Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,431,925 |
A→G |
I79V (ATC→GTC) |
b4212 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,431,925 | 0 | A | G | 99.7%
| 1135.0
/ ‑5.7
| 365 | I79V (ATC→GTC) | b4212 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (180/184); total (180/185) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
gCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcg < 2:6868355/93‑1 (MQ=255)
cGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcgc < 1:5677676/93‑1 (MQ=255)
gACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcgcg > 2:3591266/1‑93 (MQ=255)
gACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTcgcg > 2:6288259/1‑93 (MQ=255)
aCCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGt > 2:2031865/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATc < 2:4521385/93‑1 (MQ=255)
gcggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATcc < 1:2375881/93‑1 (MQ=255)
cggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCg > 2:7395989/1‑93 (MQ=255)
ggcgCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCgg < 2:5100752/93‑1 (MQ=255)
gcgcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggt < 2:139014/93‑1 (MQ=255)
gcAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCggtgg < 2:1752015/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTGGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccgc < 1:5942197/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTgccgc > 1:7070855/1‑93 (MQ=255)
ggTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGccgccg > 1:1088970/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCa < 1:6670058/93‑1 (MQ=255)
gggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtg > 2:7571394/1‑93 (MQ=255)
ggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAtgt > 2:4746632/1‑93 (MQ=255)
tgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTgg > 1:6967500/1‑93 (MQ=255)
tgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTgg > 2:2416099/1‑93 (MQ=255)
gagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGa > 2:3618259/1‑93 (MQ=255)
agtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGaa < 1:5486135/93‑1 (MQ=255)
gtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGGGGTAGAACAGGATGGTTGTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGGGGTGCCGCCGCATGTGCaag > 1:5261568/1‑92 (MQ=255)
tgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAata < 1:5134487/93‑1 (MQ=255)
gaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAatat < 1:7263533/93‑1 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 2:53887/1‑93 (MQ=255)
aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAg > 2:55912/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGc > 1:2197822/1‑93 (MQ=255)
aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGcc < 2:1487328/93‑1 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt > 1:2910063/1‑93 (MQ=255)
gATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCt > 1:6388455/1‑93 (MQ=255)
aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTc > 2:1137609/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCa > 2:6057709/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCa > 2:6171353/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCa > 2:7281119/1‑93 (MQ=255)
tcTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGAGTGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAGCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAc < 1:7622635/92‑1 (MQ=255)
gCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAc < 1:3940430/93‑1 (MQ=255)
gCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAc < 2:5448806/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgc < 2:5959165/93‑1 (MQ=255)
tGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgcc < 1:1714534/93‑1 (MQ=255)
tGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGAGGGCTTTCTTAACCGAGTCGCGTATCCGGTGTTGCCGCCGCATGTGAAATAAAGCCTCGcgcc < 2:7438623/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccgc < 2:1865959/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccgc < 2:5179215/93‑1 (MQ=255)
cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccgc > 2:4168269/1‑93 (MQ=255)
cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccgc > 1:5258355/1‑93 (MQ=255)
gcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAcgccgcg > 1:825634/1‑92 (MQ=255)
gcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCt < 1:6606081/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTg > 1:7173231/1‑93 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg < 1:4302999/93‑1 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg > 1:1486559/1‑93 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTGAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTggg < 1:3420615/93‑1 (MQ=255)
gTCGTTACAGGCGGTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCAGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTACAGCCGCTggg > 2:7748955/1‑93 (MQ=255)
tCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGc < 1:4682687/93‑1 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 1:3237757/1‑93 (MQ=255)
gTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGa > 1:3373540/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 2:1612798/1‑93 (MQ=255)
ttACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAg > 1:1868701/1‑93 (MQ=255)
tACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGc > 1:3824010/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa > 1:6212712/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa > 1:4944366/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCa < 2:5862044/93‑1 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg > 2:4877324/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg > 2:6426172/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg < 1:2646919/93‑1 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg < 1:5738363/93‑1 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg > 1:6804146/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg > 1:7579691/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAgg < 2:6476871/93‑1 (MQ=255)
gCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTg < 2:2485359/93‑1 (MQ=255)
gCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTg > 2:6696238/1‑93 (MQ=255)
gCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTg > 2:3151856/1‑93 (MQ=255)
cGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTgg > 2:403866/1‑92 (MQ=255)
gTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAg > 2:375125/1‑93 (MQ=255)
ttAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGc < 2:5722732/93‑1 (MQ=255)
aGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGa > 2:381151/1‑93 (MQ=255)
aGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGa < 1:7440352/93‑1 (MQ=255)
gAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGaa > 1:4220668/1‑93 (MQ=255)
aGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAgg > 1:583991/1‑93 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt < 2:2326863/93‑1 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt < 2:1830258/93‑1 (MQ=255)
ggATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGt < 2:1023991/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGtt < 1:530537/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGtt > 2:1201262/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGGGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGGtg > 2:1579795/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctgc < 1:2839108/93‑1 (MQ=255)
ttttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctgc > 1:2560262/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTtgctgc > 2:7720959/1‑93 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCAc > 2:2941361/1‑93 (MQ=255)
tCTTATCCGTGTCGCGTATCGGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACt < 2:2804618/93‑1 (MQ=255)
tCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACt > 2:7925105/1‑93 (MQ=255)
tCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACt > 1:2476640/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTg < 1:6052467/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg > 1:3524971/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg > 1:2078731/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTgg > 1:1319960/1‑93 (MQ=255)
aaCCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCg > 2:425631/1‑93 (MQ=255)
aaCCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACAGGCg < 1:3639763/93‑1 (MQ=255)
aCCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCgg > 2:7476219/1‑93 (MQ=255)
ccGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGa < 2:5278896/93‑1 (MQ=255)
cGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAc > 1:7803841/1‑93 (MQ=255)
cGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAc < 1:2279224/93‑1 (MQ=255)
|
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAC > NC_000913/4431835‑4432014
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
|
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTG > SRR4302543.7145488/1‑94 (MQ=60)
gggggcggggggaaaagaggggggggggggaagaaaaaagtgttttgggcgttttGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGT < SRR4302543.6447377/39‑1 (MQ=60)
TTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGT < SRR4302543.2833308/94‑1 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG < SRR4302543.6408387/94‑1 (MQ=60)
AGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCG < SRR4302543.2016348/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCG > SRR4302543.4894935/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCG < SRR4302543.5204000/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCG < SRR4302543.5729503/94‑1 (MQ=60)
GACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGT > SRR4302543.703192/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT < SRR4302543.23997/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT < SRR4302543.3223977/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAT > SRR4302543.7139622/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCC < SRR4302543.2443133/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCC < SRR4302543.3432043/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCC < SRR4302543.612019/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCG < SRR4302543.2397405/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGG > SRR4302543.535291/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGG > SRR4302543.7573666/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT > SRR4302543.6677043/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAAAATCGGAGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT > SRR4302543.7039226/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAAAAGCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGT < SRR4302543.5770761/94‑1 (MQ=60)
GCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302543.5976052/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTG < SRR4302543.4778832/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGT < SRR4302543.5084862/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGT < SRR4302543.6634111/94‑1 (MQ=60)
CAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTG < SRR4302543.7582865/94‑1 (MQ=60)
AATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCG > SRR4302543.1910368/1‑94 (MQ=60)
AATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCG > SRR4302543.3923605/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGC > SRR4302543.7139513/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGC > SRR4302543.7313538/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTGGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCC < SRR4302543.5996572/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCG > SRR4302543.1098758/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCAT < SRR4302543.6733034/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG > SRR4302543.7669202/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG > SRR4302543.7194408/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATG < SRR4302543.2185387/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTG < SRR4302543.3117451/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTG < SRR4302543.3500392/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTG > SRR4302543.5837784/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGG < SRR4302543.3745055/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGG < SRR4302543.7794466/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGG > SRR4302543.7033067/1‑94 (MQ=60)
TGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGA > SRR4302543.4384942/1‑94 (MQ=60)
TGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGA < SRR4302543.1368861/94‑1 (MQ=60)
TGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGCGGTGCCGCCGCATGTGGG > SRR4302543.2871776/1‑94 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGGGGTAGAACAGGATGGTTGTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGGGGTGCCGCCGCATGTGcaag > SRR4302543.5309035/1‑90 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAT < SRR4302543.7446828/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAT < SRR4302543.5535873/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAT > SRR4302543.5309034/1‑94 (MQ=60)
AGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAAT < SRR4302543.2119093/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATA > SRR4302543.3285167/1‑94 (MQ=60)
GTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATA > SRR4302543.3529050/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATAT < SRR4302543.1805235/94‑1 (MQ=60)
TGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATAT < SRR4302543.5180898/94‑1 (MQ=60)
TGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATAT > SRR4302543.1346251/1‑94 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTGCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCCTGTGGAATATA > SRR4302543.1360209/1‑94 (MQ=60)
GAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATA < SRR4302543.7333712/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302543.6877749/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302543.70689/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG < SRR4302543.4307419/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAG > SRR4302543.7685755/1‑94 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATTGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGC < SRR4302543.6998110/94‑1 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGCATATAGC > SRR4302543.3453282/1‑94 (MQ=60)
AAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGC > SRR4302543.2217583/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC > SRR4302543.3352623/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC < SRR4302543.6739675/94‑1 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC > SRR4302543.2251540/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCC > SRR4302543.6960489/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT > SRR4302543.6448588/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCT > SRR4302543.2936510/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTC > SRR4302543.6863223/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA < SRR4302543.5007644/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA > SRR4302543.6255610/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA > SRR4302543.7165973/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA < SRR4302543.3895228/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA > SRR4302543.234653/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA < SRR4302543.3565433/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA > SRR4302543.1260774/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGATTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCA > SRR4302543.2384468/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAC < SRR4302543.2740843/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAC < SRR4302543.2513772/94‑1 (MQ=60)
TCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGAGTGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTAGCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG < SRR4302543.7694977/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG < SRR4302543.5750569/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG < SRR4302543.3975269/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG < SRR4302543.1256659/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACG < SRR4302543.3975268/94‑1 (MQ=60)
CTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCAAGC > SRR4302543.1768985/1‑94 (MQ=60)
TGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCG < SRR4302543.1729858/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCCCGCCGG > SRR4302543.5306045/1‑94 (MQ=60)
GCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGC > SRR4302543.5305776/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCT < SRR4302543.4568244/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCG > SRR4302543.832910/1‑94 (MQ=60)
GCAGTGCTTACACGCCTTAGAACAGGATGGTTGTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTG < SRR4302543.2237169/94‑1 (MQ=60)
GCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTG < SRR4302543.6668342/94‑1 (MQ=60)
GCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTG > SRR4302543.7242874/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG > SRR4302543.2749320/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGG > SRR4302543.6662226/1‑94 (MQ=60)
cgtacTTACAGGCGTTAGAACCGGGAGGTTTTCTTTACCGTGTCACCTAACCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG < SRR4302543.403501/89‑1 (MQ=55)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG < SRR4302543.5686609/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302543.5912992/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302543.5703365/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGG > SRR4302543.1499934/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302543.4342092/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302543.6673560/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302543.7860308/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC > SRR4302543.2092979/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTGAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302543.3451226/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTACAGGCGTGAGGACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGC < SRR4302543.6673562/94‑1 (MQ=60)
TCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCG < SRR4302543.4725392/94‑1 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA < SRR4302543.7251032/94‑1 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302543.3267045/1‑94 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA < SRR4302543.7476349/94‑1 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302543.3403829/1‑94 (MQ=60)
CGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGA > SRR4302543.7303864/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302543.1885490/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302543.5326861/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302543.3661976/1‑94 (MQ=60)
GTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAG > SRR4302543.915515/1‑94 (MQ=60)
TTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCGTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGC < SRR4302543.6309917/94‑1 (MQ=60)
TTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGC > SRR4302543.3857738/1‑94 (MQ=60)
TACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCA > SRR4302543.6271371/1‑94 (MQ=60)
TACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCA > SRR4302543.4989394/1‑94 (MQ=60)
ACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTGTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAG < SRR4302543.843549/94‑1 (MQ=60)
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|
TTTAGCGACCTGCGGCGCAAAATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGA > NC_000913/4431832‑4432018
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
