Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,348,017 |
C→T |
A408A (GCG→GCA) |
yjdH ← |
putative 2‑component sensor protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,348,017 | 0 | C | T | 99.7%
| 1358.8
/ NA
| 373 | A408A (GCG→GCA) | yjdH | putative 2‑component sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (203/169); minor base G (0/1); total (203/170) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 392 total aligned reads displayed.
CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > NC_000913/4347927‑4348106
|
cGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTtgc > 1:959464/1‑93 (MQ=255)
tAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGt > 2:3447431/1‑93 (MQ=255)
tAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGt < 1:5532307/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTaa > 2:365888/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATc > 1:3892939/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATc > 1:574033/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCt > 2:2390517/1‑93 (MQ=255)
tCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGc > 1:6503189/1‑93 (MQ=255)
tCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGc > 2:1139320/1‑93 (MQ=255)
tCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGc > 1:1943409/1‑93 (MQ=255)
tCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGc < 1:7539972/93‑1 (MQ=255)
cgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGa < 2:7136033/93‑1 (MQ=255)
gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAt > 1:6327196/1‑93 (MQ=255)
gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAt < 2:7819136/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAtt > 2:2478378/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTa > 2:7063877/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTa > 1:5027072/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaa < 2:3007822/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaa > 2:2308826/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaa > 1:7701621/1‑93 (MQ=255)
ggTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaa > 1:5959069/1‑93 (MQ=255)
ggTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaa > 2:5528944/1‑93 (MQ=255)
gTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaaa > 1:160193/1‑93 (MQ=255)
ccTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAc < 2:1314926/93‑1 (MQ=255)
tCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCa < 1:4525599/93‑1 (MQ=255)
tCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCa < 1:7377602/93‑1 (MQ=255)
cACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAg < 2:1749359/93‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGc < 2:5308371/92‑1 (MQ=255)
cTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCg > 2:1607671/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCg > 2:6358060/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGa > 2:5665690/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATa < 1:4434027/93‑1 (MQ=255)
cGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa < 2:2690671/93‑1 (MQ=255)
gCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc < 2:212943/93‑1 (MQ=255)
gCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc > 1:1503198/1‑93 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTCAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:4317439/1‑93 (MQ=255)
tGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:1005577/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg > 2:307178/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAACACCAGCGATAACCGga > 2:4412944/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGgag < 2:5986749/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt < 1:2898240/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt < 2:7586553/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGTCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAttt < 1:1373579/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGa > 1:111747/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGa < 1:235146/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGAt < 2:4755190/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATc < 1:6750971/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCt > 2:6124814/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCtt < 2:7526465/93‑1 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc > 2:7917881/1‑93 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc > 1:6642800/1‑93 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc > 1:2243456/1‑93 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc > 2:1902418/1‑93 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc > 2:6570464/1‑93 (MQ=255)
tttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAc < 1:4933521/93‑1 (MQ=255)
ttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAcc < 2:7378650/93‑1 (MQ=255)
ttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAcc < 2:6067781/93‑1 (MQ=255)
ttCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAcc < 1:3722041/93‑1 (MQ=255)
tCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGTCTAAATCGGTTGCTCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAccc < 2:5112690/93‑1 (MQ=255)
tCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAccc > 2:3200151/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAccc > 1:6985304/1‑93 (MQ=255)
cACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCca > 2:4054211/1‑93 (MQ=255)
aCTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCcag > 2:6769282/1‑93 (MQ=255)
aCTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCcag > 1:2005465/1‑93 (MQ=255)
gTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCcagcag < 2:7652890/93‑1 (MQ=255)
tttAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCaga < 2:6483294/93‑1 (MQ=255)
ttAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCagag < 2:7326366/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGcc > 2:6904870/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 2:4624041/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa > 2:6693248/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa > 1:2788111/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCaa < 1:7148875/93‑1 (MQ=255)
aGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGCTCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtc > 2:5409065/1‑93 (MQ=255)
cGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtctc < 2:2801810/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATctct < 2:2590780/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCtt < 2:1252596/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCtt > 1:1738974/1‑93 (MQ=255)
tATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCtt > 1:5905347/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTc > 1:4794789/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTcc > 1:12836/1‑93 (MQ=255)
ggCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCt > 2:5912612/1‑93 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg < 1:3429246/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg < 1:2268556/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg > 2:5779631/1‑93 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg > 2:7451081/1‑93 (MQ=255)
gCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACACAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTg > 2:3957072/1‑93 (MQ=255)
ccTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGa < 2:5390436/93‑1 (MQ=255)
cTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGAt > 1:2573975/1‑93 (MQ=255)
tAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATa < 1:2634678/93‑1 (MQ=255)
tAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATa > 2:5234339/1‑93 (MQ=255)
tAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATa > 1:5219544/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAg < 2:4979684/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAg < 2:2158355/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTa < 1:3258024/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTa > 2:1478808/1‑93 (MQ=255)
tCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTa < 2:4323624/93‑1 (MQ=255)
cGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAt < 1:539268/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGCGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt > 1:3623574/1‑93 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt < 1:6121492/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAtt > 1:5828484/1‑93 (MQ=255)
|
CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > NC_000913/4347927‑4348106
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCT > NC_000913/4347924‑4348110
|
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT < SRR4302543.556449/94‑1 (MQ=60)
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT < SRR4302543.119235/94‑1 (MQ=60)
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT > SRR4302543.7598750/1‑94 (MQ=60)
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTT > SRR4302543.474337/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG > SRR4302543.5099403/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG < SRR4302543.5096290/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG > SRR4302543.2767256/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG < SRR4302543.723108/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG > SRR4302543.1400041/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG > SRR4302543.7521007/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTG < SRR4302543.5017479/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGC > SRR4302543.967870/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGC > SRR4302543.2270789/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGC > SRR4302543.2270792/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCG > SRR4302543.5804018/1‑94 (MQ=60)
GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGC > SRR4302543.2625881/1‑94 (MQ=60)
GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGC > SRR4302543.1227340/1‑94 (MQ=60)
GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGC > SRR4302543.1171463/1‑94 (MQ=60)
GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGC > SRR4302543.2794735/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCG > SRR4302543.3241994/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCG < SRR4302543.289855/94‑1 (MQ=60)
GTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGT > SRR4302543.1096637/1‑94 (MQ=60)
TAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTT < SRR4302543.5582576/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAA > SRR4302543.4541366/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAAT < SRR4302543.4943096/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAAT > SRR4302543.3716447/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAAT > SRR4302543.3716448/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATC > SRR4302543.579286/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATC > SRR4302543.4983227/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATC > SRR4302543.3927310/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATC > SRR4302543.1659160/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCT > SRR4302543.5004136/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCT > SRR4302543.5861247/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCT > SRR4302543.5528470/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTT > SRR4302543.2827433/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGC > SRR4302543.6564448/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGC < SRR4302543.7340995/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGC > SRR4302543.1960864/1‑94 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCGGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302543.58819/94‑1 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302543.383016/94‑1 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT > SRR4302543.5184885/1‑94 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302543.6597371/94‑1 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302543.4288163/94‑1 (MQ=60)
TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCT < SRR4302543.7611840/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT > SRR4302543.3673284/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT > SRR4302543.6386702/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGAT < SRR4302543.3107432/94‑1 (MQ=60)
GACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTCATCTTGCTGATT > SRR4302543.611561/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATT > SRR4302543.611559/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTA > SRR4302543.5072823/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTA > SRR4302543.1927528/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTA > SRR4302543.1883185/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAA > SRR4302543.7519606/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAA < SRR4302543.1316715/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAA > SRR4302543.7809867/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAA > SRR4302543.7774507/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAA < SRR4302543.6240356/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAA > SRR4302543.6517219/1‑94 (MQ=60)
TGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAA > SRR4302543.6013613/1‑94 (MQ=60)
TGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAA < SRR4302543.1607886/94‑1 (MQ=60)
GGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAA < SRR4302543.3475299/94‑1 (MQ=60)
GGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAA > SRR4302543.161564/1‑94 (MQ=60)
GGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAA > SRR4302543.6896850/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAC < SRR4302543.3999630/94‑1 (MQ=60)
CCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACC > SRR4302543.98517/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA < SRR4302543.1004875/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA < SRR4302543.7241371/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA > SRR4302543.7084867/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA < SRR4302543.1592450/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCA > SRR4302543.2266900/1‑94 (MQ=60)
TCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAG < SRR4302543.7448519/94‑1 (MQ=60)
TCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAG < SRR4302543.6018944/94‑1 (MQ=60)
TCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAG < SRR4302543.4566779/94‑1 (MQ=60)
TCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAG < SRR4302543.4566778/94‑1 (MQ=60)
CACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGC < SRR4302543.6775182/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCG < SRR4302543.5687139/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCG > SRR4302543.6189522/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGA > SRR4302543.5511558/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGTCTGGCAGCTGTCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAT < SRR4302543.5987793/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATA > SRR4302543.5321369/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAA < SRR4302543.4474184/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAA > SRR4302543.3415303/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAC < SRR4302543.4706301/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAC < SRR4302543.6663160/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAC > SRR4302543.1516707/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCTCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACC < SRR4302543.5369861/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACC < SRR4302543.5369860/94‑1 (MQ=60)
CCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACC < SRR4302543.2370071/94‑1 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTCAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG > SRR4302543.4356651/1‑94 (MQ=60)
CTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCG > SRR4302543.1014472/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGG > SRR4302543.1111398/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGG < SRR4302543.1400570/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGA > SRR4302543.7958344/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG < SRR4302543.4853591/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGA > SRR4302543.6007402/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGA > SRR4302543.3965632/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGA > SRR4302543.265317/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGA > SRR4302543.4464819/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAT < SRR4302543.2991811/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATT < SRR4302543.2924591/94‑1 (MQ=60)
ggagctgtgtttgtCTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTT < SRR4302543.1476998/80‑1 (MQ=60)
GCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTT < SRR4302543.1594843/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTT < SRR4302543.5245755/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTT < SRR4302543.1476999/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGTCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTG < SRR4302543.1385921/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTG < SRR4302543.1385920/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > SRR4302543.6699647/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > SRR4302543.112762/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > SRR4302543.2441124/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > SRR4302543.2464186/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGAT < SRR4302543.237177/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATC < SRR4302543.1288785/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATC > SRR4302543.7458256/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATC > SRR4302543.6381120/1‑94 (MQ=60)
CCGGCTGTCACCGTTTAAAATCAGCGTATGGCCCAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATC > SRR4302543.7100278/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCT < SRR4302543.6814722/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCT < SRR4302543.5154484/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTA < SRR4302543.5688954/94‑1 (MQ=60)
CTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAC > SRR4302543.2263805/1‑94 (MQ=60)
CTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTAC > SRR4302543.6705485/1‑94 (MQ=60)
TTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACC > SRR4302543.3410627/1‑94 (MQ=60)
TTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACC < SRR4302543.4978455/94‑1 (MQ=60)
TTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACC > SRR4302543.5812750/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCC > SRR4302543.4440695/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCC > SRR4302543.7051047/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCC > SRR4302543.5557553/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCC < SRR4302543.3754774/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAATAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCA > SRR4302543.7683880/1‑94 (MQ=60)
TCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCA > SRR4302543.7017520/1‑94 (MQ=60)
CACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAG > SRR4302543.2023486/1‑94 (MQ=60)
CACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAG < SRR4302543.4559906/94‑1 (MQ=60)
CACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAG > SRR4302543.2717664/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGC > SRR4302543.3829650/1‑94 (MQ=60)
TGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAG < SRR4302543.701888/94‑1 (MQ=60)
GTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGA < SRR4302543.2897343/94‑1 (MQ=60)
GTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGA < SRR4302543.7453367/94‑1 (MQ=60)
GTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGA > SRR4302543.1303593/1‑94 (MQ=60)
GTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGAAGA > SRR4302543.2016220/1‑94 (MQ=60)
TTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGGTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGA > SRR4302543.4579326/1‑94 (MQ=60)
TAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAG < SRR4302543.6758597/94‑1 (MQ=60)
TAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAG < SRR4302543.1670699/94‑1 (MQ=60)
TAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAG < SRR4302543.6549472/94‑1 (MQ=60)
AAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGC < SRR4302543.5757824/94‑1 (MQ=60)
AAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCC > SRR4302543.6517708/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAA < SRR4302543.3830495/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAA > SRR4302543.2813557/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302543.1964674/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAAT < SRR4302543.7218362/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATC > SRR4302543.4386563/1‑94 (MQ=60)
ctctTATGGCCTAAATCTGTTGCGCTGGTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT < SRR4302543.2010490/90‑1 (MQ=60)
AGCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCT > SRR4302543.2084303/1‑94 (MQ=60)
GCGTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTC < SRR4302543.365247/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT < SRR4302543.1416674/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT > SRR4302543.7768173/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT < SRR4302543.1888469/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT > SRR4302543.5959246/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT > SRR4302543.5959245/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTT > SRR4302543.1754480/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTC > SRR4302543.4852221/1‑94 (MQ=60)
TATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTC > SRR4302543.4838611/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCC < SRR4302543.7305156/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCC < SRR4302543.7759/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCC > SRR4302543.12949/1‑94 (MQ=60)
GCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGA < SRR4302543.3492880/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGA < SRR4302543.3459930/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGA < SRR4302543.2289275/94‑1 (MQ=60)
CCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGAT > SRR4302543.2597440/1‑94 (MQ=60)
CCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGAT < SRR4302543.167848/94‑1 (MQ=60)
CCTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGAT > SRR4302543.7886226/1‑94 (MQ=60)
CTAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATA > SRR4302543.5266557/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302543.3387788/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302543.2590746/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302543.2658534/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAG < SRR4302543.2115184/94‑1 (MQ=60)
AAATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGT < SRR4302543.2313361/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTA > SRR4302543.7194860/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAT < SRR4302543.5985776/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAT < SRR4302543.3287473/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTAT < SRR4302543.4661783/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGCGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302543.3655501/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302543.5881489/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302543.2032165/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302543.2299237/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT < SRR4302543.544264/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATT > SRR4302543.280096/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTG < SRR4302543.5889325/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTG > SRR4302543.4397780/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTG < SRR4302543.6179469/94‑1 (MQ=60)
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GTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGG < SRR4302543.686513/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGG < SRR4302543.4158997/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGG < SRR4302543.594964/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCT < SRR4302543.260080/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCT < SRR4302543.1591601/94‑1 (MQ=60)
|
CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCT > NC_000913/4347924‑4348110
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
