Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,365,769 |
T→C |
C227R (TGC→CGC) |
b2254 → |
putative sugar transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,365,769 | 0 | T | C | 99.0%
| 643.9
/ NA
| 201 | C227R (TGC→CGC) | b2254 | putative sugar transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (104/95); minor base A (2/0); total (106/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT > NC_000913/2365679‑2365858
|
aaTTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCt < 1:683899/93‑1 (MQ=255)
aaTTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCt < 1:3043486/93‑1 (MQ=255)
tCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTAc < 2:3465724/93‑1 (MQ=255)
cAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACca > 2:2954825/1‑93 (MQ=255)
cAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACca > 1:499357/1‑93 (MQ=255)
gTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACcaca > 2:308647/1‑93 (MQ=255)
gTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACcaca > 2:240399/1‑93 (MQ=255)
gTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACcaca > 2:5782756/1‑93 (MQ=255)
atcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgc < 2:663003/93‑1 (MQ=255)
tcatGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgcc > 2:3944514/1‑93 (MQ=255)
atGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAcgccgc > 2:5277423/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCt > 1:3082684/1‑93 (MQ=255)
tGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCt < 1:778054/93‑1 (MQ=255)
gCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTa < 2:3877205/93‑1 (MQ=255)
gAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGt > 1:931800/1‑93 (MQ=255)
aGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTa < 2:1809160/93‑1 (MQ=255)
gCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAt > 2:4471607/1‑93 (MQ=255)
gCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAt > 2:1052553/1‑93 (MQ=255)
gTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGCATGc > 1:256720/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCt > 1:32526/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCt > 1:3646463/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCt > 1:4424231/1‑93 (MQ=255)
gAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTg > 1:1936190/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAg < 1:3185510/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAg > 2:4994782/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGt < 1:1809874/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGt > 2:4268561/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTc < 1:3713690/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTg > 2:3676928/1‑93 (MQ=255)
gAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTc < 1:2866812/93‑1 (MQ=255)
aaTCTAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCg < 1:3856818/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCg > 1:2709746/1‑93 (MQ=255)
tCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgc > 2:3850416/1‑93 (MQ=255)
tCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgc > 2:1513906/1‑93 (MQ=255)
ccAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgca > 2:3264106/1‑93 (MQ=255)
ccAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTACTCCgca > 2:6240319/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcag > 1:2441952/1‑93 (MQ=255)
aaaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGTTGACCAGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcaga > 1:1620331/1‑92 (MQ=255)
aaaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagc > 1:4796846/1‑93 (MQ=255)
aaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagca > 2:1676309/1‑93 (MQ=255)
aaTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCACCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGgcagca > 1:1262988/1‑93 (MQ=255)
aTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCat < 1:3422788/93‑1 (MQ=255)
aTACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCat < 2:103834/93‑1 (MQ=255)
tACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatt < 1:4556911/93‑1 (MQ=255)
tACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatt < 1:3985149/93‑1 (MQ=255)
aCAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatta < 2:870652/93‑1 (MQ=255)
aCAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCatta > 2:1259295/1‑93 (MQ=255)
gTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTg > 2:548968/1‑93 (MQ=255)
ttttATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGc < 1:2087307/93‑1 (MQ=255)
ttttATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGc < 1:3670001/93‑1 (MQ=255)
ttttATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGc > 2:1985046/1‑93 (MQ=255)
ttttATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGc < 2:2713665/93‑1 (MQ=255)
tATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGAt > 2:5700173/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTg < 1:5826743/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTg > 1:5889371/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTg < 2:5897749/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTgg < 1:566044/93‑1 (MQ=255)
cgcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGa < 2:1428244/93‑1 (MQ=255)
cgcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGa < 2:2013507/93‑1 (MQ=255)
gcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAg > 1:4199564/1‑93 (MQ=255)
gcCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCAGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAg > 2:6218160/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAgg > 1:4972387/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAgg > 2:4025155/1‑93 (MQ=255)
cTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGt < 2:4317879/93‑1 (MQ=255)
cTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGt > 2:2850244/1‑93 (MQ=255)
tGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtt < 1:6072623/93‑1 (MQ=255)
tGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtt < 1:4472228/93‑1 (MQ=255)
aTTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtttt > 1:724848/1‑93 (MQ=255)
aTTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGtttt < 2:5889476/93‑1 (MQ=255)
ttAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTa < 1:1141072/93‑1 (MQ=255)
ttAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTa < 2:4787916/93‑1 (MQ=255)
ttAATTTGATGTACGACCTGGGGCCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTa < 2:3396978/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGc < 2:5131645/93‑1 (MQ=255)
aTTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCa < 1:1687886/93‑1 (MQ=255)
tttGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAt < 1:616524/93‑1 (MQ=255)
ttGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAtt > 1:1155471/1‑93 (MQ=255)
ttGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAtt < 1:4349104/93‑1 (MQ=255)
tGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTg < 2:4402398/93‑1 (MQ=255)
tGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTg > 1:2751923/1‑93 (MQ=255)
tGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTg < 2:1174935/93‑1 (MQ=255)
tGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCAGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTg < 1:391861/93‑1 (MQ=255)
gATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGc > 1:5139824/1‑93 (MQ=255)
tGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCgg > 2:2253427/1‑93 (MQ=255)
tGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCgg < 2:4593962/93‑1 (MQ=255)
gTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGt < 2:2061442/93‑1 (MQ=255)
tACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtg > 2:1283730/1‑93 (MQ=255)
aCGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 2:3278382/93‑1 (MQ=255)
aCGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:5103954/93‑1 (MQ=255)
aCGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:383387/93‑1 (MQ=255)
gACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctg > 2:192101/1‑93 (MQ=255)
gACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctg > 2:5991063/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGtgctgc > 2:5831141/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTgg > 1:5358436/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTgg > 1:4926309/1‑93 (MQ=255)
ggTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGt < 2:3041211/93‑1 (MQ=255)
ggTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGt < 2:4505916/93‑1 (MQ=255)
gACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAt < 1:4725739/93‑1 (MQ=255)
gACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAt < 1:552936/93‑1 (MQ=255)
aCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAtt > 2:5381369/1‑93 (MQ=255)
aCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGAtt > 2:4781239/1‑93 (MQ=255)
|
GAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT > NC_000913/2365679‑2365858
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC > NC_000913/2365677‑2365862
|
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCG < SRR4302533.1835741/94‑1 (MQ=60)
TGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGC > SRR4302533.5873418/1‑94 (MQ=60)
AAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGATTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCT < SRR4302533.88677/94‑1 (MQ=60)
AATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTT < SRR4302533.687944/94‑1 (MQ=60)
AATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTT < SRR4302533.3062117/94‑1 (MQ=60)
TCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACC > SRR4302533.5842335/1‑94 (MQ=60)
TCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACC > SRR4302533.3880139/1‑94 (MQ=60)
CCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCA > SRR4302533.4924457/1‑94 (MQ=60)
CCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCA > SRR4302533.502330/1‑94 (MQ=60)
GTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAA < SRR4302533.4484727/94‑1 (MQ=60)
TACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAAC < SRR4302533.3291467/94‑1 (MQ=60)
ACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACG < SRR4302533.3081013/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCT > SRR4302533.3101603/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTA < SRR4302533.782633/94‑1 (MQ=60)
CGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGT < SRR4302533.3711149/94‑1 (MQ=60)
CGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGT > SRR4302533.937270/1‑94 (MQ=60)
AGTGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT < SRR4302533.1738559/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTAT > SRR4302533.2835046/1‑94 (MQ=60)
CGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGC < SRR4302533.4665838/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGCATGC > SRR4302533.258286/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCT > SRR4302533.3668884/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCT > SRR4302533.4450975/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCT > SRR4302533.32748/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTG > SRR4302533.1947999/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGA > SRR4302533.4975194/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGT < SRR4302533.3205102/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTC < SRR4302533.1820889/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCT < SRR4302533.3736492/94‑1 (MQ=60)
TGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTG > SRR4302533.44364/1‑94 (MQ=60)
GTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCT < SRR4302533.5135899/94‑1 (MQ=60)
GTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCT < SRR4302533.1341901/94‑1 (MQ=60)
TGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTC < SRR4302533.5378413/94‑1 (MQ=60)
GAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCG < SRR4302533.2884449/94‑1 (MQ=60)
GAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCG > SRR4302533.2726376/1‑94 (MQ=60)
AATCTAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGG < SRR4302533.3880366/94‑1 (MQ=60)
ATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGC > SRR4302533.1697941/1‑94 (MQ=60)
ATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACAACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGC > SRR4302533.5525905/1‑94 (MQ=60)
TCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCA < SRR4302533.1158874/94‑1 (MQ=60)
TCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCA > SRR4302533.2486869/1‑94 (MQ=60)
CCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAG > SRR4302533.2457026/1‑94 (MQ=60)
CCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAG < SRR4302533.706210/94‑1 (MQ=60)
CAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGTTGACCAGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGA > SRR4302533.1630147/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGC > SRR4302533.4825902/1‑94 (MQ=60)
AAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCACCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCA > SRR4302533.1270544/1‑94 (MQ=60)
AATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCAT < SRR4302533.3032077/94‑1 (MQ=60)
ATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATT < SRR4302533.3443931/94‑1 (MQ=60)
ATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATT > SRR4302533.2750122/1‑94 (MQ=60)
TACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTA < SRR4302533.4584547/94‑1 (MQ=60)
TACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTA < SRR4302533.4009413/94‑1 (MQ=60)
ACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGCGTCTGCTCGGCAGCATTAT > SRR4302533.958464/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCATACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTAT < SRR4302533.4562910/94‑1 (MQ=60)
GTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGC > SRR4302533.4756302/1‑94 (MQ=60)
GTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGC < SRR4302533.3684194/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCG < SRR4302533.2100161/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCG < SRR4302533.3692561/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTG > SRR4302533.5924952/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGG < SRR4302533.5861951/94‑1 (MQ=60)
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GCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGA < SRR4302533.6057146/94‑1 (MQ=60)
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GCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGG > SRR4302533.5002535/1‑94 (MQ=60)
CTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTT > SRR4302533.3856269/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT < SRR4302533.4499280/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTT < SRR4302533.6109360/94‑1 (MQ=60)
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TTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAG > SRR4302533.4256973/1‑94 (MQ=60)
TTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAG < SRR4302533.4112730/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAG < SRR4302533.1147869/94‑1 (MQ=60)
ATAATTTGATGTACCGCCTGGTGCCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAG < SRR4302533.3962870/94‑1 (MQ=60)
TAATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGC > SRR4302533.2001142/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGCCCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT < SRR4302533.2251376/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT < SRR4302533.5005471/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT < SRR4302533.1698115/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCAT > SRR4302533.3891443/1‑94 (MQ=60)
TTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATT < SRR4302533.6130225/94‑1 (MQ=60)
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TTTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATT > SRR4302533.1162401/1‑94 (MQ=60)
TTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTG > SRR4302533.2768797/1‑94 (MQ=60)
TTGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTG < SRR4302533.4375325/94‑1 (MQ=60)
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TGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGC > SRR4302533.3643762/1‑94 (MQ=60)
TGATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCAGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGC < SRR4302533.394234/94‑1 (MQ=60)
ATGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGG > SRR4302533.1201072/1‑94 (MQ=60)
TGTACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGT < SRR4302533.1945233/94‑1 (MQ=60)
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ACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCT < SRR4302533.5134784/94‑1 (MQ=60)
ACGACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCT < SRR4302533.385703/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCT < SRR4302533.5692849/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGG > SRR4302533.4956146/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGG > SRR4302533.3248493/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGG < SRR4302533.5049129/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGG > SRR4302533.5390603/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGT > SRR4302533.741845/1‑94 (MQ=60)
GACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT < SRR4302533.4754392/94‑1 (MQ=60)
GACCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATT < SRR4302533.556212/94‑1 (MQ=60)
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CCCGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTT > SRR4302533.1505866/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAG > SRR4302533.2982621/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGCGCTGCTGGTGATTTTAC > SRR4302533.5905718/1‑94 (MQ=60)
|
TTGAAATTCCAGTACATCATGCCGAGCGTGAGTTTGGTGAATCCAAATACAGTTTTATGCGCCTGATTAATTTGATGTACGACCTGGTGACCTGCCTTACCACAACGCCGCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTGATTTTAC > NC_000913/2365677‑2365862
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
