Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,370,869 |
C→T |
A98V (GCG→GTG) |
b4533 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,370,869 | 0 | C | T | 99.6%
| 836.0
/ NA
| 253 | A98V (GCG→GTG) | b4533 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (110/142); minor base G (1/0); total (111/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > NC_000913/2370779‑2370958
|
cGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGgtgt > 1:3343771/1‑93 (MQ=255)
gATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGtt > 1:6637577/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCa > 1:8028798/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCa > 1:5144289/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCa > 2:6112807/1‑93 (MQ=255)
gTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCat > 2:3268121/1‑93 (MQ=255)
gTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCat < 2:131247/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCat < 2:4574101/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGGGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGAATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCat > 1:1769017/1‑93 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat < 2:7565356/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat > 1:1198441/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattatt < 1:4222904/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattatt < 2:10005797/93‑1 (MQ=255)
gTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTg > 2:3339442/1‑93 (MQ=255)
gTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTg > 1:1106985/1‑93 (MQ=255)
tCTGAATTTTTTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTgg < 2:8448766/93‑1 (MQ=255)
tCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTgg > 2:110706/1‑93 (MQ=255)
tCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTgg < 1:465424/93‑1 (MQ=255)
cTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggc < 2:5148181/93‑1 (MQ=255)
tGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggcg > 1:3730861/1‑93 (MQ=255)
tGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGGGGTGTTCATTATTggcg > 2:4829392/1‑93 (MQ=255)
gAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggcgg > 2:1092511/1‑93 (MQ=255)
gAATTTTGTCTGGGGGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGGCACTGGTGTGGGGGGGTGCTCATTATTggcgg > 1:1395171/1‑93 (MQ=255)
aaaTGTTTTCTGGTTGAGGCTGTGTGCAGTAAAGCTGTGCCCCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGGGTGGGGTGGTGTTCATTAATtgcgg < 2:9491796/92‑1 (MQ=255)
aaTTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggcggc < 1:2901178/93‑1 (MQ=255)
aTTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCa < 1:6121315/93‑1 (MQ=255)
ttttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAt < 2:4361426/93‑1 (MQ=255)
ttttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAt < 2:7107411/93‑1 (MQ=255)
ttttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAt < 2:4286733/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATtgcg > 1:9875167/1‑91 (MQ=255)
tCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGGACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGa > 1:4887595/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGa < 1:8811331/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGAt > 1:6907944/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCGTTGCGATcc < 1:6437865/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 2:3927778/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGAGTGGGGAGGTGATCCTTATTGGCGGGATTGCGAtac > 2:7376149/1‑91 (MQ=255)
ggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCt > 2:374824/1‑93 (MQ=255)
tGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCg < 1:6653148/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCg < 1:1556888/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCg < 1:2056139/92‑1 (MQ=255)
gACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCgg > 2:5858005/1‑93 (MQ=255)
gcGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg < 1:6053065/92‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg < 2:9646759/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGCTGAAGCAAAACTGTTGCACGACCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGa < 2:2826681/93‑1 (MQ=255)
ctggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGt > 2:5141893/1‑93 (MQ=255)
ctggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGt > 1:35967/1‑93 (MQ=255)
gctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACg < 1:5605073/93‑1 (MQ=255)
ctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACgg > 1:7555939/1‑93 (MQ=255)
attAAAACTGTGGCACGACCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTa < 2:4895148/91‑1 (MQ=255)
gTAAACCTGTGGCGCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTaa < 1:8080698/93‑1 (MQ=255)
tAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTaag > 2:7691054/1‑92 (MQ=255)
tAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAt < 2:6947027/93‑1 (MQ=255)
tAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATCGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAt > 1:9401976/1‑93 (MQ=255)
aaagCTGTGGCGGGAGCCGGTAGCGCCGCGTCTCTTGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGTAGTACGGTGTAATg < 2:8737013/93‑1 (MQ=255)
aaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATgg > 2:9162884/1‑93 (MQ=255)
aCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGc > 2:2873213/1‑93 (MQ=255)
tgtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCt > 2:8312744/1‑93 (MQ=255)
tgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGa < 2:8052801/93‑1 (MQ=255)
ggCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAt < 2:5716258/93‑1 (MQ=255)
gCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGTAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtg < 2:398988/93‑1 (MQ=255)
gCAAGATCCGGTAACGCCTCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtg < 1:5461145/93‑1 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgt < 1:9106777/93‑1 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:6234155/93‑2 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgtg > 1:7214172/1‑93 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgcg < 1:5923994/93‑3 (MQ=255)
cGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTgg > 1:9656445/1‑93 (MQ=255)
cGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgg < 1:7830489/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGGGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:2756680/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGGGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGCTGTgggg > 1:3435166/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTATCGCCGCGTCACTAGTGTGGGTTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 2:5549270/93‑1 (MQ=255)
ccGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGat < 1:4088033/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta > 2:9918632/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta > 1:9337012/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta > 1:9728738/1‑93 (MQ=255)
gTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGattat < 1:8283288/93‑1 (MQ=255)
gTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGattat > 2:777057/1‑93 (MQ=255)
ttCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTc < 2:5215619/92‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTc < 2:2306300/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAg < 1:2284438/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAg < 1:5232724/93‑1 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGc > 2:3038934/1‑93 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGc > 2:9761865/1‑93 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGc > 2:2781055/1‑93 (MQ=255)
ccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCg > 2:4324731/1‑93 (MQ=255)
cgcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGt < 1:7709587/93‑1 (MQ=255)
gcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTc > 1:4443257/1‑93 (MQ=255)
cgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCa < 2:6525656/93‑1 (MQ=255)
tCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCatt > 2:217677/1‑93 (MQ=255)
cACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCatta > 2:165698/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat < 1:6769170/92‑1 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat < 1:9257404/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCattatt < 2:1428397/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTg < 2:2451204/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGcc > 2:9564435/1‑93 (MQ=255)
gtgtGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGcc < 2:1769017/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCt > 1:617044/1‑93 (MQ=255)
gtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTc < 2:2710901/93‑1 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt < 1:8535258/93‑1 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt < 1:7948200/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGtt < 1:5389003/93‑1 (MQ=255)
|
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > NC_000913/2370779‑2370958
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > NC_000913/2370778‑2370962
|
CCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGT > SRR4302540.3380460/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGT > SRR4302540.869108/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTT > SRR4302540.6711031/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTC > SRR4302540.3413321/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCA > SRR4302540.5200004/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCA > SRR4302540.8122156/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGGTCA > SRR4302540.5674512/1‑94 (MQ=60)
TGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCAT < SRR4302540.3674259/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGGGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGAATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCAT > SRR4302540.1788212/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTA > SRR4302540.422640/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTA > SRR4302540.6942312/1‑94 (MQ=60)
TAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTAT > SRR4302540.1210771/1‑94 (MQ=60)
AAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATT > SRR4302540.5505688/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTG < SRR4302540.4268871/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTG > SRR4302540.1118415/1‑94 (MQ=60)
GTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGTCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGG < SRR4302540.3885561/94‑1 (MQ=60)
TCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGC < SRR4302540.9578641/94‑1 (MQ=60)
TCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGC < SRR4302540.470392/94‑1 (MQ=60)
CTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCG > SRR4302540.9161098/1‑94 (MQ=60)
CTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCG > SRR4302540.3771562/1‑94 (MQ=60)
CTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCG > SRR4302540.6510905/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGG > SRR4302540.1410130/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTTGTCTGGGGGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGGCACTGGTGTGGGGGGGTGCTCATTATTGGCGG > SRR4302540.1410131/1‑94 (MQ=60)
AATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCA > SRR4302540.3637402/1‑94 (MQ=60)
AATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGAA > SRR4302540.5663929/1‑94 (MQ=60)
AATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCA < SRR4302540.2932841/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAT < SRR4302540.4211831/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAT < SRR4302540.8240426/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAT < SRR4302540.6189493/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTCTGGGGGGCGCTGGCTTCAGGAAAGCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAT < SRR4302540.9971008/94‑1 (MQ=60)
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TTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGC < SRR4302540.3361244/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCG < SRR4302540.6296815/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCG > SRR4302540.9990492/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCG < SRR4302540.8162131/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGCAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCG < SRR4302540.8667485/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGGACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGA > SRR4302540.4940115/1‑94 (MQ=60)
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TCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGAT < SRR4302540.8913205/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGAT < SRR4302540.8980928/94‑1 (MQ=60)
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GCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGG < SRR4302540.5666742/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGG < SRR4302540.3444186/94‑1 (MQ=60)
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AGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAA > SRR4302540.4581390/1‑94 (MQ=60)
GTAAACCTGTGGCGCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAT < SRR4302540.8174487/94‑1 (MQ=60)
GTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAT < SRR4302540.6061947/94‑1 (MQ=60)
GTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATCGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAT > SRR4302540.9513820/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTCTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATG < SRR4302540.5967887/94‑1 (MQ=60)
CAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCGTTGCGATCCTCGGGAGGACGGTGTAATG > SRR4302540.1210998/1‑94 (MQ=60)
AAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGG < SRR4302540.8138628/94‑1 (MQ=60)
accggcgcCACGAACCGGGATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGC < SRR4302540.9184110/86‑1 (MQ=60)
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ACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCC < SRR4302540.8097225/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCT > SRR4302540.6726605/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCT > SRR4302540.1928285/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG > SRR4302540.9536555/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTG < SRR4302540.5449794/94‑1 (MQ=60)
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GGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATG < SRR4302540.2287729/94‑1 (MQ=60)
GGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATG < SRR4302540.7821383/94‑1 (MQ=60)
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CACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTG < SRR4302540.9216215/94‑1 (MQ=60)
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ACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGG > SRR4302540.9770120/1‑94 (MQ=60)
ACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGG < SRR4302540.5989451/94‑1 (MQ=60)
ACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGG > SRR4302540.6198243/1‑94 (MQ=60)
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GAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGGGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGCTGTGGGG > SRR4302540.3472510/1‑94 (MQ=60)
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CGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTA > SRR4302540.9842988/1‑94 (MQ=60)
GTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATT < SRR4302540.8379498/94‑1 (MQ=60)
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CACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTAT > SRR4302540.9426293/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT < SRR4302540.6843977/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATT < SRR4302540.3905283/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT > SRR4302540.5357895/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATT < SRR4302540.9368169/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCT < SRR4302540.430251/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCT < SRR4302540.7171078/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCT > SRR4302540.497081/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCT > SRR4302540.623624/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAG > SRR4302540.215193/1‑94 (MQ=60)
GGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTT < SRR4302540.8634424/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTT < SRR4302540.5221228/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTT < SRR4302540.8040856/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTG < SRR4302540.3548005/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTG < SRR4302540.5448265/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > SRR4302540.6136444/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGC < SRR4302540.8409238/94‑1 (MQ=60)
GGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGC < SRR4302540.6991681/94‑1 (MQ=60)
GTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCA > SRR4302540.5705582/1‑94 (MQ=60)
GTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCA > SRR4302540.5482785/1‑94 (MQ=60)
GTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCA > SRR4302540.6819673/1‑94 (MQ=60)
TGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > SRR4302540.4682545/1‑94 (MQ=60)
TGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > SRR4302540.4682544/1‑94 (MQ=60)
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CCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > NC_000913/2370778‑2370962
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
