Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,116,479 |
A→G |
A150A (GCA→GCG) |
yceA → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,116,479 | 0 | A | G | 100.0%
| 919.5
/ NA
| 284 | A150A (GCA→GCG) | yceA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (150/134); total (150/134) |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > NC_000913/1116389‑1116568
|
ggTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTa > 2:3723269/1‑93 (MQ=255)
gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAt > 1:6721655/1‑93 (MQ=255)
gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAt > 2:4978401/1‑93 (MQ=255)
tATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAtt < 2:4259533/93‑1 (MQ=255)
aTTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAttt < 1:8588755/93‑1 (MQ=255)
ttGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTa > 1:5160977/1‑93 (MQ=255)
ttGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTa > 2:1844582/1‑93 (MQ=255)
tGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAt > 2:3815510/1‑93 (MQ=255)
gATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGGACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAc > 1:7278050/1‑93 (MQ=255)
gtCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 1:5527563/92‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 1:8388529/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa > 1:4756121/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 2:6648107/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 1:816475/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 2:1119370/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa < 1:1346291/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGGATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGGTATTTATGGACa > 1:1062338/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt < 1:9914507/93‑1 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt > 2:6878283/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt < 1:1756721/93‑1 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt > 2:9427479/1‑93 (MQ=255)
cTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGc < 2:7073892/93‑1 (MQ=255)
tCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCg > 1:3907239/1‑93 (MQ=255)
tCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCg > 1:6718578/1‑93 (MQ=255)
cACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGt < 1:5814795/93‑1 (MQ=255)
cACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGt > 2:6258042/1‑93 (MQ=255)
cTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTac > 1:4079176/1‑92 (MQ=255)
ttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAcc > 2:222886/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTa > 1:299381/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTa > 2:5161616/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTa > 2:7697489/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTAt < 2:1443974/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTAt > 2:5386677/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTAt > 1:7655450/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATg > 1:7205186/1‑93 (MQ=255)
aGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAg < 2:3983456/93‑1 (MQ=255)
gCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGt > 1:593094/1‑93 (MQ=255)
cAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAgga > 2:247221/1‑91 (MQ=255)
cAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTa < 2:602549/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAt > 1:4256106/1‑93 (MQ=255)
aTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATg < 1:7420150/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGaa < 1:4671895/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAg < 2:3106019/93‑1 (MQ=255)
tGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGt < 2:2579304/93‑1 (MQ=255)
tGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGt < 2:4933178/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTg < 1:9380423/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTACGAAGTg < 2:9758218/93‑1 (MQ=255)
gTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgg < 2:7763956/93‑1 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTa > 1:4929133/1‑84 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 1:282583/93‑1 (MQ=255)
tATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCAc < 2:8514814/93‑1 (MQ=255)
tATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAGCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCAc < 1:429213/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACt < 2:5741162/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACt > 1:4590490/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACt > 2:7643472/1‑93 (MQ=255)
tCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACtt > 1:2256740/1‑93 (MQ=255)
tCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACtt > 2:9129604/1‑93 (MQ=255)
tCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACtt > 2:4579961/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTg < 2:8068290/93‑1 (MQ=255)
gCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGa > 1:2159208/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaa > 1:1069997/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaa > 1:1416823/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaaa > 1:9964344/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAc > 1:1899654/1‑93 (MQ=255)
cggcggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAcg < 1:3532797/93‑1 (MQ=255)
ggcggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAcgc > 2:3488652/1‑93 (MQ=255)
gAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTc < 1:3472617/93‑1 (MQ=255)
gaGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCg < 1:157578/92‑1 (MQ=255)
aaGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCg < 1:3845531/93‑1 (MQ=255)
tGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaaa < 2:1651120/93‑1 (MQ=255)
tGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaaa < 1:9519321/93‑1 (MQ=255)
gAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAt < 2:7831438/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGTGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTc > 2:5817992/1‑93 (MQ=255)
aCGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTc > 1:5720240/1‑93 (MQ=255)
gCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg < 2:5666582/93‑1 (MQ=255)
ccATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCgg > 2:9680269/1‑93 (MQ=255)
cATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGc > 1:1959018/1‑93 (MQ=255)
aTGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCa > 2:8337184/1‑93 (MQ=255)
gCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGa < 1:4492476/93‑1 (MQ=255)
ttGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATa > 2:9255346/1‑93 (MQ=255)
ttGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATa > 2:1682957/1‑93 (MQ=255)
tGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAc < 1:6793482/93‑1 (MQ=255)
tGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAc < 2:3220603/93‑1 (MQ=255)
gACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAcc > 2:2033378/1‑93 (MQ=255)
gACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAcc > 1:9108227/1‑93 (MQ=255)
cGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCtt > 1:6905688/1‑93 (MQ=255)
gATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTc < 1:2503779/93‑1 (MQ=255)
gATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTc < 1:6427192/93‑1 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcc > 1:9287241/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcc > 2:4109414/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcc > 1:9616034/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcc > 1:4188070/1‑93 (MQ=255)
cccGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGt < 1:868169/93‑1 (MQ=255)
cccGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGt < 2:8751602/93‑1 (MQ=255)
cGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGa < 1:3723269/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag > 1:8293311/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag < 2:4694727/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag < 2:8576159/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag < 2:127353/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGagca > 2:5926924/1‑93 (MQ=255)
|
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > NC_000913/1116389‑1116568
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG > NC_000913/1116387‑1116572
|
GACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGC < SRR4302540.5224070/94‑1 (MQ=60)
GACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGC > SRR4302540.522063/1‑94 (MQ=60)
GCGGTATTGACGATCATCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCT < SRR4302540.1994080/94‑1 (MQ=60)
ACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCT < SRR4302540.1693017/94‑1 (MQ=60)
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGCGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTA > SRR4302540.73536/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAT < SRR4302540.8533056/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAT > SRR4302540.6795840/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGACGATCCGCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAT > SRR4302540.6795839/1‑94 (MQ=60)
GTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATT > SRR4302540.4476859/1‑94 (MQ=60)
TATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTT < SRR4302540.6828588/94‑1 (MQ=60)
TATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTT < SRR4302540.1519539/94‑1 (MQ=60)
ATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTA > SRR4302540.9498509/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTA < SRR4302540.8688596/94‑1 (MQ=60)
ATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTA > SRR4302540.5217083/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGCATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTA > SRR4302540.3966064/1‑94 (MQ=60)
TTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAT < SRR4302540.9477748/94‑1 (MQ=60)
TTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAT > SRR4302540.731973/1‑94 (MQ=60)
TGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATC < SRR4302540.5646803/94‑1 (MQ=60)
GACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCG > SRR4302540.3249862/1‑94 (MQ=60)
ACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGA > SRR4302540.3774718/1‑94 (MQ=60)
ACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGA > SRR4302540.580713/1‑94 (MQ=60)
CGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGGACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAC > SRR4302540.7359256/1‑94 (MQ=60)
CGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAC < SRR4302540.42144/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACA < SRR4302540.9695685/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACA > SRR4302540.4806870/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACA < SRR4302540.7386060/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGGATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGGTATTTATGGACA > SRR4302540.1073156/1‑94 (MQ=60)
cgcctaccttttctgccaggaatgttggtgggttccctCAAGCGGCGTAAGTGAAAGGCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.1406949/56‑1 (MQ=42)
GTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.5588438/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.1360431/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.8485861/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.1406948/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT < SRR4302540.825147/94‑1 (MQ=60)
TCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATG < SRR4302540.1775758/94‑1 (MQ=60)
TCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATG > SRR4302540.3161155/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATG < SRR4302540.10030303/94‑1 (MQ=60)
CCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGC > SRR4302540.3515006/1‑94 (MQ=60)
CCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATAC > SRR4302540.9596652/1‑94 (MQ=60)
CTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCG > SRR4302540.6792705/1‑94 (MQ=60)
CTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCG > SRR4302540.3949594/1‑94 (MQ=60)
CACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTA < SRR4302540.5879065/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAC > SRR4302540.4123162/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAA > SRR4302540.4123160/1‑94 (MQ=60)
CTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAC < SRR4302540.1949021/94‑1 (MQ=60)
CTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAC > SRR4302540.2303374/1‑94 (MQ=60)
TTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACC < SRR4302540.4190024/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCA < SRR4302540.1359653/94‑1 (MQ=60)
TGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCAC < SRR4302540.5891897/94‑1 (MQ=60)
TGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCAC > SRR4302540.6807005/1‑94 (MQ=60)
GATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACT < SRR4302540.1705992/94‑1 (MQ=60)
GATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACT < SRR4302540.4323663/94‑1 (MQ=60)
ATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTA > SRR4302540.302340/1‑94 (MQ=60)
TGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTAT > SRR4302540.7741637/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATG > SRR4302540.7285509/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATG > SRR4302540.7007365/1‑94 (MQ=60)
CAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAG > SRR4302540.4840194/1‑94 (MQ=60)
agaaaggtggtggattatgTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCC‑TGGCTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTA < SRR4302540.9567800/75‑1 (MQ=60)
AGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGT > SRR4302540.599475/1‑94 (MQ=60)
AGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGT > SRR4302540.42974/1‑94 (MQ=60)
AGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGT < SRR4302540.7586550/94‑1 (MQ=60)
CAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAT > SRR4302540.4302410/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATG < SRR4302540.4913589/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA < SRR4302540.7502798/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302540.1421145/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302540.1077871/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302540.9334335/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAA > SRR4302540.1584675/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAG > SRR4302540.8744129/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAG < SRR4302540.1922906/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAG < SRR4302540.4721897/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGT < SRR4302540.7964779/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGG < SRR4302540.3628117/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGG < SRR4302540.9492084/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATaagcgcta > SRR4302540.4982262/1‑86 (MQ=60)
GTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGG < SRR4302540.6022032/94‑1 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGTAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG > SRR4302540.2218702/1‑94 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG < SRR4302540.285356/94‑1 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG < SRR4302540.6693171/94‑1 (MQ=60)
GAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGC > SRR4302540.9864846/1‑94 (MQ=60)
AGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCA > SRR4302540.3904010/1‑94 (MQ=60)
GTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCAC > SRR4302540.3911777/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACT > SRR4302540.4639907/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACT > SRR4302540.4639906/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAGCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACT < SRR4302540.433727/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTT > SRR4302540.2280959/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTT > SRR4302540.8334066/1‑94 (MQ=60)
TCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTT < SRR4302540.1892330/94‑1 (MQ=60)
CTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTG > SRR4302540.850188/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGA > SRR4302540.2182459/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAA > SRR4302540.1432125/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAA < SRR4302540.7566378/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAA > SRR4302540.1080903/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAA > SRR4302540.4781339/1‑94 (MQ=60)
CAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTACCCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAA < SRR4302540.8450642/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAA < SRR4302540.5221031/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAA > SRR4302540.10080600/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAA > SRR4302540.4629298/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC > SRR4302540.7166654/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC > SRR4302540.1920432/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC < SRR4302540.2212370/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC < SRR4302540.273026/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC < SRR4302540.911442/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGC < SRR4302540.2648689/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGC < SRR4302540.3571359/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCT < SRR4302540.2096780/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCT < SRR4302540.1597057/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302540.2012920/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302540.3579162/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCG < SRR4302540.3510423/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGA < SRR4302540.159173/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGA < SRR4302540.599435/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGA < SRR4302540.3887349/94‑1 (MQ=60)
AGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAA < SRR4302540.5199190/94‑1 (MQ=60)
tgaactaaATGCTTGACGATCGCGATGCGCTATTTATAGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAT < SRR4302540.8031255/86‑1 (MQ=60)
TGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAT < SRR4302540.9632059/94‑1 (MQ=60)
TGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAT < SRR4302540.9632057/94‑1 (MQ=60)
GAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATT > SRR4302540.6269244/1‑94 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC > SRR4302540.5783198/1‑94 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC < SRR4302540.5598485/94‑1 (MQ=60)
ACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCC > SRR4302540.3828534/1‑94 (MQ=60)
CGCCATGCTTGACGATCCCGATTCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCG > SRR4302540.1867505/1‑94 (MQ=60)
GCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGG > SRR4302540.8348724/1‑94 (MQ=60)
GCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGG > SRR4302540.8413295/1‑94 (MQ=60)
CCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGC > SRR4302540.1980312/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAG > SRR4302540.9098830/1‑94 (MQ=60)
GCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGAT < SRR4302540.10064899/94‑1 (MQ=60)
GCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGAT < SRR4302540.4541184/94‑1 (MQ=60)
GCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGAT < SRR4302540.4541185/94‑1 (MQ=60)
GTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATA < SRR4302540.5802475/94‑1 (MQ=60)
CTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATA > SRR4302540.1280090/1‑94 (MQ=60)
TTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAC > SRR4302540.7318080/1‑94 (MQ=60)
TTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAC > SRR4302540.8034179/1‑94 (MQ=60)
TGACGATCCCGATGCGCTATTTATGGACATGCGTACCCACTATGAGTATTAAGTTGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAGTTCCGGCGGCTACC > SRR4302540.9217690/1‑94 (MQ=60)
TGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACC < SRR4302540.6868615/94‑1 (MQ=60)
TGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACC > SRR4302540.9217689/1‑94 (MQ=60)
GACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCT < SRR4302540.2311960/94‑1 (MQ=60)
GACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCT > SRR4302540.6877350/1‑94 (MQ=60)
ACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTT > SRR4302540.6982473/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC > SRR4302540.9398225/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302540.2530798/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC > SRR4302540.9729403/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC > SRR4302540.4233602/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302540.4299831/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302540.6498729/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302540.518785/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302540.5587442/94‑1 (MQ=60)
CCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTG < SRR4302540.877379/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG > SRR4302540.9421905/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG < SRR4302540.9971902/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG > SRR4302540.10043031/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG > SRR4302540.8389615/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG < SRR4302540.3763888/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTGACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGC < SRR4302540.6941711/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAGAAGCGCTCGACATTCCGGCCGATACCTTCCTTGCGC > SRR4302540.2750802/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGC > SRR4302540.4716857/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGC > SRR4302540.4334322/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGC > SRR4302540.2957966/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302540.6521406/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302540.4798269/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAG < SRR4302540.3563317/94‑1 (MQ=60)
GCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGC > SRR4302540.2062461/1‑94 (MQ=60)
GCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG < SRR4302540.388687/94‑1 (MQ=60)
|
GACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG > NC_000913/1116387‑1116572
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
