Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > NC_000913/1949343‑1949529
|
AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTA > SRR4302535.998850/1‑94 (MQ=60)
AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTA > SRR4302535.1762696/1‑94 (MQ=60)
AACACAATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTG > SRR4302535.961913/1‑94 (MQ=60)
AACACAATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTG > SRR4302535.1722016/1‑94 (MQ=60)
ACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCG > SRR4302535.1414935/1‑94 (MQ=60)
CAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTATCGC > SRR4302535.2078677/1‑94 (MQ=60)
CAATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGC > SRR4302535.226821/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCA < SRR4302535.2686017/94‑1 (MQ=60)
AATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCA > SRR4302535.2330474/1‑94 (MQ=60)
AATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCA > SRR4302535.1447598/1‑94 (MQ=60)
ATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAA > SRR4302535.4612315/1‑94 (MQ=60)
ATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAA > SRR4302535.1408099/1‑94 (MQ=60)
TAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGTAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAAT < SRR4302535.3318836/94‑1 (MQ=60)
AACAGCATTAATCATATCTGCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATG < SRR4302535.2208851/94‑1 (MQ=60)
AACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATG > SRR4302535.1669334/1‑94 (MQ=60)
ACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGG > SRR4302535.3696207/1‑94 (MQ=60)
CAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGT < SRR4302535.2176868/94‑1 (MQ=60)
agcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTG > SRR4302535.4155577/10‑94 (MQ=60)
agcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTC > SRR4302535.2950641/10‑94 (MQ=60)
agcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTC > SRR4302535.4109474/10‑94 (MQ=60)
agcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTC < SRR4302535.2038463/85‑1 (MQ=60)
gcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCG < SRR4302535.2386551/86‑1 (MQ=60)
gcattaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCG < SRR4302535.1160572/86‑1 (MQ=60)
GTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCG > SRR4302535.3493466/1‑94 (MQ=60)
TATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGC < SRR4302535.3854076/94‑1 (MQ=60)
TATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGC < SRR4302535.344861/94‑1 (MQ=60)
TATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGC > SRR4302535.257801/1‑94 (MQ=60)
ttaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAT > SRR4302535.3815502/6‑94 (MQ=60)
ttaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAT > SRR4302535.2962165/6‑94 (MQ=60)
ttaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAT > SRR4302535.4405766/6‑94 (MQ=60)
AATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCC > SRR4302535.504971/1‑94 (MQ=60)
AATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCC > SRR4302535.1847435/1‑94 (MQ=60)
ATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCT < SRR4302535.1309361/94‑1 (MQ=60)
ATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCT > SRR4302535.1263225/1‑94 (MQ=60)
ACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCT < SRR4302535.1621674/94‑1 (MQ=60)
CCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTA > SRR4302535.2026603/1‑94 (MQ=60)
CATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAA > SRR4302535.2763244/1‑94 (MQ=60)
CATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAA < SRR4302535.4666615/94‑1 (MQ=60)
ATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAA > SRR4302535.3033146/1‑94 (MQ=60)
ATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAA > SRR4302535.4333891/1‑94 (MQ=60)
TATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAT < SRR4302535.3563292/94‑1 (MQ=60)
TATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAT < SRR4302535.4002816/94‑1 (MQ=60)
ATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATG < SRR4302535.1532583/94‑1 (MQ=60)
ATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATG > SRR4302535.3264120/1‑94 (MQ=60)
ATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATG < SRR4302535.4584622/94‑1 (MQ=60)
ATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATG < SRR4302535.1895454/94‑1 (MQ=60)
ATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATG > SRR4302535.2776716/1‑94 (MQ=60)
CTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGG > SRR4302535.2225656/1‑94 (MQ=60)
CTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGG > SRR4302535.4250633/1‑94 (MQ=60)
TACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGT < SRR4302535.2963072/94‑1 (MQ=60)
TACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGT < SRR4302535.3898596/94‑1 (MQ=60)
ACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTG > SRR4302535.821475/1‑94 (MQ=60)
CCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGC > SRR4302535.3504928/1‑94 (MQ=60)
CCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGC < SRR4302535.106958/94‑1 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302535.1180285/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG < SRR4302535.3545923/94‑1 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302535.3764989/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302535.1836515/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG < SRR4302535.4552524/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG < SRR4302535.4507913/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG < SRR4302535.3872876/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT > SRR4302535.1735062/1‑94 (MQ=60)
TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG > SRR4302535.4468682/1‑94 (MQ=60)
TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG < SRR4302535.4551367/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGA > SRR4302535.2156397/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTAT < SRR4302535.2512256/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAT > SRR4302535.3344232/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATC > SRR4302535.2693461/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATC > SRR4302535.3670171/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATC < SRR4302535.1230953/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTTTGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCA > SRR4302535.3241737/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC < SRR4302535.3138915/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302535.776755/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302535.3016537/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACC > SRR4302535.2292211/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCA > SRR4302535.4367778/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAG < SRR4302535.1878451/94‑1 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACTGCAATGGACGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCC > SRR4302535.4527929/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT < SRR4302535.3859616/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT > SRR4302535.1370135/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTT > SRR4302535.2228236/1‑94 (MQ=60)
TAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTG < SRR4302535.2433104/94‑1 (MQ=60)
TAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTG < SRR4302535.3261954/94‑1 (MQ=60)
TAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTG < SRR4302535.1035977/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAG > SRR4302535.1399599/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302535.889810/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGT > SRR4302535.3889055/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGT > SRR4302535.3860045/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGT > SRR4302535.3525295/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGT < SRR4302535.1993789/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGT < SRR4302535.444714/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGT > SRR4302535.3247051/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGAA > SRR4302535.3521310/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302535.851329/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302535.1039612/1‑94 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302535.4397275/1‑94 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302535.2129848/1‑94 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302535.3032949/94‑1 (MQ=60)
GAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGC < SRR4302535.4554970/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC > SRR4302535.3494320/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302535.1763073/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302535.1033448/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTCAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCGTTGAAGAGTATCCCCGC > SRR4302535.4030050/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302535.4030051/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302535.3905563/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302535.3717269/1‑94 (MQ=60)
ccttcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCC < SRR4302535.4097/89‑1 (MQ=60)
ccttcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCCCAATGGTGGCATCTTAAATGGGGGGGGTGGGGAATCACCACCCTTGAAGAGAATGCCCGCC > SRR4302535.2596713/6‑94 (MQ=33)
cttcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCA > SRR4302535.2152450/5‑94 (MQ=60)
CTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCC > SRR4302535.924413/1‑94 (MQ=60)
tcacgctttatgttttcCATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCAAAATGGGTGCGTTTGGGTACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT < SRR4302535.4313483/77‑1 (MQ=60)
acgtatgtTGATTTACAGCGGTCTACCGCAATGCTCGCATCCAAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302535.3840651/86‑1 (MQ=60)
ACGCGTTATGATTTACATCGGTCTCCCGCAAGGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302535.4030298/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302535.3230445/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302535.3126482/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302535.903478/1‑94 (MQ=60)
CGCATTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302535.4384146/1‑94 (MQ=60)
TTTATGATTTACATCGGTCTGCCGAATTGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGTTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302535.2075301/94‑1 (MQ=60)
GTTATGTTTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302535.1013589/94‑1 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGCCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCCCCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302535.2315615/94‑1 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTACCGCATTGGTCGAATCATAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTGGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302535.481716/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG < SRR4302535.1191034/94‑1 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302535.741396/1‑94 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302535.130044/1‑94 (MQ=60)
ATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG > SRR4302535.3704218/1‑94 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT > SRR4302535.2814370/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302535.3103011/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302535.1617942/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302535.2047591/1‑94 (MQ=60)
TTTACATGGGTCTCCCGCAATGGTCCCATCCTAAAGGGGTGCTGTGGGTTATCACCGGCTTTGAAGAGTTTCCCCGCCACTTTAACTGCGTGac < SRR4302535.261172/94‑3 (MQ=20)
TTGACAGCGGTCTGCCGAAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGac < SRR4302535.549317/94‑3 (MQ=60)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302535.911512/94‑4 (MQ=60)
TTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAG < SRR4302535.1162541/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgg < SRR4302535.3649351/94‑7 (MQ=60)
CATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGC > SRR4302535.1372916/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCTGCCGCAATGGTCCCATCCAAAAGGGGTGCGGTTGGTTATCACCAGCTTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcggg < SRR4302535.3774123/94‑8 (MQ=52)
ATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCA > SRR4302535.489145/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGTTTGGTTATCCCCAGCCTTAAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggca < SRR4302535.3349328/94‑10 (MQ=48)
GTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCCCCAGCCTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatt < SRR4302535.3909951/94‑12 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302535.2642925/1‑81 (MQ=60)
CCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGTTTGGGAATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG < SRR4302535.4387695/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAAG > SRR4302535.1549884/1‑94 (MQ=60)
|
AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > NC_000913/1949343‑1949529
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
