Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,568,848 |
C→T |
A408T (GCC→ACC) |
gadB ← |
glutamate decarboxylase isozyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,568,848 | 0 | C | T | 99.1%
| 268.8
/ ‑5.2
| 110 | A408T (GCC→ACC) | gadB | glutamate decarboxylase isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (45/64); total (45/65) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.24e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCAA > NC_000913/1568799‑1568936
|
aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa < 2:6003636/93‑1 (MQ=14)
aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:9626662/1‑93 (MQ=14)
aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:8429621/1‑93 (MQ=14)
aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGAAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:9863297/1‑93 (MQ=9)
aTAATGCGCACCACCACGATGGCGTGGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa < 2:7394228/93‑1 (MQ=11)
tAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCAt < 1:9457174/93‑1 (MQ=17)
aaTGGGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATa < 2:6890469/93‑1 (MQ=16)
aaTGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATa > 1:3965633/1‑93 (MQ=18)
tGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 1:4871538/93‑1 (MQ=18)
tGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 1:6157719/93‑1 (MQ=18)
tGCGCATCACCACAATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 2:8659245/93‑1 (MQ=255)
gcgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAg < 2:6606356/93‑1 (MQ=21)
gcgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAg < 1:8365309/93‑1 (MQ=21)
cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 1:9630565/93‑1 (MQ=18)
cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 2:2544513/93‑1 (MQ=21)
cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 2:6001358/93‑1 (MQ=21)
gcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:8534412/93‑1 (MQ=21)
gcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 1:291125/93‑1 (MQ=21)
gcATCACCACGATGTCGGTGCCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:4409471/93‑1 (MQ=255)
gcATCACCACGATGGCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:8193144/93‑1 (MQ=255)
cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt < 1:6275541/93‑1 (MQ=21)
cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt < 1:5789677/93‑1 (MQ=21)
cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt > 1:5421852/1‑93 (MQ=18)
aTCCCCCCGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtg < 2:156085/93‑1 (MQ=255)
aTCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtg > 1:2394635/1‑93 (MQ=18)
tCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtgt > 2:9023740/1‑93 (MQ=18)
tCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGACTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtgt < 1:8061962/93‑1 (MQ=16)
caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 1:578798/93‑1 (MQ=21)
caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 2:9401058/93‑1 (MQ=21)
caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa > 1:3847026/1‑93 (MQ=18)
caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 1:4510115/93‑1 (MQ=21)
ccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATc > 1:7507568/1‑93 (MQ=18)
cacGATGTGGTTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATcc < 2:1182239/93‑1 (MQ=255)
cacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATcc < 1:4712746/93‑1 (MQ=21)
acGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCATAGAGGTCATACAGGGGGTATccc > 2:5588292/1‑93 (MQ=255)
acGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATccc < 2:1749430/93‑1 (MQ=18)
acGATGTCGGGGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATccc < 2:8426651/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCg < 2:5289683/93‑1 (MQ=21)
cGATGTAGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGAGTGTCACCCg < 2:8983791/93‑1 (MQ=11)
cGATGGCGGTGGCGTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCg < 1:3118788/93‑1 (MQ=255)
gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 1:1525224/1‑93 (MQ=18)
gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 1:7806587/1‑93 (MQ=18)
gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 2:1239607/1‑93 (MQ=18)
aTGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGa < 2:9344159/93‑1 (MQ=21)
aTGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGa > 2:3657000/1‑93 (MQ=18)
tGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGAt < 1:4247710/93‑1 (MQ=21)
tGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGAt < 2:3588584/93‑1 (MQ=21)
ttCGGTGGCTTCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc < 1:3752991/92‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc < 2:1694473/93‑1 (MQ=21)
gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc > 2:236317/1‑93 (MQ=18)
gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc > 2:2220156/1‑93 (MQ=18)
tCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCt < 1:9420771/93‑1 (MQ=21)
tCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCt > 2:8257035/1‑93 (MQ=18)
cGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCtt < 1:6961561/93‑1 (MQ=21)
ggTGGCTTCACCTCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 1:2770933/1‑93 (MQ=16)
ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:136480/93‑1 (MQ=21)
ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:9194922/93‑1 (MQ=21)
ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 2:8142635/1‑93 (MQ=18)
ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 2:4214570/1‑93 (MQ=18)
ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAACGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 1:1965518/1‑93 (MQ=16)
ggTGCCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGTACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:9194917/93‑1 (MQ=11)
gttgCTTCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:2628875/90‑1 (MQ=255)
gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:9065464/93‑1 (MQ=16)
gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:5268667/93‑1 (MQ=21)
gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa > 2:2103630/1‑93 (MQ=18)
gggCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCAc < 1:564023/92‑1 (MQ=21)
ggCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCAcc > 2:7968966/1‑93 (MQ=18)
gCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCa < 2:924083/93‑1 (MQ=21)
gCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCa > 1:8176530/1‑93 (MQ=18)
cTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCAt < 2:8399306/93‑1 (MQ=18)
ttCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATc < 2:1918758/93‑1 (MQ=255)
ttCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGCGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATc > 1:647518/1‑93 (MQ=16)
tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt > 1:8902431/1‑93 (MQ=18)
tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt > 2:3443970/1‑93 (MQ=18)
tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt < 2:1436494/93‑1 (MQ=18)
cACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCtt > 1:1582628/1‑93 (MQ=18)
cACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCtt < 1:3361486/93‑1 (MQ=21)
ccgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTc > 2:9388815/1‑93 (MQ=18)
ccgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATACCGGATCTTCACCATCTTTc > 2:3714677/1‑93 (MQ=16)
cgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCa > 1:3895399/1‑93 (MQ=18)
gccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAg > 2:6405153/1‑93 (MQ=18)
ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt < 2:9666887/93‑1 (MQ=18)
ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt > 2:2058332/1‑93 (MQ=18)
ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt < 1:6366060/93‑1 (MQ=18)
cgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCATACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGtt > 1:6886165/1‑93 (MQ=16)
cgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGtt < 1:6205740/93‑1 (MQ=18)
gagaGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGttt > 1:7970611/1‑93 (MQ=18)
agagTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTg > 1:353452/1‑93 (MQ=18)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:1739714/93‑1 (MQ=18)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa > 1:4096009/1‑93 (MQ=18)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:9047545/93‑1 (MQ=18)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:974904/93‑1 (MQ=21)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:2293900/93‑1 (MQ=21)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:3259450/93‑1 (MQ=18)
agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCAGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:4181750/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAg < 2:1504628/93‑1 (MQ=18)
gTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAg < 2:5104118/93‑1 (MQ=18)
tGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGc > 2:9322114/1‑93 (MQ=18)
gAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCa > 1:1981433/1‑93 (MQ=18)
aaGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCaa < 2:81453/93‑1 (MQ=21)
|
ATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCAA > NC_000913/1568799‑1568936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
