Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,600,078 |
C→T |
W135* (TGG→TAG) |
yjjP ← |
putative structural protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,600,078 | 0 | C | T | 100.0%
| 831.5
/ NA
| 229 | W135* (TGG→TAG) | yjjP | putative structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (119/110); total (119/110) |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATG > NC_000913/4599988‑4600167
|
cAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATc > 1:1176420/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCGCCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTGCCAGCTATCt < 1:2496476/93‑1 (MQ=255)
aaaGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCt < 2:177040/93‑1 (MQ=255)
aagaagGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCtt < 1:3456207/93‑1 (MQ=255)
aagaagGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCtt > 2:2628913/1‑93 (MQ=255)
aagaagGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCtt > 2:1870388/1‑93 (MQ=255)
gaagGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTgg < 2:2765740/93‑1 (MQ=255)
aagGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTggg < 1:2113879/93‑1 (MQ=255)
agGTGATGACAGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGt < 2:48355/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTCTCTTgggga > 2:4244711/1‑91 (MQ=255)
ggTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTgggca > 2:519685/1‑91 (MQ=255)
ggTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTa < 2:383209/93‑1 (MQ=255)
ggTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTa < 1:3170623/93‑1 (MQ=255)
tgatgaCGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAAc < 1:3859190/93‑1 (MQ=255)
gatgaCGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACg > 1:189267/1‑93 (MQ=255)
gatgaCGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACg > 1:2753568/1‑93 (MQ=255)
aCGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAAt < 1:4036621/93‑1 (MQ=255)
aCGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAAt < 1:3152311/93‑1 (MQ=255)
cGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATg < 1:1345334/93‑1 (MQ=255)
cGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATg < 1:510840/93‑1 (MQ=255)
ggCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATgg > 2:3653015/1‑93 (MQ=255)
gCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGc > 1:2018588/1‑93 (MQ=255)
gCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGc > 2:1136808/1‑93 (MQ=255)
aCCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGTCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGTCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTg < 1:173017/93‑1 (MQ=255)
tCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAAtt > 2:707432/1‑93 (MQ=255)
ccAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTg > 1:3101573/1‑93 (MQ=255)
aGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGc < 2:1144900/93‑1 (MQ=255)
aGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGc > 2:4543884/1‑93 (MQ=255)
aGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAAGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATAGCTTAATTTggt > 2:2201934/1‑92 (MQ=255)
gCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCt < 2:2562727/93‑1 (MQ=255)
gCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCt > 2:4495170/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTaaa < 1:4478792/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTaaa > 1:1683920/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTaaa < 2:3759514/93‑1 (MQ=255)
ccGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAt < 2:3034945/93‑1 (MQ=255)
ccGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAt < 1:4366026/93‑1 (MQ=255)
ccGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAt < 1:4633120/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTGAGTTTACAGAATGAGGCGCAAGAAGGGCCACCCATTAAGGATACAAGCTATCTTGGGTAACGTGGTGGCGGAATTTGGCTaaacc < 2:739905/93‑3 (MQ=255)
gTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAGGGCCAACCATTAAGACTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCg < 2:4350921/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCg > 1:3697104/1‑93 (MQ=255)
gTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCg > 2:785913/1‑93 (MQ=255)
ttATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGt > 2:3019869/1‑93 (MQ=255)
tATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGtt > 1:2585742/1‑93 (MQ=255)
tATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGtt > 2:2279225/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGttt > 2:3421900/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTtc < 1:2307559/93‑1 (MQ=255)
gAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTtctc > 2:1590967/1‑93 (MQ=255)
gAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTtctc > 2:431575/1‑93 (MQ=255)
gTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTa < 2:3494803/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTa < 1:3263512/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTa > 1:2810791/1‑93 (MQ=255)
gTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTa > 1:3825984/1‑93 (MQ=255)
tttACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTAc > 1:2833177/1‑93 (MQ=255)
cAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCt < 2:2847351/93‑1 (MQ=255)
aGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCtt < 1:780012/93‑1 (MQ=255)
gAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCttt < 2:3279614/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCGCAGGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTACCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTa > 2:1366527/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTaa > 1:4276271/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTaa < 1:735608/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAAGAGAGTCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAAt < 2:2109125/93‑1 (MQ=255)
cgcAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCca < 1:2347974/93‑1 (MQ=255)
gcAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcag > 2:3311880/1‑93 (MQ=255)
cAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGCTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagc > 2:2094755/1‑93 (MQ=255)
aaGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagca < 2:247652/93‑1 (MQ=255)
aaGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagca > 1:1309672/1‑93 (MQ=255)
aaGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagca > 2:884420/1‑93 (MQ=255)
aaGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagca > 1:1620306/1‑93 (MQ=255)
aGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagcag > 1:1289738/1‑93 (MQ=255)
aGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagcag < 1:4134238/93‑1 (MQ=255)
aGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCcagcag > 2:1727389/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAga < 2:3641952/93‑1 (MQ=255)
aaaGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgat > 2:3320571/1‑93 (MQ=255)
aaGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatg > 1:485141/1‑93 (MQ=255)
aaGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatg > 2:1756447/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatga < 2:615108/93‑1 (MQ=255)
aGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatga < 2:3128534/93‑1 (MQ=255)
aGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatga < 1:860746/93‑1 (MQ=255)
aGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatga < 1:2268175/93‑1 (MQ=255)
ggCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAgatgat > 1:1438994/1‑93 (MQ=255)
gCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGatgatg < 1:2150565/93‑1 (MQ=255)
ccAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGc > 1:91236/1‑93 (MQ=255)
cAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCt < 1:3574375/93‑1 (MQ=255)
aCCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTcc > 2:941636/1‑93 (MQ=255)
aCCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTcc > 1:3364994/1‑93 (MQ=255)
acATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGCAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCg > 2:4214301/2‑93 (MQ=255)
cATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTCACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGCTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGc > 2:2778473/1‑93 (MQ=255)
cATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGc < 1:1555457/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCa > 1:2904322/1‑93 (MQ=255)
ttAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGaaa > 2:1407337/1‑93 (MQ=255)
ttAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa > 2:721950/1‑93 (MQ=255)
ttAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa > 2:4033263/1‑93 (MQ=255)
aaGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGa > 2:2348938/1‑93 (MQ=255)
aGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGaa < 2:4433973/93‑1 (MQ=255)
ggCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGGCAGAAt > 2:3473033/1‑93 (MQ=255)
gCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATc < 2:2666524/93‑1 (MQ=255)
ccAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACaa < 1:661822/93‑1 (MQ=255)
ccAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACaa < 2:3530996/93‑1 (MQ=255)
cAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAt < 2:2924537/93‑1 (MQ=255)
cAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAt > 2:1472656/1‑93 (MQ=255)
aGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAtg < 1:2441044/93‑1 (MQ=255)
|
GCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATG > NC_000913/4599988‑4600167
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCT > NC_000913/4599985‑4600171
|
CTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCT > SRR4302535.4628678/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCT < SRR4302535.2068562/94‑1 (MQ=60)
GCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATC > SRR4302535.1184818/1‑94 (MQ=60)
GCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATC < SRR4302535.3622975/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCGCCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTGCCAGCTATCTT < SRR4302535.2514486/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTT > SRR4302535.2804699/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTG < SRR4302535.3480229/94‑1 (MQ=60)
AAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTG < SRR4302535.1515149/94‑1 (MQ=60)
AGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGG > SRR4302535.3220950/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGG > SRR4302535.1731909/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGG < SRR4302535.4158665/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGT > SRR4302535.1375941/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGT < SRR4302535.2129134/94‑1 (MQ=60)
AGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTA > SRR4302535.2880189/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAA < SRR4302535.3192579/94‑1 (MQ=60)
TGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACG < SRR4302535.3885750/94‑1 (MQ=60)
TGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACG > SRR4302535.2773190/1‑94 (MQ=60)
TGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACG > SRR4302535.4462026/1‑94 (MQ=60)
TGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACG > SRR4302535.190574/1‑94 (MQ=60)
TGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACG < SRR4302535.982508/94‑1 (MQ=60)
TGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAA < SRR4302535.4678884/94‑1 (MQ=60)
GACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAAT < SRR4302535.2230437/94‑1 (MQ=60)
ACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATG < SRR4302535.3174217/94‑1 (MQ=60)
ACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATG < SRR4302535.4064252/94‑1 (MQ=60)
CGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGG < SRR4302535.1354939/94‑1 (MQ=60)
CGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGG < SRR4302535.514412/94‑1 (MQ=60)
GGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGC > SRR4302535.2033133/1‑94 (MQ=60)
GGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGC > SRR4302535.3731472/1‑94 (MQ=60)
GCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCT < SRR4302535.910042/94‑1 (MQ=60)
CACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTG > SRR4302535.1305280/1‑94 (MQ=60)
ACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGTCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGTCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGA < SRR4302535.174214/94‑1 (MQ=60)
CATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAAT < SRR4302535.1616984/94‑1 (MQ=60)
CATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAAT > SRR4302535.2695480/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTG > SRR4302535.3123164/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAGCCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGG < SRR4302535.3855331/94‑1 (MQ=60)
AGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCT > SRR4302535.215295/1‑94 (MQ=60)
CACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAA > SRR4302535.321441/1‑94 (MQ=60)
CACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAA > SRR4302535.4253731/1‑94 (MQ=60)
CACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAA > SRR4302535.465602/1‑94 (MQ=60)
CACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAA > SRR4302535.1696116/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAT < SRR4302535.2998861/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAT < SRR4302535.4509541/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAAT < SRR4302535.2022354/94‑1 (MQ=60)
CCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATC < SRR4302535.4664552/94‑1 (MQ=60)
CCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATC < SRR4302535.683224/94‑1 (MQ=60)
CCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATC < SRR4302535.4395899/94‑1 (MQ=60)
CGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCG > SRR4302535.3722688/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGT > SRR4302535.2124453/1‑94 (MQ=60)
TTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTT > SRR4302535.2604311/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTT < SRR4302535.470481/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTC < SRR4302535.3151887/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTC < SRR4302535.1672485/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTC < SRR4302535.1324291/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCT < SRR4302535.2324069/94‑1 (MQ=60)
GAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCT < SRR4302535.2409500/94‑1 (MQ=60)
GAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCT < SRR4302535.2835165/94‑1 (MQ=60)
AGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTA > SRR4302535.2830772/1‑94 (MQ=60)
AGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTA > SRR4302535.3852380/1‑94 (MQ=60)
GTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTAC > SRR4302535.2853288/1‑94 (MQ=60)
GTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTAC > SRR4302535.3471248/1‑94 (MQ=60)
GTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTAC < SRR4302535.3286178/94‑1 (MQ=60)
aaaaaagagggcgaaaaAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCT < SRR4302535.4007067/77‑1 (MQ=60)
CAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTT > SRR4302535.2251594/1‑94 (MQ=60)
AGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTT < SRR4302535.785487/94‑1 (MQ=60)
GAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAGCCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTG < SRR4302535.707128/94‑1 (MQ=60)
GAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTG < SRR4302535.1427436/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAA > SRR4302535.4305541/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAAT < SRR4302535.740779/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATC < SRR4302535.3557609/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATC > SRR4302535.4037040/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCC < SRR4302535.2594436/94‑1 (MQ=60)
CGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTNANCCAG > SRR4302535.1973026/1‑94 (MQ=60)
CGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAG > SRR4302535.3982939/1‑94 (MQ=60)
CGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAG < SRR4302535.2364807/94‑1 (MQ=60)
CGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAG < SRR4302535.2483052/94‑1 (MQ=60)
CAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCA > SRR4302535.1319033/1‑94 (MQ=60)
CAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCA > SRR4302535.1631994/1‑94 (MQ=60)
AAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAG > SRR4302535.1298928/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGA < SRR4302535.4162544/94‑1 (MQ=60)
AGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTAGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGA < SRR4302535.2804756/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATG > SRR4302535.488543/1‑94 (MQ=60)
AGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGAT < SRR4302535.2284344/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGAT > SRR4302535.1449280/1‑94 (MQ=60)
AGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGAT < SRR4302535.866827/94‑1 (MQ=60)
GGCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATG < SRR4302535.1796185/94‑1 (MQ=60)
GCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGC > SRR4302535.91881/1‑94 (MQ=60)
GCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGC < SRR4302535.2300114/94‑1 (MQ=60)
GCCAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGC < SRR4302535.2166029/94‑1 (MQ=60)
CAACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTC < SRR4302535.3599156/94‑1 (MQ=60)
AACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCC > SRR4302535.3388408/1‑94 (MQ=60)
AACCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCC < SRR4302535.6243/94‑1 (MQ=60)
CCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGC > SRR4302535.1675011/1‑94 (MQ=60)
CCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGC > SRR4302535.3187981/1‑94 (MQ=60)
CCATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGC > SRR4302535.1258025/1‑94 (MQ=60)
CATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAGTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCA < SRR4302535.3317146/94‑1 (MQ=60)
CATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCA > SRR4302535.2924854/1‑94 (MQ=60)
CATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCA < SRR4302535.1566669/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAA > SRR4302535.759693/1‑94 (MQ=60)
ATTAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAA > SRR4302535.2460841/1‑94 (MQ=60)
TAAGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGA > SRR4302535.499093/1‑94 (MQ=60)
AGGCTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAAT > SRR4302535.3615720/1‑94 (MQ=60)
CTACCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCAC > SRR4302535.860631/1‑94 (MQ=60)
CCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAT > SRR4302535.4306835/1‑94 (MQ=60)
CCAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAT < SRR4302535.666441/94‑1 (MQ=60)
CAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATG > SRR4302535.2356501/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATG < SRR4302535.3093043/94‑1 (MQ=60)
AGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGT < SRR4302535.4373436/94‑1 (MQ=60)
AGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGT > SRR4302535.130098/1‑94 (MQ=60)
AGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGT > SRR4302535.2595328/1‑94 (MQ=60)
AGCTATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGT < SRR4302535.2458629/94‑1 (MQ=60)
TATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCT < SRR4302535.4333216/94‑1 (MQ=60)
TATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCT > SRR4302535.3151141/1‑94 (MQ=60)
TATCTTGGGTAACGTAATGGCTCAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCT < SRR4302535.1093824/94‑1 (MQ=60)
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CTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCT > NC_000913/4599985‑4600171
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
