Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,387,542 |
A→G |
F133L (TTT→CTT) |
psd ← |
phosphatidylserine decarboxylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,387,542 | 0 | A | G | 99.5%
| 662.9
/ ‑4.9
| 214 | F133L (TTT→CTT) | psd | phosphatidylserine decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (105/108); total (106/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.05e-01 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAACGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTT > NC_000913/4387452‑4387631
|
ccGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTAc > 1:2613540/1‑93 (MQ=255)
ggCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCg < 2:2716871/93‑1 (MQ=255)
ggCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCg > 2:453703/1‑93 (MQ=255)
gCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGt > 2:447269/1‑93 (MQ=255)
cACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGtt < 1:2946806/93‑1 (MQ=255)
cGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGc > 1:1166723/1‑93 (MQ=255)
tAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCgg > 2:1338198/1‑93 (MQ=255)
gATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGaa < 2:3770317/93‑1 (MQ=255)
gATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGT‑‑CAAGCGTACCGTTGCGGAACa < 1:788202/93‑1 (MQ=255)
atcatcTCACGCAGAATACCGTTGCACGTCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAAc < 2:4324577/93‑1 (MQ=255)
tcatcTCACGCAGAATACCGTTGCACGTCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGACAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTGGCGGAACa < 2:4563184/93‑1 (MQ=255)
tcatcTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACa > 2:706901/1‑93 (MQ=255)
tcatcTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACa > 1:2785566/1‑93 (MQ=255)
catcTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAg < 2:3122525/93‑1 (MQ=255)
atcTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACCgg > 2:3665885/1‑93 (MQ=255)
atcTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAgg < 2:2210175/93‑1 (MQ=255)
tctcACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGt < 2:4133454/93‑1 (MQ=255)
ctcACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGCGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTc > 1:1401181/1‑93 (MQ=255)
cGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGcc > 2:4348783/1‑93 (MQ=255)
cGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGcc < 1:885574/93‑1 (MQ=255)
gCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCa < 1:1582987/93‑1 (MQ=255)
cAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCAt > 1:4404622/1‑93 (MQ=255)
gAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACACGCGTACAGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCa > 2:391719/1‑93 (MQ=255)
gAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCa > 1:2368327/1‑93 (MQ=255)
tACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGCCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGAt > 1:3232660/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATa < 1:3577634/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAg < 1:1091278/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAg < 2:786214/93‑1 (MQ=255)
cGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGt > 1:3189853/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGt < 1:2341212/93‑1 (MQ=255)
gTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGtt > 1:3111988/1‑93 (MQ=255)
gTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGtt > 2:1266793/1‑93 (MQ=255)
tGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgc < 2:2913039/93‑1 (MQ=255)
gCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcc < 2:1816846/93‑1 (MQ=255)
gCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcc < 2:8694/93‑1 (MQ=255)
gCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcc < 1:3879651/93‑1 (MQ=255)
cACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcct < 2:2728898/93‑1 (MQ=255)
cACGGCATGTGTACGCGGTGGGAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTCCCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcct < 2:340013/93‑1 (MQ=255)
cGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGCTAGTtgcctgc > 2:586815/1‑93 (MQ=255)
ggCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTtgcctgcc < 2:3287175/93‑1 (MQ=255)
gCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCca < 2:1533686/93‑1 (MQ=255)
tgtgTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCcagca > 1:1561506/1‑93 (MQ=255)
tgtgTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCcagca > 1:3675588/1‑93 (MQ=255)
tgtgTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCcagca > 2:3373351/1‑93 (MQ=255)
tgtgTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCATACcagca > 2:392950/1‑93 (MQ=255)
agtgtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCcagca > 1:4424019/2‑93 (MQ=255)
gtgtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCcagcag < 1:1873022/93‑1 (MQ=255)
tgtACGCGGTGGTAGTCACTCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAgg > 2:4576855/1‑93 (MQ=255)
tgtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAgg < 2:3702433/93‑1 (MQ=255)
tgtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAgg < 2:191527/93‑1 (MQ=255)
tgtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAgg > 1:741217/1‑93 (MQ=255)
ggtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAgg < 1:4310861/92‑1 (MQ=255)
gtACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAggg < 1:2418759/93‑1 (MQ=255)
tACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGc < 2:278039/93‑1 (MQ=255)
tACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGc > 1:2018317/1‑93 (MQ=255)
tACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGc < 1:2675408/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCtt < 1:977481/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTc < 2:2410328/93‑1 (MQ=255)
cgGTGGTAGTCACGCGGGGATAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCg > 2:2666056/1‑93 (MQ=255)
cgGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCg > 1:4042075/1‑93 (MQ=255)
gtggtAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAg < 1:565651/93‑1 (MQ=255)
ggtAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGc < 2:347776/93‑1 (MQ=255)
ggtAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGc < 2:3715144/93‑1 (MQ=255)
ggtAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGc < 2:1404478/93‑1 (MQ=255)
gtAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCt > 1:4251875/1‑93 (MQ=255)
tAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTg < 2:3173847/93‑1 (MQ=255)
gTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTa > 1:4143813/1‑93 (MQ=255)
gTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTa > 2:4622311/1‑93 (MQ=255)
gTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTa > 1:82543/1‑93 (MQ=255)
gTCACGCGGGGAGAGGGAAGTGGTCACAAGCGTTCCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTa < 1:2051005/93‑1 (MQ=255)
cACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGt < 2:4445280/93‑1 (MQ=255)
cACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGt < 1:718311/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtg < 1:2209400/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtg < 2:2106325/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtg < 1:1791271/93‑1 (MQ=255)
gcgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtgt > 2:350927/1‑93 (MQ=255)
gcgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtgt < 1:504322/93‑1 (MQ=255)
cgGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTtgtg < 1:2115328/93‑1 (MQ=255)
ggggAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTgg > 2:2267608/1‑93 (MQ=255)
gggAGAGGTAAGTGGTCACAAACGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGc > 2:3967725/1‑93 (MQ=255)
ggAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGcc < 2:2526476/93‑1 (MQ=255)
ggAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGGGGcc < 2:2423707/93‑1 (MQ=255)
gagaGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCt < 1:2852649/93‑1 (MQ=255)
gagaGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCt < 1:921773/93‑1 (MQ=255)
gagaGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCt > 1:346646/1‑93 (MQ=255)
agagGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCtt < 1:1188710/93‑1 (MQ=255)
gagGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCttt < 2:236354/93‑1 (MQ=255)
gagGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCttt > 1:672307/1‑93 (MQ=255)
gagGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCttt < 2:1157048/93‑1 (MQ=255)
agGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTg < 2:3531386/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTgg < 1:3015887/93‑1 (MQ=255)
gTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGc < 2:2241679/93‑1 (MQ=255)
gTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGc > 2:2473305/1‑93 (MQ=255)
gTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGc > 1:752090/1‑93 (MQ=255)
tAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATGGTGGCCTGCCAGCAGGGTTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCt < 2:2001698/93‑1 (MQ=255)
tAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCt > 1:4218425/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCtt < 2:3513735/93‑1 (MQ=255)
tGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCAATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGTTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCa < 2:2991551/93‑1 (MQ=255)
tCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGa > 1:2358829/1‑93 (MQ=255)
caAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGAttt > 2:1719084/1‑93 (MQ=255)
|
CGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAACGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTT > NC_000913/4387452‑4387631
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATCGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAACGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTATC > NC_000913/4387449‑4387635
|
GATCGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAG < SRR4302535.4517808/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGC < SRR4302535.1990264/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGC < SRR4302535.1822657/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTA > SRR4302535.978707/1‑94 (MQ=60)
CCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTAC > SRR4302535.2632285/1‑94 (MQ=60)
CCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTAC > SRR4302535.736948/1‑94 (MQ=60)
GGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGAAAGTGGTCACAACCGTACCGT > SRR4302535.213793/1‑94 (MQ=60)
GCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTT < SRR4302535.1738595/94‑1 (MQ=60)
CACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTG < SRR4302535.2875194/94‑1 (MQ=60)
CACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTG < SRR4302535.2967512/94‑1 (MQ=60)
CACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTG > SRR4302535.2378851/1‑94 (MQ=60)
ACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGC > SRR4302535.1175054/1‑94 (MQ=60)
ACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTCC > SRR4302535.1502741/1‑94 (MQ=60)
GATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGT‑‑CAAGCGTACCGTTGCGGAACAG < SRR4302535.793736/94‑1 (MQ=60)
ATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACA > SRR4302535.3676805/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACA > SRR4302535.4138268/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACA > SRR4302535.3313557/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACA > SRR4302535.2805388/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACA > SRR4302535.4446093/1‑94 (MQ=60)
CATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGG < SRR4302535.872440/94‑1 (MQ=60)
CATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGG > SRR4302535.727492/1‑94 (MQ=60)
CATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGG > SRR4302535.400956/1‑94 (MQ=60)
ATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGT > SRR4302535.3842351/1‑94 (MQ=60)
TCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGCGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTC > SRR4302535.1411181/1‑94 (MQ=60)
TCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTC < SRR4302535.4250308/94‑1 (MQ=60)
CTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCC > SRR4302535.2054860/1‑94 (MQ=60)
CTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCC < SRR4302535.782809/94‑1 (MQ=60)
CTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCC > SRR4302535.1581604/1‑94 (MQ=60)
CTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCC > SRR4302535.423887/1‑94 (MQ=60)
TCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCG > SRR4302535.539392/1‑94 (MQ=60)
TCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCG > SRR4302535.703626/1‑94 (MQ=60)
CACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGC > SRR4302535.2979332/1‑94 (MQ=60)
CACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGC > SRR4302535.2435889/1‑94 (MQ=60)
CGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCA < SRR4302535.891840/94‑1 (MQ=60)
CGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCA < SRR4302535.3576994/94‑1 (MQ=60)
GCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCAT < SRR4302535.1594412/94‑1 (MQ=60)
GCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCAT > SRR4302535.4434765/1‑94 (MQ=60)
AGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCA > SRR4302535.3243744/1‑94 (MQ=60)
AGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCA > SRR4302535.2385330/1‑94 (MQ=60)
GAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAG > SRR4302535.2846079/1‑94 (MQ=60)
GAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAG > SRR4302535.1104545/1‑94 (MQ=60)
AATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGA > SRR4302535.237328/1‑94 (MQ=60)
ATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGAT > SRR4302535.4265845/1‑94 (MQ=60)
ATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGCCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGAT > SRR4302535.3255076/1‑94 (MQ=60)
TACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATA > SRR4302535.4391266/1‑94 (MQ=60)
TACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATA < SRR4302535.3229566/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATA < SRR4302535.1191393/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAG > SRR4302535.2774693/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAG < SRR4302535.924688/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAG < SRR4302535.3602436/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGT > SRR4302535.3211914/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGT < SRR4302535.1099055/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTT < SRR4302535.2357959/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTT > SRR4302535.3133651/1‑94 (MQ=60)
TGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCC < SRR4302535.2631337/94‑1 (MQ=60)
GCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCT < SRR4302535.2904043/94‑1 (MQ=60)
GCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCT < SRR4302535.3906282/94‑1 (MQ=60)
CACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTG > SRR4302535.2001207/1‑94 (MQ=60)
ACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGGCCGCCATCAGATAGTTGCGTGC > SRR4302535.850598/1‑94 (MQ=60)
ATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCA > SRR4302535.1572758/1‑94 (MQ=60)
ATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCA > SRR4302535.3701038/1‑94 (MQ=60)
AAGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCA > SRR4302535.4454318/1‑94 (MQ=60)
GTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGG > SRR4302535.746424/1‑94 (MQ=60)
GTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGG < SRR4302535.1886519/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGG < SRR4302535.4340351/94‑1 (MQ=60)
GTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGC < SRR4302535.2436173/94‑1 (MQ=60)
GTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGC > SRR4302535.2032860/1‑94 (MQ=60)
TACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCT < SRR4302535.2694550/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTC < SRR4302535.984424/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCG > SRR4302535.4069747/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAG > SRR4302535.2613554/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAG > SRR4302535.3884567/1‑94 (MQ=60)
GTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGG < SRR4302535.569613/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGC > SRR4302535.754393/1‑94 (MQ=60)
GGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCT < SRR4302535.4662642/94‑1 (MQ=60)
GGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCT > SRR4302535.4281010/1‑94 (MQ=60)
AGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTA > SRR4302535.4172188/1‑94 (MQ=60)
AGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTA > SRR4302535.83128/1‑94 (MQ=60)
GTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAG > SRR4302535.1384022/1‑94 (MQ=60)
GTCACGCGGGGAGAGGGAAGTGGTCACAAGCGTTCCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAG < SRR4302535.2065775/94‑1 (MQ=60)
CACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTT < SRR4302535.723358/94‑1 (MQ=60)
CACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTT > SRR4302535.669501/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGT < SRR4302535.1804224/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGT < SRR4302535.2225137/94‑1 (MQ=60)
GCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTG < SRR4302535.507847/94‑1 (MQ=60)
CGGGGATAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGG < SRR4302535.2675562/94‑1 (MQ=60)
CGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGG < SRR4302535.805040/94‑1 (MQ=60)
CGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGG < SRR4302535.2130596/94‑1 (MQ=60)
GGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGC < SRR4302535.3082717/94‑1 (MQ=60)
GGGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCC > SRR4302535.1941400/1‑94 (MQ=60)
GGAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCT > SRR4302535.349034/1‑94 (MQ=60)
GAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTT < SRR4302535.928309/94‑1 (MQ=60)
GAGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTT < SRR4302535.2872859/94‑1 (MQ=60)
AGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTT > SRR4302535.676999/1‑94 (MQ=60)
AGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTT > SRR4302535.2318263/1‑94 (MQ=60)
AGAGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTT < SRR4302535.1197223/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGG < SRR4302535.1555023/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGG > SRR4302535.2071066/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGC < SRR4302535.3037020/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGC > SRR4302535.2244050/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGC > SRR4302535.757384/1‑94 (MQ=60)
GTAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCT > SRR4302535.4247292/1‑94 (MQ=60)
TAAGTGGTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTT > SRR4302535.3158705/1‑94 (MQ=60)
GTCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGA > SRR4302535.2375753/1‑94 (MQ=60)
TCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGAT < SRR4302535.4316456/94‑1 (MQ=60)
TCACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGAT < SRR4302535.4587748/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTT > SRR4302535.1838159/1‑94 (MQ=60)
AGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTAT < SRR4302535.3995614/94‑1 (MQ=60)
AGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTAT > SRR4302535.3694689/1‑94 (MQ=60)
AGCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTAT < SRR4302535.3995615/94‑1 (MQ=60)
GCGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTATC < SRR4302535.1561648/94‑1 (MQ=60)
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GATCGCCCGGCACGTAGATCATCTCACGCAGAATACCGTTGCACGGCATGTGTACGCGGTGGTAGTCACGCGGGGAGAGGTAAGTGGTCACAAACGTACCGTTGCGGAACAGGTCCGCCATCAGATAGTTGCCTGCCAGCAGGGCTTCGAGGCTGTAGTTGTGGCCTTTGGCTTGCAGGATTTTATC > NC_000913/4387449‑4387635
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
