Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,826,476 |
T→C |
N428S (AAC→AGC) |
b1746 ← |
putative aldehyde dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,826,476 | 0 | T | C | 100.0%
| 510.2
/ NA
| 156 | N428S (AAC→AGC) | b1746 | putative aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (83/73); total (83/73) |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826386‑1826564
|
gCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTa < 2:1382225/93‑1 (MQ=255)
aTACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAc < 2:2596138/93‑1 (MQ=255)
tACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACa > 1:1647334/1‑93 (MQ=255)
tACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACa > 2:6936437/1‑93 (MQ=255)
tccAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACaa < 2:3976630/92‑1 (MQ=255)
aCCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACaa < 2:7923365/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc > 2:6249670/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc < 1:6499186/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAttc > 2:1991575/1‑91 (MQ=255)
aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc < 1:6780485/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc > 2:8305997/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc > 2:1888732/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc > 2:6056335/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGGAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccgc > 1:1009987/1‑91 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc < 2:708700/93‑1 (MQ=255)
cTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcc < 1:5523250/93‑1 (MQ=255)
ggggCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcccg < 1:1099167/93‑1 (MQ=255)
gCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCgcgc > 1:3585151/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGCTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGccgc > 2:9072454/1‑91 (MQ=255)
tGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc > 2:1060546/1‑93 (MQ=255)
ggTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCa > 1:361872/1‑93 (MQ=255)
ggTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCa > 1:699991/1‑93 (MQ=255)
gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg > 1:8131188/1‑93 (MQ=255)
gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg > 1:2856554/1‑93 (MQ=255)
gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg > 2:5034670/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGc < 1:9869418/93‑1 (MQ=255)
gtACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGc < 2:2970615/92‑1 (MQ=255)
tACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCa < 1:4263848/93‑1 (MQ=255)
aCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCaa > 2:4150025/1‑93 (MQ=255)
aCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCaa > 2:5411789/1‑93 (MQ=255)
aCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCaa < 2:7612138/93‑1 (MQ=255)
aCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCaa < 2:7612139/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAAc < 2:3174818/93‑1 (MQ=255)
cGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACa < 2:836053/93‑1 (MQ=255)
cGGAACCACCAAGGGCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACa < 1:5923205/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCACCGATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 1:4462197/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 1:6260779/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg > 1:3213731/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 1:7050324/93‑1 (MQ=255)
gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt < 2:862189/93‑1 (MQ=255)
cACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAt < 1:437804/93‑1 (MQ=255)
aCCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATc > 2:428723/1‑93 (MQ=255)
aCCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATc > 1:2381344/1‑93 (MQ=255)
aCCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATc < 1:3949752/93‑1 (MQ=255)
aCCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATc > 1:637950/1‑93 (MQ=255)
cAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGa > 1:3452197/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGaa > 1:1571514/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAAc < 1:2944812/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAAc > 2:2577033/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACt < 1:9710836/93‑1 (MQ=255)
ccgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt > 1:2716946/1‑93 (MQ=255)
cgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtttt < 2:2915224/93‑1 (MQ=255)
cgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtttt > 1:2905331/1‑93 (MQ=255)
gccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTc > 2:244663/1‑93 (MQ=255)
ccgAATGGGGCGGTACGGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 1:2369122/93‑1 (MQ=255)
ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 2:6856544/93‑1 (MQ=255)
ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 2:3195392/93‑1 (MQ=255)
ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc > 2:2231025/1‑93 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc < 1:228516/93‑1 (MQ=255)
gAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCg < 1:3405717/93‑1 (MQ=255)
gAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCg > 2:3732680/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCGGTACTGGCAGCACCAGTAAGAAGCTTGCTCCAGCTAACAATCCCAGCCCGCGCCTCCAACAACCGTTGATCGAACTTTCCGCGCta > 2:1406863/1‑92 (MQ=255)
gcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgggg > 2:5196981/1‑93 (MQ=255)
cgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg > 1:6684552/1‑93 (MQ=255)
cgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg > 1:7127413/1‑93 (MQ=255)
ggTACTGGCAGCGCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATGCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGa < 1:5650414/93‑1 (MQ=255)
ggTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGa < 1:5650413/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAc < 1:8139377/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAcc < 1:4385244/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa > 2:7212541/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa > 2:5441248/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 2:5837676/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa > 2:9745297/1‑93 (MQ=255)
cagcaCCGGTAAGCGTTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc < 2:3800554/93‑1 (MQ=255)
cagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc < 1:6030115/93‑1 (MQ=255)
cagcaCAGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc < 1:7124064/93‑1 (MQ=255)
gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 1:1789207/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 2:4017902/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:2997448/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:5299886/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCaa > 1:9123486/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCaa < 1:1823632/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCaa < 1:6466008/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTACCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCaa > 1:9038296/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga < 2:9477743/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagag < 2:4245285/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag < 2:7335854/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag > 1:7908799/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagagc > 1:1858104/1‑92 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagagc > 1:8614321/1‑92 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt < 2:4481687/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt > 1:2701051/1‑93 (MQ=255)
ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg > 1:7696323/1‑93 (MQ=255)
ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg > 2:8712438/1‑93 (MQ=255)
tttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa > 2:3712091/1‑93 (MQ=255)
tttGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa < 1:9943515/93‑1 (MQ=255)
ttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAg < 1:7743142/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa < 1:8567638/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAg < 1:5879561/93‑1 (MQ=255)
ccAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgt < 2:9595759/93‑1 (MQ=255)
|
GCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826386‑1826564
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > NC_000913/1826384‑1826569
|
CGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCT < SRR4302540.4355698/94‑1 (MQ=60)
CGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCT < SRR4302540.9904674/94‑1 (MQ=60)
GGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTA < SRR4302540.8410143/94‑1 (MQ=60)
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACA > SRR4302540.1665311/1‑94 (MQ=60)
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACA > SRR4302540.1898947/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCC < SRR4302540.6571445/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCC < SRR4302540.6855453/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGGAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCGC > SRR4302540.1020229/1‑94 (MQ=60)
gcgctagtgcggtgcgtacgggacGCACCACTGCCGCCAAATGACGCGGTACTGGCAGCACCGGTACGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302540.5247049/70‑1 (MQ=58)
GCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCC > SRR4302540.1169205/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCC < SRR4302540.5584069/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGC < SRR4302540.1110483/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGC > SRR4302540.3624311/1‑94 (MQ=60)
GCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCC < SRR4302540.5658071/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTC > SRR4302540.6533950/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCC > SRR4302540.279319/1‑94 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA > SRR4302540.6812261/1‑94 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA < SRR4302540.8634767/94‑1 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA > SRR4302540.707502/1‑94 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA > SRR4302540.365588/1‑94 (MQ=60)
GGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAG > SRR4302540.8225570/1‑94 (MQ=60)
GGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAG > SRR4302540.2887498/1‑94 (MQ=60)
GGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAG < SRR4302540.7996595/94‑1 (MQ=60)
GTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGC < SRR4302540.2960039/94‑1 (MQ=60)
TTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCA < SRR4302540.9984687/94‑1 (MQ=60)
TACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAA < SRR4302540.4310220/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG > SRR4302540.3248624/1‑94 (MQ=60)
CGGAACCACCAAGGGCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG < SRR4302540.5988651/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCGATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT < SRR4302540.4510568/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT < SRR4302540.7128730/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT < SRR4302540.6330434/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT > SRR4302540.5902227/1‑94 (MQ=60)
AGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGA > SRR4302540.991974/1‑94 (MQ=60)
AGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGA > SRR4302540.4466520/1‑94 (MQ=60)
AGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGA > SRR4302540.3357876/1‑94 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC > SRR4302540.644736/1‑94 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC > SRR4302540.2406997/1‑94 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC > SRR4302540.4420122/1‑94 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC < SRR4302540.442454/94‑1 (MQ=60)
ACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCG < SRR4302540.3992395/94‑1 (MQ=60)
CCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGA > SRR4302540.3489751/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAA > SRR4302540.1588731/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAAC < SRR4302540.4281944/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACT < SRR4302540.2977195/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACT > SRR4302540.6681016/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTT < SRR4302540.9824964/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTT > SRR4302540.2746243/1‑94 (MQ=60)
CCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTT > SRR4302540.2937048/1‑94 (MQ=60)
CCGAATGGGGCGGTACGGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCC < SRR4302540.2394635/94‑1 (MQ=60)
CCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCC < SRR4302540.2394636/94‑1 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG < SRR4302540.230726/94‑1 (MQ=60)
GAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGC < SRR4302540.3442831/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGG < SRR4302540.7326975/94‑1 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG > SRR4302540.7206795/1‑94 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG > SRR4302540.6758372/1‑94 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG < SRR4302540.8080615/94‑1 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCGCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATGCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA < SRR4302540.5712623/94‑1 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA > SRR4302540.6207927/1‑94 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA < SRR4302540.5712622/94‑1 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA > SRR4302540.1820920/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACC < SRR4302540.8233851/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA < SRR4302540.4432855/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA < SRR4302540.3490426/94‑1 (MQ=60)
CGGGCAGCCCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA < SRR4302540.913473/94‑1 (MQ=60)
CAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACC < SRR4302540.712358/94‑1 (MQ=60)
CAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACC < SRR4302540.6097033/94‑1 (MQ=60)
CAGCACAGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACC < SRR4302540.7203396/94‑1 (MQ=60)
AGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCG > SRR4302540.2434904/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCG > SRR4302540.1808656/1‑94 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA > SRR4302540.3030478/1‑94 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA > SRR4302540.5357876/1‑94 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA > SRR4302540.5357874/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAA > SRR4302540.9233152/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTACCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAA > SRR4302540.9146782/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAG < SRR4302540.1843562/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAG < SRR4302540.1733731/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAG < SRR4302540.6537964/94‑1 (MQ=60)
TAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG > SRR4302540.8001020/1‑94 (MQ=60)
TAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG > SRR4302540.3645141/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG < SRR4302540.7179697/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGT > SRR4302540.2730198/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGC > SRR4302540.1878481/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGC > SRR4302540.8714411/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCG > SRR4302540.7784047/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCG > SRR4302540.5997145/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAA > SRR4302540.3012748/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAG < SRR4302540.10059637/94‑1 (MQ=60)
TTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGC < SRR4302540.7833546/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAG < SRR4302540.8667141/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAG < SRR4302540.8809172/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT < SRR4302540.5944543/94‑1 (MQ=60)
AGCTAACAATCCCCTCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTT < SRR4302540.3771149/94‑1 (MQ=60)
AGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTT < SRR4302540.3112581/94‑1 (MQ=60)
CTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > SRR4302540.7949941/1‑94 (MQ=60)
CTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > SRR4302540.7949940/1‑94 (MQ=60)
CTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT < SRR4302540.7451859/94‑1 (MQ=60)
CTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT < SRR4302540.3898398/94‑1 (MQ=60)
|
CGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > NC_000913/1826384‑1826569
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
