Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,579,865 |
T→C |
S252G (AGC→GGC) |
hsdM ← |
DNA methylase M |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,579,865 | 0 | T | C | 100.0%
| 888.0
/ NA
| 289 | S252G (AGC→GGC) | hsdM | DNA methylase M |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (139/150); total (139/150) |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGAC > NC_000913/4579775‑4579954
|
cAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAc < 2:4328387/93‑1 (MQ=255)
cAAAGGTGCGGGCAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAc > 2:1875993/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCAcc > 2:3187115/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGGCAccc > 2:6233267/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAccc > 2:4840639/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCa > 2:1840753/1‑93 (MQ=255)
ggTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCag < 1:6103376/93‑1 (MQ=255)
tGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCagag > 2:7603894/1‑93 (MQ=255)
gCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgt < 1:116919/93‑1 (MQ=255)
cGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtg > 2:3250462/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAgtgt < 1:4288051/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGtt < 2:3002501/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGGGtt > 2:1593958/1‑93 (MQ=255)
gTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTg > 1:497433/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTGGTGCCCGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGGGACAATATGCGCCTTCAGCACATTTTCACCCTCGACACCCAGAAGGTTGc > 2:1090173/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGcc > 1:5642099/1‑93 (MQ=255)
aTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGccc < 2:881684/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAATGTTTCCCa > 1:3226798/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTGCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCa < 2:3684255/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 1:390763/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 1:1065519/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGa < 1:3115235/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCCCGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGAc < 1:594893/93‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACgg > 1:3725805/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGa < 1:2293741/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAt < 2:5672846/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc < 1:4567326/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgc > 1:4716262/1‑93 (MQ=255)
cggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 1:2176274/93‑1 (MQ=255)
cggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 1:7867034/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACCATATGCGCCTTCGGCCGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGCGTgcggcg > 2:7205569/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgccg > 1:7367962/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgccg > 1:5759049/1‑93 (MQ=255)
cgcTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGcgccgc > 2:4459505/1‑93 (MQ=255)
cTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGccgccg < 1:2654006/93‑1 (MQ=255)
cTGCCAAACGGCGGGTTAGCGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGccgccg < 2:1715669/93‑1 (MQ=255)
tGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGccgccgg > 2:4614120/1‑92 (MQ=255)
gCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTg > 1:2037967/1‑93 (MQ=255)
cAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt < 1:2376808/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt < 1:2479137/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt < 2:6331923/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGt > 2:2110028/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCg > 1:5739319/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGa < 1:1102669/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGa < 1:4413482/93‑1 (MQ=255)
ggcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAgg > 2:557521/1‑93 (MQ=255)
ggcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAgg < 2:1245106/93‑1 (MQ=255)
ggcggGTTAGTGGCAACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAgg < 2:7506266/93‑1 (MQ=255)
gcggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGt < 1:1753452/93‑1 (MQ=255)
cggGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGtt < 2:6789007/93‑1 (MQ=255)
gggTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTg < 2:6904919/93‑1 (MQ=255)
gggTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGGTg > 1:1271018/1‑93 (MQ=255)
gggTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGCTTTCACCGTCGCCACCCAGAGCGTTGCCCAGACGGATTGCGGCGCCGTGGTCGAGGTTg > 1:3012436/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGcc < 1:7547546/93‑1 (MQ=255)
aGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTc > 1:5278079/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCa > 2:3881707/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGCCGAGGTTGCCTTCa > 1:3681568/1‑93 (MQ=255)
tGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCaa < 2:6883614/93‑1 (MQ=255)
ggCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAat < 2:7332528/93‑1 (MQ=255)
ggCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAat > 1:2876956/1‑93 (MQ=255)
gCGACAATATGCGCCTTCGGGAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGTCGCCGTTGTCGAGGTTCCCTTCAata > 2:2283185/1‑93 (MQ=255)
cGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAatat < 2:3801046/93‑1 (MQ=255)
gACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATc > 1:4837516/1‑93 (MQ=255)
cAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGt < 1:968738/93‑1 (MQ=255)
cAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGt < 2:6228495/93‑1 (MQ=255)
cAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATGGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGt < 2:5768924/93‑1 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg < 2:6422155/93‑1 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg > 1:6957185/1‑93 (MQ=255)
aaTATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGACACCCAGAGTGTTGCCCAGAAGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTg > 2:5508914/1‑93 (MQ=255)
atatGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgc > 1:2548249/1‑93 (MQ=255)
tgtGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgca < 1:1610331/91‑1 (MQ=255)
tatGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgca > 2:4132267/1‑93 (MQ=255)
atGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcag > 2:4096003/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcagc > 2:6545135/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcagca < 2:1125043/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcagca > 2:5174393/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcagca < 1:5814807/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTgcagca < 1:6696785/93‑1 (MQ=255)
cgcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGcagcag < 2:826171/93‑1 (MQ=255)
gcCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCCGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcagg > 1:3346527/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggc > 1:7261432/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggc > 2:6057380/1‑93 (MQ=255)
cTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggca < 1:7717261/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggca > 1:1875277/1‑93 (MQ=255)
cTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcaggca < 1:4132268/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtc > 2:2197026/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTTTTCACCGTCGCCACCAAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtc < 2:5387822/93‑1 (MQ=255)
cAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcat < 2:4934903/93‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatc < 2:7793222/93‑1 (MQ=255)
ggTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTtcatca < 2:1374968/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAg < 1:4488626/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGACCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAg > 2:1339803/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGc > 1:1089826/1‑93 (MQ=255)
cACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGGCGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCa > 2:2387306/1‑93 (MQ=255)
cACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCa < 1:5566910/93‑1 (MQ=255)
cACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCa < 2:2623450/93‑1 (MQ=255)
aCCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAg > 2:2939179/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAga < 1:6386837/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAgacg < 1:6845084/93‑1 (MQ=255)
tCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAgacga > 2:5965927/1‑93 (MQ=255)
|
CAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGAC > NC_000913/4579775‑4579954
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT > NC_000913/4579772‑4579958
|
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCC > SRR4302543.990888/1‑94 (MQ=60)
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCC > SRR4302543.7640452/1‑94 (MQ=60)
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCC < SRR4302543.3141016/94‑1 (MQ=60)
GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCC < SRR4302543.3127550/94‑1 (MQ=60)
ACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCAC > SRR4302543.550539/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCC > SRR4302543.5738531/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCC > SRR4302543.4683957/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCC > SRR4302543.2568031/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCA > SRR4302543.1095320/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGA < SRR4302543.6161204/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAG > SRR4302543.1929819/1‑94 (MQ=60)
TGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGT < SRR4302543.3749036/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTG < SRR4302543.117976/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTG > SRR4302543.31957/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTG < SRR4302543.5813090/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTG < SRR4302543.2638009/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGT < SRR4302543.5067055/94‑1 (MQ=60)
GGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTT < SRR4302543.4327021/94‑1 (MQ=60)
GGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTT > SRR4302543.1980165/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTG > SRR4302543.502031/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGGTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGGTG > SRR4302543.109977/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCC > SRR4302543.5693535/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCCCCCAGAGTCTTGCCC > SRR4302543.2474573/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGGGTGTTGCCC > SRR4302543.5811337/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCC > SRR4302543.429078/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCA > SRR4302543.3255970/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGGTGCCCA > SRR4302543.2969421/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAATGTTTCCCA > SRR4302543.3255969/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGAC < SRR4302543.3143257/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGAC < SRR4302543.394370/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGAC < SRR4302543.1075097/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACG < SRR4302543.2275398/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCCCGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACG < SRR4302543.600351/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGG > SRR4302543.3758567/1‑94 (MQ=60)
GTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGGGTTGCCCAGACGGG > SRR4302543.1776759/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAT < SRR4302543.2282764/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAT < SRR4302543.2314666/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGGTAGGGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGCTTTCACCGTCGCCACCCAGAGCGTTGCCCAGACGGGT > SRR4302543.215736/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAT < SRR4302543.1664614/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATT < SRR4302543.7430466/94‑1 (MQ=60)
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CTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGC > SRR4302543.4759351/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCG < SRR4302543.664552/94‑1 (MQ=60)
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TGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTG > SRR4302543.5744590/1‑94 (MQ=60)
TGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGGGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTG > SRR4302543.5840058/1‑94 (MQ=60)
GCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGtttggccccccgggg > SRR4302543.6431322/1‑79 (MQ=60)
GCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGG < SRR4302543.7613609/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGT > SRR4302543.7955482/1‑94 (MQ=60)
CCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGT < SRR4302543.3736655/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGGTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGAGGCGCCGTGGT > SRR4302543.5896343/1‑94 (MQ=60)
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ACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAG < SRR4302543.1112608/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTT < SRR4302543.1769115/94‑1 (MQ=60)
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CGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGGTG > SRR4302543.1282370/1‑94 (MQ=60)
CGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGGTG > SRR4302543.2744608/1‑94 (MQ=60)
CGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGCTTTCACCGTCGCCACCCAGAGCGTTGCCCAGACGGATTGCGGCGCCGTGGTCGAGGTTG > SRR4302543.3039709/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCT < SRR4302543.7619446/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCT > SRR4302543.445645/1‑94 (MQ=60)
TAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTC > SRR4302543.5325703/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGCCGAGGTTGCCTTCA > SRR4302543.3713920/1‑94 (MQ=60)
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TGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAAT < SRR4302543.1984827/94‑1 (MQ=60)
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TGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAAT > SRR4302543.1473342/1‑94 (MQ=60)
GGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATA < SRR4302543.7914383/94‑1 (MQ=60)
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ATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCA < SRR4302543.5477313/94‑1 (MQ=60)
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GCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGC < SRR4302543.2953931/94‑1 (MQ=60)
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CCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCA > SRR4302543.1892126/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCA < SRR4302543.5804375/94‑1 (MQ=60)
CCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGGTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCA > SRR4302543.7045277/1‑94 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGCGGTTGCCTTCAATATCGCGCAGCCGGCAG > SRR4302543.6778339/1‑94 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAG < SRR4302543.3638121/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAG < SRR4302543.7790243/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAG < SRR4302543.4169545/94‑1 (MQ=60)
TCGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTT < SRR4302543.5980254/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTC < SRR4302543.1130933/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTC > SRR4302543.1132188/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTC > SRR4302543.1102603/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCA < SRR4302543.5027853/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCAT < SRR4302543.3056029/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATC > SRR4302543.3451235/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATC < SRR4302543.4383978/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCACGGAGTTCATC > SRR4302543.2594937/1‑94 (MQ=60)
AGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCA < SRR4302543.979895/94‑1 (MQ=60)
AGGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCA > SRR4302543.7642450/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAG < SRR4302543.232643/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGT < SRR4302543.4529400/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGT < SRR4302543.4529399/94‑1 (MQ=60)
TTTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTG < SRR4302543.67529/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCGTCGCCACGCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGC > SRR4302543.48970/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGC > SRR4302543.7833111/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGC > SRR4302543.1099620/1‑94 (MQ=60)
TTCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCC < SRR4302543.1100487/94‑1 (MQ=60)
TCACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCA < SRR4302543.4899023/94‑1 (MQ=60)
CACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAG < SRR4302543.5617559/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGA < SRR4302543.5629801/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGA > SRR4302543.1420190/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGA > SRR4302543.471348/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGAC < SRR4302543.6446954/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGAC < SRR4302543.2561841/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGAC > SRR4302543.4777697/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCAAGACGGATTGCGCCGCCGTGGACGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGAC < SRR4302543.7082857/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACTGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACG < SRR4302543.6352679/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA > SRR4302543.2884174/1‑94 (MQ=60)
GTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA < SRR4302543.6909676/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTCCGCCCCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGA < SRR4302543.6909677/94‑1 (MQ=60)
TCGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGAC < SRR4302543.7416233/94‑1 (MQ=60)
CGCCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACG > SRR4302543.5004722/1‑94 (MQ=60)
CGCCACCCAGAGCGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACG < SRR4302543.3971261/94‑1 (MQ=60)
CCACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGG > SRR4302543.4407440/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT < SRR4302543.3987497/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGG > SRR4302543.3532784/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGG > SRR4302543.2229050/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACAGGT > SRR4302543.4287796/1‑94 (MQ=60)
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GAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGT > NC_000913/4579772‑4579958
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
