Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,579,865 |
T→C |
S252G (AGC→GGC) |
hsdM ← |
DNA methylase M |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,579,865 | 0 | T | C | 99.4%
| 491.7
/ ‑4.8
| 162 | S252G (AGC→GGC) | hsdM | DNA methylase M |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (81/80); total (82/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.82e-01 |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA > NC_000913/4579775‑4579953
|
cAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAc < 1:1388259/93‑1 (MQ=255)
cAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAc < 2:2391887/93‑1 (MQ=255)
aaaaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAc < 1:1537824/92‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCCTCGCCAcc > 2:2252024/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCAACGTCGCCAcc > 1:275306/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAccc < 2:2707165/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAccc > 2:132434/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCa > 1:207653/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCa > 1:2672908/1‑93 (MQ=255)
cGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCagagag > 2:336660/1‑91 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt < 2:1906417/93‑1 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt > 1:438591/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt > 2:4379711/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt < 1:3669923/93‑1 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCCGAgtgt > 1:4021312/1‑93 (MQ=255)
ggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGtt < 2:467690/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGtt < 2:4025789/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGtt < 2:2950189/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGtt > 2:2971451/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCCCCCAGAGTGTTGc > 2:274372/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCCGAGGGTTGcc > 2:1010654/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGcc < 2:140304/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGccc > 1:259182/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGGCCAGa > 2:2344485/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 2:3249049/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACg > 1:3160047/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGa < 1:4316613/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGa < 2:3638711/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGCGCTGCCCAGACGGAtt > 2:3871520/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc < 1:2693172/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc > 2:3981154/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc < 2:1707682/93‑1 (MQ=255)
cggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 1:1441397/93‑1 (MQ=255)
ggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgcc > 1:3964200/1‑93 (MQ=255)
ggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGACCAGACGGAGTGcgcc > 1:1230647/1‑93 (MQ=255)
cgcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgccgc > 2:73272/1‑93 (MQ=255)
gcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCgccgcc < 1:4667743/93‑1 (MQ=255)
tGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGt > 1:1174202/1‑93 (MQ=255)
gCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTg < 2:163442/93‑1 (MQ=255)
ccAAACGGCGTGTTAGTGGCTACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTgg < 2:4468452/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCTGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt < 1:921899/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt < 2:2424186/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCg > 1:3467987/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGa < 1:4254518/93‑1 (MQ=255)
cggcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAg < 1:3297657/93‑1 (MQ=255)
cggcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAg > 1:1123497/1‑93 (MQ=255)
cggcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAg < 2:788504/93‑1 (MQ=255)
gcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGt < 2:4077917/93‑1 (MQ=255)
gcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGt < 2:891002/93‑1 (MQ=255)
cggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGTTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGtt < 2:4659318/93‑1 (MQ=255)
cggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGtt < 2:252221/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGGTTGAGCCCCCGTGGTCGAGGTTGcc > 1:665268/1‑93 (MQ=255)
ttAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCt < 1:4552824/93‑1 (MQ=255)
ttAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCt > 1:4144370/1‑93 (MQ=255)
ttAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCt > 2:1995983/1‑93 (MQ=255)
aGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTc < 1:18146/93‑1 (MQ=255)
gCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAata < 1:2080182/93‑1 (MQ=255)
gCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAata < 1:4064947/93‑1 (MQ=255)
gCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAata > 2:1869465/1‑93 (MQ=255)
gACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATc < 1:843515/93‑1 (MQ=255)
gACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATc < 2:4460786/93‑1 (MQ=255)
cAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGt > 1:4639921/1‑93 (MQ=255)
cAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGt < 1:624151/93‑1 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg > 1:856019/1‑93 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg > 1:3727118/1‑93 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg > 1:3302960/1‑93 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCCTg > 1:1049516/1‑93 (MQ=255)
atatGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgc > 1:2821277/1‑93 (MQ=255)
tatGCGCTTTCGGTAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCTGTGGTCGAGGTTGCCTTTAATATCGTgca < 2:606220/93‑1 (MQ=255)
tatGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgca > 1:1048476/1‑93 (MQ=255)
tatGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgca < 2:3985608/93‑1 (MQ=255)
aatGCGCCTTCGGCCGGTTTCCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGAATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgca < 2:2555218/92‑1 (MQ=255)
atGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcag < 1:2660164/93‑1 (MQ=255)
cgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGcagcag > 2:3456456/1‑93 (MQ=255)
gcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcagg > 1:1354371/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggc < 2:3929131/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggca < 1:4010891/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggcag < 2:1626378/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggcag > 1:2950908/1‑93 (MQ=255)
cGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGtt > 1:4106070/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtca > 2:3513601/1‑93 (MQ=255)
cAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcat < 2:1040014/93‑1 (MQ=255)
cAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcag > 1:4501519/1‑92 (MQ=255)
aGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatc > 2:2694368/1‑93 (MQ=255)
aGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatc < 1:1587180/93‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatc > 1:2028971/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCTTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGGAGGAGGGAGGtcatca > 2:4066618/1‑93 (MQ=255)
ggTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatca < 1:3269933/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGCGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGATCATCAg > 2:4177139/1‑93 (MQ=255)
ttttCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGt > 2:3591912/1‑93 (MQ=255)
ttttCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGt < 2:575092/93‑1 (MQ=255)
tttCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTg > 2:2940338/1‑93 (MQ=255)
tCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGcc < 2:3152048/93‑1 (MQ=255)
cACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCa < 1:3658197/93‑1 (MQ=255)
aCCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAg > 1:3011008/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAg > 1:4475310/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAg > 2:3110732/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAga < 2:2672908/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAgacg > 2:3191556/1‑93 (MQ=255)
tCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAgacga > 1:2369798/1‑93 (MQ=255)
|
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA > NC_000913/4579775‑4579953
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT > NC_000913/4579772‑4579958
|
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCC > SRR4302535.4634886/1‑94 (MQ=60)
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACC < SRR4302535.1398166/94‑1 (MQ=60)
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCAACGTCGCCACC > SRR4302535.277225/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACC < SRR4302535.1548905/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCA > SRR4302535.2692031/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCA > SRR4302535.209078/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGT > SRR4302535.441658/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCCGAGTGT > SRR4302535.4048827/1‑94 (MQ=60)
GGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTT < SRR4302535.3695338/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTG > SRR4302535.2707848/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTG < SRR4302535.1769108/94‑1 (MQ=60)
AATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCC > SRR4302535.260975/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACG < SRR4302535.3430470/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACG > SRR4302535.3181973/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGG < SRR4302535.3240866/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAT < SRR4302535.1185263/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAT < SRR4302535.4346142/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATT > SRR4302535.3692735/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGC < SRR4302535.2750264/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGC > SRR4302535.3781475/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCG < SRR4302535.2712419/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCC < SRR4302535.1415498/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCC > SRR4302535.3991280/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCC < SRR4302535.1451706/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGACCAGACGGAGTGCGCC > SRR4302535.1239445/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCG < SRR4302535.4699286/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGT > SRR4302535.1182584/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGT < SRR4302535.3309975/94‑1 (MQ=60)
GCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGG < SRR4302535.3037686/94‑1 (MQ=60)
GCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGG < SRR4302535.1364706/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCCGAGTGTTGCCCAGGCGGATTGCGCCGCCGTGGT > SRR4302535.4411642/1‑94 (MQ=60)
CCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGT < SRR4302535.857290/94‑1 (MQ=60)
CAAACGGCTGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTC < SRR4302535.928435/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCG > SRR4302535.3492087/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAG < SRR4302535.4283665/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAG > SRR4302535.1131514/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGG > SRR4302535.4525366/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGG < SRR4302535.3320585/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTT < SRR4302535.4018793/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTT < SRR4302535.2446674/94‑1 (MQ=60)
GGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGC > SRR4302535.2813874/1‑94 (MQ=60)
GGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGC > SRR4302535.1523707/1‑94 (MQ=60)
GGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGGTTGAGCCCCCGTGGTCGAGGTTGCC > SRR4302535.669912/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCT > SRR4302535.4172750/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCCCCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTT > SRR4302535.923517/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTT < SRR4302535.4583934/94‑1 (MQ=60)
TAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTC > SRR4302535.2978256/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCA < SRR4302535.18282/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCACCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCA > SRR4302535.4219497/1‑94 (MQ=60)
GCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATAT < SRR4302535.4092762/94‑1 (MQ=60)
GCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATAT < SRR4302535.2095170/94‑1 (MQ=60)
CGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATC < SRR4302535.3661798/94‑1 (MQ=60)
CGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATC < SRR4302535.2059696/94‑1 (MQ=60)
CGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATC > SRR4302535.796666/1‑94 (MQ=60)
GACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCG < SRR4302535.849442/94‑1 (MQ=60)
ACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGT > SRR4302535.4671383/1‑94 (MQ=60)
CAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTG > SRR4302535.3325928/1‑94 (MQ=60)
CAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTG < SRR4302535.628487/94‑1 (MQ=60)
CAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTG > SRR4302535.3752937/1‑94 (MQ=60)
CAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTG > SRR4302535.862053/1‑94 (MQ=60)
CAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCCTG > SRR4302535.1056981/1‑94 (MQ=60)
AATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGC > SRR4302535.2841313/1‑94 (MQ=60)
AATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGC > SRR4302535.4152998/1‑94 (MQ=60)
ATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCA < SRR4302535.1911536/94‑1 (MQ=60)
ATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCA > SRR4302535.1055913/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGC < SRR4302535.2679220/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGC > SRR4302535.478213/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGG < SRR4302535.4044294/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGG > SRR4302535.1364058/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGC > SRR4302535.1065813/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCA > SRR4302535.464726/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCA < SRR4302535.1167519/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAG > SRR4302535.2971637/1‑94 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAG < SRR4302535.4038329/94‑1 (MQ=60)
TCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTT > SRR4302535.4134185/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCT > SRR4302535.2289785/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCAT > SRR4302535.2648233/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCAG > SRR4302535.4532434/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATC > SRR4302535.2043596/1‑94 (MQ=60)
AGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCA < SRR4302535.1598634/94‑1 (MQ=60)
AGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCA < SRR4302535.4434244/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAG < SRR4302535.3292648/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGC < SRR4302535.4678744/94‑1 (MQ=60)
CACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAG > SRR4302535.4506017/1‑94 (MQ=60)
CACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAG > SRR4302535.3032102/1‑94 (MQ=60)
CACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAG > SRR4302535.412655/1‑94 (MQ=60)
CACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAG < SRR4302535.3683520/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA > SRR4302535.2386814/1‑94 (MQ=60)
CCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGG < SRR4302535.1141277/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT < SRR4302535.498116/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT < SRR4302535.3434120/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT > SRR4302535.176350/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGG > SRR4302535.3897020/1‑94 (MQ=60)
|
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT > NC_000913/4579772‑4579958
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
