Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,556,088 |
G→A |
R204R (CGC→CGT) |
b2441 ← |
ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,556,088 | 0 | G | A | 99.6%
| 836.0
/ NA
| 235 | R204R (CGC→CGT) | b2441 | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (131/102); total (131/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555999‑2556177
|
ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:4711649/1‑93 (MQ=255)
ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:9279976/1‑93 (MQ=255)
tCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACATCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCtt > 1:5026083/1‑93 (MQ=255)
cGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTa < 1:242094/93‑1 (MQ=255)
cGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTa > 1:3889070/1‑93 (MQ=255)
gATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTaa < 2:1798130/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGTTGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGGTGAATTCGTCGATCACGCCATAGATGGTATCTAATACACGGCATAAg > 2:8980022/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGt > 1:4184374/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGGTGACGTGCGGCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGtt < 2:5251869/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAGGtt < 2:2955544/93‑1 (MQ=255)
gtggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTcc > 1:4708283/1‑93 (MQ=255)
tggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGATGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTcaa > 2:4419625/1‑91 (MQ=255)
tgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgt > 1:10033629/1‑93 (MQ=255)
tgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgt < 2:9584308/93‑1 (MQ=255)
gACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtc > 1:6101471/1‑93 (MQ=255)
aCGTGCGCCAGTGCACAGCCCTGAGTTGGGATGTTTAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACGCACGGCTTAAGTTTTCCAcgtcg < 1:3213435/93‑1 (MQ=255)
aCGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtcg > 2:8791753/1‑93 (MQ=255)
tGCACCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtca < 1:5385848/93‑1 (MQ=255)
ccAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGACTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACTTCgtcagtca > 1:3267760/1‑93 (MQ=255)
cAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAc > 2:3205052/1‑93 (MQ=255)
aGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAcc > 2:3174209/1‑93 (MQ=255)
aGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAcc < 1:5275817/93‑1 (MQ=255)
gTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCg < 1:9434194/93‑1 (MQ=255)
gTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCg > 1:7153164/1‑93 (MQ=255)
aGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTaa > 1:6796060/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAAc < 2:9427582/93‑1 (MQ=255)
cccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACg > 1:8738637/1‑93 (MQ=255)
ccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGc < 2:1301707/93‑1 (MQ=255)
cTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGcc > 1:4531495/1‑93 (MQ=255)
cTGAGTAGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGcc < 1:8982643/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCg > 2:5788507/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTGGGATGTTGAATTTGACGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCg > 1:1633157/1‑93 (MQ=255)
gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa < 2:6503231/93‑1 (MQ=255)
gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa > 2:279952/1‑93 (MQ=255)
gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa < 2:8907832/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt < 2:5435187/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt > 1:3045545/1‑93 (MQ=255)
tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 1:6039769/1‑93 (MQ=255)
tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 2:7626041/1‑93 (MQ=255)
tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 1:9833708/1‑93 (MQ=255)
gggATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAcc > 2:1502393/1‑93 (MQ=255)
gggATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAcc > 2:9693688/1‑93 (MQ=255)
gATGTTGAATTTGTCGATCACGCGATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGc < 2:5507905/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCa < 1:7633038/93‑1 (MQ=255)
tGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAt < 2:4592251/93‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:9065040/1‑93 (MQ=255)
gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc < 1:8798777/93‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:3813782/1‑93 (MQ=255)
gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:4229190/1‑93 (MQ=255)
ttGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCg > 2:617396/1‑93 (MQ=255)
aTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCa < 1:4326157/93‑1 (MQ=255)
tttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAc > 2:4102830/1‑93 (MQ=255)
tttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAc < 2:2471540/93‑1 (MQ=255)
ttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAcc < 2:5964016/93‑1 (MQ=255)
tGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAccc > 1:5491430/1‑93 (MQ=255)
tCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCg > 1:7582137/1‑93 (MQ=255)
cGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGa > 2:5566350/1‑93 (MQ=255)
gATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa < 1:2813040/93‑1 (MQ=255)
gATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa > 2:6846063/1‑93 (MQ=255)
caTCACGCCATAGATTGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa < 2:2240809/92‑1 (MQ=255)
aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 2:7355877/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 2:8319212/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 1:106535/1‑93 (MQ=255)
aTCAAGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTGCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg < 2:8429217/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 2:6534245/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 1:5564721/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 1:5225307/93‑1 (MQ=255)
ccATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGc > 1:9212315/1‑93 (MQ=255)
aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 1:7006104/93‑1 (MQ=255)
aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc > 2:706500/1‑93 (MQ=255)
aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 1:4838326/93‑1 (MQ=255)
aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 2:5843262/93‑1 (MQ=255)
aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt < 1:5867107/93‑1 (MQ=255)
aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt < 1:117118/93‑1 (MQ=255)
aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt > 2:918413/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt > 1:3563507/1‑93 (MQ=255)
gATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTc > 2:3853033/1‑93 (MQ=255)
gATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTc < 2:6026559/93‑1 (MQ=255)
tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt > 1:3468352/1‑93 (MQ=255)
tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt < 1:9642571/93‑1 (MQ=255)
tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt < 2:324093/93‑1 (MQ=255)
tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt > 1:7049821/1‑93 (MQ=255)
ggTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTa < 1:8301813/93‑1 (MQ=255)
ggTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTa > 2:2023004/1‑93 (MQ=255)
ggTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTa > 2:804232/1‑93 (MQ=255)
ggTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTa < 2:2321203/93‑1 (MQ=255)
tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa > 2:1180580/1‑93 (MQ=255)
tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa < 2:8549196/93‑1 (MQ=255)
tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa > 1:3333919/1‑93 (MQ=255)
tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 1:2113817/1‑93 (MQ=255)
tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt < 1:8856308/93‑1 (MQ=255)
tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 2:571419/1‑93 (MQ=255)
tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 1:3189919/1‑93 (MQ=255)
ccAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAttt > 2:1526989/1‑93 (MQ=255)
ccAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAttt > 2:7883708/1‑93 (MQ=255)
cAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTg > 2:2946766/1‑93 (MQ=255)
aaCACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgc > 2:7268604/1‑93 (MQ=255)
acacacGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcg > 1:8017896/1‑93 (MQ=255)
acacacGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcg > 2:4398254/1‑93 (MQ=255)
cacaCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcgc < 1:6602278/93‑1 (MQ=255)
|
GCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555999‑2556177
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCGCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGCGGC > NC_000913/2555996‑2556180
|
ATCGCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTCAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACAC < SRR4302540.4753526/94‑1 (MQ=60)
TTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACATCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTT > SRR4302540.5080484/1‑94 (MQ=60)
TTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTT < SRR4302540.3815294/94‑1 (MQ=60)
TCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTA > SRR4302540.3931298/1‑94 (MQ=60)
TCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTA > SRR4302540.3931299/1‑94 (MQ=60)
CGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAA < SRR4302540.244434/94‑1 (MQ=60)
GATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAG < SRR4302540.4682013/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGT > SRR4302540.6751323/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGT < SRR4302540.9113645/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGT > SRR4302540.4229844/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTT > SRR4302540.1123818/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTT < SRR4302540.5385963/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTT > SRR4302540.9427033/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCC > SRR4302540.4758602/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCA < SRR4302540.6738482/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCA < SRR4302540.9276429/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCAC < SRR4302540.3439808/94‑1 (MQ=60)
GTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGT > SRR4302540.10150334/1‑94 (MQ=60)
TGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTC < SRR4302540.8456187/94‑1 (MQ=60)
TGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTC > SRR4302540.6169405/1‑94 (MQ=60)
GACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCG < SRR4302540.201435/94‑1 (MQ=60)
GACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCG > SRR4302540.8578043/1‑94 (MQ=60)
ACGTGCGCCAGTGCACAGCCCTGAGTTGGGATGTTTAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CGCACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGT < SRR4302540.3248321/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCA > SRR4302540.9677064/1‑94 (MQ=60)
TGCACCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAG < SRR4302540.5445086/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGACTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACTTCGTCAGTCA > SRR4302540.3303423/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCA < SRR4302540.4311135/94‑1 (MQ=60)
CCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAC < SRR4302540.5808555/94‑1 (MQ=60)
CAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACC < SRR4302540.8928902/94‑1 (MQ=60)
AGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCG > SRR4302540.7232883/1‑94 (MQ=60)
AGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCG < SRR4302540.5333420/94‑1 (MQ=60)
AGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACAG > SRR4302540.796710/1‑94 (MQ=60)
GTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGG < SRR4302540.9546243/94‑1 (MQ=60)
TACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCTTAGATGGAATCAAAACCACGC‑‑CTTAAGTTTTCCACGCCGTCAGTCACCGGT > SRR4302540.3298643/1‑94 (MQ=60)
TACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGG < SRR4302540.9591299/94‑1 (MQ=60)
ACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGT > SRR4302540.51197/1‑94 (MQ=60)
CACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTT < SRR4302540.7688958/94‑1 (MQ=60)
CACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTT < SRR4302540.6959444/94‑1 (MQ=60)
ACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCGATAGATTGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTA < SRR4302540.6115081/94‑1 (MQ=60)
ACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTA < SRR4302540.6115080/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAA > SRR4302540.6871227/1‑94 (MQ=60)
AGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAAC < SRR4302540.353681/94‑1 (MQ=60)
GCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACG > SRR4302540.8840086/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCC > SRR4302540.3345503/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCC > SRR4302540.4580543/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCC < SRR4302540.7377402/94‑1 (MQ=60)
CTGAGTTGGGATGTTGAATTTGACGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCG > SRR4302540.1651025/1‑94 (MQ=60)
CTGAGTAGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCG < SRR4302540.9089792/94‑1 (MQ=60)
GAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAT > SRR4302540.3078960/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATC > SRR4302540.8845600/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATC < SRR4302540.8946861/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCA < SRR4302540.55885/94‑1 (MQ=60)
TTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAC > SRR4302540.6106834/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAC > SRR4302540.9948709/1‑94 (MQ=60)
GGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGC > SRR4302540.8388864/1‑94 (MQ=60)
GTGTTGAATTTGTCGGTCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACTCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCCCCGCGT < SRR4302540.9067583/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAT < SRR4302540.7718907/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAT > SRR4302540.5014085/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAT > SRR4302540.271920/1‑94 (MQ=60)
TGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATC > SRR4302540.778487/1‑94 (MQ=60)
GTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCG < SRR4302540.2406335/94‑1 (MQ=60)
GTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCG > SRR4302540.4660081/1‑94 (MQ=60)
GTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCG < SRR4302540.8900509/94‑1 (MQ=60)
AATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCA < SRR4302540.3426367/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAC > SRR4302540.1106212/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAC < SRR4302540.4373258/94‑1 (MQ=60)
TTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCC > SRR4302540.5551886/1‑94 (MQ=60)
TTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCC > SRR4302540.7227240/1‑94 (MQ=60)
TGTCGATCCCGCCATAGATGGTATCCAG‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCC < SRR4302540.5504253/94‑1 (MQ=60)
TGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCC < SRR4302540.5504252/94‑1 (MQ=60)
GTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCG > SRR4302540.1829342/1‑94 (MQ=60)
GTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCG > SRR4302540.7667255/1‑94 (MQ=60)
TCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGA > SRR4302540.2530539/1‑94 (MQ=60)
GATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAG < SRR4302540.2843416/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAG > SRR4302540.107678/1‑94 (MQ=60)
ATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGG > SRR4302540.5318293/1‑94 (MQ=60)
CACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAA > SRR4302540.9760766/1‑94 (MQ=60)
ACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAA < SRR4302540.5282283/94‑1 (MQ=60)
ACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAA < SRR4302540.5625996/94‑1 (MQ=60)
GCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGC > SRR4302540.7516273/1‑94 (MQ=60)
GCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGC > SRR4302540.9322849/1‑94 (MQ=60)
ATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCT < SRR4302540.4890150/94‑1 (MQ=60)
ATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCT < SRR4302540.7083858/94‑1 (MQ=60)
ATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCT < SRR4302540.7083859/94‑1 (MQ=60)
ATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCT > SRR4302540.2955345/1‑94 (MQ=60)
ATAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCT < SRR4302540.4499357/94‑1 (MQ=60)
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TAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTT > SRR4302540.3602432/1‑94 (MQ=60)
TAGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTT < SRR4302540.3296188/94‑1 (MQ=60)
AGATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTC < SRR4302540.5772518/94‑1 (MQ=60)
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ATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGT > SRR4302540.3506113/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGT > SRR4302540.7128221/1‑94 (MQ=60)
TGGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTA < SRR4302540.9756150/94‑1 (MQ=60)
GGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAG < SRR4302540.8398202/94‑1 (MQ=60)
GGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAG > SRR4302540.49305/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAG > SRR4302540.6465710/1‑94 (MQ=60)
GTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGA < SRR4302540.3698667/94‑1 (MQ=60)
GTATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGA > SRR4302540.3370531/1‑94 (MQ=60)
TATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAT > SRR4302540.7094022/1‑94 (MQ=60)
ATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATT > SRR4302540.3224572/1‑94 (MQ=60)
ATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATT > SRR4302540.2136503/1‑94 (MQ=60)
ATCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATT > SRR4302540.3224573/1‑94 (MQ=60)
TCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTT > SRR4302540.10163058/1‑94 (MQ=60)
TCCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTT < SRR4302540.8958780/94‑1 (MQ=60)
CCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTG > SRR4302540.1201420/1‑94 (MQ=60)
CCAA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTG < SRR4302540.5987747/94‑1 (MQ=60)
AA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACTGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCG > SRR4302540.3160973/1‑94 (MQ=60)
AA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCG < SRR4302540.3181087/94‑1 (MQ=60)
AA‑‑CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCG > SRR4302540.8111148/1‑94 (MQ=60)
CACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGCG < SRR4302540.6675389/94‑1 (MQ=60)
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CACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGCGGC > SRR4302540.9018514/1‑94 (MQ=60)
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ATCGCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAA‑‑CACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGCGGC > NC_000913/2555996‑2556180
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
