Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
772,731 |
A→G |
Y156C (TAC→TGC) |
cydB → |
cytochrome d terminal oxidase polypeptide subunit II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 772,731 | 0 | A | G | 100.0%
| 876.5
/ NA
| 265 | Y156C (TAC→TGC) | cydB | cytochrome d terminal oxidase polypeptide subunit II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (136/129); total (136/129) |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAA > NC_000913/772641‑772820
|
tAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGtgcta < 2:3824313/93‑1 (MQ=255)
cTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTacac < 2:4105352/93‑1 (MQ=255)
ttCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACAcc > 1:516290/1‑93 (MQ=255)
tCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCg < 1:7155497/93‑1 (MQ=255)
gccgcTGGTAATTGGTGTAGCGTTCTGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTTActt > 2:4665365/1‑93 (MQ=255)
gccgcTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAActt > 1:4594024/1‑93 (MQ=255)
ccgcTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAActtc < 1:1077071/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTACCCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAActtct < 1:36598/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAActtct < 1:6033075/93‑1 (MQ=255)
cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACttcttc > 1:1958998/1‑93 (MQ=255)
tGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTCCACCGGTAACTTCTTcc > 2:7059493/1‑93 (MQ=255)
tGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTcc < 2:2099161/93‑1 (MQ=255)
tGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTcc > 2:1848103/1‑93 (MQ=255)
ggTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCa > 1:9044496/1‑93 (MQ=255)
gTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAg < 2:9690381/93‑1 (MQ=255)
gTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAg < 1:1424855/93‑1 (MQ=255)
tAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGt > 2:5419778/1‑93 (MQ=255)
tAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGt > 2:9386811/1‑93 (MQ=255)
tAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGt < 2:9814093/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGtt < 1:4313767/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGtt < 2:5053516/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTACGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGc > 1:6213297/1‑93 (MQ=255)
ggTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCtt < 2:8729368/93‑1 (MQ=255)
gtgtAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTa < 1:1090622/93‑1 (MQ=255)
tgtAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTaa < 1:4848400/93‑1 (MQ=255)
tgtAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTaa > 1:2082211/1‑93 (MQ=255)
tgtAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGGGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTaa < 1:4675557/93‑1 (MQ=255)
gtAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAAc < 2:9040827/93‑1 (MQ=255)
tAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAAcc > 1:1897348/1‑93 (MQ=255)
cGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGt > 2:2777403/1‑93 (MQ=255)
cGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGt < 2:2943780/93‑1 (MQ=255)
gTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGtt < 1:4995838/93‑1 (MQ=255)
gTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGtt > 1:2280909/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGtt < 2:876739/93‑1 (MQ=255)
ttCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTc > 2:4456708/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGCAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTc > 2:1586797/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCg < 1:2330481/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCg < 2:6021507/93‑1 (MQ=255)
cGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCgg > 2:6403721/1‑93 (MQ=255)
cGGTAACCTGTGGCAGGGCGTACCGTTCACCGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCTGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCgg < 2:6668542/93‑1 (MQ=255)
ggTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGc < 2:3320943/93‑1 (MQ=255)
gTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGcc < 1:7422107/93‑1 (MQ=255)
gTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGcc > 2:439682/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCctgc > 2:5665795/1‑93 (MQ=255)
tGTTGCAGGGCGTACCCTTCGACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTTCACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTgg < 2:7853445/93‑1 (MQ=255)
gTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGc > 2:8583705/1‑93 (MQ=255)
ttGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCa < 2:3988187/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGc < 2:918112/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGc > 1:640808/1‑93 (MQ=255)
aGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCg > 1:2202496/1‑93 (MQ=255)
aGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCg > 1:7596086/1‑93 (MQ=255)
gggCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCgg > 1:5022117/1‑92 (MQ=255)
ggCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCgtg > 1:9834673/1‑93 (MQ=255)
cGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCgtggt < 2:740086/93‑1 (MQ=255)
gTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCgtggtg > 2:8093294/1‑93 (MQ=255)
gTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCgtggtg < 1:2549162/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAg > 2:8894012/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAg < 1:6537079/93‑1 (MQ=255)
ccGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGc > 1:920571/1‑93 (MQ=255)
cGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCg > 1:8529121/1‑93 (MQ=255)
ttCAACGTTGATGAATATCTGCGTGTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTa > 1:302675/1‑93 (MQ=255)
ttCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTa > 1:1983389/1‑93 (MQ=255)
gtCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTa < 1:8348239/92‑1 (MQ=255)
tCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGtcg > 1:5121410/1‑91 (MQ=255)
tCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAg > 1:5714860/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAggg > 2:3461436/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGga < 2:4585577/93‑1 (MQ=255)
cGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgat < 2:1249332/93‑1 (MQ=255)
agTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgat < 1:5974588/92‑1 (MQ=255)
ttGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgatga < 2:5577327/93‑1 (MQ=255)
tgatgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgatgat < 1:3566768/93‑1 (MQ=255)
tgatgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgatgat > 2:3674532/1‑93 (MQ=255)
gatgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGgatgata > 2:2421850/1‑92 (MQ=255)
atgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGTTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCa < 1:5564924/93‑1 (MQ=255)
atgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCa < 2:5465823/93‑1 (MQ=255)
tgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAt > 2:3157230/1‑93 (MQ=255)
tgaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAt > 1:3989599/1‑93 (MQ=255)
gaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAtt > 1:3423155/1‑93 (MQ=255)
gaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAtt < 2:7563787/93‑1 (MQ=255)
gaATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAtt > 2:10047513/1‑93 (MQ=255)
aaTATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTa > 2:7137801/1‑93 (MQ=255)
aaTATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGAACATTa > 1:3279737/1‑93 (MQ=255)
tatCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACt > 2:6825578/1‑93 (MQ=255)
atCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGGTGATTATTACTc > 1:7845955/1‑93 (MQ=255)
cTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAg < 2:9401434/93‑1 (MQ=255)
tGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAgg > 1:8708230/1‑93 (MQ=255)
gCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAggg < 2:5834006/93‑1 (MQ=255)
gCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAggg > 2:2345109/1‑93 (MQ=255)
gCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAggg < 2:3657739/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGTGCTACACCGGTACCTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgc < 2:7737832/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAggga > 2:5979482/1‑92 (MQ=255)
cGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgc < 1:9475740/93‑1 (MQ=255)
gTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgcg < 1:6939188/93‑1 (MQ=255)
gTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgcg > 2:2269451/1‑93 (MQ=255)
tCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTTAGCGTAGGGATGATCATTACTTAggggga > 1:9603856/1‑90 (MQ=255)
tCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgcgc > 2:9635024/1‑93 (MQ=255)
tCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGgcgc > 2:3274520/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCa < 1:3808703/93‑1 (MQ=255)
tgtgCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGGGCaa > 2:6866063/1‑93 (MQ=255)
tgtgCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCaa > 1:8043384/1‑93 (MQ=255)
|
GTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAA > NC_000913/772641‑772820
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTA > NC_000913/772639‑772824
|
TTGTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGC < SRR4302540.3852639/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGC < SRR4302540.440390/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCT > SRR4302540.6309319/1‑94 (MQ=60)
TAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTAC > SRR4302540.2172024/1‑94 (MQ=60)
AGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACA < SRR4302540.2830691/94‑1 (MQ=60)
AGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACA > SRR4302540.1330198/1‑94 (MQ=60)
GCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACAC < SRR4302540.84940/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACC > SRR4302540.521826/1‑94 (MQ=60)
TTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCG > SRR4302540.5649078/1‑94 (MQ=60)
TTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCG < SRR4302540.8759251/94‑1 (MQ=60)
TCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGG < SRR4302540.7235243/94‑1 (MQ=60)
TCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGG < SRR4302540.7235245/94‑1 (MQ=60)
TCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGG > SRR4302540.6898295/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGA > SRR4302540.381402/1‑94 (MQ=60)
GTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTA > SRR4302540.2260599/1‑94 (MQ=60)
CCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACT < SRR4302540.6509648/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTT > SRR4302540.4643449/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACAGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTC > SRR4302540.4643450/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCT < SRR4302540.1088078/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTACCCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTT < SRR4302540.36977/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTT > SRR4302540.9635640/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTT < SRR4302540.6100035/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTC > SRR4302540.1980292/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTC > SRR4302540.4369007/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTC > SRR4302540.4300062/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTC > SRR4302540.4300063/1‑94 (MQ=60)
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TGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCA > SRR4302540.2056803/1‑94 (MQ=60)
TGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTAAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTTTTCCG > SRR4302540.7291484/1‑94 (MQ=60)
GTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGT > SRR4302540.1447608/1‑94 (MQ=60)
GTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGT < SRR4302540.1440279/94‑1 (MQ=60)
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GAATTGGTGTAGTGTTTGGTAACCTGTTGCAGGGCGTTCCCGTCAACGTTGATTAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTT < SRR4302540.8868169/94‑1 (MQ=60)
AATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTG < SRR4302540.4360734/94‑1 (MQ=60)
AATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTG < SRR4302540.3828330/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTACGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGC > SRR4302540.6282430/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTT > SRR4302540.1946282/1‑94 (MQ=60)
GGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCGGTTGCTTA < SRR4302540.460004/94‑1 (MQ=60)
GGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTA < SRR4302540.7334579/94‑1 (MQ=60)
GTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAA > SRR4302540.9994506/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAA > SRR4302540.2104580/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAA < SRR4302540.1101814/94‑1 (MQ=60)
GTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAA > SRR4302540.8607609/1‑94 (MQ=60)
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TGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAAC < SRR4302540.4900343/94‑1 (MQ=60)
TGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGGGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAAC < SRR4302540.4725585/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACC > SRR4302540.1918111/1‑94 (MQ=60)
TAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCC < SRR4302540.8707014/94‑1 (MQ=60)
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GCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGT > SRR4302540.9393637/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTT < SRR4302540.2012104/94‑1 (MQ=60)
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CGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTT > SRR4302540.2305412/1‑94 (MQ=60)
CGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTT > SRR4302540.2117905/1‑94 (MQ=60)
GTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTC < SRR4302540.5049916/94‑1 (MQ=60)
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GTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTC < SRR4302540.3385578/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTC > SRR4302540.1115220/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGG < SRR4302540.2355590/94‑1 (MQ=60)
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CGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGC > SRR4302540.7508085/1‑94 (MQ=60)
GTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCT < SRR4302540.2465040/94‑1 (MQ=60)
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TTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTACCTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAG < SRR4302540.6413959/94‑1 (MQ=60)
TTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTACCTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAG < SRR4302540.505250/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGG > SRR4302540.3400509/1‑94 (MQ=60)
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CAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTGACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCG > SRR4302540.945570/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCG > SRR4302540.2226290/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCG < SRR4302540.8119059/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCG > SRR4302540.7681425/1‑94 (MQ=60)
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AGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGG > SRR4302540.5076482/1‑94 (MQ=60)
AGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGG > SRR4302540.2341542/1‑94 (MQ=60)
AGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCCGCCTGCTGGCAGGCGT > SRR4302540.2341543/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGTAGGCGAG > SRR4302540.2621248/1‑94 (MQ=60)
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GGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTG > SRR4302540.9949680/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTG > SRR4302540.4826453/1‑94 (MQ=60)
GGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGG < SRR4302540.7784075/94‑1 (MQ=60)
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GTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGA < SRR4302540.5198150/94‑1 (MQ=60)
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ACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGC < SRR4302540.6609629/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCG > SRR4302540.8628223/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCG > SRR4302540.3898300/1‑94 (MQ=60)
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GTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTGTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTA > SRR4302540.305682/1‑94 (MQ=60)
GTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTACCCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCtggaggggcgtg > SRR4302540.1936704/1‑82 (MQ=60)
GTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTA > SRR4302540.2004891/1‑94 (MQ=60)
GTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTA < SRR4302540.3614141/94‑1 (MQ=60)
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TTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTCG > SRR4302540.5176860/1‑94 (MQ=60)
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TTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAG < SRR4302540.5311983/94‑1 (MQ=60)
GTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAG < SRR4302540.8445131/94‑1 (MQ=60)
TCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGG < SRR4302540.8347629/94‑1 (MQ=60)
CAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCACCTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTCGCAGGCGCGGCGAGCGCAGGG > SRR4302540.5069099/1‑94 (MQ=60)
ACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGAT < SRR4302540.3490438/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGATGAATATCTGCGTCTGGGCTACACCGGTAACTTCGTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGAT < SRR4302540.5257524/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATG < SRR4302540.1098801/94‑1 (MQ=60)
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TTGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGAT < SRR4302540.9263922/94‑1 (MQ=60)
TGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATC < SRR4302540.4924816/94‑1 (MQ=60)
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TGATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACAGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATC < SRR4302540.7781568/94‑1 (MQ=60)
GATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCA > SRR4302540.8002315/1‑94 (MQ=60)
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ATGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCAT > SRR4302540.4032544/1‑94 (MQ=60)
TGAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATT > SRR4302540.3460374/1‑94 (MQ=60)
GAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTA > SRR4302540.5211604/1‑94 (MQ=60)
GAATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGAACATTA > SRR4302540.3315560/1‑94 (MQ=60)
AATATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTACCGTCTTCCAGTTTATTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTAC < SRR4302540.2296580/94‑1 (MQ=60)
TATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGGTTAACCCGTTCGGACTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGCTGATCATTACTC > SRR4302540.1947639/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGGTGATTATTACTC > SRR4302540.7937636/1‑94 (MQ=60)
TCTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAG < SRR4302540.6180409/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGG > SRR4302540.8809311/1‑94 (MQ=60)
TGCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGG < SRR4302540.6566132/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGC < SRR4302540.3931699/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCG < SRR4302540.9588119/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCG < SRR4302540.3495411/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTAGGAATGCTGGCAGGCGTGGGGAGCATAGGGATGATCATTACTCAGGGAG > SRR4302540.6969132/1‑94 (MQ=60)
GTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTTAGCGTAGGGATGATCATTACTtaggggga > SRR4302540.9717132/1‑86 (MQ=60)
GTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTTAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGC > SRR4302540.9717133/1‑94 (MQ=60)
GTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGC > SRR4302540.5362534/1‑94 (MQ=60)
GTCTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGC < SRR4302540.7016427/94‑1 (MQ=60)
CTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAA < SRR4302540.3850183/94‑1 (MQ=60)
CTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAA > SRR4302540.8136839/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAA < SRR4302540.7559146/94‑1 (MQ=60)
GTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACC < SRR4302540.1672461/94‑1 (MQ=60)
GTGCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACC > SRR4302540.937740/1‑94 (MQ=60)
GCTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTA > SRR4302540.753075/1‑94 (MQ=60)
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TGGTAGCTTCGTTCCGCCGCTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTA > NC_000913/772639‑772824
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
