Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,136,396 |
A→G |
G301G (GGA→GGG) |
flgI → |
FlgI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,136,396 | 0 | A | G | 100.0%
| 757.7
/ NA
| 232 | G301G (GGA→GGG) | flgI | FlgI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (107/125); total (107/125) |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATA > NC_000913/1136306‑1136484
|
gACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAg > 1:3536052/1‑93 (MQ=255)
aCAGCTGCGCGGTAGCGCCGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCCTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCCGATATACCGTTTGGTGGTGGGCAGa > 2:4221975/1‑93 (MQ=255)
aCAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGa < 1:653299/93‑1 (MQ=255)
aCAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGa > 2:2142333/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGAc < 1:3977995/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACtgt < 2:2678753/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTgg < 1:1814226/93‑1 (MQ=255)
cgGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTa < 2:2449085/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTAc < 1:1322159/93‑1 (MQ=255)
tAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTc < 1:6041016/93‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTcc > 2:2580283/1‑93 (MQ=255)
aGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTcc < 2:2907177/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca < 2:3228796/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca > 2:3451578/1‑93 (MQ=255)
gcAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca > 2:1989169/1‑93 (MQ=255)
gcAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCcaca < 1:36507/93‑1 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaac > 1:1017066/1‑92 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa < 1:4079478/93‑1 (MQ=255)
aGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa < 2:78471/93‑1 (MQ=255)
aGGCGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACaaa < 2:1093997/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc < 1:2837329/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc < 2:4488444/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc > 1:1279934/1‑93 (MQ=255)
ggggAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAc < 2:5898650/93‑1 (MQ=255)
gAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCa > 1:3058891/1‑93 (MQ=255)
gAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCa < 1:6174416/93‑1 (MQ=255)
aaTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAg < 2:3894889/93‑1 (MQ=255)
aTCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGa > 1:811437/1‑93 (MQ=255)
tctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGCGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGAt > 1:6023275/1‑93 (MQ=255)
ctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATc > 1:940124/1‑93 (MQ=255)
ctctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATc < 2:3551351/93‑1 (MQ=255)
ctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGa > 2:6200444/1‑93 (MQ=255)
ctcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGa < 1:5251817/93‑1 (MQ=255)
tcAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAt > 2:5212054/1‑93 (MQ=255)
aGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAttt < 2:5556581/93‑1 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc > 2:3188085/1‑93 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc > 1:4300050/1‑93 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc > 1:5609569/1‑93 (MQ=255)
tAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAc > 1:5479393/1‑93 (MQ=255)
cAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGcc < 1:1773542/93‑1 (MQ=255)
aGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCa < 1:5386781/93‑1 (MQ=255)
aGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCa < 2:3771277/93‑1 (MQ=255)
gTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCag < 1:1608248/93‑1 (MQ=255)
gTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCag < 2:1338485/93‑1 (MQ=255)
tAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCagag < 1:4957515/93‑1 (MQ=255)
aaTCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgc < 2:615200/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcgg < 1:2477614/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcgg < 2:2320596/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcgg < 2:5785036/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAgcggcg > 2:5600970/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGcggcgg > 1:3963549/1‑93 (MQ=255)
cAGGCCAATGTCAGCCAGCCCGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGt > 1:1087988/1‑93 (MQ=255)
cAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGt > 1:3327415/1‑93 (MQ=255)
aGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGtt < 1:4858062/93‑1 (MQ=255)
ggCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTc > 1:4602007/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc > 2:5984616/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc > 1:3732118/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc > 1:5950623/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc < 2:1800579/93‑1 (MQ=255)
ccAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGc > 2:5713469/1‑93 (MQ=255)
cAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCt < 1:5632191/93‑1 (MQ=255)
aaTGTCAGCCAGCCAGCTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTg > 1:2812911/1‑93 (MQ=255)
aTGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTtgctgc > 2:3065100/1‑93 (MQ=255)
tGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCa > 2:1711198/1‑93 (MQ=255)
agccagccAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGc < 2:3670070/93‑1 (MQ=255)
agccagccAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGc < 1:1830809/93‑1 (MQ=255)
gccagccaGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCg > 1:5041165/1‑93 (MQ=255)
gccagccaGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCg > 1:497623/1‑93 (MQ=255)
cagccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTa < 2:1245856/93‑1 (MQ=255)
cagccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTa < 1:5885841/93‑1 (MQ=255)
agccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTAc > 1:3205570/1‑93 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACg < 1:4864359/93‑1 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACg < 2:624054/93‑1 (MQ=255)
gccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACg < 2:4533157/93‑1 (MQ=255)
ccagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGt < 2:4129713/93‑1 (MQ=255)
cagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGtt > 2:3052877/1‑93 (MQ=255)
cagATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGGTCGCTGCAAAGCGTACGtt > 2:2832598/1‑93 (MQ=255)
agATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTc > 1:1216809/1‑93 (MQ=255)
agATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTc < 2:3808150/93‑1 (MQ=255)
gATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTcc < 1:1422299/93‑1 (MQ=255)
aTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCa < 1:4180259/93‑1 (MQ=255)
aTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCa < 2:252777/93‑1 (MQ=255)
tACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAg < 2:5066881/93‑1 (MQ=255)
tACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAg < 1:1518931/93‑1 (MQ=255)
tACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGGTCCAg > 1:904696/1‑93 (MQ=255)
acacCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAgc > 2:4777875/1‑93 (MQ=255)
acCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAgcgc < 1:3860779/93‑1 (MQ=255)
ccGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGcc > 1:4404091/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCCGCGCCa > 2:669184/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGccc > 1:6135057/1‑92 (MQ=255)
cGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCa < 2:1953526/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGGTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCCGCGCCa > 2:21960/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAg < 2:408813/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAg > 2:494042/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGc > 1:5302350/1‑93 (MQ=255)
gtggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCa > 1:1099584/1‑93 (MQ=255)
gtggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCa < 2:3625201/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCaa < 1:2037090/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCaa < 1:2661828/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGGTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTccaa > 2:1408488/1‑90 (MQ=255)
|
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATA > NC_000913/1136306‑1136484
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCTCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGT > NC_000913/1136303‑1136488
|
CCTCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATAAACCGTTTGGTGGTGGG > SRR4302533.2530754/1‑94 (MQ=60)
CTCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGC > SRR4302533.5078729/1‑94 (MQ=60)
CTCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGC < SRR4302533.5862010/94‑1 (MQ=60)
tgtACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCA < SRR4302533.469612/91‑1 (MQ=60)
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAG < SRR4302533.4206649/94‑1 (MQ=60)
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAG > SRR4302533.3557845/1‑94 (MQ=60)
CGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAG > SRR4302533.3557846/1‑94 (MQ=60)
GACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGA > SRR4302533.5330516/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGAC < SRR4302533.657156/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACT > SRR4302533.413738/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACT < SRR4302533.4002214/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGG < SRR4302533.2700339/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGT < SRR4302533.1825302/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTT < SRR4302533.67655/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACT < SRR4302533.1330092/94‑1 (MQ=60)
TAGCGCAGGGGAGTCTCTCAGTAGCAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCC < SRR4302533.3135357/94‑1 (MQ=60)
TAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCC < SRR4302533.6077624/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACA < SRR4302533.5814817/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAA < SRR4302533.36747/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAC > SRR4302533.1023044/1‑94 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC < SRR4302533.4104312/94‑1 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC > SRR4302533.1287627/1‑94 (MQ=60)
AGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAAC > SRR4302533.859709/1‑94 (MQ=60)
GGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACG < SRR4302533.2854794/94‑1 (MQ=60)
GGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCA > SRR4302533.3077662/1‑94 (MQ=60)
GGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCA > SRR4302533.5478371/1‑94 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG > SRR4302533.2806850/1‑94 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG < SRR4302533.3826037/94‑1 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG < SRR4302533.6211520/94‑1 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG < SRR4302533.6293551/94‑1 (MQ=60)
GAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAACCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAG < SRR4302533.3685487/94‑1 (MQ=60)
AATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGA > SRR4302533.816192/1‑94 (MQ=60)
ATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGCGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGAT > SRR4302533.6059777/1‑94 (MQ=60)
TCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATC > SRR4302533.945647/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCG < SRR4302533.5283261/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAT < SRR4302533.5283373/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAT > SRR4302533.1210499/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAT > SRR4302533.1751522/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAT > SRR4302533.5001099/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGAT > SRR4302533.148090/1‑94 (MQ=60)
CAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTT < SRR4302533.1307985/94‑1 (MQ=60)
AGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTA < SRR4302533.4097990/94‑1 (MQ=60)
GTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAC > SRR4302533.4325910/1‑94 (MQ=60)
GTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAC > SRR4302533.5512427/1‑94 (MQ=60)
GTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAC > SRR4302533.5643469/1‑94 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTAGG > SRR4302533.4331626/1‑94 (MQ=60)
TAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACG < SRR4302533.2835503/94‑1 (MQ=60)
AACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGC > SRR4302533.6040145/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCC > SRR4302533.3903936/1‑94 (MQ=60)
CAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCA < SRR4302533.1784344/94‑1 (MQ=60)
CAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCA > SRR4302533.4753997/1‑94 (MQ=60)
AGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAG < SRR4302533.3926831/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAG < SRR4302533.5419146/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAG < SRR4302533.6066033/94‑1 (MQ=60)
GTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGA > SRR4302533.1599455/1‑94 (MQ=60)
GTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGA < SRR4302533.1618006/94‑1 (MQ=60)
TAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGC < SRR4302533.848604/94‑1 (MQ=60)
TAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGC < SRR4302533.4987549/94‑1 (MQ=60)
AATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCTATTTACGCCAGAGCG > SRR4302533.2026402/1‑94 (MQ=60)
AATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCG < SRR4302533.6215459/94‑1 (MQ=60)
ATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGG > SRR4302533.1365029/1‑94 (MQ=60)
ATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGG < SRR4302533.4888534/94‑1 (MQ=60)
TCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGC < SRR4302533.2492896/94‑1 (MQ=60)
CGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCG > SRR4302533.5014247/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGG > SRR4302533.3987696/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCCAATGTCAGCCAGCCCGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGT > SRR4302533.1094397/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGT > SRR4302533.3347977/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGCT > SRR4302533.4143229/1‑94 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302533.1770498/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302533.4887504/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC < SRR4302533.116401/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTC > SRR4302533.4629889/1‑94 (MQ=60)
GGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCG < SRR4302533.4900718/94‑1 (MQ=60)
GGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCG > SRR4302533.1788227/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGC > SRR4302533.3755013/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGC > SRR4302533.5986614/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGCTACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302533.2830225/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302533.4577982/1‑94 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG < SRR4302533.5666249/94‑1 (MQ=60)
CAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTG > SRR4302533.314428/1‑94 (MQ=60)
AATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCATACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGC > SRR4302533.5742439/1‑94 (MQ=60)
TGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAA > SRR4302533.3302539/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGC < SRR4302533.4913871/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCG < SRR4302533.1841985/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCG > SRR4302533.500587/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCG > SRR4302533.5071676/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGATACACTGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTAC < SRR4302533.3623175/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTAC < SRR4302533.5921405/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTAC < SRR4302533.1834071/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTAC > SRR4302533.3225306/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACG > SRR4302533.5602732/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACG < SRR4302533.1027621/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGATCGCTGCAAAGCGTACG > SRR4302533.6076215/1‑94 (MQ=60)
GCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGT < SRR4302533.4893835/94‑1 (MQ=60)
GCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGT > SRR4302533.5935158/1‑94 (MQ=60)
CCAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTT > SRR4302533.913089/1‑94 (MQ=60)
CAGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTC > SRR4302533.1224118/1‑94 (MQ=60)
AGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCC > SRR4302533.950182/1‑94 (MQ=60)
AGATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCC < SRR4302533.5656290/94‑1 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA < SRR4302533.1342743/94‑1 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA < SRR4302533.1430897/94‑1 (MQ=60)
GATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCA < SRR4302533.620552/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAG < SRR4302533.4205576/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAG < SRR4302533.3993862/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAG < SRR4302533.3421851/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAG < SRR4302533.6141348/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGGTCCAG > SRR4302533.910000/1‑94 (MQ=60)
TACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGC < SRR4302533.1101280/94‑1 (MQ=60)
TACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGC < SRR4302533.1528074/94‑1 (MQ=60)
TACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGC < SRR4302533.5229206/94‑1 (MQ=60)
ACACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCgcgcc > SRR4302533.4369768/1‑89 (MQ=60)
ACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCC < SRR4302533.5348357/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCC > SRR4302533.4430685/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCC > SRR4302533.2312363/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCC < SRR4302533.3884347/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCC > SRR4302533.6172022/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAG < SRR4302533.2526337/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGC > SRR4302533.5334115/1‑94 (MQ=60)
TTTGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCC > SRR4302533.3040535/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTC < SRR4302533.1272575/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTC > SRR4302533.5444491/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCA > SRR4302533.1106102/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCCGCCTCAA > SRR4302533.192718/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAA < SRR4302533.4560680/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAAT < SRR4302533.2049651/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAAT < SRR4302533.2678171/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACTCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGT < SRR4302533.6124019/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGT < SRR4302533.368627/94‑1 (MQ=60)
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CCTCGACAGCTGCGCGGTAGCGCAGGGGAATCTCTCAGTAACAGTTAATCGTCAGGCCAATGTCAGCCAGCCAGATACACCGTTTGGTGGTGGACAGACTGTGGTTACTCCACAAACGCAGATCGATTTACGCCAGAGCGGCGGTTCGCTGCAAAGCGTACGTTCCAGCGCCAGCCTCAATAACGT > NC_000913/1136303‑1136488
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
