Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,941,713 |
T→C |
S92S (AGT→AGC) |
yebI → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,941,713 | 0 | T | C | 99.5%
| 605.2
/ ‑4.9
| 190 | S92S (AGT→AGC) | yebI | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (101/88); minor base G (1/0); total (102/88) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941623‑1941802
|
cGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAgcgc > 1:6633312/1‑93 (MQ=255)
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc > 1:5767955/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCt < 1:3146973/93‑1 (MQ=255)
tACCCTGCTGCTGGCGGTCTGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACTCGTTATTAGGGATTATGGCCCACAGCGCCCt < 1:5533130/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGt < 1:10024542/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGt < 2:3403428/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGt < 2:852511/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGc < 2:4205006/93‑1 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGGGGAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGACCAGCGCCCTGTCGcg > 1:2718688/1‑92 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACCCGTTATTAGGGGTTATTGCGCACAGCGCCCTGTCGCt > 1:62771/1‑93 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATTGCGCACAGAGCCCTGTCGCt > 2:4324782/1‑93 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCgat < 1:965219/93‑3 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGAGCACAGCGCCCTGTCGCt > 2:2642510/1‑93 (MQ=255)
ctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGc > 2:5190537/1‑93 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt < 2:7933864/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtg < 1:7951254/93‑1 (MQ=255)
cgggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtgg < 2:6402985/93‑1 (MQ=255)
gggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggg > 1:6729795/1‑92 (MQ=255)
gcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggtgg < 1:913033/93‑1 (MQ=255)
cggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTggtggt < 2:6825793/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTc < 2:6725268/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACCCGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGACCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCg > 2:709137/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCg > 2:9263088/1‑93 (MQ=255)
cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTg > 2:9566337/1‑93 (MQ=255)
cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGACCTGGTGGTCGTg < 2:1085391/93‑1 (MQ=255)
tGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTgg > 2:4032627/1‑92 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAg > 2:9705552/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGt < 2:4658328/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGGCGTGAGt > 2:4563533/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGAGAGGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 2:9653555/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 2:2049873/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 2:1210029/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 2:4717539/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAt > 1:8630158/1‑93 (MQ=255)
gCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAt < 1:4349757/93‑1 (MQ=255)
cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATg < 2:9205367/93‑1 (MQ=255)
tGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGt > 2:1356276/1‑93 (MQ=255)
tGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGt > 1:619643/1‑93 (MQ=255)
tGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGt > 2:7804273/1‑93 (MQ=255)
gagaGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTa < 1:8142922/90‑1 (MQ=255)
agaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTa > 2:3211447/1‑93 (MQ=255)
agaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTa > 1:8498756/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAata < 2:9875221/93‑1 (MQ=255)
gCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAatat > 2:1238073/1‑93 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 1:3370544/93‑1 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 2:1103308/93‑1 (MQ=255)
tCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCg < 1:5882049/93‑1 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt < 1:4805916/93‑1 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGACTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt > 2:8465252/1‑93 (MQ=255)
cacaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtg > 2:8523060/1‑93 (MQ=255)
cacaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtg > 2:6572893/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtgt > 1:9840172/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtgt < 2:3100233/93‑1 (MQ=255)
caGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGtt > 2:5668461/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg < 1:9218604/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg < 1:8759715/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttga < 1:4238922/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 2:9439662/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 1:6813153/93‑1 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 2:8608625/93‑1 (MQ=255)
ggCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:1459005/1‑93 (MQ=255)
ggCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:9753385/1‑93 (MQ=255)
gCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttg > 2:17139/1‑93 (MQ=255)
cGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga > 2:3638684/1‑93 (MQ=255)
cGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga < 2:7028221/93‑1 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:6425049/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:8252165/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg > 1:5140431/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg > 1:1955485/1‑93 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc < 1:3316734/93‑1 (MQ=255)
gcacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt < 2:6308484/92‑1 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 2:8303687/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 1:3511638/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc < 1:8174315/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc > 1:3103144/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc > 1:2263719/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc > 2:5411939/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc > 1:7805837/1‑93 (MQ=255)
gTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCt > 1:9897674/1‑93 (MQ=255)
gTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCt > 2:8310260/1‑93 (MQ=255)
ttattaGGGATTGTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTg < 1:4592099/93‑1 (MQ=255)
ttattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTGATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTg > 2:2626685/1‑93 (MQ=255)
cttaGGCATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCACTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGtt < 1:8605058/92‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 1:1437887/1‑93 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg > 1:9470902/1‑93 (MQ=255)
aGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCgg > 2:5731461/1‑93 (MQ=255)
aGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCgg > 1:1762783/1‑93 (MQ=255)
ggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTg > 1:4394834/1‑93 (MQ=255)
gATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGa > 1:714183/1‑93 (MQ=255)
ttATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAtt > 1:5285150/1‑93 (MQ=255)
ttATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAtt < 1:1296024/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTg > 2:2355673/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc < 2:8183492/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc < 2:4777727/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc > 1:4534483/1‑93 (MQ=255)
ggCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCt < 1:2897490/93‑1 (MQ=255)
ggCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCt < 2:6280531/93‑1 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 2:747829/1‑93 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt > 1:2125996/1‑93 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt > 1:7533116/1‑93 (MQ=255)
|
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941623‑1941802
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG > NC_000913/1941622‑1941806
|
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGC > SRR4302540.6706729/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC > SRR4302540.7992408/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC > SRR4302540.775908/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC > SRR4302540.5831651/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC < SRR4302540.454523/94‑1 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTGCCCAGCTGGCGATCGTCACGTTTTTAGGGGTGATGGGGCACAGGGCCC > SRR4302540.3610732/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACCGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC > SRR4302540.9261943/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC > SRR4302540.10060898/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC > SRR4302540.5524417/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGAGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTGTGGCGCACAGGGCCC > SRR4302540.2896861/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTG < SRR4302540.3181254/94‑1 (MQ=60)
TACCCTGCTGCTGGCGGTCTGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACTCGTTATTAGGGATTATGGCCCACAGCGCCCTG < SRR4302540.5594060/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGT < SRR4302540.6654963/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTC < SRR4302540.10141190/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCG > SRR4302540.8273441/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGGGGAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGACCAGCGCCCTGTCGCG > SRR4302540.2747999/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACCCGTTATTAGGGGTTATTGCGCACAGCGCCCTGTCGCT > SRR4302540.63401/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTG < SRR4302540.9850901/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGATG < SRR4302540.975181/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGG < SRR4302540.8043940/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGG > SRR4302540.6804095/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTG < SRR4302540.2616492/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGT < SRR4302540.922696/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTGGTATGGATGAAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTC < SRR4302540.9023925/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGG > SRR4302540.2987770/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTG < SRR4302540.9935887/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG < SRR4302540.5946438/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG < SRR4302540.489294/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG < SRR4302540.8245994/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGCGGTCGTGAG < SRR4302540.2093263/94‑1 (MQ=60)
GGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGT > SRR4302540.8125700/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCTGCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCTCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT < SRR4302540.5994759/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT > SRR4302540.8730400/1‑94 (MQ=60)
GCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATG < SRR4302540.4397075/94‑1 (MQ=60)
CTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGT > SRR4302540.626241/1‑94 (MQ=60)
GGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCT > SRR4302540.1311491/1‑94 (MQ=60)
GAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTA > SRR4302540.8597509/1‑94 (MQ=60)
GAG‑AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAA < SRR4302540.8237438/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAAT < SRR4302540.2263454/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATA < SRR4302540.6868941/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302540.3145516/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC < SRR4302540.3407393/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC > SRR4302540.9403009/1‑94 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG > SRR4302540.5719148/1‑94 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG > SRR4302540.643707/1‑94 (MQ=60)
TCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGT < SRR4302540.5947052/94‑1 (MQ=60)
CCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTG < SRR4302540.3250563/94‑1 (MQ=60)
CCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTG < SRR4302540.4857353/94‑1 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT < SRR4302540.3769430/94‑1 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT > SRR4302540.8534386/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGT > SRR4302540.9955217/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTG < SRR4302540.4299263/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGA < SRR4302540.8861294/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGA < SRR4302540.9329180/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302540.4285045/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT < SRR4302540.6888550/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302540.1474889/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302540.8694278/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302540.9867822/1‑94 (MQ=60)
GGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTG < SRR4302540.6791295/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302540.6563282/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302540.1453988/1‑94 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302540.6496564/1‑94 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302540.8348084/1‑94 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG > SRR4302540.5196114/1‑94 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG > SRR4302540.3389042/1‑94 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG < SRR4302540.3435943/94‑1 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG > SRR4302540.1976747/1‑94 (MQ=60)
TCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGC > SRR4302540.4614948/1‑94 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT < SRR4302540.3353101/94‑1 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT < SRR4302540.8761172/94‑1 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT > SRR4302540.3549892/1‑94 (MQ=60)
ACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACC > SRR4302540.3137123/1‑94 (MQ=60)
ACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACC > SRR4302540.7897057/1‑94 (MQ=60)
ACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACC > SRR4302540.2288015/1‑94 (MQ=60)
CGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCT > SRR4302540.10013276/1‑94 (MQ=60)
CGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCT < SRR4302540.8269265/94‑1 (MQ=60)
CGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCT > SRR4302540.1758135/1‑94 (MQ=60)
TTATTAGGGATTGTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT < SRR4302540.4641518/94‑1 (MQ=60)
TTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT > SRR4302540.4801635/1‑94 (MQ=60)
TATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTT > SRR4302540.9729293/1‑94 (MQ=60)
TATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCCGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTT < SRR4302540.1087704/94‑1 (MQ=60)
CTTAGGCATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCACTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC < SRR4302540.8705054/94‑1 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302540.1453486/1‑94 (MQ=60)
TTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCG > SRR4302540.9583241/1‑94 (MQ=60)
TAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGG < SRR4302540.1923830/94‑1 (MQ=60)
TAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGG > SRR4302540.1781908/1‑94 (MQ=60)
GGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTG > SRR4302540.4442518/1‑94 (MQ=60)
GGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGA > SRR4302540.721852/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT > SRR4302540.4410649/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT > SRR4302540.5342902/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGCGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATTGCTTACCTGTTCGGTGATT > SRR4302540.81298/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTT > SRR4302540.87118/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTT < SRR4302540.1309440/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGC > SRR4302540.4583565/1‑94 (MQ=60)
GGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTG < SRR4302540.2929096/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTG < SRR4302540.7505813/94‑1 (MQ=60)
GCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGG < SRR4302540.5247046/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302540.7070284/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG < SRR4302540.9979911/94‑1 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG < SRR4302540.6310497/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > SRR4302540.2148805/1‑94 (MQ=60)
ACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > SRR4302540.7617472/1‑94 (MQ=60)
GCGCCCTATCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC < SRR4302540.3292608/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG < SRR4302540.7888534/94‑1 (MQ=60)
|
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG > NC_000913/1941622‑1941806
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
