Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,019,162 |
A→G |
Y39H (TAC→CAC) |
ompA ← |
outer membrane protein 3a |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,019,162 | 0 | A | G | 100.0%
| 521.9
/ NA
| 161 | Y39H (TAC→CAC) | ompA | outer membrane protein 3a |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (95/66); total (95/66) |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTG > NC_000913/1019074‑1019251
|
gggTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAATCAGTGTCATGGTGCTgg > 2:2506949/1‑93 (MQ=255)
ggTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTggg > 1:624032/1‑93 (MQ=255)
gTTACCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa < 1:1523636/93‑1 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCCTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTgggc > 1:4784805/1‑92 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa < 1:2845015/93‑1 (MQ=255)
gTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGa < 1:5105863/93‑1 (MQ=255)
ttAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAc > 2:2336566/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGACATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAcc < 1:4271704/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAg > 1:93687/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGc < 2:291890/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGc > 1:1331043/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGc < 2:5903053/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGc > 1:1031427/1‑93 (MQ=255)
cTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGcc > 1:3081053/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCa > 1:2425053/1‑93 (MQ=255)
ggTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCa > 1:4751771/1‑93 (MQ=255)
gTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAg > 1:5951193/1‑93 (MQ=255)
tAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGt < 2:5575643/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt < 1:877368/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTAGGACCAGCCCAGtt > 2:4627422/1‑93 (MQ=255)
aaCCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGATGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGtt > 1:5483131/1‑93 (MQ=255)
accaccAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGttt > 1:4195077/1‑93 (MQ=255)
accaccAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGttt > 2:1554699/1‑93 (MQ=255)
caccaAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAg > 1:3283973/1‑93 (MQ=255)
accaAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGc > 2:3562150/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCAcc < 2:1467227/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGCCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGTTCGGGCCATTGTTGTTGATGAATCCAGTGTCATGGTGCTGGCACCAGCCCAGTTTAGCACCa < 1:6137154/93‑1 (MQ=255)
aaGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAg < 2:2710543/93‑1 (MQ=255)
gCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAgtg > 2:2613446/1‑93 (MQ=255)
aGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCa > 1:3791904/1‑93 (MQ=255)
aGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCa < 2:2267018/93‑1 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt > 1:4956914/1‑93 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt < 1:4907238/93‑1 (MQ=255)
gcCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgt > 2:2855199/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGgtgct > 2:3030436/1‑91 (MQ=255)
cAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGtt > 2:917608/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGtt > 2:450556/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 2:3797135/1‑93 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa < 2:1177130/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTa > 2:5602799/1‑93 (MQ=255)
tttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCg < 2:4814242/93‑1 (MQ=255)
ttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCgg < 1:1696666/93‑1 (MQ=255)
ttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCgg > 2:3513557/1‑93 (MQ=255)
ttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCgg < 2:1451880/93‑1 (MQ=255)
ttCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCgg < 1:339451/93‑1 (MQ=255)
tCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGa < 2:1751127/93‑1 (MQ=255)
tCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGa > 2:875275/1‑93 (MQ=255)
cATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAg > 1:4406828/1‑93 (MQ=255)
aTGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGc < 2:1393005/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGc > 1:1646831/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCg > 2:5008959/1‑93 (MQ=255)
gTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGcc < 1:2519998/93‑1 (MQ=255)
gTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGcc < 2:6001251/93‑1 (MQ=255)
tCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCt < 1:1263478/93‑1 (MQ=255)
ggCCATTGTTGTTGATGAAACCAGCGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTgcg > 2:2302784/1‑93 (MQ=255)
gCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTgcgc > 1:5294390/1‑93 (MQ=255)
gCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTgcgc < 1:293827/93‑1 (MQ=255)
ccATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCt > 1:1789478/1‑93 (MQ=255)
cATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGCAGCGGCCTGCGCTa > 1:3180974/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc > 1:5446641/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAc > 2:2711936/1‑93 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg > 1:5292224/1‑93 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg < 1:5266329/93‑1 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg > 1:4045838/1‑93 (MQ=255)
ttgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGCTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACg > 1:1017033/1‑93 (MQ=255)
tgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACgg > 2:4150515/1‑93 (MQ=255)
tgttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACgg > 2:316953/1‑93 (MQ=255)
gttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGt < 1:4486000/93‑1 (MQ=255)
gttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGt < 1:3723864/93‑1 (MQ=255)
gttgttgATGAAACCAGTGTCACGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGt < 2:5422629/93‑1 (MQ=255)
ttgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTa > 2:567658/1‑93 (MQ=255)
tgttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAg < 2:4550692/93‑1 (MQ=255)
gttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGc > 1:2265968/1‑93 (MQ=255)
ttgATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCg < 2:5794574/93‑1 (MQ=255)
gatgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGaa > 1:3285937/1‑93 (MQ=255)
tgaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAc < 1:2418636/93‑1 (MQ=255)
gaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGaaaac > 1:5891448/1‑91 (MQ=255)
gaAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAcc < 2:4008846/93‑1 (MQ=255)
aaaCCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAcca > 2:6197795/1‑93 (MQ=255)
aCCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagc > 2:1334069/1‑93 (MQ=255)
ccAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagcc > 1:2824478/1‑93 (MQ=255)
ccAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagcc > 1:5983650/1‑93 (MQ=255)
cAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagcca < 2:3402460/93‑1 (MQ=255)
aGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAccagccag < 2:4324267/93‑1 (MQ=255)
gtgtCATGGTGCTGGGACTAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGt > 2:4292871/1‑93 (MQ=255)
gtgtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGt < 2:4014592/93‑1 (MQ=255)
tgtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTg < 1:3827884/93‑1 (MQ=255)
tgtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTg < 1:915055/93‑1 (MQ=255)
gtCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGc > 2:124501/1‑93 (MQ=255)
tCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGcc < 1:3886760/93‑1 (MQ=255)
tCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGcc < 1:4112400/93‑1 (MQ=255)
cATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCa < 1:3561258/93‑1 (MQ=255)
cATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCa > 1:4357937/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGCTGGGACCTGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAc < 2:788745/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAc < 2:5566139/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAc < 2:1543229/93‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACt > 1:2284286/1‑93 (MQ=255)
tGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACt < 1:5182375/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTg > 2:3574398/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTg < 1:4126927/93‑1 (MQ=255)
|
GGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTG > NC_000913/1019074‑1019251
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATACGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCAAT > NC_000913/1019070‑1019255
|
ATACGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGC > SRR4302533.124493/1‑94 (MQ=60)
TACGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCT < SRR4302533.144611/94‑1 (MQ=60)
GGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGG > SRR4302533.627694/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCCTTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGC > SRR4302533.4813787/1‑94 (MQ=60)
GTTACCCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAC < SRR4302533.1532808/94‑1 (MQ=60)
GTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAC < SRR4302533.5136707/94‑1 (MQ=60)
GTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGAC < SRR4302533.2862522/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGACATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCA < SRR4302533.4297412/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAG > SRR4302533.94277/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAG > SRR4302533.889362/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGC > SRR4302533.1037492/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGC > SRR4302533.1339027/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCC > SRR4302533.3099955/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA > SRR4302533.4780579/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA > SRR4302533.2440024/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCA > SRR4302533.3984625/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAG > SRR4302533.5987190/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAG > SRR4302533.4940862/1‑94 (MQ=60)
GTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGT < SRR4302533.537836/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGATGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTT > SRR4302533.5516182/1‑94 (MQ=60)
AACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTT < SRR4302533.882520/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTT > SRR4302533.4220469/1‑94 (MQ=60)
CCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAG > SRR4302533.3304244/1‑94 (MQ=60)
CACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGC > SRR4302533.1587442/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCA > SRR4302533.2894543/1‑94 (MQ=60)
ACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCA > SRR4302533.3831293/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGCCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGTTCGGGCCATTGTTGTTGATGAATCCAGTGTCATGGTGCTGGCACCAGCCCAGTTTAGCACCAG < SRR4302533.6174127/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGT < SRR4302533.5856315/94‑1 (MQ=60)
AGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTG < SRR4302533.855431/94‑1 (MQ=60)
CACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTA > SRR4302533.4599630/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGTAGCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTAC > SRR4302533.3091659/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACC > SRR4302533.2227851/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCA > SRR4302533.3815117/1‑94 (MQ=60)
CGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGT > SRR4302533.4986940/1‑94 (MQ=60)
GCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTG < SRR4302533.4936970/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTG > SRR4302533.353560/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTT > SRR4302533.6148500/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTT > SRR4302533.3754097/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTC > SRR4302533.5208636/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTC > SRR4302533.2632020/1‑94 (MQ=60)
TTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGA < SRR4302533.341521/94‑1 (MQ=60)
TTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGA < SRR4302533.1706942/94‑1 (MQ=60)
TCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAG > SRR4302533.4433439/1‑94 (MQ=60)
CATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGC > SRR4302533.1656804/1‑94 (MQ=60)
CATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGC < SRR4302533.1249984/94‑1 (MQ=60)
CATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGC > SRR4302533.2461872/1‑94 (MQ=60)
GGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCC < SRR4302533.1744091/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCT < SRR4302533.6009072/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCT < SRR4302533.5296924/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCT < SRR4302533.2535526/94‑1 (MQ=60)
TCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTG < SRR4302533.1271037/94‑1 (MQ=60)
GGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGC > SRR4302533.5326081/1‑94 (MQ=60)
GCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCT < SRR4302533.295621/94‑1 (MQ=60)
GCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCT > SRR4302533.1800359/1‑94 (MQ=60)
CCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGCAGCGGCCTGCGCTA > SRR4302533.3200544/1‑94 (MQ=60)
CATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAC > SRR4302533.5479452/1‑94 (MQ=60)
CATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTAC > SRR4302533.3207279/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302533.5323906/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302533.4070460/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302533.5323907/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGCTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACG > SRR4302533.1023011/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGG < SRR4302533.5297929/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGT < SRR4302533.3378606/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTA < SRR4302533.4513159/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTA < SRR4302533.3746712/94‑1 (MQ=60)
TGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGC > SRR4302533.2279987/1‑94 (MQ=60)
TGATGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAA > SRR4302533.3306221/1‑94 (MQ=60)
TGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACC < SRR4302533.2433576/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAAAC > SRR4302533.5927035/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCC > SRR4302533.2841859/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCC > SRR4302533.6019886/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCC > SRR4302533.4092340/1‑94 (MQ=60)
CCAGTGTCATGGTGCTGGGGCCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCA < SRR4302533.2408739/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC < SRR4302533.4784751/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC < SRR4302533.920434/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC < SRR4302533.3851286/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGC > SRR4302533.1413620/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC > SRR4302533.4426859/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCC > SRR4302533.418575/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCA > SRR4302533.4384242/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCA < SRR4302533.3910470/94‑1 (MQ=60)
TCATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCA < SRR4302533.4137394/94‑1 (MQ=60)
CATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCAC < SRR4302533.3583200/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACT > SRR4302533.2298424/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACT > SRR4302533.4355210/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTG < SRR4302533.5213666/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGC < SRR4302533.4151980/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > SRR4302533.3371346/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA < SRR4302533.5864896/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCA > SRR4302533.113160/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCAA > SRR4302533.3417690/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGACCAGCCCAGTTTAGCTCCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCAAT < SRR4302533.3711210/94‑1 (MQ=60)
|
ATACGGGTTAACCTGGTAACCACCAAAAGCACCAGCGCCCAGTTGGTTTTCATGGGTCGGGCCATTGTTGTTGATGAAACCAGTGTCATGGTACTGGGACCAGCCCAGTTTAGCACCAGTGTACCAGGTGTTATCTTTCGGAGCGGCCTGCGCTACGGTAGCGAAACCAGCCAGTGCCACTGCAAT > NC_000913/1019070‑1019255
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
