Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,431,925 |
A→G |
I79V (ATC→GTC) |
b4212 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,431,925 | 0 | A | G | 98.6%
| 658.3
/ ‑2.8
| 217 | I79V (ATC→GTC) | b4212 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (120/93); total (122/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
gCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcg > 1:2720304/1‑93 (MQ=255)
gCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGGGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcg > 1:2400746/1‑93 (MQ=255)
gACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGCcgcg > 2:346451/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATc < 1:1895572/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATc > 2:2141863/1‑93 (MQ=255)
gcggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTCAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATcc > 2:3830739/1‑93 (MQ=255)
ggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCgg < 2:3386601/93‑1 (MQ=255)
gcgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggt > 1:3132228/1‑93 (MQ=255)
gcgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggt < 1:1140475/93‑1 (MQ=255)
gcgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggt < 1:1775584/93‑1 (MQ=255)
cgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggtg < 2:1390515/93‑1 (MQ=255)
gcAAAATCGGTGTGGTGAGTAAAAAGATGCTTGCTCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggtgg < 2:1935463/93‑1 (MQ=255)
cAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggtggt > 1:3393261/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgc < 2:230106/93‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgc > 2:1275348/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccg > 2:389161/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccgc < 1:3931963/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccgc > 1:2057098/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccgcc > 1:755292/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGGGCCGCCGCa > 1:4173673/1‑93 (MQ=255)
ggggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAt < 1:3771830/93‑1 (MQ=255)
ggggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAt < 2:3244293/93‑1 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg > 2:2332847/1‑93 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg < 1:1038294/93‑1 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg > 2:4379606/1‑93 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg > 1:295365/1‑93 (MQ=255)
gtgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtgtg < 2:1118303/93‑1 (MQ=255)
gtgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtgtg > 1:1169358/1‑93 (MQ=255)
gtgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtgtg < 1:302140/93‑1 (MQ=255)
gagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGa < 1:2530571/93‑1 (MQ=255)
agtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGaa < 1:861027/93‑1 (MQ=255)
agcgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGaa < 2:3737824/90‑1 (MQ=255)
gaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAatat > 2:4024796/1‑93 (MQ=255)
gaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAatat > 2:2699481/1‑93 (MQ=255)
aaaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTCTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAtata < 2:3549215/93‑1 (MQ=255)
aaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGc > 1:1306996/1‑93 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAgac > 1:327871/1‑91 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGcc > 2:1785944/1‑93 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGcc < 1:3344060/93‑1 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGTAATATAGCCt > 1:4358530/1‑93 (MQ=255)
aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTc < 1:4607513/93‑1 (MQ=255)
aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTc > 1:21569/1‑93 (MQ=255)
aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTc > 1:4285474/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCa < 2:709111/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCGGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgc > 2:2161440/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgc > 1:1209024/1‑93 (MQ=255)
gcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCt > 1:162385/1‑93 (MQ=255)
aGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTgg > 1:2374024/1‑93 (MQ=255)
aGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTgg < 2:458602/93‑1 (MQ=255)
tCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGc > 2:2947140/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 1:2104896/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 1:597257/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 1:3468852/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 2:520982/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 2:2021158/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 2:1952770/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 1:3513423/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 2:1640345/1‑93 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCCGGGCGAGc < 2:4572811/93‑1 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc > 1:1326796/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa < 1:4441024/93‑1 (MQ=255)
gtcGTAAGATCAGGATGGTTTTCTTAATCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGt < 2:4673988/91‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAggg > 1:562510/1‑92 (MQ=255)
cGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGa > 2:1850259/1‑93 (MQ=255)
gTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGACTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAg > 1:3544010/1‑93 (MQ=255)
gTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGGGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAg > 2:1232460/1‑93 (MQ=255)
gAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaa > 1:2822200/1‑93 (MQ=255)
gAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaa > 2:1103054/1‑93 (MQ=255)
aaCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaa > 1:2771004/1‑93 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaaa > 2:1908166/1‑93 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaaa < 2:569234/93‑1 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaaa > 2:2690520/1‑93 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGCCGAGCAGGGGAGCGaaaa > 1:1263704/1‑93 (MQ=255)
aCAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGCAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaaaa > 1:95854/1‑93 (MQ=255)
cAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAg < 2:3094004/93‑1 (MQ=255)
aGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAgg < 2:1306589/93‑1 (MQ=255)
aGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAgg < 2:3625942/93‑1 (MQ=255)
aGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAgg < 1:3980371/93‑1 (MQ=255)
aGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGCGAGCGAAAAgg > 2:144846/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGtt < 1:4627030/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGtt < 1:3840584/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtg > 2:4113507/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtg < 2:733107/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtg > 2:2418177/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtg < 1:324758/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtg > 1:2496315/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgc < 2:2846233/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgc < 2:59311/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgc > 1:298839/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgc < 2:4418428/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgc > 1:2917091/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTAACGGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctgc < 2:4072367/93‑1 (MQ=255)
tttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCa < 1:1068986/93‑1 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAc < 1:30962/93‑1 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAc > 2:283261/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTg > 2:2588605/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg > 1:2026958/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCgg > 1:1515531/1‑93 (MQ=255)
ccGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCggc > 1:2662063/1‑92 (MQ=255)
cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAc < 1:21991/93‑1 (MQ=255)
|
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
|
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG < SRR4302535.3806951/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG < SRR4302535.2093864/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCAACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG > SRR4302535.3087097/1‑94 (MQ=60)
TTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGT > SRR4302535.2515868/1‑94 (MQ=60)
TAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTC > SRR4302535.2721877/1‑94 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG < SRR4302535.3185690/94‑1 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG > SRR4302535.2739737/1‑94 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGGGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG > SRR4302535.2418013/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCG < SRR4302535.1613918/94‑1 (MQ=60)
GACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGT > SRR4302535.538547/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTT > SRR4302535.3957601/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT < SRR4302535.2990710/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT > SRR4302535.632727/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCC > SRR4302535.567809/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCC < SRR4302535.1909211/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT < SRR4302535.2198829/94‑1 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT > SRR4302535.3154042/1‑94 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302535.2961126/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302535.4322782/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302535.1148600/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302535.1788443/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGT > SRR4302535.3416870/1‑94 (MQ=60)
CAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTG < SRR4302535.3092543/94‑1 (MQ=60)
AAATCGGTGGGGGGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCC > SRR4302535.2541867/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGC > SRR4302535.2071917/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCC < SRR4302535.3958804/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCC > SRR4302535.760611/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGGGCCGCCGCA > SRR4302535.4202240/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG < SRR4302535.4581339/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG > SRR4302535.297425/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG < SRR4302535.3797850/94‑1 (MQ=60)
GGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGT < SRR4302535.1045667/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTG > SRR4302535.1177708/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGG < SRR4302535.304244/94‑1 (MQ=60)
TGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGA > SRR4302535.1591543/1‑94 (MQ=60)
GAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAA < SRR4302535.2329278/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAA < SRR4302535.2548808/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAT < SRR4302535.867109/94‑1 (MQ=60)
TGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATAT < SRR4302535.3044515/94‑1 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACGGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATA < SRR4302535.3865922/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302535.3551458/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG < SRR4302535.621085/94‑1 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGC > SRR4302535.1316331/1‑94 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGC > SRR4302535.3014751/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGGC > SRR4302535.2870888/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC > SRR4302535.1230315/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGAC > SRR4302535.330145/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGTAATATAGCCT > SRR4302535.4388368/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT < SRR4302535.3367356/94‑1 (MQ=60)
GATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTC > SRR4302535.4314791/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTC > SRR4302535.21728/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA < SRR4302535.4638825/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAC < SRR4302535.778229/94‑1 (MQ=60)
CTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGC > SRR4302535.1217712/1‑94 (MQ=60)
CTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGC > SRR4302535.2926913/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCC < SRR4302535.3400814/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCT > SRR4302535.163517/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG > SRR4302535.2391078/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302535.2077776/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302535.3671770/94‑1 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302535.2120077/1‑94 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302535.3492957/1‑94 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302535.601439/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302535.3537837/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302535.1980698/1‑94 (MQ=60)
TTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGC > SRR4302535.1336266/1‑94 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302535.4471472/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG > SRR4302535.2395877/1‑94 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302535.4140670/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGG < SRR4302535.460749/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGG > SRR4302535.1398160/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGG < SRR4302535.2570324/94‑1 (MQ=60)
AGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGG > SRR4302535.566443/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCCCTGGGCGAGCcggg > SRR4302535.465185/1‑90 (MQ=60)
GGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTG > SRR4302535.132902/1‑94 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302535.3152244/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302535.2435177/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGACTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG > SRR4302535.3568625/1‑94 (MQ=60)
CGTTAGAACAGCATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAG < SRR4302535.2749880/94‑1 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGC > SRR4302535.2562157/1‑94 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGC < SRR4302535.963557/94‑1 (MQ=60)
GTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGC > SRR4302535.4223683/1‑94 (MQ=60)
TTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCG < SRR4302535.3385033/94‑1 (MQ=60)
AGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAA > SRR4302535.2842237/1‑94 (MQ=60)
AGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAA < SRR4302535.1296173/94‑1 (MQ=60)
AGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCAGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAA < SRR4302535.216863/94‑1 (MQ=60)
GAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAA > SRR4302535.2790736/1‑94 (MQ=60)
AACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAA < SRR4302535.3506110/94‑1 (MQ=60)
AACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAA > SRR4302535.164272/1‑94 (MQ=60)
AACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGCCGAGCAGGGGAGCGAAAA > SRR4302535.1272745/1‑94 (MQ=60)
AACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGCAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAA > SRR4302535.96535/1‑94 (MQ=60)
ACAGTATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGCGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302535.2386354/94‑1 (MQ=60)
ACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302535.993863/94‑1 (MQ=60)
ACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAG < SRR4302535.1071769/94‑1 (MQ=60)
CAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGG < SRR4302535.3987539/94‑1 (MQ=60)
CAGGATGGTTTTATTAACCGTGTCGCGGATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGG < SRR4302535.1126020/94‑1 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT < SRR4302535.4007565/94‑1 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT < SRR4302535.1182798/94‑1 (MQ=60)
AGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCACATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGT > SRR4302535.3323489/1‑94 (MQ=60)
GGATGGTTTTCTTACCCGTGTGGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTT < SRR4302535.2806175/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTT < SRR4302535.3470135/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTT > SRR4302535.4412303/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG > SRR4302535.3285169/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG > SRR4302535.2514323/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG < SRR4302535.4658442/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG < SRR4302535.3867048/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTG < SRR4302535.2064449/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC < SRR4302535.327005/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC > SRR4302535.4050454/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC > SRR4302535.300921/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGC > SRR4302535.2937683/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTG > SRR4302535.1245200/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAC < SRR4302535.1076586/94‑1 (MQ=60)
TTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACT < SRR4302535.31201/94‑1 (MQ=60)
TTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACT > SRR4302535.2058011/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACT < SRR4302535.3139447/94‑1 (MQ=60)
CTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGG > SRR4302535.2041563/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGG > SRR4302535.3656736/1‑94 (MQ=60)
TTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGC < SRR4302535.1170783/94‑1 (MQ=60)
AACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGG > SRR4302535.1526449/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGC > SRR4302535.2681126/1‑94 (MQ=60)
CGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACT > SRR4302535.2464845/1‑94 (MQ=60)
CGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACT > SRR4302535.4564019/1‑94 (MQ=60)
CGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACT > SRR4302535.3750901/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACT < SRR4302535.22155/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTG < SRR4302535.33772/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGG > SRR4302535.2086189/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGG > SRR4302535.309677/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > SRR4302535.152841/1‑94 (MQ=60)
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TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
