)
GC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302535.4543817/1‑94 (MQ=60)
C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA < SRR4302535.655130/94‑1 (MQ=60)
C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCGACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAACTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA > SRR4302535.486893/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302535.22866/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302535.1382472/94‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302535.1179832/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302535.2558850/1‑94 (MQ=60)
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CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
