Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,826,476 |
T→C |
N428S (AAC→AGC) |
b1746 ← |
putative aldehyde dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,826,476 | 0 | T | C | 100.0%
| 552.5
/ NA
| 169 | N428S (AAC→AGC) | b1746 | putative aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (77/92); total (77/92) |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTG > NC_000913/1826387‑1826565
|
cATACCAGACGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTaa > 2:6136419/1‑93 (MQ=255)
aTACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAc > 1:743168/1‑93 (MQ=255)
aTACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAc < 2:226342/93‑1 (MQ=255)
tACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACa < 1:4452005/93‑1 (MQ=255)
aCCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGAATCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGATAACaa > 1:2147768/1‑93 (MQ=255)
aCCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGACAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACaa < 1:5954104/93‑1 (MQ=255)
ccAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAt < 2:4215838/93‑1 (MQ=255)
ccAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAt < 2:743168/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc < 1:5402163/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc > 1:4635726/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc > 1:4584102/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc < 2:1279057/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc < 2:5190711/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccc < 2:297622/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc < 1:1704498/93‑1 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc > 2:851173/1‑93 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc < 1:544783/93‑1 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc > 1:1250486/1‑93 (MQ=255)
cTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcc > 1:4269453/1‑93 (MQ=255)
tGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgccc > 1:59382/1‑93 (MQ=255)
ggggCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcccg > 1:3825618/1‑93 (MQ=255)
cGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTACCAATCCCCGCCCTCGcc > 1:5114488/1‑93 (MQ=255)
cGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGcc < 1:4518067/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt < 1:3678340/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 1:3104662/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt < 1:3302919/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 2:2605661/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCTAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc > 2:2058686/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc > 2:3689006/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc < 1:373542/93‑1 (MQ=255)
gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg < 1:3762296/93‑1 (MQ=255)
aCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCaa > 1:388722/1‑93 (MQ=255)
cGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACa < 2:2133292/93‑1 (MQ=255)
gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt > 1:248005/1‑93 (MQ=255)
aatcACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGtt < 1:5237500/90‑1 (MQ=255)
aaGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGtt < 1:1187148/93‑1 (MQ=255)
aaGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGtt < 1:5178076/93‑1 (MQ=255)
aaGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGtt < 1:4925477/93‑1 (MQ=255)
aGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTg > 1:2573194/1‑93 (MQ=255)
aGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTg < 2:2595059/93‑1 (MQ=255)
aGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTg > 1:3995611/1‑93 (MQ=255)
aGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTg < 2:2744641/93‑1 (MQ=255)
ccAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg > 1:4078207/1‑93 (MQ=255)
ccAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg < 2:3962653/93‑1 (MQ=255)
ccAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg < 1:358781/93‑1 (MQ=255)
ccAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATACCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg > 1:273025/1‑93 (MQ=255)
cAATGCCTCCGAATGGCGCGGTACTGTCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGa < 2:3117328/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGaa < 2:1605421/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAAc < 2:4165562/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACt < 1:2502379/93‑1 (MQ=255)
gccgccGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtt > 2:2609658/1‑93 (MQ=255)
ccgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt < 1:4122001/93‑1 (MQ=255)
cgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtttt > 1:6165560/1‑93 (MQ=255)
cgccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtttt < 1:699811/93‑1 (MQ=255)
gccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTc > 1:1572667/1‑93 (MQ=255)
ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 1:2350073/93‑1 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc < 1:3413036/93‑1 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc < 2:1759611/93‑1 (MQ=255)
gAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCg > 2:5677589/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTc > 2:4974258/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCg < 1:979312/93‑1 (MQ=255)
gcggGGTGCTGGCAGCACCGGTACGCGGTTTGTCCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgg < 2:2880484/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggg > 1:2462495/1‑93 (MQ=255)
gcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgggg > 1:4370333/1‑93 (MQ=255)
gcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgggg < 1:4339217/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggggag > 2:1285134/1‑90 (MQ=255)
cTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAcc < 2:2974812/93‑1 (MQ=255)
tgacagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCACGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:5228266/90‑1 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa > 1:3366533/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa > 2:3514508/1‑93 (MQ=255)
cggCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:462815/92‑1 (MQ=255)
ggCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAg > 2:111032/1‑93 (MQ=255)
gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAGCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 1:1763356/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 1:792787/93‑1 (MQ=255)
cagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc > 2:3267231/1‑93 (MQ=255)
gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 1:4800698/1‑93 (MQ=255)
gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 1:5299603/1‑93 (MQ=255)
gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 2:6282029/1‑93 (MQ=255)
caCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGc < 1:3965369/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 2:5323025/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCaa < 2:5429030/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAag < 2:4214933/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAag < 1:4022268/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga < 1:5313796/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagag < 2:3437581/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagag < 1:1203752/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag > 2:4269708/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTTTGTGCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag < 2:3441211/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTGTGCCAGCTAACAAGCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag < 2:1406243/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt > 2:305845/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt < 2:5490869/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTc < 1:3553337/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTc < 2:2529892/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGa > 2:1991033/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCg < 2:4823623/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGGCCGAAGCGa > 2:5832557/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAg > 2:2727915/1‑93 (MQ=255)
cAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgtg > 2:5728720/1‑93 (MQ=255)
cAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgtg < 1:1387186/93‑1 (MQ=255)
cAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgtg < 1:895005/93‑1 (MQ=255)
|
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTG > NC_000913/1826387‑1826565
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > NC_000913/1826387‑1826569
|
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAC > SRR4302533.747543/1‑94 (MQ=60)
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAC > SRR4302533.4492521/1‑94 (MQ=60)
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAC > SRR4302533.4421589/1‑94 (MQ=60)
TACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAA < SRR4302533.4478923/94‑1 (MQ=60)
TACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAA > SRR4302533.4353949/1‑94 (MQ=60)
TACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGAATCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGATAACAA > SRR4302533.2160997/1‑94 (MQ=60)
ACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAT < SRR4302533.2679930/94‑1 (MQ=60)
ACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGACAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAT < SRR4302533.5990119/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATC > SRR4302533.4611873/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATC > SRR4302533.4663814/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCACCACCGGTAAGCGGCTTGTTCCAGCTAACAATC > SRR4302533.990099/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCC < SRR4302533.5434626/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCC > SRR4302533.5334082/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCTGGGGCGATGGTTGCCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAGCCC < SRR4302533.3218181/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCC > SRR4302533.3613763/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302533.410715/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302533.1714822/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302533.6187995/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGC > SRR4302533.1257956/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCC < SRR4302533.548016/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCC > SRR4302533.4295153/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCC > SRR4302533.59772/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCG > SRR4302533.4008238/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCG > SRR4302533.3849007/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGGTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCG > SRR4302533.4706729/1‑94 (MQ=60)
GCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTACCAATCCCCGCCCTCGCC > SRR4302533.5145398/1‑94 (MQ=60)
CGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCT > SRR4302533.3123748/1‑94 (MQ=60)
CGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCT < SRR4302533.4545428/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTC < SRR4302533.3700950/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTC < SRR4302533.3323314/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCC < SRR4302533.375800/94‑1 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA < SRR4302533.1305350/94‑1 (MQ=60)
TGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA > SRR4302533.5442203/1‑94 (MQ=60)
GTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGC < SRR4302533.3785359/94‑1 (MQ=60)
TACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAA > SRR4302533.391068/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG < SRR4302533.6283035/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT < SRR4302533.4155049/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT > SRR4302533.249536/1‑94 (MQ=60)
AATCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302533.5268989/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302533.1194272/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG > SRR4302533.4019937/1‑94 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302533.4955308/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG > SRR4302533.2589023/1‑94 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302533.5209348/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302533.2227288/94‑1 (MQ=60)
AGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGA < SRR4302533.18994/94‑1 (MQ=60)
GCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAT < SRR4302533.3859441/94‑1 (MQ=60)
GCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAT < SRR4302533.2402456/94‑1 (MQ=60)
ACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCG > SRR4302533.4103033/1‑94 (MQ=60)
ACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCG > SRR4302533.1674311/1‑94 (MQ=60)
ACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCG > SRR4302533.2532222/1‑94 (MQ=60)
ACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATACCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCG > SRR4302533.274687/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGA < SRR4302533.360965/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTT < SRR4302533.2517812/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTT < SRR4302533.4147027/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTT > SRR4302533.6202621/1‑94 (MQ=60)
CGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTC < SRR4302533.703954/94‑1 (MQ=60)
CGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTC > SRR4302533.1582138/1‑94 (MQ=60)
CCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCC < SRR4302533.2364610/94‑1 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG < SRR4302533.1524181/94‑1 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG < SRR4302533.3434120/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTC > SRR4302533.1241771/1‑94 (MQ=60)
GGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGG < SRR4302533.4992704/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGG < SRR4302533.985054/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGG > SRR4302533.2477686/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGG > SRR4302533.5220613/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGG < SRR4302533.4065055/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGG > SRR4302533.4396717/1‑94 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG < SRR4302533.4365369/94‑1 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG > SRR4302533.4585108/1‑94 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA < SRR4302533.4639149/94‑1 (MQ=60)
GTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAA > SRR4302533.4893602/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA > SRR4302533.3387328/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA < SRR4302533.3589670/94‑1 (MQ=60)
TGACAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCACGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302533.5259719/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302533.465573/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC < SRR4302533.3711673/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC > SRR4302533.598282/1‑94 (MQ=60)
GCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAGCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC < SRR4302533.1774094/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC < SRR4302533.797453/94‑1 (MQ=60)
AGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCG > SRR4302533.5331352/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCG > SRR4302533.4829776/1‑94 (MQ=60)
GCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGC < SRR4302533.885372/94‑1 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA < SRR4302533.3989527/94‑1 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA > SRR4302533.3955403/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGA < SRR4302533.4046759/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAG > SRR4302533.728186/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAG < SRR4302533.5345639/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGA < SRR4302533.1210985/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGA > SRR4302533.5205899/1‑94 (MQ=60)
TAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG < SRR4302533.5426445/94‑1 (MQ=60)
TAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG < SRR4302533.302106/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGT > SRR4302533.2479396/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGT < SRR4302533.5318177/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTC < SRR4302533.3834231/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCC < SRR4302533.3575224/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCG > SRR4302533.3408113/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGA > SRR4302533.3510209/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGA > SRR4302533.970113/1‑94 (MQ=60)
CAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGT < SRR4302533.1395534/94‑1 (MQ=60)
CAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGT < SRR4302533.900263/94‑1 (MQ=60)
GCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA < SRR4302533.5657459/94‑1 (MQ=60)
CTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT < SRR4302533.3330920/94‑1 (MQ=60)
|
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTAT > NC_000913/1826387‑1826569
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
