Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,941,713 |
T→C |
S92S (AGT→AGC) |
yebI → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,941,713 | 0 | T | C | 100.0%
| 574.2
/ NA
| 179 | S92S (AGT→AGC) | yebI | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (81/98); total (81/98) |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941623‑1941802
|
cGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGGCCAAAGCTGGGGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCAGAgcgc > 1:649862/1‑93 (MQ=255)
ttACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAACGccc > 2:5180118/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGTATTATGGCGCACAGCGCCCt < 1:2813922/93‑1 (MQ=255)
tACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCt < 2:3205983/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTg > 2:2110084/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGt > 2:5871700/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGt > 2:5829335/1‑93 (MQ=255)
tgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGc < 1:4166258/93‑1 (MQ=255)
ctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGc < 2:624747/93‑1 (MQ=255)
ctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGc < 2:4093134/93‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGcc < 2:5657159/93‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGcc < 1:6010489/93‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGcc < 2:4617460/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGGCACGTTATTAGGGGTTATGGGGCACAGCGCCCCGTCGCTGGGGCt > 2:5375039/1‑93 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCt < 2:343119/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt < 1:3597827/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt < 1:121768/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACATCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtg < 1:2695072/93‑1 (MQ=255)
gggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggt < 2:3820078/93‑1 (MQ=255)
ggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggtg > 2:4335653/1‑93 (MQ=255)
gcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggtgg < 2:2820038/93‑1 (MQ=255)
gggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTagtggt < 1:2249033/92‑1 (MQ=255)
cggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTggtggt < 2:2010735/93‑1 (MQ=255)
cggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTggtggt < 2:4701561/93‑1 (MQ=255)
cgctCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTggtggt < 1:465684/90‑1 (MQ=255)
ggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTc < 1:911350/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGt < 1:5813179/93‑1 (MQ=255)
tGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGa < 1:5945416/93‑1 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAg > 1:1541529/1‑93 (MQ=255)
tATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc < 1:1103348/93‑1 (MQ=255)
tATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc < 1:5532480/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 1:3790566/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 1:1331109/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 1:1870346/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGa < 1:5890876/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAt > 2:5772624/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATg > 2:2247091/1‑93 (MQ=255)
ggAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTc > 2:4075490/1‑93 (MQ=255)
ggAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTc > 2:2661937/1‑93 (MQ=255)
ggAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTc > 2:1013271/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAata < 1:2471088/93‑1 (MQ=255)
aGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAata > 1:435534/1‑93 (MQ=255)
aGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGCCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAata < 1:4317761/93‑1 (MQ=255)
gCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAatat > 1:2605831/1‑93 (MQ=255)
gCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAatat > 2:2678646/1‑93 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 2:1173796/93‑1 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 2:3561873/93‑1 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 1:1882989/93‑1 (MQ=255)
ccACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgt < 2:4189624/93‑1 (MQ=255)
caGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGtt > 1:1433783/1‑93 (MQ=255)
caGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGtt > 2:5989990/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg > 1:2976095/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg < 2:4981826/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat > 2:613499/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt > 1:5254614/1‑93 (MQ=255)
ggATCGACACGTTATTAGTGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga < 1:1237911/92‑1 (MQ=255)
cGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga < 1:2423673/93‑1 (MQ=255)
cGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttga < 2:877852/93‑1 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat < 2:3641879/93‑1 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat < 1:1500976/93‑1 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat > 2:3503908/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:353513/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 2:2048408/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg > 2:3282025/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg > 1:5147842/1‑93 (MQ=255)
tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATgg < 1:4993751/93‑1 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc < 2:5399109/93‑1 (MQ=255)
gACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCt > 1:5606022/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 1:6032660/1‑93 (MQ=255)
cacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTa < 1:5679929/93‑1 (MQ=255)
cacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTa > 2:3042002/1‑93 (MQ=255)
gTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCt > 2:1717369/1‑93 (MQ=255)
gTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCt < 2:3344133/93‑1 (MQ=255)
ttattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTg < 1:3458100/93‑1 (MQ=255)
attaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGtt < 2:3769601/93‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 1:5652238/1‑93 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 1:5662309/1‑93 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 1:3077678/1‑93 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg < 2:4836774/93‑1 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg < 1:3908629/93‑1 (MQ=255)
aGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCCGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCgg > 2:1562073/1‑93 (MQ=255)
gggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGt > 1:2202822/1‑93 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 1:6086025/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 1:1656516/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 1:5314933/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 1:768846/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc < 2:4028666/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc < 2:3596183/93‑1 (MQ=255)
gcgcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTg < 2:3652869/93‑1 (MQ=255)
gcgcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTg < 1:1072771/93‑1 (MQ=255)
gcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGc > 1:5238117/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 2:4580614/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 2:1780457/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 1:4789339/1‑93 (MQ=255)
acaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAg < 2:649862/93‑1 (MQ=255)
acaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAg > 1:574583/1‑93 (MQ=255)
acaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAg > 2:118726/1‑93 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt < 2:3640373/93‑1 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt < 1:962290/93‑1 (MQ=255)
caGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt > 1:291231/1‑93 (MQ=255)
|
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > NC_000913/1941623‑1941802
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGA > NC_000913/1941622‑1941804
|
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGC > SRR4302533.5298149/1‑94 (MQ=60)
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGGCCAAAGCTGGGGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCAGAGCGC > SRR4302533.653696/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC > SRR4302533.1804266/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC < SRR4302533.2951547/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGTATTATGGCGCACAGCGCCCTG < SRR4302533.2831241/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTC < SRR4302533.943023/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTC < SRR4302533.6022486/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGTTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGC > SRR4302533.5258342/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCT < SRR4302533.4191502/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGG < SRR4302533.4963739/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGG < SRR4302533.2318798/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGC < SRR4302533.3581987/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCC < SRR4302533.2590499/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCT > SRR4302533.6117426/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCT < SRR4302533.6046904/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGGAGCGTCCACAGCTGGGGATCGACGCGTTATTAGGGATTATAGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTG > SRR4302533.4043688/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTG < SRR4302533.122535/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTG < SRR4302533.3619964/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACATCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGG < SRR4302533.2711588/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGG < SRR4302533.5663138/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGT < SRR4302533.5629567/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTAGTGGTC < SRR4302533.2262932/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTC < SRR4302533.468463/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCG > SRR4302533.4619695/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCG < SRR4302533.916696/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTG < SRR4302533.5848287/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG < SRR4302533.5981370/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAG > SRR4302533.1550816/1‑94 (MQ=60)
GGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGT < SRR4302533.3496566/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCT < SRR4302533.1109882/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCT < SRR4302533.5565882/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTG > SRR4302533.1520720/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTG > SRR4302533.5700122/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGAGGTCGTGAGTCTGT > SRR4302533.5485732/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT < SRR4302533.1881749/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT < SRR4302533.3813777/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT < SRR4302533.1339094/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAT < SRR4302533.5926461/94‑1 (MQ=60)
GCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATG < SRR4302533.362230/94‑1 (MQ=60)
CTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGT > SRR4302533.1243013/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATA > SRR4302533.438129/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302533.2486329/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT > SRR4302533.2621836/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGCCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302533.4343762/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC > SRR4302533.4030146/1‑94 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC < SRR4302533.1894488/94‑1 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG > SRR4302533.2735259/1‑94 (MQ=60)
CCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTG < SRR4302533.1366955/94‑1 (MQ=60)
ACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTT > SRR4302533.1442443/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTT < SRR4302533.1251975/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTG > SRR4302533.2994303/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT > SRR4302533.5286181/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT > SRR4302533.4193149/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302533.1629730/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302533.207936/1‑94 (MQ=60)
GGATCGACACGTTATTAGTGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT < SRR4302533.1245306/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT < SRR4302533.2438634/94‑1 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302533.5773014/1‑94 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG < SRR4302533.1892414/94‑1 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302533.1481285/1‑94 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG < SRR4302533.1510023/94‑1 (MQ=60)
GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302533.355670/1‑94 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG < SRR4302533.292534/94‑1 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG < SRR4302533.5067439/94‑1 (MQ=60)
ATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGG > SRR4302533.5178946/1‑94 (MQ=60)
TCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGC < SRR4302533.5024027/94‑1 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT > SRR4302533.4351235/1‑94 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT > SRR4302533.5639897/1‑94 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT < SRR4302533.5805153/94‑1 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT < SRR4302533.6318042/94‑1 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT > SRR4302533.6069221/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC < SRR4302533.5714236/94‑1 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC < SRR4302533.3892750/94‑1 (MQ=60)
GTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTG < SRR4302533.841807/94‑1 (MQ=60)
TTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT > SRR4302533.26377/1‑94 (MQ=60)
TTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT < SRR4302533.3479447/94‑1 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302533.3096565/1‑94 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302533.5686401/1‑94 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302533.5696520/1‑94 (MQ=60)
TTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCG < SRR4302533.1161274/94‑1 (MQ=60)
TAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGG < SRR4302533.3932502/94‑1 (MQ=60)
AGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGT > SRR4302533.2216399/1‑94 (MQ=60)
GGATTATGTCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGA > SRR4302533.719732/1‑94 (MQ=60)
GGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGGCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGT > SRR4302533.5963939/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT < SRR4302533.6122819/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT < SRR4302533.5346784/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT < SRR4302533.1666541/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATATCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG < SRR4302533.606554/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG < SRR4302533.773377/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCT > SRR4302533.5852165/1‑94 (MQ=60)
GGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTG > SRR4302533.3342965/1‑94 (MQ=60)
GCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGG < SRR4302533.1079094/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC < SRR4302533.3096035/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302533.5269612/1‑94 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302533.5691832/1‑94 (MQ=60)
GCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCA > SRR4302533.4818350/1‑94 (MQ=60)
GCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCA > SRR4302533.2240870/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > SRR4302533.577975/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > SRR4302533.472151/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG < SRR4302533.2478587/94‑1 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > SRR4302533.994542/1‑94 (MQ=60)
ACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGT > SRR4302533.293004/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTG < SRR4302533.967943/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGA < SRR4302533.5211401/94‑1 (MQ=60)
|
CCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGA > NC_000913/1941622‑1941804
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
