Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,776,008 |
T→C |
Y264Y (TAT→TAC) |
b1695 → |
putative oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,776,008 | 0 | T | C | 100.0%
| 735.4
/ NA
| 227 | Y264Y (TAT→TAC) | b1695 | putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (107/120); total (107/120) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTATGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAA > NC_000913/1775918‑1776097
|
tgtgATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAATATGCCGCCCGCTACGc < 2:9560707/93‑1 (MQ=255)
tgtgATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGc > 1:4417780/1‑93 (MQ=255)
tgtgATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGc > 2:7518700/1‑93 (MQ=255)
gtgATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGcc > 1:3748837/1‑93 (MQ=255)
tgATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGcca < 1:9661791/93‑1 (MQ=255)
tgATGTACAACTCTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGTGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGcta > 1:7719997/1‑91 (MQ=255)
gATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGccac > 1:8147656/1‑92 (MQ=255)
aTGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGccaac < 1:3242531/93‑1 (MQ=255)
aCAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCcaaccaac < 1:7357679/93‑1 (MQ=255)
cTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTAt > 1:6529024/1‑93 (MQ=255)
tttGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATc < 2:2611335/93‑1 (MQ=255)
tttGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATc > 2:5901492/1‑93 (MQ=255)
tttGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATc < 2:6173396/93‑1 (MQ=255)
tttGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATc > 1:5896126/1‑93 (MQ=255)
tGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGc < 1:3998837/93‑1 (MQ=255)
agaTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCtt < 1:2462868/93‑1 (MQ=255)
gaTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCttt < 1:1305710/93‑1 (MQ=255)
gaTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCttt > 2:7880946/1‑93 (MQ=255)
gaTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCttt > 2:8487521/1‑93 (MQ=255)
aTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCtttt > 1:8631940/1‑93 (MQ=255)
aTGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCtttt < 1:7151106/93‑1 (MQ=255)
ggAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTgg < 2:1819582/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTaa < 2:3241545/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTaa > 2:1415021/1‑93 (MQ=255)
gcCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGc > 1:3614175/1‑93 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCGTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc < 1:949849/93‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc < 2:4388928/93‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc > 1:1103633/1‑93 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc > 1:8452783/1‑93 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc < 1:2778144/93‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc < 2:6885310/93‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGcc > 1:2205428/1‑93 (MQ=255)
tGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCa > 1:7857587/1‑93 (MQ=255)
tGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCa > 1:6375052/1‑93 (MQ=255)
gATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCAt < 2:6572859/93‑1 (MQ=255)
gATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCAt > 2:3053996/1‑93 (MQ=255)
tCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTg < 1:9582013/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGt > 2:5648972/1‑93 (MQ=255)
aCGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTc < 2:4578274/93‑1 (MQ=255)
gccgcGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCAt > 1:4870335/1‑93 (MQ=255)
cgcgcgCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATaa < 2:5540483/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAga < 1:6036433/93‑1 (MQ=255)
cagcaCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAgat < 2:7202879/93‑1 (MQ=255)
cagcaCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAgat > 1:5408703/1‑93 (MQ=255)
gcaCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAgatga > 1:3580640/1‑93 (MQ=255)
caCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAgatgat > 1:227627/1‑93 (MQ=255)
aCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATc > 1:7923585/1‑93 (MQ=255)
aCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATc < 2:2885384/93‑1 (MQ=255)
aCCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATc < 2:483447/93‑1 (MQ=255)
ccGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATcc < 2:4810302/93‑1 (MQ=255)
ccGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATcc < 1:5103926/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCa > 2:5909247/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCa > 2:2469265/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCa < 1:2214270/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCa < 1:6984096/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCa > 2:2026705/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAg < 1:1523762/93‑1 (MQ=255)
ggCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAg < 2:731372/93‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATACCCAGATGATCCAgg < 1:5495570/93‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAgg > 2:8881670/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGa < 1:6150638/93‑1 (MQ=255)
tttGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaa < 2:3161063/93‑1 (MQ=255)
ttGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaaa > 1:6869605/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGAATACGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCACCCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCAATGGTCATAACCAGCTGATCCAGGaaa < 2:8964022/93‑1 (MQ=255)
tGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaaaa < 2:1224904/93‑1 (MQ=255)
gCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaaaaa < 1:4049240/93‑1 (MQ=255)
gCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaaaaa < 2:3944645/93‑1 (MQ=255)
gCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGaaaaa < 2:1688827/93‑1 (MQ=255)
aaTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTgg < 2:3316564/93‑1 (MQ=255)
aaTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTgg < 2:4699057/93‑1 (MQ=255)
aaTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTgg < 1:6323287/93‑1 (MQ=255)
aaTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTgg > 2:8745189/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTgg > 2:3464525/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGgc < 1:1416042/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGgc < 1:4574299/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGgc > 2:2350534/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGgcg > 1:8825570/1‑93 (MQ=255)
cgcCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCt < 1:9244749/93‑1 (MQ=255)
cTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGAt < 1:1625741/93‑1 (MQ=255)
cTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGAt < 2:8501956/93‑1 (MQ=255)
tttGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATg < 2:9151933/93‑1 (MQ=255)
tttGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATg > 2:2204231/1‑93 (MQ=255)
tttGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATg < 2:7423372/93‑1 (MQ=255)
tttGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATg > 2:3982578/1‑93 (MQ=255)
ttGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATgg > 1:1782668/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGc < 1:890174/93‑1 (MQ=255)
tGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGc > 2:8643587/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCg > 1:6627362/1‑93 (MQ=255)
aaGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGa > 2:6029677/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTa < 2:4017536/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTaa > 1:3923582/1‑93 (MQ=255)
gccgccCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAg < 2:1050485/93‑1 (MQ=255)
ccgcccgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGa < 1:8068789/93‑1 (MQ=255)
ccgcccgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGa < 1:2740708/93‑1 (MQ=255)
cgcccgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGAt > 1:5664810/1‑93 (MQ=255)
gcccgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATc < 2:977245/93‑1 (MQ=255)
ccgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGa > 1:1985357/1‑93 (MQ=255)
cgcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGac > 2:9241314/1‑93 (MQ=255)
gcTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGaca > 2:8245678/1‑93 (MQ=255)
cTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGacaa < 2:5006668/93‑1 (MQ=255)
|
TGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTATGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAA > NC_000913/1775918‑1776097
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAATGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTATGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAACATG > NC_000913/1775915‑1776101
|
CAATGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTAC < SRR4302540.4039196/94‑1 (MQ=60)
ATGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGC > SRR4302540.4465647/1‑94 (MQ=60)
TGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCC < SRR4302540.8240999/94‑1 (MQ=60)
TGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCC > SRR4302540.3789741/1‑94 (MQ=60)
TGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCC < SRR4302540.2287098/94‑1 (MQ=60)
GTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCA > SRR4302540.1124033/1‑94 (MQ=60)
TGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAC > SRR4302540.8242236/1‑94 (MQ=60)
TGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAA < SRR4302540.9775523/94‑1 (MQ=60)
TGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAA > SRR4302540.4084736/1‑94 (MQ=60)
ATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACC < SRR4302540.3277827/94‑1 (MQ=60)
TACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAAC > SRR4302540.5834755/1‑94 (MQ=60)
TACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAAC < SRR4302540.795266/94‑1 (MQ=60)
ACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACG < SRR4302540.7439732/94‑1 (MQ=60)
ACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACG > SRR4302540.6233017/1‑94 (MQ=60)
CAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGT < SRR4302540.8082763/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTAT < SRR4302540.2471481/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTAT > SRR4302540.6601522/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATC > SRR4302540.5961240/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAGATGGAGCGCCAGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTAGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATC < SRR4302540.9063919/94‑1 (MQ=60)
TGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCT < SRR4302540.5915686/94‑1 (MQ=60)
TGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCT < SRR4302540.4041875/94‑1 (MQ=60)
AGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTT > SRR4302540.8910805/1‑94 (MQ=60)
AGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTT < SRR4302540.2489372/94‑1 (MQ=60)
AGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTT > SRR4302540.277742/1‑94 (MQ=60)
GATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTT > SRR4302540.8732207/1‑94 (MQ=60)
GATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTT < SRR4302540.1319257/94‑1 (MQ=60)
ATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTG < SRR4302540.7230799/94‑1 (MQ=60)
ATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTG < SRR4302540.4289974/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCTCCTATGAAGATGCCTCCCGTTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGT < SRR4302540.1568975/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAA < SRR4302540.3530821/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAA > SRR4302540.9708127/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTAGCGCTTTTGttat > SRR4302540.8392370/1‑90 (MQ=60)
CGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGC > SRR4302540.3653692/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCC > SRR4302540.1115010/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCC > SRR4302540.2229256/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCC > SRR4302540.8550919/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCC > SRR4302540.8550918/1‑94 (MQ=60)
CCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCGTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCC < SRR4302540.959729/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCC < SRR4302540.6648764/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCC < SRR4302540.4276603/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCC < SRR4302540.2446436/94‑1 (MQ=60)
CCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCC < SRR4302540.2808166/94‑1 (MQ=60)
CTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCA > SRR4302540.6446031/1‑94 (MQ=60)
CTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCA < SRR4302540.3891886/94‑1 (MQ=60)
CTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCA > SRR4302540.7949401/1‑94 (MQ=60)
TGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCAT < SRR4302540.9752575/94‑1 (MQ=60)
GATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATT < SRR4302540.2231303/94‑1 (MQ=60)
GATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATT < SRR4302540.619107/94‑1 (MQ=60)
GATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATT > SRR4302540.8242270/1‑94 (MQ=60)
TCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGG < SRR4302540.9695158/94‑1 (MQ=60)
AACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTC > SRR4302540.1782349/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCAT > SRR4302540.4922577/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCAT < SRR4302540.7342163/94‑1 (MQ=60)
CCGCGCGCATCACCGGATTTGCCGAATGCGCTTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAA < SRR4302540.7871959/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGCAGCCCCGGCTTTGCCGACTGCGCCTTTGCAGATGCGGCCCGCTATGCCAACCACCGTATCGCTTTTGGTAAGCCCtttgtgcattac > SRR4302540.6515510/1‑82 (MQ=60)
CGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAAC > SRR4302540.9585434/1‑94 (MQ=60)
CGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCA < SRR4302540.7603776/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAG < SRR4302540.6808976/94‑1 (MQ=60)
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CGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGA > SRR4302540.4474883/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCACCGGCCTTGCCGAAAGCGCCTTTGAAGCTGCCGCCCGCTACGCCAACCACCGAATCGCTTTTGATAAGCCCATTGGTCATAACCAGA < SRR4302540.3625222/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGAT > SRR4302540.5468177/1‑94 (MQ=60)
GCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGAT < SRR4302540.3998837/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGAT < SRR4302540.6103443/94‑1 (MQ=60)
CAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATG > SRR4302540.1576757/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGA > SRR4302540.3619747/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGA < SRR4302540.1374663/94‑1 (MQ=60)
GCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGAT > SRR4302540.229827/1‑94 (MQ=60)
CACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATC > SRR4302540.8015944/1‑94 (MQ=60)
CACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGCCATAACCAGATGATC < SRR4302540.6427974/94‑1 (MQ=60)
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ACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCC > SRR4302540.1865250/1‑94 (MQ=60)
CCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCA < SRR4302540.5159177/94‑1 (MQ=60)
CCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCA < SRR4302540.3928321/94‑1 (MQ=60)
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CGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAG < SRR4302540.2238172/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAG < SRR4302540.7061654/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAG < SRR4302540.9007717/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGG < SRR4302540.1540628/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGG < SRR4302540.7049493/94‑1 (MQ=60)
GCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATACCCAGATGATCCAGGA < SRR4302540.5556074/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAA < SRR4302540.6219138/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAA > SRR4302540.6945757/1‑94 (MQ=60)
GCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAAC < SRR4302540.4092896/94‑1 (MQ=60)
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GAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGG > SRR4302540.6595953/1‑94 (MQ=60)
AATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGC > SRR4302540.2067432/1‑94 (MQ=60)
AATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGC < SRR4302540.9651673/94‑1 (MQ=60)
AATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGC < SRR4302540.6393707/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGTAAAACTGGCG > SRR4302540.8991530/1‑94 (MQ=60)
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ATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCG > SRR4302540.8927631/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTG < SRR4302540.9355453/94‑1 (MQ=60)
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TTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGG < SRR4302540.5480101/94‑1 (MQ=60)
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TTTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGG > SRR4302540.2143229/1‑94 (MQ=60)
TTGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGC > SRR4302540.5340026/1‑94 (MQ=60)
TGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCG < SRR4302540.899633/94‑1 (MQ=60)
TGAAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCG > SRR4302540.6700732/1‑94 (MQ=60)
AAGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGAT > SRR4302540.6248745/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATT > SRR4302540.5097095/1‑94 (MQ=60)
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ATGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAA < SRR4302540.5996919/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAACACTGGCGCTGATGGCGATTACG > SRR4302540.3599844/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGAT < SRR4302540.8162411/94‑1 (MQ=60)
CCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGAT > SRR4302540.5727194/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGCTACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGAT < SRR4302540.2770301/94‑1 (MQ=60)
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TACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAACA > SRR4302540.6734404/1‑94 (MQ=60)
TACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAACA < SRR4302540.5129677/94‑1 (MQ=60)
TACGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAACA > SRR4302540.8852700/1‑94 (MQ=60)
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CAATGTGATGTACAACTTTGAGATGGAGCGCCTGATCAACGCCGCGCGCAGCACCGGCTTTGCCGAATGCGCCTTTGAAGATGCCGCCCGCTATGCCAACCAACGTATCGCTTTTGGTAAGCCCATTGGTCATAACCAGATGATCCAGGAAAAACTGGCGCTGATGGCGATTAAGATCGACAACATG > NC_000913/1775915‑1776101
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
