Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,941,864 |
T→C |
M169T (ATG→ACG) |
b2810 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,941,864 | 0 | T | C | 99.7%
| 913.5
/ ‑5.2
| 282 | M169T (ATG→ACG) | b2810 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (128/153); total (128/154) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
AATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGG > NC_000913/2941774‑2941956
|
aaTTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGt > 1:3819577/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGa < 2:3171921/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGaa < 1:1957874/93‑1 (MQ=255)
gcGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAAc < 1:2423491/92‑1 (MQ=255)
ccGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAAc < 2:568266/93‑1 (MQ=255)
cGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACg < 1:7062303/93‑1 (MQ=255)
cGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACg > 1:1912595/1‑93 (MQ=255)
gCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGt < 2:3591097/93‑1 (MQ=255)
gCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGt > 2:10041958/1‑93 (MQ=255)
cTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGtt > 2:8891209/1‑93 (MQ=255)
ttAATGCTCAGCGACTGCCGGATTTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTa < 2:8488164/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTa < 2:1103832/93‑1 (MQ=255)
tAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTAc > 1:207862/1‑93 (MQ=255)
tAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTAc < 1:9921211/93‑1 (MQ=255)
tAATGCGAAGCGACTGCCGGATGTCGAATTGTTGCCAGAGCTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTAc < 2:5842832/93‑1 (MQ=255)
aaTGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACt < 1:6539045/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTg < 1:5895552/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTg < 1:1256085/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGCAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTg < 1:1776038/93‑1 (MQ=255)
tGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTgg > 1:8248249/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGc < 1:302143/93‑1 (MQ=255)
gcAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCgg < 2:4815405/93‑1 (MQ=255)
gcAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCgg > 2:8734315/1‑93 (MQ=255)
cAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGt < 2:1895937/93‑1 (MQ=255)
cAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGt < 2:9366285/93‑1 (MQ=255)
cAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGt < 2:1254415/93‑1 (MQ=255)
gCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTg > 2:7190594/1‑93 (MQ=255)
gCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTg > 2:6635011/1‑93 (MQ=255)
cGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGc > 1:8349991/1‑93 (MQ=255)
cGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGc > 2:5510818/1‑93 (MQ=255)
gcTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTACCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGccc < 1:5597179/92‑1 (MQ=255)
cTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTGCCCg > 2:3764498/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCgg > 2:3628446/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCgg > 2:5767837/1‑93 (MQ=255)
tccGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGa < 2:4066218/92‑1 (MQ=255)
gCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGa < 1:1511133/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGAt < 1:7975801/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGAt > 1:4419207/1‑93 (MQ=255)
cGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATc < 2:2685973/93‑1 (MQ=255)
ggATGTCGATTTGTTGCTAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCt > 1:626398/1‑93 (MQ=255)
ggATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCt > 1:9266761/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTgg > 1:963169/1‑93 (MQ=255)
gTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTggag > 2:9835980/1‑91 (MQ=255)
tCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGgcgc < 2:9019122/93‑1 (MQ=255)
tgATTTGTTGCCAGAACTGATTTCTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGcgcg < 1:3106506/92‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCCAGTACTGATTACTCCTCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGCTGCCCGGTTCTGGcgcggg > 2:8947036/1‑91 (MQ=255)
aTTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGagcggg > 2:3922453/1‑91 (MQ=255)
aTTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgag < 1:4550428/93‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCCGATCTGGCgcgag > 2:3130611/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgagc < 2:3354246/93‑1 (MQ=255)
tttGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgagc < 1:3611134/93‑1 (MQ=255)
tttGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTCACTGGCGGGTGCCCGGATCTGGCgcgagc > 1:865601/1‑93 (MQ=255)
tgttgCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgagcga < 1:3262852/93‑1 (MQ=255)
tgttgCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgagcga < 2:2403787/93‑1 (MQ=255)
tgttgCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCgcgagcga > 1:1131875/1‑93 (MQ=255)
gttgCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAt > 2:8374127/1‑93 (MQ=255)
tgCCAGGACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGGTTa > 2:9761854/1‑93 (MQ=255)
gCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTGCCCGGCATTGGCGGGGGGGATTAc > 2:9621475/1‑93 (MQ=255)
ccAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTAcc < 2:7704757/93‑1 (MQ=255)
cAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCt < 1:2770301/93‑1 (MQ=255)
aGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCtt < 2:7865622/93‑1 (MQ=255)
cTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCt > 2:5285017/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTc < 1:3601268/93‑1 (MQ=255)
tGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTGGCCCGGTCTTGCGCGGGCGGTTACCTTTGCTc > 2:5089762/1‑93 (MQ=255)
gATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTct > 2:2878412/1‑92 (MQ=255)
gATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTct > 2:10011567/1‑92 (MQ=255)
gATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCCTTGCTCa > 1:3368460/1‑93 (MQ=255)
gATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAATACCTTTGCTct > 1:8768709/1‑92 (MQ=255)
ttACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCAtt < 1:5109867/93‑1 (MQ=255)
tACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTc > 1:4739868/1‑93 (MQ=255)
tACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTc < 1:8482970/93‑1 (MQ=255)
tACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATATGGCGCGAGAGCATACCTTTTCTCAttt > 2:467409/1‑92 (MQ=255)
aCTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCa < 2:9541901/93‑1 (MQ=255)
cTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAg < 1:6775839/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGc < 1:7470088/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTGCCCGGTTCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGc > 1:8990711/1‑93 (MQ=255)
ccccGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGcc > 1:1633815/1‑93 (MQ=255)
ccccGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGcc < 2:8608019/93‑1 (MQ=255)
cGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCggg < 2:6130469/93‑1 (MQ=255)
gTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCgggg > 1:7657248/1‑92 (MQ=255)
tAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGAt < 2:6931490/93‑1 (MQ=255)
tAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGAt < 2:4342079/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGAtg < 2:6525077/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGAtg < 2:630510/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGgtggtggtg > 1:3906611/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtga < 2:1444898/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatg < 1:2594955/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatg > 1:686041/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGggatg > 2:1127504/1‑93 (MQ=255)
tGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCTATTTCCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatgg < 2:6794522/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggt > 2:8251631/1‑93 (MQ=255)
gTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCTGATCTGGCGCGAGCTATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttga < 2:5972414/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttga < 1:5359593/93‑1 (MQ=255)
ttGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttgat < 2:9129219/93‑1 (MQ=255)
ttGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttgag > 1:7740385/1‑92 (MQ=255)
ttGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGGGGtgatggttgat > 1:467955/1‑93 (MQ=255)
gggTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGgtgatgggtgatgg > 2:9060249/1‑93 (MQ=255)
gggTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttgatgg < 2:6481233/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGtgatggttgatggt < 1:1582874/93‑1 (MQ=255)
tCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGc > 2:9160149/1‑93 (MQ=255)
|
AATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGG > NC_000913/2941774‑2941956
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG > NC_000913/2941771‑2941957
|
TGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGAC > SRR4302540.7950532/1‑94 (MQ=60)
TGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGAC < SRR4302540.7350456/94‑1 (MQ=60)
GAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACG > SRR4302540.7511401/1‑94 (MQ=60)
AAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGT > SRR4302540.3861156/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAA > SRR4302540.4240602/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAAC < SRR4302540.1979161/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACG < SRR4302540.2449602/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACG > SRR4302540.1933486/1‑94 (MQ=60)
CGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGT < SRR4302540.7140853/94‑1 (MQ=60)
CGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGT > SRR4302540.3788825/1‑94 (MQ=60)
CGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGT > SRR4302540.8997199/1‑94 (MQ=60)
CGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGT < SRR4302540.5554399/94‑1 (MQ=60)
CGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGT < SRR4302540.3644572/94‑1 (MQ=60)
GCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTT > SRR4302540.8016316/1‑94 (MQ=60)
GCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTT < SRR4302540.1538161/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGCTCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTA < SRR4302540.3207772/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGCTTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGCTA > SRR4302540.2457375/1‑94 (MQ=60)
CTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTA < SRR4302540.1408869/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTAC > SRR4302540.209900/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTAC < SRR4302540.7663055/94‑1 (MQ=60)
TAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACT < SRR4302540.10037065/94‑1 (MQ=60)
AATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTG < SRR4302540.6611609/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCCGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGGAAGACGTCGAACGTTACTGG > SRR4302540.3112313/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG > SRR4302540.8845735/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG > SRR4302540.47172/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG > SRR4302540.3112312/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG < SRR4302540.1268957/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG > SRR4302540.8344124/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG < SRR4302540.5960661/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGCAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGG < SRR4302540.1795320/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCG < SRR4302540.305143/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCG < SRR4302540.9620972/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGT‑GAACGTTACTGGGGG > SRR4302540.6271657/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGG > SRR4302540.8996323/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGG < SRR4302540.3333805/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGT > SRR4302540.1703028/1‑94 (MQ=60)
AGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCATAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTG > SRR4302540.4986822/1‑94 (MQ=60)
AGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTG < SRR4302540.153345/94‑1 (MQ=60)
AGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTG > SRR4302540.3014999/1‑94 (MQ=60)
GCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGC > SRR4302540.8446903/1‑94 (MQ=60)
CGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCC < SRR4302540.9791639/94‑1 (MQ=60)
GACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTgggcc > SRR4302540.9405158/1‑89 (MQ=60)
GACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCC < SRR4302540.3876140/94‑1 (MQ=60)
GACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCC < SRR4302540.3194982/94‑1 (MQ=60)
GACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGAGTTAGGTCAGACAACGAACGTTACTGGCGGTTGCCC > SRR4302540.3535836/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTACCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCG < SRR4302540.5658758/94‑1 (MQ=60)
CGGCCGGATGTTGATGTGTTGCCAGATCTGGTTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGTTCGTTACTGGCGGTTGCCCGG < SRR4302540.1906778/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGAT < SRR4302540.1527831/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGAT > SRR4302540.4467087/1‑94 (MQ=60)
CCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATC < SRR4302540.8068718/94‑1 (MQ=60)
CGGATGTCGATTTGTTGCTAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCT > SRR4302540.633065/1‑94 (MQ=60)
CGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCT > SRR4302540.9377593/1‑94 (MQ=60)
CGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCT < SRR4302540.6879355/94‑1 (MQ=60)
CGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCT < SRR4302540.8364139/94‑1 (MQ=60)
GATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGG > SRR4302540.973120/1‑94 (MQ=60)
GATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGG < SRR4302540.2419098/94‑1 (MQ=60)
GATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCACCGTAGTTGGATTATGGCGATGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGCTCTGG > SRR4302540.6972807/1‑94 (MQ=60)
GTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGC < SRR4302540.4614108/94‑1 (MQ=60)
GTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTGCCCCGGTTCTGGCGC > SRR4302540.2759256/1‑94 (MQ=60)
TGATTTGTTGCCAGAACTGATTTCTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGA < SRR4302540.3140509/94‑1 (MQ=60)
CGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGG > SRR4302540.3381078/1‑94 (MQ=60)
GATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAG > SRR4302540.6477971/1‑94 (MQ=60)
GATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAG < SRR4302540.7182449/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCcgttttccggctcgcgcgccagc > SRR4302540.874790/1‑71 (MQ=60)
ATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGC < SRR4302540.4599643/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTCACTGGCGGGTGCCCGGATCTGGCGCGAGC > SRR4302540.874791/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTGCCAGAACTGATTCCTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCG < SRR4302540.2033727/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCG < SRR4302540.3650607/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGA > SRR4302540.1143657/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAT < SRR4302540.6904283/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAT < SRR4302540.3298454/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAT < SRR4302540.188717/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATT < SRR4302540.4945694/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATT < SRR4302540.6549111/94‑1 (MQ=60)
CCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGCTTACCT > SRR4302540.160004/1‑94 (MQ=60)
CCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCT < SRR4302540.3942571/94‑1 (MQ=60)
CAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTT < SRR4302540.2800237/94‑1 (MQ=60)
GAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTG < SRR4302540.8363257/94‑1 (MQ=60)
AACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGC > SRR4302540.274443/1‑94 (MQ=60)
CTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTC > SRR4302540.8309383/1‑94 (MQ=60)
TGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCT > SRR4302540.2353893/1‑94 (MQ=60)
TGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCA < SRR4302540.3640620/94‑1 (MQ=60)
TGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCCTTGCTCA > SRR4302540.3405299/1‑94 (MQ=60)
TGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGAATACCTTTGCTCT > SRR4302540.8870340/1‑94 (MQ=60)
GATTTCTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCAT < SRR4302540.846026/94‑1 (MQ=60)
GATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGGGCGATTACCTTTGCTCAT > SRR4302540.4075016/1‑94 (MQ=60)
ATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATT < SRR4302540.5941342/94‑1 (MQ=60)
TTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTC > SRR4302540.4790452/1‑94 (MQ=60)
TTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTC < SRR4302540.5165172/94‑1 (MQ=60)
TACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCA < SRR4302540.8581512/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCCGC > SRR4302540.10067667/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGC < SRR4302540.6850730/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGGTGCCCGGTTCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGC > SRR4302540.9098378/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACATCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGC < SRR4302540.7709457/94‑1 (MQ=60)
CGCCCCGGAGTCGGGTTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGC < SRR4302540.5755270/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGGTCTGGCGCGGGCGCGTACCTTTGCTCcatccgcc > SRR4302540.2033695/1‑86 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGGGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCC > SRR4302540.9195986/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGGGGGCGATTATCTTTGCTCATTCAGGC > SRR4302540.2033694/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCC < SRR4302540.7553429/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCC < SRR4302540.5567867/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCC > SRR4302540.1651691/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCC > SRR4302540.9295886/1‑94 (MQ=60)
CCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGCGCGGTTTCCTTTGCTTCTTCAGCCCG > SRR4302540.1959710/1‑94 (MQ=60)
CCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGG > SRR4302540.6097326/1‑94 (MQ=60)
CGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGG > SRR4302540.7743462/1‑94 (MQ=60)
CTAGTCGTATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGAT < SRR4302540.7804915/94‑1 (MQ=60)
tgctgactcttGCGTTGGGGCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATGACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGT < SRR4302540.1711567/83‑1 (MQ=60)
GTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGT < SRR4302540.1711566/94‑1 (MQ=60)
CGGATTCTGGCGTTGGGGCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGG < SRR4302540.3690085/94‑1 (MQ=60)
GGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGggcggttagcttnnnnccttctgccgngntgggngn > SRR4302540.3591857/1‑58 (MQ=60)
GGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGT < SRR4302540.291086/94‑1 (MQ=60)
GGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGT < SRR4302540.1626659/94‑1 (MQ=60)
GGATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGG > SRR4302540.7870318/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGGTGGTGGTG > SRR4302540.3948965/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTG < SRR4302540.8584236/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTG < SRR4302540.3546349/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTG > SRR4302540.3648185/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTG > SRR4302540.4598346/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGAT < SRR4302540.1978253/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATG < SRR4302540.6976559/94‑1 (MQ=60)
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TCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATG > SRR4302540.693402/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATG < SRR4302540.5284496/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGG < SRR4302540.2622938/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGT > SRR4302540.1188018/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGA < SRR4302540.9754704/94‑1 (MQ=60)
CGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGCTCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTTATTCAGCCGGGGTGGGGGTGATGGGTGA > SRR4302540.3941203/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACGTTTGCTCATTCAGCCGGGGTGGGGGGGATGGTTGA > SRR4302540.7332490/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGA > SRR4302540.4735696/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTAACTTTGCTCATTCAGCCGGGGTGGTGGgggtgggtga > SRR4302540.85393/1‑84 (MQ=60)
GTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGAT < SRR4302540.5418458/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGAT < SRR4302540.1481299/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGAG > SRR4302540.7830753/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGGGGTGATGGTTGAT > SRR4302540.472961/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGGGGTGATGGTTGAG > SRR4302540.8009748/1‑94 (MQ=60)
TTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATG < SRR4302540.6614861/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATG < SRR4302540.7812447/94‑1 (MQ=60)
GGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATTGTGGTGATGGTTGATGGT < SRR4302540.10078224/94‑1 (MQ=60)
GGGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGG > SRR4302540.8257656/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGGTCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGGGGTGGTTGATGGTG > SRR4302540.1885554/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTG > SRR4302540.9506003/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTG < SRR4302540.1600165/94‑1 (MQ=60)
TCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCT > SRR4302540.4777962/1‑94 (MQ=60)
GCAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCT < SRR4302540.2527949/94‑1 (MQ=60)
CAGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTC > SRR4302540.6723221/1‑94 (MQ=60)
AGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCA > SRR4302540.6717152/1‑94 (MQ=60)
AGACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCA > SRR4302540.2057711/1‑94 (MQ=60)
GACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAG > SRR4302540.3043336/1‑94 (MQ=60)
GACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAG < SRR4302540.4245640/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGG < SRR4302540.8029883/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGG < SRR4302540.4597483/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCCAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGGGATGGGTGATGGTGCTCAGG > SRR4302540.9162019/1‑94 (MQ=60)
CGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGCTGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG > SRR4302540.6767607/1‑94 (MQ=60)
CGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG < SRR4302540.1428643/94‑1 (MQ=60)
CGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG > SRR4302540.8457705/1‑94 (MQ=60)
CGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG < SRR4302540.2269304/94‑1 (MQ=60)
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TGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGG > NC_000913/2941771‑2941957
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
