Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,136,396 |
A→G |
G301G (GGA→GGG) |
flgI → |
FlgI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,136,396 | 0 | A | G | 100.0%
| 700.2
/ NA
| 215 | G301G (GGA→GGG) | flgI | FlgI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (115/100); total (115/100) |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAA > NC_000913/1136306‑1136485
|
tgACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCa < 2:4031086/92‑1 (MQ=255)
acacCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACCCCGTTTGGTGGTGGGCAGa < 2:5860881/93‑1 (MQ=255)
aCAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGGGGTGGGCAGa > 2:8553303/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGAc < 2:3741252/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACt > 1:6022077/1‑93 (MQ=255)
gCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACtg > 1:3486559/1‑93 (MQ=255)
cTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACtgt < 2:3424837/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTgg < 1:9510733/93‑1 (MQ=255)
gcgGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGtt < 2:3489985/93‑1 (MQ=255)
cgGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTa > 1:7953151/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTAc < 2:8124556/93‑1 (MQ=255)
tAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTc < 1:9735692/93‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTcc > 2:1352673/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGTGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTAGGCAGACTGTGGTTACTCcac < 2:8626886/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACAACGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca > 1:4633596/1‑93 (MQ=255)
ccAGGGGAATCTCTCACTAACAGTAAATCGGCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca < 2:554998/92‑1 (MQ=255)
cAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaa > 2:9760408/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAATTTCTCAGTAACAGTAAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa < 2:9559552/93‑1 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCGCaaa > 1:9977402/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa > 1:1584784/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa > 2:1658777/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa > 1:3428710/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa > 1:3082920/1‑93 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACGGTAAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTGGGTGGTGGGCAGACGGTGGTTACTCCTCAAAc < 2:6652771/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc > 1:5067914/1‑93 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc > 2:7942306/1‑93 (MQ=255)
gggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACg > 2:2480998/1‑93 (MQ=255)
ggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGc > 2:4656186/1‑93 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCac > 1:1936285/1‑92 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAg > 1:522427/1‑93 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAg < 2:2015164/93‑1 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAg < 1:6398449/93‑1 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAg > 2:4242720/1‑93 (MQ=255)
tctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGAt < 1:4699078/93‑1 (MQ=255)
ctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATc > 1:5979705/1‑93 (MQ=255)
ctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATc > 2:294614/1‑93 (MQ=255)
ctctcAGTAACAGTTAATCGGCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACGCCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATc < 1:2430933/93‑1 (MQ=255)
ctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCTGATCGa < 2:9881830/93‑1 (MQ=255)
ctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGa > 1:2199662/1‑93 (MQ=255)
cAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAtt < 2:2819637/93‑1 (MQ=255)
gTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTa < 2:6773249/93‑1 (MQ=255)
gTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTa > 2:6960952/1‑93 (MQ=255)
gTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTa < 1:6248431/93‑1 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc < 1:9138818/93‑1 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc > 2:2232661/1‑93 (MQ=255)
aCAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTCGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGc > 2:1958050/1‑93 (MQ=255)
gTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCag > 1:7079149/1‑93 (MQ=255)
gTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACAACGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCag > 2:6180873/1‑93 (MQ=255)
ttAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCCCAAAAGCAGATGGCTTTACGcgacg > 1:2596730/1‑89 (MQ=255)
ttAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCaga < 1:2126328/93‑1 (MQ=255)
ttAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCaga < 2:5624945/93‑1 (MQ=255)
tAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCagag > 2:609333/1‑93 (MQ=255)
aaTCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgc < 2:5261280/93‑1 (MQ=255)
aaTCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgc > 2:7658334/1‑93 (MQ=255)
aaTCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgc < 1:2412213/93‑1 (MQ=255)
cGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcggc < 2:8355076/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcggcg > 1:7487813/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt > 1:5395139/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt > 2:8240822/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt > 1:8802725/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt < 1:7796191/93‑1 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt > 2:9658612/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt < 1:3308781/93‑1 (MQ=255)
ggCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTc > 1:1473424/1‑93 (MQ=255)
ggCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGGTc > 1:4293211/1‑93 (MQ=255)
gCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCg > 2:7492112/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtttgt > 1:8491673/1‑90 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc > 2:3266775/1‑93 (MQ=255)
cAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCt > 1:7644105/1‑93 (MQ=255)
aaTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTg > 1:3734353/1‑93 (MQ=255)
aaTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTg > 1:3954252/1‑93 (MQ=255)
aaTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTg > 1:772204/1‑93 (MQ=255)
aTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGc < 2:7244292/93‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGc > 1:1074855/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCaa > 2:2429142/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCaa > 1:8233245/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCaaa > 2:8757273/1‑93 (MQ=255)
cagccagcCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAg < 2:5140461/93‑1 (MQ=255)
agccagccAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGc < 1:7871686/93‑1 (MQ=255)
ccagccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGt < 2:5421923/93‑1 (MQ=255)
cagccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTa < 2:5377362/93‑1 (MQ=255)
cagccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTa < 2:1213439/93‑1 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTTCg > 2:6497530/1‑93 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACg > 2:4060762/1‑93 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACg < 1:3786666/93‑1 (MQ=255)
cagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGtt > 1:1627665/1‑93 (MQ=255)
gATACACCGTTTGGTGGTGGGGAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTcc > 1:4397124/1‑93 (MQ=255)
gATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTcc > 2:7998319/1‑93 (MQ=255)
aTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCa > 1:8887373/1‑93 (MQ=255)
aTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCa < 2:9087745/93‑1 (MQ=255)
aTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCa < 2:394483/93‑1 (MQ=255)
acacCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAgc > 1:8323407/1‑93 (MQ=255)
ccGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGcc < 2:317589/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGc > 1:6880927/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGATCGCTGGACAGCGTCCGGTCCACCGCCAGc > 2:6693070/1‑93 (MQ=255)
gtggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCa < 1:4793432/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAAt > 2:2156887/1‑93 (MQ=255)
ggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAAt < 1:1004764/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAAt < 2:9935347/93‑1 (MQ=255)
tggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATaa < 1:6985766/93‑1 (MQ=255)
|
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAA > NC_000913/1136306‑1136485
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG > NC_000913/1136305‑1136489
|
TCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCA > SRR4302540.5609216/1‑94 (MQ=60)
CCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGAGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCA < SRR4302540.5984648/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACT > SRR4302540.3742431/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACT > SRR4302540.4923427/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACT > SRR4302540.6088885/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGAGTG > SRR4302540.2030188/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTG > SRR4302540.3524529/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGT < SRR4302540.4788974/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTG < SRR4302540.1285907/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGG > SRR4302540.4710376/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGT < SRR4302540.9623389/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTA < SRR4302540.6410754/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTA > SRR4302540.8045859/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTAC < SRR4302540.4397841/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTC < SRR4302540.5249090/94‑1 (MQ=60)
TAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCC < SRR4302540.9850002/94‑1 (MQ=60)
AGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCA > SRR4302540.8494/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACAACGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACA > SRR4302540.4683214/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCGCAAA > SRR4302540.10093751/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAA > SRR4302540.1602095/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAA > SRR4302540.3116749/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAA > SRR4302540.3465968/1‑94 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC > SRR4302540.2447528/1‑94 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC > SRR4302540.5122707/1‑94 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC > SRR4302540.3451722/1‑94 (MQ=60)
GGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACG < SRR4302540.7888731/94‑1 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG > SRR4302540.528041/1‑94 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG < SRR4302540.7849375/94‑1 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAC > SRR4302540.1957380/1‑94 (MQ=60)
AATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGA < SRR4302540.6469681/94‑1 (MQ=60)
AATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGA > SRR4302540.8011047/1‑94 (MQ=60)
TCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATC < SRR4302540.4749306/94‑1 (MQ=60)
TCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATC > SRR4302540.6045909/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAGTAACAGTTAATCGGCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACGCCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCG < SRR4302540.2457123/94‑1 (MQ=60)
TCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGA > SRR4302540.2223416/1‑94 (MQ=60)
CAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTT > SRR4302540.8379087/1‑94 (MQ=60)
GTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAC < SRR4302540.6986510/94‑1 (MQ=60)
GTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAC < SRR4302540.6317967/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302540.3321525/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302540.8821579/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302540.8828839/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302540.8904534/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302540.9248619/94‑1 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAAG < SRR4302540.2107583/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAG > SRR4302540.7157937/1‑94 (MQ=60)
GTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCCCAAAAGCAGATggctttacgcgacg > SRR4302540.2624735/1‑80 (MQ=60)
GTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGA > SRR4302540.4606086/1‑94 (MQ=60)
TTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAG < SRR4302540.2149142/94‑1 (MQ=60)
AATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCG < SRR4302540.2438215/94‑1 (MQ=60)
ATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGGGCGG > SRR4302540.10042440/1‑94 (MQ=60)
ATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGG < SRR4302540.2642218/94‑1 (MQ=60)
TCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGC < SRR4302540.6135628/94‑1 (MQ=60)
CGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCG > SRR4302540.7571399/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCG > SRR4302540.7571398/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCG > SRR4302540.7156740/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGG > SRR4302540.7292922/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGG > SRR4302540.1036629/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTT > SRR4302540.5454458/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTT > SRR4302540.8904487/1‑94 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC > SRR4302540.1489532/1‑94 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302540.5127361/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302540.7887321/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302540.3345031/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGGTC > SRR4302540.4339918/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTtgt > SRR4302540.8590339/1‑91 (MQ=60)
CCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCT > SRR4302540.7730142/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302540.780419/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302540.3996929/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302540.3775097/1‑94 (MQ=60)
AATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGC > SRR4302540.1085832/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCA > SRR4302540.3486089/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCA > SRR4302540.2164842/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCA > SRR4302540.3172955/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCA > SRR4302540.3899772/1‑94 (MQ=60)
TGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAA < SRR4302540.3806104/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAA > SRR4302540.8328948/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACGGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGC > SRR4302540.1798217/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCG < SRR4302540.6505574/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCG < SRR4302540.7963636/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACG > SRR4302540.7831773/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACG < SRR4302540.9749874/94‑1 (MQ=60)
GCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGT < SRR4302540.3827951/94‑1 (MQ=60)
CCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTT > SRR4302540.1645490/1‑94 (MQ=60)
CAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTC > SRR4302540.7750433/1‑94 (MQ=60)
AGATACACCGTTTGGTGGTGGGGAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCC > SRR4302540.4444822/1‑94 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA > SRR4302540.8990261/1‑94 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA < SRR4302540.4141989/94‑1 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA < SRR4302540.4141990/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAG < SRR4302540.2417815/94‑1 (MQ=60)
TACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGC > SRR4302540.8420015/1‑94 (MQ=60)
ACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCG > SRR4302540.2551053/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCC < SRR4302540.6072500/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAG < SRR4302540.9340706/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGC < SRR4302540.1607064/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGC > SRR4302540.6957203/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCT < SRR4302540.155152/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCA > SRR4302540.8165629/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCCGCCTCAA > SRR4302540.9110549/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAA < SRR4302540.5371400/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAA < SRR4302540.4844704/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATA < SRR4302540.1014957/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGAGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAA > SRR4302540.6950454/1‑94 (MQ=60)
TGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGGCAGCCTCAATAAC > SRR4302540.5760941/1‑94 (MQ=60)
TGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAAC < SRR4302540.7063332/94‑1 (MQ=60)
GGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACG < SRR4302540.5503131/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG < SRR4302540.5670196/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG < SRR4302540.3002644/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG < SRR4302540.5670195/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG < SRR4302540.1974920/94‑1 (MQ=60)
|
TCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGTG > NC_000913/1136305‑1136489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
