Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,215,052 |
A→G |
E122G (GAG→GGG) |
aceA → |
isocitrate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,215,052 | 0 | A | G | 100.0%
| 680.0
/ NA
| 216 | E122G (GAG→GGG) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (110/106); total (110/106) |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214964‑4215141
|
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg > 2:2725510/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGAAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGccg > 2:685176/1‑91 (MQ=255)
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCCGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTAGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg > 2:271685/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa < 2:644733/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa < 2:4172966/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt > 2:3175970/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt > 1:1861379/1‑93 (MQ=255)
cAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATc < 1:3815753/93‑1 (MQ=255)
aGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATca > 1:2569114/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa > 2:1960845/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaaca > 2:3390012/1‑93 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 2:3728483/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 1:622784/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 2:4642031/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGACGCTACCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCaacaac < 1:4144836/93‑1 (MQ=255)
ggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAacac < 1:2345906/93‑1 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt < 2:2678382/93‑1 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt > 1:3974735/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCtt < 2:3881183/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGGATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGGGCCAGCTGTGGTGGGGGGGATCAACAACACCtt > 2:4390607/1‑93 (MQ=255)
cGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcg < 2:181231/93‑1 (MQ=255)
gCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgt > 1:1792490/1‑93 (MQ=255)
cTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtc < 1:911090/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg < 1:1260543/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 1:2097712/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 2:4229923/1‑93 (MQ=255)
ccTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGc > 1:468575/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGTCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 1:2867141/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 2:110543/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc < 2:2387144/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg < 2:3297206/93‑1 (MQ=255)
cggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATc < 1:1194457/93‑1 (MQ=255)
cggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATc < 2:1226761/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACGCCTTCCGTCGTGCCGATCa < 2:4575136/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa < 1:756322/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa > 2:3264/1‑93 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa < 1:1460194/93‑1 (MQ=255)
gcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAg > 1:1241989/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGa < 2:1200992/93‑1 (MQ=255)
cAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAt < 1:3307605/93‑1 (MQ=255)
cAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAt < 1:3056510/93‑1 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 1:3838433/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 1:3210172/1‑93 (MQ=255)
gCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATcc > 1:3400027/1‑93 (MQ=255)
gCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATcc > 1:1421590/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 2:882447/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 1:1598688/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 1:599178/1‑93 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg > 2:2576391/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATgg > 1:3375813/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGt < 2:208387/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc < 1:310744/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 1:2926918/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCAGTTGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:334259/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 1:4552541/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:3024807/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg < 1:1390506/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg < 1:2009146/93‑1 (MQ=255)
ggATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgc > 1:3574646/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 2:3993705/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCggg > 1:23554/1‑93 (MQ=255)
tCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCggg > 2:2420502/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAt > 1:2464790/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAt > 1:977154/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTg > 2:4071854/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTg > 2:763378/1‑93 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa > 2:3930344/1‑93 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTCCCAGATCAGGTGGGGCGGATCATCAAGACCTTCCATCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTgt > 2:2213842/1‑92 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg < 2:3668330/93‑1 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg < 1:2972048/93‑1 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGc < 1:3823801/93‑1 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGc > 2:1681755/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 1:399165/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCgg < 2:2448490/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCgg > 1:2291676/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg > 1:3432169/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg > 2:2013849/1‑93 (MQ=255)
ccGGCAAGCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGc < 1:2623419/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGa > 1:2540151/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATcc > 2:3304757/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATcc > 2:3035297/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATctg > 1:409095/1‑91 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg < 2:4160149/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc < 1:4403281/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc > 1:2824829/1‑93 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc < 1:3151391/93‑1 (MQ=255)
cTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTTAGACGGGCGATAcgcg > 2:3334225/1‑93 (MQ=255)
cTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgcg > 1:3703414/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCgcgc > 1:691746/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGCCAGCTGTGGGGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATTGCCCGCGGGCATTGAGCCGGGGGATTCtcgc > 2:531624/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt < 2:3746824/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt > 1:1660116/1‑93 (MQ=255)
ccAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTc < 2:1453478/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTa > 1:1690178/1‑93 (MQ=255)
tggtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACt > 2:4452014/1‑93 (MQ=255)
ggtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACtt > 2:1507266/1‑93 (MQ=255)
gtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTc < 1:1964214/93‑1 (MQ=255)
gtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTc < 2:2043660/93‑1 (MQ=255)
tggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTcc > 2:1072574/1‑93 (MQ=255)
tggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTcc < 2:3485643/93‑1 (MQ=255)
|
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214964‑4215141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG > NC_000913/4214959‑4215143
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG > SRR4302535.4460485/1‑94 (MQ=60)
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG < SRR4302535.127137/94‑1 (MQ=60)
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG < SRR4302535.714675/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGG < SRR4302535.4572206/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGG < SRR4302535.2419302/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGG < SRR4302535.2429548/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC < SRR4302535.3802342/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAT > SRR4302535.1874802/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302535.3852961/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302535.1818389/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302535.3727856/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCA > SRR4302535.788783/1‑94 (MQ=60)
CAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCA < SRR4302535.3842079/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCA > SRR4302535.2587593/1‑94 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAA > SRR4302535.62244/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAAC < SRR4302535.627111/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGACGCTACCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACA < SRR4302535.4173218/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC < SRR4302535.2362718/94‑1 (MQ=60)
GCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCT > SRR4302535.4001886/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC < SRR4302535.2583613/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGT < SRR4302535.2424116/94‑1 (MQ=60)
CGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGT > SRR4302535.1805449/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACCTGGCGGCCAGCATGGATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGT > SRR4302535.2088199/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG < SRR4302535.917567/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT > SRR4302535.335608/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT < SRR4302535.1269563/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG > SRR4302535.2112840/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG > SRR4302535.4629539/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGC > SRR4302535.471853/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGTCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCC > SRR4302535.2887450/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCC > SRR4302535.3426062/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCG > SRR4302535.55039/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAGCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGAT > SRR4302535.2344038/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGAT < SRR4302535.2367824/94‑1 (MQ=60)
GCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATC < SRR4302535.3130879/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCA < SRR4302535.1203013/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302535.1470658/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302535.146759/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302535.761647/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG > SRR4302535.1250859/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA > SRR4302535.2960965/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA > SRR4302535.1977885/1‑94 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302535.4095032/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302535.3077902/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC > SRR4302535.3232408/1‑94 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302535.3330621/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302535.1666574/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302535.2275969/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC > SRR4302535.3864891/1‑94 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302535.936015/1‑94 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302535.3423690/1‑94 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302535.1431740/1‑94 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302535.2767567/1‑94 (MQ=60)
CATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAA > SRR4302535.1221580/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACCCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT < SRR4302535.674642/94‑1 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT > SRR4302535.1610218/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT > SRR4302535.603367/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT < SRR4302535.4154395/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302535.3848390/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG > SRR4302535.3399291/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGT > SRR4302535.1736019/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC > SRR4302535.2947548/1‑94 (MQ=60)
TCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCC < SRR4302535.312899/94‑1 (MQ=60)
TCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCC > SRR4302535.3532101/1‑94 (MQ=60)
TCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCC < SRR4302535.2619102/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302535.1426349/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302535.4583650/94‑1 (MQ=60)
CGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGC < SRR4302535.2023614/94‑1 (MQ=60)
CGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGC < SRR4302535.1400428/94‑1 (MQ=60)
CGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGC > SRR4302535.3599430/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG > SRR4302535.1445338/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG > SRR4302535.2766134/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG < SRR4302535.2004588/94‑1 (MQ=60)
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ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG > SRR4302535.23740/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG > SRR4302535.1758849/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG > SRR4302535.3203577/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCA > SRR4302535.4358646/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT > SRR4302535.984093/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT > SRR4302535.953319/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT > SRR4302535.2482564/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGAATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT > SRR4302535.2535383/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA > SRR4302535.2858356/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC < SRR4302535.2992910/94‑1 (MQ=60)
TCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCC < SRR4302535.3354703/94‑1 (MQ=60)
TCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCC > SRR4302535.1471138/1‑94 (MQ=60)
TCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCC < SRR4302535.3850177/94‑1 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG > SRR4302535.401961/1‑94 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG < SRR4302535.3024556/94‑1 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302535.2308069/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGG > SRR4302535.3456021/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAAGCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCG < SRR4302535.2642219/94‑1 (MQ=60)
CGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGA > SRR4302535.2558446/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAT > SRR4302535.2031653/1‑94 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC < SRR4302535.3418407/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCTG > SRR4302535.411967/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG < SRR4302535.613944/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG < SRR4302535.3073313/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG > SRR4302535.4002473/1‑94 (MQ=60)
AACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGC < SRR4302535.3961034/94‑1 (MQ=60)
AACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGC > SRR4302535.2844883/1‑94 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302535.4433415/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG > SRR4302535.3729059/1‑94 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302535.3173292/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGC > SRR4302535.696594/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCT > SRR4302535.1672114/1‑94 (MQ=60)
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GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG > SRR4302535.3667949/1‑94 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302535.3107241/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302535.2460123/94‑1 (MQ=60)
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GCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTC < SRR4302535.3966488/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTC < SRR4302535.2931155/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA > SRR4302535.1702410/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC < SRR4302535.1701121/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC < SRR4302535.4203737/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC < SRR4302535.1978376/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAATAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302535.3288431/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302535.1252521/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG > SRR4302535.1681202/1‑94 (MQ=60)
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG > NC_000913/4214959‑4215143
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
