Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,019,162 |
A→G |
Y39H (TAC→CAC) |
ompA ← |
outer membrane protein 3a |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,019,162 | 0 | A | G | 100.0%
| 773.3
/ NA
| 235 | Y39H (TAC→CAC) | ompA | outer membrane protein 3a |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (145/90); total (145/90) |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTG > NC_000913/1019073‑1019251
|
cGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTg < 2:5077969/93‑1 (MQ=255)
ggTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTggg > 2:2241205/1‑93 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa > 1:2425425/1‑93 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa > 1:3314940/1‑93 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa > 2:378677/1‑93 (MQ=255)
ttAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAc > 1:6546428/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCa < 1:2130815/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCa > 1:8073846/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAg > 1:5751052/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAg > 1:7233456/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTAACAACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACAAg < 2:3024169/93‑1 (MQ=255)
tGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGccc > 1:8777121/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCa > 1:5203540/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCa > 2:1699483/1‑93 (MQ=255)
tAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGt < 1:9093744/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt < 2:9267166/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt > 2:130060/1‑93 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt < 2:4236153/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt > 2:8563332/1‑93 (MQ=255)
accaAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGc > 2:1607404/1‑93 (MQ=255)
ccaAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCa > 1:3196106/1‑93 (MQ=255)
ccaAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCa < 1:9929347/93‑1 (MQ=255)
aaaaGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAcc > 2:603270/1‑93 (MQ=255)
aaaGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCa > 2:3856484/1‑93 (MQ=255)
gCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAgtg < 1:747621/93‑1 (MQ=255)
gCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAgtg < 1:630533/93‑1 (MQ=255)
aGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCa < 1:9563125/93‑1 (MQ=255)
cgcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAgg < 2:2173620/93‑1 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt > 2:5904585/1‑93 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt < 1:1790744/93‑1 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt > 1:3262410/1‑93 (MQ=255)
cccAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAggcg > 1:2516436/1‑91 (MQ=255)
ccAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgtgt < 1:1564320/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGtt > 1:4627563/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 2:5640639/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 2:4815859/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 1:1015929/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 1:10044921/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 1:6683596/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCACGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 1:2731262/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTAt > 1:9769580/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTAt > 2:7719874/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc > 1:6049911/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc < 2:8239356/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc < 2:9111202/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc > 1:3060249/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc > 2:440286/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc > 1:3753165/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGCGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATc < 1:1047846/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCt < 2:9034729/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCt < 2:3718519/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCttt > 1:6799395/1‑93 (MQ=255)
ttttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTc > 2:193403/1‑93 (MQ=255)
tttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCg < 2:6164932/93‑1 (MQ=255)
tCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCggg > 2:4308350/1‑92 (MQ=255)
tCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGa > 1:8416091/1‑93 (MQ=255)
tCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGa > 2:5719958/1‑93 (MQ=255)
cATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAg < 2:9529122/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGc < 1:4650349/93‑1 (MQ=255)
gTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGcc > 2:7897423/1‑93 (MQ=255)
cGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTg > 1:439021/1‑93 (MQ=255)
ccATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCt > 1:343243/1‑93 (MQ=255)
cATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTa > 2:4653815/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc > 2:2495777/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc < 2:631925/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc < 1:4841486/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc > 2:1774635/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc < 1:8268610/93‑1 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg > 1:3183358/1‑93 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg > 2:5530252/1‑93 (MQ=255)
tgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACgg > 1:470471/1‑93 (MQ=255)
gttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGt > 1:3972084/1‑93 (MQ=255)
ttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTa > 2:6781825/1‑93 (MQ=255)
ttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTa > 1:5282771/1‑93 (MQ=255)
ttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTa > 2:4132529/1‑93 (MQ=255)
tgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAg < 1:1644272/93‑1 (MQ=255)
tgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAg > 2:7246046/1‑93 (MQ=255)
tttgATGAAAACAGTGTCATGGTGCTGGGAACAGTCCAGTTTAGCCCCAGTGTACAAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGc < 2:3142284/92‑1 (MQ=255)
gttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGc > 2:912236/1‑93 (MQ=255)
gttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGc < 2:10044920/93‑1 (MQ=255)
gttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATATTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGc < 2:7626701/93‑1 (MQ=255)
ttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCg > 2:545878/1‑93 (MQ=255)
tgatgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGa > 2:7248312/1‑93 (MQ=255)
gatgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGaa > 1:7279713/1‑93 (MQ=255)
gatgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGaa > 2:6230497/1‑93 (MQ=255)
tgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAc > 1:9036523/1‑93 (MQ=255)
tgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAc > 2:2274835/1‑93 (MQ=255)
tgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAc < 2:2796992/93‑1 (MQ=255)
gaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAcc < 2:3401369/93‑1 (MQ=255)
aCCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagc < 2:6431767/93‑1 (MQ=255)
gtgtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGt > 2:8224452/1‑93 (MQ=255)
gtgtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGt > 1:5528645/1‑93 (MQ=255)
gtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGc < 2:5220170/93‑1 (MQ=255)
gtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGc > 1:2954121/1‑93 (MQ=255)
tCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGcc > 1:2207628/1‑93 (MQ=255)
tCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGcc > 2:8809866/1‑93 (MQ=255)
cATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCa > 1:7646295/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAc > 2:6658251/1‑93 (MQ=255)
tGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAcg > 1:4282925/1‑92 (MQ=255)
ggTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTg < 1:7755063/93‑1 (MQ=255)
|
CGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTG > NC_000913/1019073‑1019251
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > NC_000913/1019075‑1019253
|
GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGA > SRR4302540.3351277/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGA > SRR4302540.2451557/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGA > SRR4302540.5912061/1‑94 (MQ=60)
GTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAC > SRR4302540.6619055/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCA > SRR4302540.8167533/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAG > SRR4302540.5814528/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAG < SRR4302540.2153676/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAG > SRR4302540.7314133/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGC > SRR4302540.3223173/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCC > SRR4302540.8878775/1‑94 (MQ=60)
CTGATAACCGCCAAAAGCACCAGCACCCAGTTGGTTTTCACGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCC < SRR4302540.4455950/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA < SRR4302540.6864027/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA > SRR4302540.5260218/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA > SRR4302540.7012212/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAG < SRR4302540.344367/94‑1 (MQ=60)
GGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAG < SRR4302540.2528150/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTT < SRR4302540.3173312/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTT > SRR4302540.1328616/1‑94 (MQ=60)
TAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTT > SRR4302540.527763/1‑94 (MQ=60)
TAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTT < SRR4302540.9202997/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTT < SRR4302540.1607984/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTT > SRR4302540.8828807/1‑94 (MQ=60)
CCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAG < SRR4302540.3857409/94‑1 (MQ=60)
CCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGACATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGCGCTGGGACCAGCCCAGTTTAC > SRR4302540.6826506/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCA > SRR4302540.7326355/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCA < SRR4302540.2450811/94‑1 (MQ=60)
ACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCA > SRR4302540.3230819/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAC < SRR4302540.10045254/94‑1 (MQ=60)
CCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAC > SRR4302540.3570875/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAC > SRR4302540.8987341/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAC > SRR4302540.9606723/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCA > SRR4302540.4407979/1‑94 (MQ=60)
GCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGT < SRR4302540.637239/94‑1 (MQ=60)
GCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGT < SRR4302540.755586/94‑1 (MQ=60)
CACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTA < SRR4302540.2588012/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTAC > SRR4302540.4773948/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACC < SRR4302540.2355656/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCA < SRR4302540.5436655/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAG < SRR4302540.9676169/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCAGTAGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAG > SRR4302540.10008273/1‑94 (MQ=60)
CGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGT > SRR4302540.3298008/1‑94 (MQ=60)
GCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTG < SRR4302540.1810209/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGCG > SRR4302540.2543618/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTT > SRR4302540.3247548/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTT < SRR4302540.1581490/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTT > SRR4302540.4677137/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTA > SRR4302540.10161694/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTA > SRR4302540.1026224/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTA > SRR4302540.6757412/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCACGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTA > SRR4302540.2760734/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTAT > SRR4302540.9884130/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATC > SRR4302540.3093821/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATC > SRR4302540.3794111/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATC > SRR4302540.6117143/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATC > SRR4302540.7491067/1‑94 (MQ=60)
TTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGCGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCT < SRR4302540.1058498/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTGATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTT < SRR4302540.1914693/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTT > SRR4302540.6874610/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTT < SRR4302540.3528503/94‑1 (MQ=60)
TTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCG < SRR4302540.6734973/94‑1 (MQ=60)
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TTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGA > SRR4302540.8513775/1‑94 (MQ=60)
TCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAG < SRR4302540.9703613/94‑1 (MQ=60)
TCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGGGTTATCTTTCGGAC > SRR4302540.1350159/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGGGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCG < SRR4302540.7473404/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCG < SRR4302540.4700121/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCG < SRR4302540.9161439/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCG < SRR4302540.9882419/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCT < SRR4302540.9129087/94‑1 (MQ=60)
TCGGGCCCTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG > SRR4302540.4039553/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG > SRR4302540.1055942/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG < SRR4302540.1716688/94‑1 (MQ=60)
TCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG > SRR4302540.443686/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG > SRR4302540.4039554/1‑94 (MQ=60)
GGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGAACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCG > SRR4302540.8031984/1‑94 (MQ=60)
GCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCT < SRR4302540.8406737/94‑1 (MQ=60)
GCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCT > SRR4302540.346726/1‑94 (MQ=60)
CCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTA > SRR4302540.4699063/1‑94 (MQ=60)
CCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTA > SRR4302540.3185051/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302540.3217950/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302540.4747666/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG < SRR4302540.4893341/94‑1 (MQ=60)
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TTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGG > SRR4302540.475510/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGG > SRR4302540.5815976/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGT > SRR4302540.4014899/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTA > SRR4302540.5340485/1‑94 (MQ=60)
TGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGC < SRR4302540.1662232/94‑1 (MQ=60)
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TGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAA > SRR4302540.7360940/1‑94 (MQ=60)
ATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAC > SRR4302540.9144977/1‑94 (MQ=60)
ATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAC < SRR4302540.6465216/94‑1 (MQ=60)
ATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAC > SRR4302540.6338553/1‑94 (MQ=60)
TGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGTCTGCGCTACGGTAGCGAAACC < SRR4302540.3318569/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACC < SRR4302540.261793/94‑1 (MQ=60)
GAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCA < SRR4302540.8283041/94‑1 (MQ=60)
AAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAG < SRR4302540.4608890/94‑1 (MQ=60)
AAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAG > SRR4302540.1024059/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCC > SRR4302540.5717155/1‑94 (MQ=60)
CAGTGTCATGGTTGTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCGTTCGGGGCGGCCTGCTCTACGGTAGCGAAACCAGCCAG < SRR4302540.7913073/94‑1 (MQ=60)
CAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAG > SRR4302540.5248236/1‑94 (MQ=60)
CAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAG < SRR4302540.7809341/94‑1 (MQ=60)
AGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGT > SRR4302540.5589535/1‑94 (MQ=60)
GTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTG > SRR4302540.756180/1‑94 (MQ=60)
GTGTCATGGGGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGGGCAACGGTAGCGAAACCACCCAGTC > SRR4302540.8476965/1‑94 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC > SRR4302540.4852276/1‑94 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC < SRR4302540.8447941/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC > SRR4302540.2986655/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC > SRR4302540.2231473/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC < SRR4302540.10053247/94‑1 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC > SRR4302540.2231474/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC > SRR4302540.1789875/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCA > SRR4302540.7732361/1‑94 (MQ=60)
CATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAC > SRR4302540.2772058/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACT > SRR4302540.3005651/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACT > SRR4302540.7995626/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACT > SRR4302540.6510075/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACG > SRR4302540.4329510/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGC < SRR4302540.7845634/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > SRR4302540.7887228/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > SRR4302540.4973924/1‑94 (MQ=60)
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GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > NC_000913/1019075‑1019253
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
