Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,456,531 |
A→G |
M82V (ATG→GTG) |
b1394 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,456,531 | 0 | A | G | 100.0%
| 580.3
/ NA
| 179 | M82V (ATG→GTG) | b1394 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (78/101); total (78/101) |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGATGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCA > NC_000913/1456441‑1456620
|
tacttacAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGgtgt < 1:1652816/93‑1 (MQ=255)
acttacAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTc < 1:2711364/93‑1 (MQ=255)
ttacAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAg > 2:9522510/1‑93 (MQ=255)
ttacAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAg > 2:8666034/1‑93 (MQ=255)
tacAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGt > 1:821255/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTg < 1:5049601/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTg < 1:1422951/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGa < 2:638347/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGaa > 1:4866485/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACg > 2:4521849/1‑93 (MQ=255)
ccGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGtt < 1:6021724/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGttt < 1:7108877/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGttt < 2:3187155/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCATCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTc < 2:6221274/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCt < 2:6909262/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGGGTCAGTTGAACGTTTCt > 2:3970632/1‑93 (MQ=255)
gccgcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCt < 2:4994545/91‑1 (MQ=255)
gcgcGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCta < 2:1633421/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCta < 1:1080910/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCta < 2:360843/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCta < 2:7839191/93‑1 (MQ=255)
cgcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCtat < 2:2715569/93‑1 (MQ=255)
cgcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCtat > 2:9077760/1‑93 (MQ=255)
gcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCtata > 2:1819538/1‑93 (MQ=255)
gcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCtata > 1:7249677/1‑93 (MQ=255)
gcgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCtata > 1:3655026/1‑93 (MQ=255)
cgGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATaa > 2:7327640/1‑93 (MQ=255)
ggATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAc < 2:3465549/93‑1 (MQ=255)
ggATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAc < 2:1373574/93‑1 (MQ=255)
ggATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAc > 1:9960727/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAcc > 2:2100726/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAcc > 2:7559073/1‑93 (MQ=255)
ttttGGGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGGGTCAGGTGAACGTTTCTATAACTCa > 2:9641882/1‑93 (MQ=255)
tttGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCAc < 1:1759467/93‑1 (MQ=255)
ttGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACt > 2:1147802/1‑93 (MQ=255)
tgtgCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTg < 1:2513832/93‑1 (MQ=255)
gtgCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTgg < 2:8773368/93‑1 (MQ=255)
gtgCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTgg < 1:9350013/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTa < 1:7912499/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCAACGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTa < 2:6632762/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTag > 1:1995810/1‑92 (MQ=255)
cTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTAc < 1:9594028/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTAc < 1:9945802/93‑1 (MQ=255)
tCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCg > 1:2792528/1‑93 (MQ=255)
aGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGcc < 1:7013190/93‑1 (MQ=255)
aGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGcc > 2:3696687/1‑93 (MQ=255)
ggATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCt < 2:5476054/93‑1 (MQ=255)
ggATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCt < 1:9408810/93‑1 (MQ=255)
ggATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCt < 1:2006135/93‑1 (MQ=255)
gATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTg > 2:214220/1‑93 (MQ=255)
cTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCa < 2:662052/93‑1 (MQ=255)
ttAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCACCGCACCGGATTTAGGGGAGTCAGCTGAACGTTGCTATAACCCACTGGTAGCTCGCCGGGCaa > 1:3126431/1‑93 (MQ=255)
tAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCaaa < 2:3809503/93‑1 (MQ=255)
aaCGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCaaaa > 2:5050468/1‑93 (MQ=255)
cGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACt < 2:3827890/93‑1 (MQ=255)
gATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTg > 2:1285622/1‑93 (MQ=255)
gATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTg > 2:8372294/1‑93 (MQ=255)
aTCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTAGCCTGCCACAACTGc > 1:440081/1‑93 (MQ=255)
tCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCACAACTGcc > 2:6367267/1‑93 (MQ=255)
gTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaa > 1:6246837/1‑93 (MQ=255)
gTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaa > 2:627375/1‑93 (MQ=255)
gTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaa > 2:5512645/1‑93 (MQ=255)
gTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaa < 1:3661593/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaaa > 1:5746690/1‑93 (MQ=255)
tAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCaaa < 2:2614671/93‑1 (MQ=255)
cGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAAcc < 2:8082688/93‑1 (MQ=255)
cGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAAcc < 1:4349669/93‑1 (MQ=255)
gTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCg < 1:7743336/93‑1 (MQ=255)
tGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGt > 2:377212/1‑93 (MQ=255)
gATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTg < 2:4687576/93‑1 (MQ=255)
aTCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGa < 1:306237/93‑1 (MQ=255)
tCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAt > 1:3331685/1‑93 (MQ=255)
tCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAt < 1:6110853/93‑1 (MQ=255)
cccACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCCAAACTGCCAAAACCGGTGATc > 2:7016921/1‑93 (MQ=255)
ccACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAACACTGCCAAAACCGGTGATCt > 1:8363594/1‑93 (MQ=255)
ccACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAGCCGGTGATCt < 2:6188576/93‑1 (MQ=255)
acaGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCtgt < 2:422235/93‑1 (MQ=255)
caGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCtgtg > 1:6681541/1‑93 (MQ=255)
caGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCtgtg < 1:7111546/93‑1 (MQ=255)
ggCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCa < 2:9298745/93‑1 (MQ=255)
ggCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCa > 2:7976497/1‑93 (MQ=255)
ggCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCa < 2:3043587/93‑1 (MQ=255)
gCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAg > 1:7417366/1‑93 (MQ=255)
ccGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGCACGTTTCTATAACCCCCTGGTACGTCGCCTGGCCACACTCCCAATACCGGTGCTCTGCGCCGTCa > 1:2139151/1‑93 (MQ=255)
ccGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCa > 1:1773745/1‑93 (MQ=255)
cGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCaa < 2:46336/93‑1 (MQ=255)
gCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAt > 1:5868683/1‑93 (MQ=255)
cACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtg < 1:4564862/93‑1 (MQ=255)
cACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtg > 1:1105075/1‑93 (MQ=255)
cACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtg > 2:7186421/1‑93 (MQ=255)
cccGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACTTTTCTATAACCCACTGGTACGTCTCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtgg < 2:1139251/92‑1 (MQ=255)
aCCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtgg < 1:4555567/93‑1 (MQ=255)
aCCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtgg < 1:4555566/93‑1 (MQ=255)
ccGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtggc < 1:2663800/93‑1 (MQ=255)
ccGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtggc > 1:8315275/1‑93 (MQ=255)
cGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtggcg < 1:8716626/93‑1 (MQ=255)
tttAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAtggcgtggc < 2:2977964/93‑1 (MQ=255)
tAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTggcgg < 1:6498567/93‑1 (MQ=255)
tAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTggcgg < 1:8710628/93‑1 (MQ=255)
ggggTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCggca < 2:7501407/93‑1 (MQ=255)
|
TTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGATGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCA > NC_000913/1456441‑1456620
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGATGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAGGGG > NC_000913/1456438‑1456624
|
CTGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGG > SRR4302540.2774534/1‑94 (MQ=60)
TGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGT < SRR4302540.6210370/94‑1 (MQ=60)
TGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGT < SRR4302540.5650517/94‑1 (MQ=60)
TGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGT > SRR4302540.9409831/1‑94 (MQ=60)
TACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTC < SRR4302540.1670833/94‑1 (MQ=60)
TACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTC > SRR4302540.2094844/1‑94 (MQ=60)
ACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTTGGGGTGTCA > SRR4302540.5394135/1‑94 (MQ=60)
ACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCA < SRR4302540.2740601/94‑1 (MQ=60)
CTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAG < SRR4302540.2692765/94‑1 (MQ=60)
CTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAG < SRR4302540.5032406/94‑1 (MQ=60)
TTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGT > SRR4302540.829986/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGA < SRR4302540.1438354/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGA < SRR4302540.5104203/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGA < SRR4302540.8149353/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGA > SRR4302540.6246257/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAA > SRR4302540.4918677/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAAC > SRR4302540.3747031/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTT < SRR4302540.6088530/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTC < SRR4302540.7187994/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTAT < SRR4302540.4615683/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTAT < SRR4302540.1091972/94‑1 (MQ=60)
CGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATA > SRR4302540.3695056/1‑94 (MQ=60)
CGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATA > SRR4302540.7330573/1‑94 (MQ=60)
GCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAA > SRR4302540.8815236/1‑94 (MQ=60)
CGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAAC > SRR4302540.10076956/1‑94 (MQ=60)
GGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACC < SRR4302540.7886110/94‑1 (MQ=60)
GATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCC < SRR4302540.3240046/94‑1 (MQ=60)
TTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACT < SRR4302540.1778545/94‑1 (MQ=60)
TTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACT < SRR4302540.8408299/94‑1 (MQ=60)
TGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGG < SRR4302540.2540990/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGT < SRR4302540.9461380/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTAG > SRR4302540.2017433/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTAC < SRR4302540.8004755/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACG < SRR4302540.10061940/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACG < SRR4302540.9707246/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCG > SRR4302540.2822675/1‑94 (MQ=60)
TCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGC > SRR4302540.7677671/1‑94 (MQ=60)
AGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCT < SRR4302540.2669745/94‑1 (MQ=60)
AGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCT < SRR4302540.7091053/94‑1 (MQ=60)
GGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTG < SRR4302540.2027846/94‑1 (MQ=60)
GGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTG < SRR4302540.9520695/94‑1 (MQ=60)
ATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGC < SRR4302540.6507636/94‑1 (MQ=60)
ATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGC < SRR4302540.7098574/94‑1 (MQ=60)
TCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCA < SRR4302540.944937/94‑1 (MQ=60)
CTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCACCGCACCGGATTTAGGGGAGTCAGCTGAACGTTGCTATAACCCACTGGTAGCTCGCCGGGCAA > SRR4302540.3160570/1‑94 (MQ=60)
GATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGC > SRR4302540.2770747/1‑94 (MQ=60)
GATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGC > SRR4302540.4440949/1‑94 (MQ=60)
GATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTAGCCTGCCACAACTGC > SRR4302540.444764/1‑94 (MQ=60)
CGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAA > SRR4302540.6316353/1‑94 (MQ=60)
GTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAA < SRR4302540.3701673/94‑1 (MQ=60)
GTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAA < SRR4302540.3701672/94‑1 (MQ=60)
GTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAA > SRR4302540.5810073/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAAC < SRR4302540.7340341/94‑1 (MQ=60)
AACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAAC < SRR4302540.9671146/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCG < SRR4302540.4396987/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCG > SRR4302540.6603945/1‑94 (MQ=60)
GTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGG < SRR4302540.7833744/94‑1 (MQ=60)
TTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGT > SRR4302540.4587112/1‑94 (MQ=60)
TTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGT > SRR4302540.7283018/1‑94 (MQ=60)
ATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAT < SRR4302540.5928024/94‑1 (MQ=60)
ATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAT < SRR4302540.1790386/94‑1 (MQ=60)
ATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAT > SRR4302540.3368265/1‑94 (MQ=60)
ATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGAT < SRR4302540.309278/94‑1 (MQ=60)
TCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATC < SRR4302540.6178897/94‑1 (MQ=60)
CCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAACACTGCCAAAACCGGTGATCT > SRR4302540.8460650/1‑94 (MQ=60)
CCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTG < SRR4302540.1442898/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTG > SRR4302540.6755345/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGC < SRR4302540.7190700/94‑1 (MQ=60)
AGGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCA > SRR4302540.6170922/1‑94 (MQ=60)
GGCCCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAG > SRR4302540.7499982/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAcccgtggacttgtgcattca > SRR4302540.8866502/1‑74 (MQ=60)
CCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCA > SRR4302540.8667039/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCA > SRR4302540.2162138/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCA > SRR4302540.1793002/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCA < SRR4302540.1384671/94‑1 (MQ=60)
CGCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAAT > SRR4302540.5933560/1‑94 (MQ=60)
GCACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATG > SRR4302540.1116472/1‑94 (MQ=60)
CACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGG < SRR4302540.4614157/94‑1 (MQ=60)
CACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTGCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGG < SRR4302540.4614156/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGC < SRR4302540.4604822/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGC < SRR4302540.4604823/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGC > SRR4302540.8411797/1‑94 (MQ=60)
CCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCG < SRR4302540.2692690/94‑1 (MQ=60)
CCGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCG < SRR4302540.1943050/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGT < SRR4302540.8817817/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGT < SRR4302540.1766778/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGT < SRR4302540.3563613/94‑1 (MQ=60)
TTAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGG > SRR4302540.2892622/1‑94 (MQ=60)
TAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGC > SRR4302540.10065642/1‑94 (MQ=60)
TAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGC < SRR4302540.8811744/94‑1 (MQ=60)
TAGGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGC < SRR4302540.6570818/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAG < SRR4302540.6820591/94‑1 (MQ=60)
GGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAGGT < SRR4302540.2068006/94‑1 (MQ=60)
GGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAGGG < SRR4302540.7657075/94‑1 (MQ=60)
GGTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAGGG > SRR4302540.4266533/1‑94 (MQ=60)
GTGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCTGTCAATGGCGTGGCGGCAGGGG > SRR4302540.7258280/1‑94 (MQ=60)
|
CTGTTACTTACAGGTGCCGGGCGCGGATTTTGTGCTGGTCAGGATCTTAACGATCGTAACGTTGATCCCACAGGCCCCGCACCGGATTTAGGGATGTCAGTTGAACGTTTCTATAACCCACTGGTACGTCGCCTGGCAAAACTGCCAAAACCGGTGATCTGTGCAGTCAATGGCGTGGCGGCAGGGG > NC_000913/1456438‑1456624
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
