Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,464,010 |
T→C |
H230H (CAT→CAC) |
yfdC → |
putative transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,464,010 | 0 | T | C | 99.7%
| 972.5
/ ‑5.2
| 300 | H230H (CAT→CAC) | yfdC | putative transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (162/137); total (163/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.30e-01 |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCATATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTAC > NC_000913/2463920‑2464099
|
tgtGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCacat > 2:1354526/3‑93 (MQ=255)
tATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCacat > 1:1501162/1‑93 (MQ=255)
tATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCacat > 2:1721014/1‑93 (MQ=255)
tATGGTGTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGAGGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCacat < 2:2324592/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCg < 2:9688050/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCg < 1:204574/93‑1 (MQ=255)
ggTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGt > 2:3843564/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTg < 2:926929/93‑1 (MQ=255)
tttGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTgg < 1:9167727/93‑1 (MQ=255)
tttGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCGGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTgg < 2:1996544/93‑1 (MQ=255)
ttGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGt < 1:1696398/93‑1 (MQ=255)
tGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTc < 2:3285093/93‑1 (MQ=255)
ggATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCg > 2:6887270/1‑93 (MQ=255)
gATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCgg > 1:1136316/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGt < 2:6405258/93‑1 (MQ=255)
tGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGtt < 1:2080338/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTc < 2:8528880/92‑1 (MQ=255)
gTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTc < 1:1004041/93‑1 (MQ=255)
ttCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTg < 1:3730670/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGt > 2:7736527/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGt > 2:8764574/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGtt > 1:6578551/1‑93 (MQ=255)
cTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTg > 1:5672315/1‑93 (MQ=255)
cAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGaaa < 1:429150/93‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGaaa < 1:6874437/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAAt < 2:8236106/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTAGTCGGTTCTGTTGAAAt < 1:9857187/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATc > 2:216445/1‑93 (MQ=255)
gCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATc > 1:6314234/1‑93 (MQ=255)
gggTGCGGCCAAGATTGTTGTGATTATATTGGTGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCCCCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCct < 1:9484872/93‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCctc > 1:5141021/1‑93 (MQ=255)
gTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCctct < 1:963259/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCctct < 1:127775/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTa > 2:2853290/1‑93 (MQ=255)
cGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATc < 1:7854858/93‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATc < 1:8192470/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGATTTTTGTGATTATATTGGTTGCCTGGCTTTTTTGCCTGGGTTGCCCCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCt < 2:4792803/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCt < 1:252661/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCt < 2:5542599/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCt > 1:4860805/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTg > 1:579115/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTg > 2:1230159/1‑93 (MQ=255)
cAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTgg < 2:5812874/93‑1 (MQ=255)
aGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGgtgt < 1:4554120/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGttt < 2:5161276/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTa < 1:7656678/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTa > 2:5750893/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTa > 2:648714/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGGAATCCTCTATCTGGTGTTTaa > 2:7934558/1‑93 (MQ=255)
gtggtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAAc < 1:8790348/93‑1 (MQ=255)
tggtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACg > 2:7161985/1‑93 (MQ=255)
tggtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACg > 1:2721458/1‑93 (MQ=255)
ggtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACgg < 2:443175/93‑1 (MQ=255)
ggtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACgg < 1:3373628/93‑1 (MQ=255)
gtgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGt < 2:5458469/93‑1 (MQ=255)
tgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTa < 2:1256409/93‑1 (MQ=255)
tgATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTa > 1:8702975/1‑93 (MQ=255)
ttATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGc < 2:9628921/93‑1 (MQ=255)
tataTTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCt > 1:4030074/1‑93 (MQ=255)
atatTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTg > 1:3126340/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACTCCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGc > 1:8982360/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGc > 2:7146839/1‑93 (MQ=255)
atTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCa < 1:1923476/93‑1 (MQ=255)
atTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCa > 1:3584718/1‑93 (MQ=255)
gatgaCCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTg > 1:52728/1‑93 (MQ=255)
atgaCCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTgg < 1:7969667/93‑1 (MQ=255)
tgaCCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGa < 1:1546546/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTATTGCCCTGGGTGACTCCTCCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGa < 2:3480356/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGa < 1:2151356/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGa < 1:9345767/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAt > 1:6537386/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAt > 2:1192611/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAt > 1:8944518/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAt > 2:2639329/1‑93 (MQ=255)
ggCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAtt < 1:3091399/93‑1 (MQ=255)
gCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAttt < 2:7815590/93‑1 (MQ=255)
tATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCAt < 1:3674450/93‑1 (MQ=255)
tATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGACGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCAt > 1:2273550/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATc > 2:10031252/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTgg > 1:3278690/1‑93 (MQ=255)
cccTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGc < 2:1859688/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGccc < 1:4435925/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGACCCCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCt < 2:8174188/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGACACCCCCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCt < 1:7251774/93‑1 (MQ=255)
gggTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCGCTGGAGCGATTTCATCTGGCCCtt < 2:7315096/93‑1 (MQ=255)
gggTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCtt > 2:4253416/1‑93 (MQ=255)
gggTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCtt < 2:8574503/93‑1 (MQ=255)
gggTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCtt > 2:8935336/1‑93 (MQ=255)
tGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGc > 2:9359683/1‑93 (MQ=255)
acacCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAc > 1:8861981/1‑93 (MQ=255)
acacCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAc < 2:789663/93‑1 (MQ=255)
caccacCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAct < 2:9576181/93‑1 (MQ=255)
caccCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacc < 2:3944754/93‑1 (MQ=255)
caccCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacc < 2:9040469/93‑1 (MQ=255)
accCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacct > 1:8517145/1‑93 (MQ=255)
cccACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacctc > 2:7426359/1‑92 (MQ=255)
cccACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActaccta < 1:2899942/93‑1 (MQ=255)
cccACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActaccta > 1:5726003/1‑93 (MQ=255)
ccACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacctac > 1:6619229/1‑93 (MQ=255)
ccACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCActacctac > 1:6345375/1‑93 (MQ=255)
|
TATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCATATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTAC > NC_000913/2463920‑2464099
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCATATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTTT > NC_000913/2463917‑2464102
|
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACTACCCAC > SRR4302540.9747194/1‑94 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC < SRR4302540.6097183/94‑1 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC > SRR4302540.6389639/1‑94 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC < SRR4302540.6097182/94‑1 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC > SRR4302540.9747193/1‑94 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC > SRR4302540.6598367/1‑94 (MQ=60)
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCAC > SRR4302540.6598368/1‑94 (MQ=60)
ACTGTGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACA > SRR4302540.3227760/1‑94 (MQ=60)
ACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACA > SRR4302540.67446/1‑94 (MQ=60)
ACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACA > SRR4302540.9498381/1‑94 (MQ=60)
ACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACA > SRR4302540.3347704/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACAT < SRR4302540.5309078/94‑1 (MQ=60)
CTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACAT > SRR4302540.5794898/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACAT > SRR4302540.2689930/1‑94 (MQ=60)
CTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACAT > SRR4302540.1517701/1‑94 (MQ=60)
TATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATC > SRR4302540.1038569/1‑94 (MQ=60)
TATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATC < SRR4302540.4534534/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGT < SRR4302540.206583/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCGAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTG > SRR4302540.8456432/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGG > SRR4302540.5721336/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGATGTTGCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGG < SRR4302540.8811962/94‑1 (MQ=60)
TTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGT < SRR4302540.9277716/94‑1 (MQ=60)
TTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGT > SRR4302540.9434593/1‑94 (MQ=60)
TTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTC < SRR4302540.1714776/94‑1 (MQ=60)
TTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTC > SRR4302540.9246726/1‑94 (MQ=60)
GGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGG > SRR4302540.1148167/1‑94 (MQ=60)
GGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGG > SRR4302540.2525078/1‑94 (MQ=60)
GATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGT < SRR4302540.2022341/94‑1 (MQ=60)
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ATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTT > SRR4302540.8933815/1‑94 (MQ=60)
TGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTC < SRR4302540.2102689/94‑1 (MQ=60)
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TGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTC > SRR4302540.1628988/1‑94 (MQ=60)
GTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCT < SRR4302540.3337985/94‑1 (MQ=60)
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TCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTT < SRR4302540.2216181/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTT > SRR4302540.6651422/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTG > SRR4302540.5734774/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTG > SRR4302540.4463872/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGCGGGCGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGA > SRR4302540.5823858/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAA < SRR4302540.8986104/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAA < SRR4302540.4202513/94‑1 (MQ=60)
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CAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAAT < SRR4302540.433664/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATC < SRR4302540.1880831/94‑1 (MQ=60)
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AGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTAGTCGGTTCTGTTGAAATC < SRR4302540.9972375/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCC > SRR4302540.791200/1‑94 (MQ=60)
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GGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTC > SRR4302540.5196707/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACAGCACCCACATCGTCGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTA < SRR4302540.1824015/94‑1 (MQ=60)
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GTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTA < SRR4302540.129122/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTA < SRR4302540.973211/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTAT > SRR4302540.3191593/1‑94 (MQ=60)
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GCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGG > SRR4302540.3118104/1‑94 (MQ=60)
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AGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTT < SRR4302540.4603360/94‑1 (MQ=60)
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TTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAA < SRR4302540.7742885/94‑1 (MQ=60)
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TGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGG > SRR4302540.3555176/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGG > SRR4302540.6396768/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGG > SRR4302540.6396767/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGT < SRR4302540.3410497/94‑1 (MQ=60)
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ATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGC > SRR4302540.155896/1‑94 (MQ=60)
TTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCT > SRR4302540.8694969/1‑94 (MQ=60)
TTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCT > SRR4302540.4073528/1‑94 (MQ=60)
TTATATAGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGCGGTCGGTTCTGCTGAAATCCTCTATCTGGGGGTTAACGGTACGCT > SRR4302540.9064140/1‑94 (MQ=60)
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TATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTG < SRR4302540.372060/94‑1 (MQ=60)
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ATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCATctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaatataaaacaaaacgaaacaaca > SRR4302540.2246544/1‑42 (MQ=60)
ATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGC > SRR4302540.5740245/1‑94 (MQ=60)
ATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGC > SRR4302540.9189273/1‑94 (MQ=60)
ATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGC > SRR4302540.5739958/1‑94 (MQ=60)
TATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCA < SRR4302540.289684/94‑1 (MQ=60)
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TTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACT < SRR4302540.6658304/94‑1 (MQ=60)
TTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACT < SRR4302540.9612550/94‑1 (MQ=60)
TTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACT > SRR4302540.314574/1‑94 (MQ=60)
TTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACT > SRR4302540.8371911/1‑94 (MQ=60)
TGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTG > SRR4302540.386053/1‑94 (MQ=60)
TGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTG > SRR4302540.53255/1‑94 (MQ=60)
GATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGG < SRR4302540.1552314/94‑1 (MQ=60)
ATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGA < SRR4302540.8062535/94‑1 (MQ=60)
ATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGNGTTTAACGGTACGCTGCACTGGA > SRR4302540.4197232/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAG < SRR4302540.1563608/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAG > SRR4302540.8813811/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCG < SRR4302540.6006188/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCG > SRR4302540.3119658/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCG < SRR4302540.6574284/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGA > SRR4302540.6693349/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAT < SRR4302540.9457103/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAT > SRR4302540.9049678/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAT > SRR4302540.6642959/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAT > SRR4302540.6609938/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGAT < SRR4302540.2174489/94‑1 (MQ=60)
GGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTT < SRR4302540.3125310/94‑1 (MQ=60)
GCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTC < SRR4302540.9877827/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCAT > SRR4302540.9464442/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGACGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCAT > SRR4302540.2297956/1‑94 (MQ=60)
TATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATC > SRR4302540.480142/1‑94 (MQ=60)
TATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATC < SRR4302540.3714628/94‑1 (MQ=60)
TATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATC < SRR4302540.3714627/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCT > SRR4302540.9101686/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTG < SRR4302540.2890230/94‑1 (MQ=60)
TGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGG > SRR4302540.3314502/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGG > SRR4302540.8207620/1‑94 (MQ=60)
CCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCC > SRR4302540.1117598/1‑94 (MQ=60)
CCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCC > SRR4302540.678455/1‑94 (MQ=60)
CCCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCC < SRR4302540.867347/94‑1 (MQ=60)
CCTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCC > SRR4302540.4994259/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCT < SRR4302540.4483990/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCT > SRR4302540.4558734/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGACACCCCCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTT < SRR4302540.7332695/94‑1 (MQ=60)
GGGTGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTC > SRR4302540.8511844/1‑94 (MQ=60)
GGTGACACCACCCGCATCGTGGTCCGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCG < SRR4302540.2077673/94‑1 (MQ=60)
TGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCA < SRR4302540.8277296/94‑1 (MQ=60)
TGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCA > SRR4302540.4866005/1‑94 (MQ=60)
TGACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTACTCTGGCCCTTCGCC > SRR4302540.7113264/1‑94 (MQ=60)
GACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAC > SRR4302540.5241623/1‑94 (MQ=60)
GACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAC < SRR4302540.452534/94‑1 (MQ=60)
GACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAC > SRR4302540.8964528/1‑94 (MQ=60)
GACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAC < SRR4302540.7962218/94‑1 (MQ=60)
GACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCAC > SRR4302540.5078485/1‑94 (MQ=60)
ACACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACT < SRR4302540.443612/94‑1 (MQ=60)
CACCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTA < SRR4302540.3595500/94‑1 (MQ=60)
CCACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACC > SRR4302540.2179345/1‑94 (MQ=60)
CACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCT > SRR4302540.1395735/1‑94 (MQ=60)
CACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCT > SRR4302540.8616122/1‑94 (MQ=60)
CACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCT > SRR4302540.3778432/1‑94 (MQ=60)
CACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCT > SRR4302540.692122/1‑94 (MQ=60)
CACCCACATCGTGGGCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCT > SRR4302540.1395736/1‑94 (MQ=60)
ACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTA > SRR4302540.2675315/1‑94 (MQ=60)
ACCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTA > SRR4302540.5789051/1‑94 (MQ=60)
CCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGTAGCGATTTNANCTGGCCCTTCGCACTACCTAC > SRR4302540.2168467/1‑94 (MQ=60)
CCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTAC < SRR4302540.2931581/94‑1 (MQ=60)
CCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTAC > SRR4302540.6692523/1‑94 (MQ=60)
CCCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTAC > SRR4302540.6416032/1‑94 (MQ=60)
CCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACT < SRR4302540.3746322/94‑1 (MQ=60)
CCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACT > SRR4302540.2245911/1‑94 (MQ=60)
CCACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACT < SRR4302540.10064009/94‑1 (MQ=60)
CACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTT < SRR4302540.870363/94‑1 (MQ=60)
CACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTT > SRR4302540.6843600/1‑94 (MQ=60)
ACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTTT > SRR4302540.5108882/1‑94 (MQ=60)
ACATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTTT > SRR4302540.2779105/1‑94 (MQ=60)
|
CACTATGGTTTGGATGTTTCCTGCAGCGGGTGCGGCAAAGATTGTGGTGATTATATTGATGACCTGGCTTATTGCCCTGGGTGACACCACCCATATCGTGGTCGGTTCTGTTGAAATCCTCTATCTGGTGTTTAACGGTACGCTGCACTGGAGCGATTTCATCTGGCCCTTCGCACTACCTACTTT > NC_000913/2463917‑2464102
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
