Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,365,769 |
T→C |
C227R (TGC→CGC) |
b2254 → |
putative sugar transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,365,769 | 0 | T | C | 100.0%
| 803.2
/ NA
| 248 | C227R (TGC→CGC) | b2254 | putative sugar transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (135/113); total (135/113) |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
AAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT > NC_000913/2365680‑2365858
|
aaTTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCt > 1:3139816/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTa < 1:1922759/93‑1 (MQ=255)
tCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAc < 1:6527730/93‑1 (MQ=255)
tCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAc > 1:8443254/1‑93 (MQ=255)
tCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAc < 1:7969526/93‑1 (MQ=255)
cAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACca < 1:3692502/93‑1 (MQ=255)
aGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACcac < 2:8157684/93‑1 (MQ=255)
gTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACcaca > 1:7119915/1‑93 (MQ=255)
tACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACaa < 1:1785576/93‑1 (MQ=255)
tACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACaa < 2:1481087/93‑1 (MQ=255)
aCATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAc < 2:3673161/93‑1 (MQ=255)
catcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcg > 1:1452870/1‑93 (MQ=255)
atcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgc > 1:9382270/1‑93 (MQ=255)
atcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgc > 2:9392732/1‑93 (MQ=255)
tcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgcc > 2:1912612/1‑93 (MQ=255)
tcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgcc > 1:1273268/1‑93 (MQ=255)
tcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgcc > 2:3220489/1‑93 (MQ=255)
catGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgccg > 2:5218015/1‑93 (MQ=255)
catGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgccg > 1:4581091/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCt > 2:1613366/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCt > 2:4369299/1‑93 (MQ=255)
gCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTa < 2:9042180/93‑1 (MQ=255)
cGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACg < 1:7237216/93‑1 (MQ=255)
gAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGt > 1:3946978/1‑93 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACgca < 2:9658255/93‑3 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa < 1:2150861/93‑1 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa > 2:1742342/1‑93 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa < 1:4285930/93‑1 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa < 2:2427337/93‑1 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa < 1:4879005/93‑1 (MQ=255)
gCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAt > 2:2237940/1‑93 (MQ=255)
ggTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATg < 1:2817426/92‑1 (MQ=255)
cGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAtc > 1:9597868/1‑92 (MQ=255)
gTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGc > 1:4708335/1‑93 (MQ=255)
gTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGc > 2:8405913/1‑93 (MQ=255)
gAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTg < 2:786588/93‑1 (MQ=255)
aGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGa > 1:5677817/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAg < 1:4224797/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAg < 2:2022054/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTc < 1:9284211/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTg < 2:3287420/93‑1 (MQ=255)
gTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGCCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGc < 2:2936323/93‑1 (MQ=255)
gTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGc > 1:9194955/1‑93 (MQ=255)
tGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCt > 2:3158128/1‑93 (MQ=255)
aaTCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCg > 2:4759793/1‑93 (MQ=255)
aaTCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCg < 1:3648084/93‑1 (MQ=255)
cAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcag < 1:10035088/93‑1 (MQ=255)
aaaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAGGCCGCTCCGTATGCTGAGTCTGCTCGgtagc > 1:2246318/1‑93 (MQ=255)
aaaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagc < 2:2160943/93‑1 (MQ=255)
aaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagca < 2:3706755/93‑1 (MQ=255)
aaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagca > 2:3698002/1‑93 (MQ=255)
aTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagcac < 2:6164764/93‑2 (MQ=255)
aTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCat < 1:6781295/93‑1 (MQ=255)
aTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCat < 1:1606377/93‑1 (MQ=255)
aCAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatta > 2:602118/1‑93 (MQ=255)
aCAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACCTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatta > 1:1299996/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCattat < 1:900130/93‑1 (MQ=255)
aGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCattatt < 2:4712607/93‑1 (MQ=255)
ttATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGa < 1:3583693/93‑1 (MQ=255)
tATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGAt < 2:8865763/93‑1 (MQ=255)
tATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGAt < 1:2608454/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTg > 2:113119/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTgg > 2:2816170/1‑93 (MQ=255)
cgcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGa > 2:9168660/1‑93 (MQ=255)
agcCTGAGTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGa < 1:6901603/92‑1 (MQ=255)
gcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAg > 1:7882636/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAgg > 2:9677071/1‑93 (MQ=255)
cTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGt < 2:2380463/93‑1 (MQ=255)
cTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGt > 1:5370110/1‑93 (MQ=255)
tGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtt > 2:9513160/1‑93 (MQ=255)
tGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtt < 1:2948697/93‑1 (MQ=255)
gATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGttt < 1:6031344/93‑1 (MQ=255)
gATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGttt > 2:6855143/1‑93 (MQ=255)
gATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGCCTGCTCGGCAGCATTATTGCGCTTGGAGGttt > 2:3045474/1‑93 (MQ=255)
aTTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtttt > 1:2467184/1‑93 (MQ=255)
aTTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtttt < 1:6166147/93‑1 (MQ=255)
ttAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTa > 2:7306508/1‑93 (MQ=255)
ttAATTTGATGTACCCCCTGGTGACCCGCCTTAGCACAACGGCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTa < 1:8552880/93‑1 (MQ=255)
tAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAg < 2:768154/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGc > 2:6565686/1‑93 (MQ=255)
aTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGTATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCa > 2:8640439/1‑93 (MQ=255)
aTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGct > 1:3414817/1‑92 (MQ=255)
aTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCa < 1:4169116/93‑1 (MQ=255)
tttGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAt < 2:4478929/93‑1 (MQ=255)
gATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGc > 1:1169947/1‑93 (MQ=255)
aTGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCg > 2:5639951/1‑93 (MQ=255)
aTGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCg < 1:4113045/93‑1 (MQ=255)
tACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTGTTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtg > 1:4470555/1‑93 (MQ=255)
tACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAg > 1:5837565/1‑76 (MQ=255)
tACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtg < 1:2955933/93‑1 (MQ=255)
aCGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 2:3910676/93‑1 (MQ=255)
gACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctg > 2:5250432/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctgc > 1:747233/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctgc < 2:5855587/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGctgctg > 2:9607478/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTgg < 2:6681769/93‑1 (MQ=255)
gTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg > 2:1055745/1‑93 (MQ=255)
tGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGa < 2:6359780/93‑1 (MQ=255)
gACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAt > 1:3058693/1‑93 (MQ=255)
aCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAtt > 1:3270139/1‑93 (MQ=255)
|
AAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT > NC_000913/2365680‑2365858
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC > NC_000913/2365676‑2365862
|
ATTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCC > SRR4302540.1675697/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCC > SRR4302540.1286486/1‑94 (MQ=60)
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG < SRR4302540.3979254/94‑1 (MQ=60)
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG > SRR4302540.6501189/1‑94 (MQ=60)
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG > SRR4302540.6316971/1‑94 (MQ=60)
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG < SRR4302540.8535581/94‑1 (MQ=60)
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG < SRR4302540.3625405/94‑1 (MQ=60)
AAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCT < SRR4302540.7208957/94‑1 (MQ=60)
AAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCT > SRR4302540.3174054/1‑94 (MQ=60)
ATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTA > SRR4302540.2118544/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAC > SRR4302540.8541267/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAC > SRR4302540.8541266/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAC < SRR4302540.1943722/94‑1 (MQ=60)
TCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACC < SRR4302540.6600221/94‑1 (MQ=60)
TCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACC < SRR4302540.8062393/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGAAGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCA < SRR4302540.4363956/94‑1 (MQ=60)
CAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCAC < SRR4302540.3732831/94‑1 (MQ=60)
AGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACA > SRR4302540.7199190/1‑94 (MQ=60)
AGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACA < SRR4302540.9010246/94‑1 (MQ=60)
TACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAC > SRR4302540.4852220/1‑94 (MQ=60)
TACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAC < SRR4302540.8019702/94‑1 (MQ=60)
TACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAC < SRR4302540.1804969/94‑1 (MQ=60)
TACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAC < SRR4302540.944635/94‑1 (MQ=60)
ACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACG > SRR4302540.1468673/1‑94 (MQ=60)
CATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGC > SRR4302540.9493947/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCC > SRR4302540.1286383/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCC > SRR4302540.4296903/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCC > SRR4302540.1286384/1‑94 (MQ=60)
TCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCG > SRR4302540.4630473/1‑94 (MQ=60)
TCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCG > SRR4302540.6853304/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCT > SRR4302540.4619268/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCT < SRR4302540.2512752/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTAC < SRR4302540.5526764/94‑1 (MQ=60)
CCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACG < SRR4302540.4736956/94‑1 (MQ=60)
CCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACG < SRR4302540.365056/94‑1 (MQ=60)
CGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGT > SRR4302540.3989594/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGT < SRR4302540.7069308/94‑1 (MQ=60)
CGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGT < SRR4302540.7317942/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGTTTTTGTGAATCAAAATACAGGTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGGGACCCGCCTTTCCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.4931389/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.3031342/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.4931393/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.4332552/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.2173991/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302540.8460494/94‑1 (MQ=60)
GCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATC > SRR4302540.9711112/1‑94 (MQ=60)
GGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGC < SRR4302540.2847868/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGC > SRR4302540.4758655/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCT < SRR4302540.2925162/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCT > SRR4302540.8620020/1‑94 (MQ=60)
TGAGTGTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTG < SRR4302540.9332630/94‑1 (MQ=60)
GAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGA > SRR4302540.5740334/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGT > SRR4302540.6444005/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGT < SRR4302540.4270785/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCT < SRR4302540.9395166/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGC > SRR4302540.9305245/1‑94 (MQ=60)
GTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGAACCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCT < SRR4302540.7933283/94‑1 (MQ=60)
TGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGACTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTC < SRR4302540.1822277/94‑1 (MQ=60)
GAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCG < SRR4302540.6253828/94‑1 (MQ=60)
AATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGG > SRR4302540.1318681/1‑94 (MQ=60)
AATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGG < SRR4302540.3688046/94‑1 (MQ=60)
AATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGG > SRR4302540.5086443/1‑94 (MQ=60)
ATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGC > SRR4302540.4176748/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAGGCCGCTCCGTATGCTGAGTCTGCTCGGTAGC > SRR4302540.2270450/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGC < SRR4302540.10151799/94‑1 (MQ=60)
CAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGC > SRR4302540.2270449/1‑94 (MQ=60)
AATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCAT > SRR4302540.7029479/1‑94 (MQ=60)
ATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATT < SRR4302540.1623958/94‑1 (MQ=60)
ATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATT < SRR4302540.6856278/94‑1 (MQ=60)
ATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATT > SRR4302540.2388301/1‑94 (MQ=60)
TACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTA < SRR4302540.3688055/94‑1 (MQ=60)
TACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACCTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTA > SRR4302540.1313471/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTAT < SRR4302540.3147059/94‑1 (MQ=60)
ACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTAT < SRR4302540.6682796/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATT < SRR4302540.909697/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATT > SRR4302540.5842528/1‑94 (MQ=60)
AGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTG > SRR4302540.3819119/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTG < SRR4302540.4046587/94‑1 (MQ=60)
GTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGC > SRR4302540.9364974/1‑94 (MQ=60)
TTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGA < SRR4302540.961594/94‑1 (MQ=60)
TTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGAT < SRR4302540.3622836/94‑1 (MQ=60)
TTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGAT < SRR4302540.3622837/94‑1 (MQ=60)
TATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATT < SRR4302540.2636610/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGG < SRR4302540.3381016/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAG > SRR4302540.7974675/1‑94 (MQ=60)
CGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAG < SRR4302540.2845031/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAG < SRR4302540.4266080/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGAGTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAG < SRR4302540.6978310/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGT > SRR4302540.3947536/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGT > SRR4302540.5429130/1‑94 (MQ=60)
CTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTT < SRR4302540.10092429/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT > SRR4302540.7374300/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT < SRR4302540.2981147/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT > SRR4302540.1258270/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGAACTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTGTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGGTT > SRR4302540.4779387/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTTGAGGTACGCCCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT < SRR4302540.2981139/94‑1 (MQ=60)
TATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTT < SRR4302540.6098280/94‑1 (MQ=60)
GATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTT > SRR4302540.2493735/1‑94 (MQ=60)
GATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTT < SRR4302540.6098281/94‑1 (MQ=60)
GATTAATGTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTT < SRR4302540.9558270/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTA < SRR4302540.6234853/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTA > SRR4302540.1403658/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTA > SRR4302540.7554394/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTA > SRR4302540.4339355/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCAAACCGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTA < SRR4302540.6234852/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTGATGTACCCCCTGGTGACCCGCCTTAGCACAACGGCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAG < SRR4302540.8652226/94‑1 (MQ=60)
TAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTCTGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGTTTGGTGGTTTagcc > SRR4302540.3442156/1‑90 (MQ=60)
TAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGC > SRR4302540.398839/1‑94 (MQ=60)
TAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGC > SRR4302540.1065385/1‑94 (MQ=60)
TAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGC > SRR4302540.5908713/1‑94 (MQ=60)
AATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCT > SRR4302540.3451990/1‑94 (MQ=60)
AATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCA < SRR4302540.303371/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT < SRR4302540.4214333/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT > SRR4302540.1469704/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT > SRR4302540.9939627/1‑94 (MQ=60)
TGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGC > SRR4302540.1182063/1‑94 (MQ=60)
TGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGC < SRR4302540.5569100/94‑1 (MQ=60)
TGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGC < SRR4302540.1185498/94‑1 (MQ=60)
GATGTACGACCTGGTGCCCCGCCTTACCTCAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTTCTCGGCAGCATGATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCG < SRR4302540.690629/94‑1 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG > SRR4302540.2597461/1‑94 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG > SRR4302540.4757617/1‑94 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG < SRR4302540.9289721/94‑1 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG > SRR4302540.3253102/1‑94 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG < SRR4302540.8024614/94‑1 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG < SRR4302540.4157451/94‑1 (MQ=60)
TGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGT < SRR4302540.1963208/94‑1 (MQ=60)
GTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTGTTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTG > SRR4302540.4519032/1‑94 (MQ=60)
GTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGaagcgctagatcggaa > SRR4302540.5902113/1‑78 (MQ=60)
GTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTG > SRR4302540.2193543/1‑94 (MQ=60)
TACGACCTGGTTACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGC < SRR4302540.2988487/94‑1 (MQ=60)
TACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGC < SRR4302540.2988490/94‑1 (MQ=60)
TACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGC > SRR4302540.9108955/1‑94 (MQ=60)
ACGACCTGGTGACCCGCCTTACCGCAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGAATGGGGGTGCT > SRR4302540.1774831/1‑94 (MQ=60)
ACGACCTGGTGACCCGCCTTACCGCAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCCATTGGAGGATTTAGAATTCGGGTGCT > SRR4302540.1774827/1‑94 (MQ=60)
ACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCT > SRR4302540.1774832/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGC > SRR4302540.755194/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCT > SRR4302540.4265712/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCT < SRR4302540.3556845/94‑1 (MQ=60)
GGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTG > SRR4302540.3163606/1‑94 (MQ=60)
TGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAT > SRR4302540.3092254/1‑94 (MQ=60)
GACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT > SRR4302540.3305831/1‑94 (MQ=60)
ACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTT > SRR4302540.3800571/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTT > SRR4302540.1709968/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTT > SRR4302540.6768672/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC < SRR4302540.8985710/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC > SRR4302540.8391013/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC < SRR4302540.5770731/94‑1 (MQ=60)
|
ATTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC > NC_000913/2365676‑2365862
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
