Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,116,479 |
A→G |
A150A (GCA→GCG) |
yceA → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,116,479 | 0 | A | G | 99.6%
| 714.7
/ NA
| 222 | A150A (GCA→GCG) | yceA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (126/95); minor base T (0/1); total (126/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > NC_000913/1116389‑1116568
|
cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCt < 1:3686955/93‑1 (MQ=255)
gTATTGACGATCCTCACTTTGATGGCAGCAATGTTGGTGATTATCTTAAAGCGGCGGAAGTGCACGCCATGCTTGAAGATCCCGATGCCCTAt > 2:4111175/1‑93 (MQ=255)
gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAt > 2:4744442/1‑93 (MQ=255)
gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAt < 2:2373443/93‑1 (MQ=255)
tATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAtt > 2:5901239/1‑93 (MQ=255)
aTTGACGATCCTCACTGTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAttt < 1:2522683/93‑1 (MQ=255)
ttGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTa < 2:1781813/93‑1 (MQ=255)
ttGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTa < 2:2332633/93‑1 (MQ=255)
tGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAt < 2:2536629/93‑1 (MQ=255)
tGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAt < 1:2850156/93‑1 (MQ=255)
gACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATc > 1:3460131/1‑93 (MQ=255)
aCGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCg > 2:3626418/1‑93 (MQ=255)
gATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAc < 2:5761652/93‑1 (MQ=255)
gATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAc > 2:784131/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGGCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACa > 2:875209/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt > 2:3326213/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAt > 1:4558514/1‑93 (MQ=255)
ccTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATg < 1:3882066/93‑1 (MQ=255)
cACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGt < 2:486894/93‑1 (MQ=255)
aCTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTa > 1:2765732/1‑93 (MQ=255)
cTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTaa > 2:1137606/1‑93 (MQ=255)
tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAc > 1:4688337/1‑93 (MQ=255)
tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAc > 2:5632175/1‑93 (MQ=255)
tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAc < 1:3180688/93‑1 (MQ=255)
tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAc < 2:1463963/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAcc > 1:2481932/1‑93 (MQ=255)
tGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCa > 2:758018/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTa > 2:2571929/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCAATGTTGGTGAGGATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACGACTAt > 1:4221392/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATg > 1:2146279/1‑93 (MQ=255)
aGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAg > 2:2118965/1‑93 (MQ=255)
aGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAg > 2:3710212/1‑93 (MQ=255)
cAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTa < 1:978753/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAt < 2:1640560/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTGGTGAGTATCGGCAAGGTGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAt < 2:3480177/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa > 1:2398036/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa < 2:4079318/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa < 2:5410695/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa < 1:3450492/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa > 1:3995198/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGaa < 2:2006223/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGaa > 1:5921247/1‑93 (MQ=255)
gTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgg > 2:4170919/1‑93 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 2:30292/93‑1 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 1:2318257/93‑1 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 2:321678/93‑1 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg > 2:5064901/1‑93 (MQ=255)
tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 2:5403303/93‑1 (MQ=255)
gAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgggg < 1:3905895/93‑1 (MQ=255)
aGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGc > 1:6184862/1‑93 (MQ=255)
aGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGc < 2:2940380/93‑1 (MQ=255)
gTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCa > 2:4349461/1‑93 (MQ=255)
tATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCAc > 1:4159886/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACt < 2:6170305/93‑1 (MQ=255)
tCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACtt < 1:2533648/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCGGCGTAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACttt < 2:577999/93‑1 (MQ=255)
tGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTg < 2:3261721/93‑1 (MQ=255)
tGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTg > 2:1740603/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaa > 1:3543911/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaa < 1:1935964/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaaaa < 1:5356964/93‑1 (MQ=255)
ggcggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAcgc < 2:6297933/93‑1 (MQ=255)
cggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACgcgc > 2:2456610/1‑93 (MQ=255)
aggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCGGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACgcgc < 2:387958/92‑1 (MQ=255)
ggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCt > 1:2842834/1‑93 (MQ=255)
ggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCt < 1:2356457/93‑1 (MQ=255)
gAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTc > 1:3064752/1‑93 (MQ=255)
gAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTc > 1:5056932/1‑93 (MQ=255)
gAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTc > 1:5801392/1‑93 (MQ=255)
aaGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCg > 1:1762211/1‑93 (MQ=255)
aaGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCg < 1:1088799/93‑1 (MQ=255)
aGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGa > 1:1518124/1‑93 (MQ=255)
gTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaa > 1:1688592/1‑93 (MQ=255)
gTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaa > 1:3311617/1‑93 (MQ=255)
gTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaa > 1:1338833/1‑93 (MQ=255)
gTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaa > 1:2853805/1‑93 (MQ=255)
tGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaaa > 1:1180436/1‑93 (MQ=255)
gAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAt > 1:5520401/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAtt < 1:2795398/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGGAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTc > 1:5968285/1‑93 (MQ=255)
gctaTGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAGGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg < 1:1799760/90‑1 (MQ=255)
tGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAg > 1:749641/1‑93 (MQ=255)
ttGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATa > 2:4519756/1‑93 (MQ=255)
gACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAcc > 2:2267397/1‑93 (MQ=255)
cGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCtg < 2:365878/93‑2 (MQ=255)
gATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTc > 2:2181185/1‑93 (MQ=255)
gATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTc < 2:5475757/93‑1 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGGCATGTGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGAGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcg > 2:4204603/1‑92 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGCAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGCTACCTTcc > 1:5583278/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTcc > 2:2707127/1‑93 (MQ=255)
tCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCg < 1:2963977/93‑1 (MQ=255)
tCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCg < 2:4439055/93‑1 (MQ=255)
tCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCg > 2:1232470/1‑93 (MQ=255)
cggATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTg > 2:3974061/3‑93 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag > 1:497009/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGag > 2:4459069/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGagc < 1:5174742/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGagc > 1:2699030/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGagca < 1:1441841/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGagca > 1:4606574/1‑93 (MQ=255)
|
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > NC_000913/1116389‑1116568
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG > NC_000913/1116389‑1116572
|
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTA < SRR4302533.3709616/94‑1 (MQ=60)
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTA < SRR4302533.5335572/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTAT > SRR4302533.4770715/1‑94 (MQ=60)
GTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATT > SRR4302533.1702047/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGATCCTCACTGTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTA < SRR4302533.2538225/94‑1 (MQ=60)
TTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTAT < SRR4302533.3697982/94‑1 (MQ=60)
TGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATC > SRR4302533.3481490/1‑94 (MQ=60)
TGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATC < SRR4302533.2867691/94‑1 (MQ=60)
GACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCG < SRR4302533.4865920/94‑1 (MQ=60)
ACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGA < SRR4302533.2499165/94‑1 (MQ=60)
ACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGA > SRR4302533.4355726/1‑94 (MQ=60)
ACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGA < SRR4302533.1488503/94‑1 (MQ=60)
CGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAC > SRR4302533.341476/1‑94 (MQ=60)
CGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGAC > SRR4302533.6167098/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACAT > SRR4302533.4586159/1‑94 (MQ=60)
CCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGC < SRR4302533.3905756/94‑1 (MQ=60)
CCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGC > SRR4302533.5196421/1‑94 (MQ=60)
CCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGC < SRR4302533.2384231/94‑1 (MQ=60)
CACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTA > SRR4302533.2782689/1‑94 (MQ=60)
CTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAAC > SRR4302533.4716755/1‑94 (MQ=60)
TTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACC < SRR4302533.3200253/94‑1 (MQ=60)
TTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACC > SRR4302533.2497237/1‑94 (MQ=60)
TGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCAC > SRR4302533.5761752/1‑94 (MQ=60)
GATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACT < SRR4302533.1233906/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCAATGTTGGTGAGGATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACGACTAT > SRR4302533.4246919/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATG > SRR4302533.2159499/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGA < SRR4302533.2437759/94‑1 (MQ=60)
CAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAG > SRR4302533.4185282/1‑94 (MQ=60)
CAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAG < SRR4302533.2868118/94‑1 (MQ=60)
CAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAT > SRR4302533.5835345/1‑94 (MQ=60)
CAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAT < SRR4302533.984492/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302533.1781413/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302533.2863333/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302533.2412838/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGA > SRR4302533.4019523/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGTAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGTA > SRR4302533.5957041/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAA < SRR4302533.3471797/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAA > SRR4302533.5957040/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAG > SRR4302533.179293/1‑94 (MQ=60)
GGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGG < SRR4302533.2818754/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGG < SRR4302533.4308586/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGG < SRR4302533.374314/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGG > SRR4302533.460125/1‑94 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG > SRR4302533.307177/1‑94 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG > SRR4302533.2559302/1‑94 (MQ=60)
TGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGG < SRR4302533.2332609/94‑1 (MQ=60)
GAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGC < SRR4302533.3929751/94‑1 (MQ=60)
GAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGC > SRR4302533.6221994/1‑94 (MQ=60)
GTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCAC > SRR4302533.4185098/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACT > SRR4302533.2877683/1‑94 (MQ=60)
TCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTT < SRR4302533.2549247/94‑1 (MQ=60)
CTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTG < SRR4302533.3610328/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAA > SRR4302533.3565751/1‑94 (MQ=60)
CAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAA > SRR4302533.3948790/1‑94 (MQ=60)
CAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAA < SRR4302533.1947773/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC < SRR4302533.5389122/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAC < SRR4302533.1884091/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACG < SRR4302533.4151497/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGC < SRR4302533.5073821/94‑1 (MQ=60)
GGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCG < SRR4302533.2442299/94‑1 (MQ=60)
GGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCG < SRR4302533.3281302/94‑1 (MQ=60)
GCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGC < SRR4302533.1134443/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCT > SRR4302533.2797912/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCT > SRR4302533.2860330/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGTAAACGCGCTC > SRR4302533.2238950/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302533.5087496/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302533.3226414/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302533.3083576/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC < SRR4302533.2338612/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC < SRR4302533.2371026/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC < SRR4302533.1625181/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTC > SRR4302533.5836437/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCG > SRR4302533.1772947/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCG < SRR4302533.2718462/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGA < SRR4302533.1095227/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGA > SRR4302533.1527262/1‑94 (MQ=60)
AGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAA > SRR4302533.1698825/1‑94 (MQ=60)
AGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAA > SRR4302533.3332068/1‑94 (MQ=60)
AGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAA > SRR4302533.1346891/1‑94 (MQ=60)
AGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAA > SRR4302533.2871362/1‑94 (MQ=60)
GTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAA > SRR4302533.1187527/1‑94 (MQ=60)
TGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAT > SRR4302533.5553732/1‑94 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC < SRR4302533.2544335/94‑1 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC > SRR4302533.821009/1‑94 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC < SRR4302533.2812591/94‑1 (MQ=60)
AACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGGAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTC > SRR4302533.6004417/1‑94 (MQ=60)
GCTATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAGGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGG < SRR4302533.1810709/94‑1 (MQ=60)
CCATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGC < SRR4302533.5329629/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAG > SRR4302533.58453/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAG > SRR4302533.754056/1‑94 (MQ=60)
TCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGAT < SRR4302533.1351619/94‑1 (MQ=60)
GCTTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGAT < SRR4302533.2585100/94‑1 (MQ=60)
TTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAC < SRR4302533.228278/94‑1 (MQ=60)
TTGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAC > SRR4302533.2913313/1‑94 (MQ=60)
TGACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACC > SRR4302533.6172642/1‑94 (MQ=60)
ACGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTT < SRR4302533.6275584/94‑1 (MQ=60)
CGATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTC < SRR4302533.2818106/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGCAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGCTACCTTCC > SRR4302533.5617014/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC > SRR4302533.3995781/1‑94 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302533.3198932/94‑1 (MQ=60)
GATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCC < SRR4302533.5549635/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTGTGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCG < SRR4302533.4677938/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCG > SRR4302533.3479231/1‑94 (MQ=60)
TCCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGT < SRR4302533.2982096/94‑1 (MQ=60)
ACCCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGT < SRR4302533.3907936/94‑1 (MQ=60)
CCGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGA < SRR4302533.1462902/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG > SRR4302533.499971/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAG > SRR4302533.3536873/1‑94 (MQ=60)
GATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGC > SRR4302533.2715585/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302533.984712/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302533.5597636/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA < SRR4302533.5206000/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302533.4634477/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCA > SRR4302533.2099905/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAG < SRR4302533.1450541/94‑1 (MQ=60)
CGCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGCGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCT > SRR4302533.2375395/1‑94 (MQ=60)
GCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG < SRR4302533.164325/94‑1 (MQ=60)
GCTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTGCCGTGAGCAGCTG > SRR4302533.1098415/1‑94 (MQ=60)
|
CGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTCCGTGAGCAGCTG > NC_000913/1116389‑1116572
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
