Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,348,017 |
C→T |
A408A (GCG→GCA) |
yjdH ← |
putative 2‑component sensor protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,348,017 | 0 | C | T | 100.0%
| 812.6
/ NA
| 224 | A408A (GCG→GCA) | yjdH | putative 2‑component sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (103/121); total (103/121) |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > NC_000913/4347927‑4348106
|
gTGGTAATCAGCGTCGCGGCCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGGGTATGTTCTAAATCGGTtgcc > 2:1795439/1‑92 (MQ=255)
gTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTtgcg > 2:666535/1‑93 (MQ=255)
tGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTtgcgc < 2:1221394/93‑1 (MQ=255)
tGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTtgcgc > 1:96794/1‑93 (MQ=255)
ggTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTtgcgcg > 1:4083740/1‑93 (MQ=255)
tAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGt > 2:3917483/1‑93 (MQ=255)
tAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGt < 2:2129642/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGtt > 2:2166400/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTa > 1:4249892/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGTGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTaa < 2:3744196/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTaa < 1:3687461/93‑1 (MQ=255)
aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATc > 2:3561440/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCt < 2:4217944/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCtt < 1:788216/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCtt < 1:2766991/93‑1 (MQ=255)
tCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGc > 1:3735880/1‑93 (MQ=255)
cgcgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCt < 2:1023130/93‑1 (MQ=255)
cgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGa < 1:1269009/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAtt > 2:1573715/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaa > 2:583691/1‑93 (MQ=255)
ggTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaa > 1:3231576/1‑93 (MQ=255)
gTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaaa < 1:1965956/93‑1 (MQ=255)
ccTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAc < 2:651092/93‑1 (MQ=255)
cTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAcc > 2:3655018/1‑93 (MQ=255)
cTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAcc < 2:1943502/93‑1 (MQ=255)
tCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCa > 1:1386766/1‑93 (MQ=255)
tCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCa < 1:1881123/93‑1 (MQ=255)
cACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAg < 1:2451370/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGa < 2:1498133/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGa > 1:2015357/1‑93 (MQ=255)
agCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAATGTTTAAAATCAGAGTAAGGACAACATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGa < 1:4684913/92‑1 (MQ=255)
ccGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATa > 2:4374927/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATa > 1:3987997/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATa < 2:2694828/93‑1 (MQ=255)
cGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa > 1:2351233/1‑93 (MQ=255)
cGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa > 1:4193811/1‑93 (MQ=255)
gCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc < 1:2438202/93‑1 (MQ=255)
gCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc < 2:1647967/93‑1 (MQ=255)
cTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAcc < 2:1325589/93‑1 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:1480719/1‑93 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:625377/1‑93 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg < 1:1019364/93‑1 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 2:2478525/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg < 2:2302272/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg < 2:2517656/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg > 1:2921909/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGgaga < 2:2383775/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt > 1:4303685/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt < 1:4299870/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt > 1:1342899/1‑93 (MQ=255)
gCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAtt > 2:799719/1‑93 (MQ=255)
gCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAtt < 2:3509257/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAttt < 2:4616327/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGa < 1:2126306/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGAt > 2:2793382/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATc < 1:1065553/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATc > 1:1142106/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATc < 1:4066091/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCtt > 2:1202027/1‑93 (MQ=255)
ttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAcc < 2:3957789/93‑1 (MQ=255)
cACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCca > 2:4498546/1‑93 (MQ=255)
cACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCca > 2:416084/1‑93 (MQ=255)
cACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCca < 2:3016601/93‑1 (MQ=255)
tGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCcagca > 1:881147/1‑93 (MQ=255)
tttAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCaga < 1:189379/93‑1 (MQ=255)
ttAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCagag > 2:3430408/1‑93 (MQ=255)
ttAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCagag < 2:4033593/93‑1 (MQ=255)
tAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCagaga < 2:243801/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGcc < 1:3369546/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCa > 1:453166/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 1:4641806/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 2:1969500/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 1:294671/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 1:3871097/93‑1 (MQ=255)
aGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtc < 1:1234356/93‑1 (MQ=255)
aGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtc < 1:281439/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtct > 1:3079601/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATctct < 2:3270044/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGCGAGCCACTCTCtt > 2:2585873/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTc > 1:300914/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTc > 2:500494/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTcc > 1:2232717/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTcc > 2:3593988/1‑93 (MQ=255)
ggCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCt < 2:705328/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg > 1:359285/1‑93 (MQ=255)
ccTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAGACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGa > 2:2663405/1‑93 (MQ=255)
ccTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGa < 2:3460655/93‑1 (MQ=255)
tAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATa > 1:4339193/1‑93 (MQ=255)
tAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATa < 1:534656/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAg < 1:1848720/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAg > 1:167084/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAg < 2:2911630/93‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGt < 2:3704822/93‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGt < 2:473078/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTa < 1:2597002/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTa < 2:170003/93‑1 (MQ=255)
cGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAt < 1:951125/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt > 2:3340389/1‑93 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt < 1:3494736/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt > 2:4123195/1‑93 (MQ=255)
|
CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > NC_000913/4347927‑4348106
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGC > NC_000913/4347924‑4348109
|
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT < SRR4302535.4656831/94‑1 (MQ=60)
CAACATGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCATTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT < SRR4302535.3927526/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG < SRR4302535.3606319/94‑1 (MQ=60)
GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGC > SRR4302535.97478/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCG > SRR4302535.4111666/1‑94 (MQ=60)
GGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGG > SRR4302535.1896177/1‑94 (MQ=60)
GGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGG < SRR4302535.1303500/94‑1 (MQ=60)
GTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGT < SRR4302535.2402375/94‑1 (MQ=60)
GTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGT < SRR4302535.3280606/94‑1 (MQ=60)
GTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGT > SRR4302535.1595287/1‑94 (MQ=60)
AATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTA > SRR4302535.4279003/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAAT < SRR4302535.4332500/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAAT < SRR4302535.3712974/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGCGACCTTGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTT < SRR4302535.936344/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCGCCCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTG < SRR4302535.4464981/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTG < SRR4302535.2786696/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTG < SRR4302535.793750/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGC > SRR4302535.3761737/1‑94 (MQ=60)
gctcgcCCTGGCCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302535.3390004/88‑1 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT > SRR4302535.3753778/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT < SRR4302535.4176109/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT < SRR4302535.1278080/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTA < SRR4302535.1170424/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTA < SRR4302535.4703197/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAA > SRR4302535.3019318/1‑94 (MQ=60)
TGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAA > SRR4302535.3253984/1‑94 (MQ=60)
GTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAA < SRR4302535.1980128/94‑1 (MQ=60)
TCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAC < SRR4302535.2493769/94‑1 (MQ=60)
CCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACC > SRR4302535.1111961/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA > SRR4302535.1396663/1‑94 (MQ=60)
TCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAG < SRR4302535.1894683/94‑1 (MQ=60)
CACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGC < SRR4302535.430840/94‑1 (MQ=60)
CACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGC < SRR4302535.1379466/94‑1 (MQ=60)
CACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGC < SRR4302535.2469039/94‑1 (MQ=60)
CACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGC > SRR4302535.894161/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGA < SRR4302535.3765171/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGA > SRR4302535.1624057/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGA > SRR4302535.3033440/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGA > SRR4302535.2029877/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAT < SRR4302535.2890500/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAT < SRR4302535.2083152/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAATGTTTAAAATCAGAGTAAGGACAACATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAT < SRR4302535.4716617/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATA > SRR4302535.4015267/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAC > SRR4302535.2984805/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAA < SRR4302535.596555/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAA > SRR4302535.2368089/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAA > SRR4302535.4222509/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAC < SRR4302535.3208602/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACC < SRR4302535.2455766/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACC < SRR4302535.3605262/94‑1 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG < SRR4302535.4104429/94‑1 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG < SRR4302535.2508951/94‑1 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG > SRR4302535.1491310/1‑94 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG > SRR4302535.629726/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGG > SRR4302535.2803872/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGG > SRR4302535.2942519/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGG < SRR4302535.1026604/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGA < SRR4302535.360749/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGA > SRR4302535.720681/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAT < SRR4302535.4045087/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAT > SRR4302535.1352485/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAT > SRR4302535.4333130/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAT > SRR4302535.1027976/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATT < SRR4302535.4329295/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTG < SRR4302535.3789219/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGAT < SRR4302535.3860876/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGAT < SRR4302535.2141634/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATC > SRR4302535.1150249/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCT < SRR4302535.963847/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCT < SRR4302535.4093916/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCT < SRR4302535.1073133/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTT > SRR4302535.2726188/1‑94 (MQ=60)
CTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAC > SRR4302535.3930438/1‑94 (MQ=60)
TTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACC > SRR4302535.409761/1‑94 (MQ=60)
CACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAG > SRR4302535.1895282/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGC > SRR4302535.4340717/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCA > SRR4302535.887386/1‑94 (MQ=60)
TGTGTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAG < SRR4302535.2294145/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAG < SRR4302535.2875898/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAG < SRR4302535.190686/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGA < SRR4302535.4273272/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCA < SRR4302535.3392990/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCA > SRR4302535.456341/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302535.3897699/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302535.296727/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302535.4673272/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302535.1256895/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATC > SRR4302535.61777/1‑94 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT > SRR4302535.3101074/1‑94 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT < SRR4302535.796889/94‑1 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT < SRR4302535.1243177/94‑1 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT < SRR4302535.4223254/94‑1 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT < SRR4302535.283403/94‑1 (MQ=60)
GCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTC > SRR4302535.2006197/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT > SRR4302535.3641492/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTC > SRR4302535.303009/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCC > SRR4302535.496412/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCC > SRR4302535.2248593/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCT < SRR4302535.2046704/94‑1 (MQ=60)
GGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTG < SRR4302535.2465219/94‑1 (MQ=60)
GGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTG < SRR4302535.2166426/94‑1 (MQ=60)
GGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTG < SRR4302535.1179996/94‑1 (MQ=60)
GGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTG > SRR4302535.361774/1‑94 (MQ=60)
GGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTG < SRR4302535.1954909/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGA > SRR4302535.1388922/1‑94 (MQ=60)
CTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATA > SRR4302535.4368867/1‑94 (MQ=60)
CTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATA < SRR4302535.4363852/94‑1 (MQ=60)
CTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATA > SRR4302535.4651791/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG > SRR4302535.4684165/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302535.2266714/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302535.538395/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG > SRR4302535.168245/1‑94 (MQ=60)
AAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGT < SRR4302535.1884173/94‑1 (MQ=60)
AAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGT < SRR4302535.1862043/94‑1 (MQ=60)
AATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTT < SRR4302535.3516171/94‑1 (MQ=60)
AATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTT < SRR4302535.329035/94‑1 (MQ=60)
AATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTT > SRR4302535.1806910/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAT < SRR4302535.2615653/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTGCGCGCTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAT < SRR4302535.1468534/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT < SRR4302535.957857/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302535.2963935/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTG < SRR4302535.3519015/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGG < SRR4302535.2795589/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGG > SRR4302535.3051229/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGC < SRR4302535.835603/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGC > SRR4302535.4345655/1‑94 (MQ=60)
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CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGC > NC_000913/4347924‑4348109
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
