Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,370,869 |
C→T |
A98V (GCG→GTG) |
b4533 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,370,869 | 0 | C | T | 100.0%
| 725.2
/ NA
| 209 | A98V (GCG→GTG) | b4533 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (86/123); total (86/123) |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > NC_000913/2370779‑2370958
|
gATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGtt > 2:5744711/1‑93 (MQ=255)
gATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGtt > 1:2896604/1‑93 (MQ=255)
aTGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTc < 2:4944332/93‑1 (MQ=255)
ttAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCatt > 1:4708716/1‑93 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat < 1:496978/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat < 1:5948399/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat < 2:6270880/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCaatat < 2:2162774/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCGGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattat < 2:1464882/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattatt < 2:2328834/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCattatt < 2:3363661/93‑1 (MQ=255)
gTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTg < 2:5764685/93‑1 (MQ=255)
tCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTgg > 2:4156186/1‑93 (MQ=255)
cTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggc < 2:2508776/93‑1 (MQ=255)
cTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggc < 1:724978/93‑1 (MQ=255)
tGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggcg < 2:2554088/93‑1 (MQ=255)
aaTTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTggcggc > 1:4075932/1‑93 (MQ=255)
ttttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCAt < 1:679213/93‑1 (MQ=255)
tttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCATTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGATGGTGTTCATTATTGGCGGCAtt < 2:5083955/93‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATtg < 2:4609156/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGAt < 2:3644828/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATc > 1:4556446/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 2:5953925/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc > 1:3870889/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 1:3799192/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATcc < 1:2946799/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGGATTGCGATCCt > 2:3077904/1‑93 (MQ=255)
tGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCg < 1:4026423/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCg < 1:1414478/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCggg > 1:4638026/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg > 2:3699946/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg > 2:1866184/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCggg > 1:547026/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGa < 1:1230214/93‑1 (MQ=255)
ctggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGt > 1:2156533/1‑93 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGCGTa > 2:1020487/1‑93 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTa > 2:1250438/1‑93 (MQ=255)
tggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTa < 1:783386/93‑1 (MQ=255)
ggctgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTAc < 1:2707447/93‑1 (MQ=255)
tgCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGgt < 1:1006685/93‑1 (MQ=255)
cAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGgtgt < 1:1746112/93‑1 (MQ=255)
aGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTa > 2:1404968/1‑93 (MQ=255)
tAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAAt < 1:4828941/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATg > 2:2952217/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATgg > 2:6115123/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATgg > 2:1950839/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATggg > 1:5359670/1‑93 (MQ=255)
aCTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGc > 2:1639276/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGcc < 1:5858802/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCt < 2:4969983/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCt < 1:5487363/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCt < 2:354111/93‑1 (MQ=255)
gtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTg > 1:3431533/1‑93 (MQ=255)
gtgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTg > 1:3001574/1‑93 (MQ=255)
tgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGa < 2:3755612/93‑1 (MQ=255)
tgGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGa < 2:789072/93‑1 (MQ=255)
ggCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGGGTACGGTGTAATGGGGCTGAt > 2:5633230/1‑93 (MQ=255)
ggCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAt < 2:1429555/93‑1 (MQ=255)
cACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:1073274/93‑2 (MQ=255)
cACGAACCGGTACCGCCGCGTCACTGATGTGGGGTGGTGTTCATTATGGGCGGTATTGCGATCCTCGGGATTACGTTGTAATGGGCCTGAtgc < 2:657942/93‑2 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgcg < 2:1774471/93‑3 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgcg < 2:182323/93‑3 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgcg > 1:5786390/1‑91 (MQ=255)
aCGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGAtgcg > 1:6250998/1‑91 (MQ=255)
cGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgg < 2:2107556/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:128664/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg < 1:3246065/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:2025684/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg < 1:1943405/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTACTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCgggg > 1:3377730/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTATCTCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 1:626518/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 2:4546026/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGa < 1:4347254/93‑1 (MQ=255)
ccGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGat < 1:4464890/93‑1 (MQ=255)
ccGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGCGat > 2:5808832/1‑93 (MQ=255)
cGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatt < 1:3127474/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGatta < 2:4478593/93‑1 (MQ=255)
tATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGattatt < 2:6021576/93‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTc < 1:4213934/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCa < 1:351160/93‑1 (MQ=255)
cgccgcGTCACTGGTGTGGGGTAGTGTTCATTATGGGCGGCACTGCGATCCTCGGGTGTGCGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAg < 2:5423523/93‑1 (MQ=255)
gccgcGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGc < 1:5597181/93‑1 (MQ=255)
gcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTATGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTc > 1:355411/1‑93 (MQ=255)
gcgTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTc > 2:5617501/1‑93 (MQ=255)
gTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCat > 2:5521763/1‑93 (MQ=255)
cACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCatta > 2:1696681/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat < 2:4022312/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattat > 1:365809/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTGGTGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattatt < 1:743884/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattatt < 1:6197161/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCattatt > 1:2066991/1‑93 (MQ=255)
gtgtGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGcc > 1:6162706/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCt > 2:2926524/1‑93 (MQ=255)
gtgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTc < 2:1009057/93‑1 (MQ=255)
tgGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCa > 2:1098205/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAg > 1:5292150/1‑93 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt > 1:3694453/1‑93 (MQ=255)
gggTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGt < 2:1994185/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGtt < 2:426727/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTgc > 1:632034/1‑93 (MQ=255)
|
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGC > NC_000913/2370779‑2370958
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACCCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > NC_000913/2370776‑2370962
|
ACCCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGG > SRR4302533.208619/1‑94 (MQ=60)
CCCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTG > SRR4302533.886677/1‑94 (MQ=60)
CCCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTG > SRR4302533.1794473/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTT > SRR4302533.2914414/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTC > SRR4302533.69568/1‑94 (MQ=60)
TGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCAT > SRR4302533.4807533/1‑94 (MQ=60)
GTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATT > SRR4302533.3248734/1‑94 (MQ=60)
GTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATT > SRR4302533.4737255/1‑94 (MQ=60)
AAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATT < SRR4302533.526119/94‑1 (MQ=60)
AAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATT < SRR4302533.5984377/94‑1 (MQ=60)
AAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATT < SRR4302533.4329420/94‑1 (MQ=60)
AAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATT < SRR4302533.499940/94‑1 (MQ=60)
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AGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTG < SRR4302533.334454/94‑1 (MQ=60)
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CTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCG > SRR4302533.4688776/1‑94 (MQ=60)
CTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCG < SRR4302533.729266/94‑1 (MQ=60)
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TGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGG < SRR4302533.636999/94‑1 (MQ=60)
GAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGC > SRR4302533.4100743/1‑94 (MQ=60)
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TGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCC > SRR4302533.3894516/1‑94 (MQ=60)
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TAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATG < SRR4302533.4858205/94‑1 (MQ=60)
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ACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGAT < SRR4302533.3794733/94‑1 (MQ=60)
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GGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGTGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTAT > SRR4302533.4080167/1‑94 (MQ=60)
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TGTTCATTATTGGCGGCATTGCGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGCGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > SRR4302533.2078504/1‑94 (MQ=60)
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ACCCGATGTTAAGTCTGAATTTTGTCTGGGTGACGCTGGCTGCAGTAAAACTGTGGCACGAACCGGTATCGCCGCGTCACTGGTGTGGGGTGGCGTTCATTATTGGCGGCATTGTGATCCTCGGGAGTACGGTGTAATGGGCCTGATGTGGGGATTATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAA > NC_000913/2370776‑2370962
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
