Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,989,898 |
A→G |
Q378R (CAG→CGG) |
cyaA → |
adenylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,989,898 | 0 | A | G | 99.8%
| 1450.8
/ NA
| 449 | Q378R (CAG→CGG) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (197/251); total (197/252) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 466 total aligned reads displayed.
CGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989807‑3989987
|
cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGt < 1:3361582/93‑1 (MQ=255)
aGTGTTGATCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCg < 1:2990695/93‑1 (MQ=255)
aGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCg > 2:8561258/1‑93 (MQ=255)
aGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCg > 2:3075249/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATTCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGt < 2:2182391/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGt < 2:3378798/93‑1 (MQ=255)
tgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGAGTg > 2:7586702/1‑93 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 2:7869975/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 2:1587607/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 1:3074094/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 1:2879319/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAg < 2:10018706/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAg > 1:8437336/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAgg < 1:6754671/93‑1 (MQ=255)
aGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGgcg > 1:5680527/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGgcgcc > 1:7355520/1‑92 (MQ=255)
ccAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGca > 1:4369100/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGca > 2:4021322/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGca > 2:6910736/1‑93 (MQ=255)
cAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcac < 2:7479257/93‑1 (MQ=255)
aGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcaca > 1:8682518/1‑93 (MQ=255)
aGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcaca > 2:8868116/1‑93 (MQ=255)
ttAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAc > 1:7258053/1‑93 (MQ=255)
aGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGa < 1:6891370/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGt < 1:2687607/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGt < 2:2355695/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGt > 2:4268171/1‑93 (MQ=255)
gCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGc < 1:220870/93‑1 (MQ=255)
gTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGa > 2:675133/1‑93 (MQ=255)
gTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGa < 2:9326995/93‑1 (MQ=255)
gTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGa < 2:4783747/93‑1 (MQ=255)
tGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAc > 1:9908345/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAc < 2:4482414/93‑1 (MQ=255)
ggggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg < 1:9683704/93‑1 (MQ=255)
ggggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg < 1:6634680/93‑1 (MQ=255)
gggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgc < 2:2502055/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgcg < 2:8413728/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:7709697/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:1879808/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 2:3537372/93‑1 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat > 2:1112833/1‑93 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga < 2:267660/93‑1 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga > 1:1298035/1‑93 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga < 2:6210715/93‑1 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga < 2:9697057/93‑1 (MQ=255)
aCGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGc < 2:3198453/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa < 1:10002552/93‑1 (MQ=255)
gAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCag > 1:6389997/1‑93 (MQ=255)
aaGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCaga < 2:6549062/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAATATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc < 1:8865029/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc < 2:496767/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc > 2:2779003/1‑93 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc < 1:3152542/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc < 2:1306218/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGc < 2:5363977/93‑1 (MQ=255)
cTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCt > 1:9525059/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGGAGAGCTa > 2:9581804/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGGGCGTGAGGCGCACAACGAGGTGCTCGACGCGCTGATGCCGCGCTa > 1:4771321/1‑93 (MQ=255)
ggCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGGGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTaa > 1:1241701/1‑93 (MQ=255)
ggCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTaa > 1:613980/1‑93 (MQ=255)
ggCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTaa < 2:1856943/93‑1 (MQ=255)
cAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATc < 2:8762401/93‑1 (MQ=255)
cAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATc < 1:2490788/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCt > 1:3826968/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGa > 2:2048155/1‑93 (MQ=255)
gCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAt > 2:3623631/1‑93 (MQ=255)
cTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATc > 1:9029419/1‑93 (MQ=255)
cTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATc > 2:8263503/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc > 2:5774104/1‑93 (MQ=255)
cGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCg > 2:3824884/1‑93 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt > 1:7547768/1‑93 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt > 2:8028700/1‑93 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt < 1:5393798/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATTCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCttt < 1:8174887/93‑1 (MQ=255)
ccGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgc < 2:9469233/93‑1 (MQ=255)
cgcgATAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcg < 2:4575804/93‑1 (MQ=255)
cgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg > 2:6374819/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 1:176833/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 1:4261588/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt < 2:295136/93‑1 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc > 1:8564234/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGc > 2:1441019/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGc > 2:913062/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCaa < 1:9311851/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAt < 2:7311608/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAt < 2:5563840/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc > 1:5083646/1‑93 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc < 2:707529/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc < 1:626986/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc > 1:8332910/1‑93 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt < 1:4495445/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCt > 1:3591185/1‑93 (MQ=255)
aTTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCtt < 1:5496676/93‑1 (MQ=255)
aTTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCtt < 1:6993464/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTa < 2:980628/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTa < 2:6004602/93‑1 (MQ=255)
tGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAg < 1:3413172/93‑1 (MQ=255)
tGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAg > 1:2054616/1‑93 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc < 2:3931685/93‑1 (MQ=255)
aTCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCg < 1:4932852/93‑1 (MQ=255)
|
CGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989807‑3989987
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 231 total aligned reads displayed.
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > NC_000913/3989805‑3989991
|
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG > SRR4302540.4592861/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG < SRR4302540.1908850/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGG < SRR4302540.8947215/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGG < SRR4302540.1967587/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGT < SRR4302540.2159712/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGT < SRR4302540.9247412/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG < SRR4302540.3398380/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG < SRR4302540.3257189/94‑1 (MQ=60)
AGTGTTGATCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT < SRR4302540.3023667/94‑1 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT > SRR4302540.6934144/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT < SRR4302540.3023669/94‑1 (MQ=60)
GTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTG > SRR4302540.8701848/1‑94 (MQ=60)
GTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGGTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGCGCGTG > SRR4302540.1115558/1‑94 (MQ=60)
gggTGAGCCAGTGAGTGAGCGAGTGGGGGTGGGACGAAGCTCGGCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGA < SRR4302540.9582852/91‑1 (MQ=60)
TGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGA < SRR4302540.9582851/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302540.2910636/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302540.3438972/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG > SRR4302540.8535287/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG > SRR4302540.2801504/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302540.6050514/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302540.6408909/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302540.7008833/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGC > SRR4302540.3036700/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGC > SRR4302540.4661349/1‑94 (MQ=60)
GAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCG < SRR4302540.1998535/94‑1 (MQ=60)
GAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCG < SRR4302540.4503015/94‑1 (MQ=60)
GAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGCGCTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCG < SRR4302540.9884940/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGC > SRR4302540.9189205/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCC > SRR4302540.7437551/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCA > SRR4302540.4416571/1‑94 (MQ=60)
CAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACA > SRR4302540.8783349/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGTAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA > SRR4302540.7238095/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA > SRR4302540.6852324/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA < SRR4302540.8795583/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAC > SRR4302540.3071026/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG < SRR4302540.4551532/94‑1 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG < SRR4302540.8943501/94‑1 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG > SRR4302540.8471068/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG > SRR4302540.4496611/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAG < SRR4302540.9790302/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAG > SRR4302540.7362630/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAG < SRR4302540.6582064/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAG < SRR4302540.6967804/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAG < SRR4302540.7478973/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT < SRR4302540.1302533/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT < SRR4302540.1302531/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT > SRR4302540.6386690/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTT < SRR4302540.2716653/94‑1 (MQ=60)
TGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTT < SRR4302540.9129287/94‑1 (MQ=60)
TGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTT < SRR4302540.3640964/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTT < SRR4302540.6997904/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGTGGGGTTGGGGCGAAGCTCGTCCGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGC < SRR4302540.3431440/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGC < SRR4302540.3431190/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGC > SRR4302540.7959368/1‑94 (MQ=60)
GCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCT < SRR4302540.223013/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCT < SRR4302540.2616146/94‑1 (MQ=60)
GGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTC < SRR4302540.7159143/94‑1 (MQ=60)
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CGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTC > SRR4302540.5649046/1‑94 (MQ=60)
CGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTC < SRR4302540.1913084/94‑1 (MQ=60)
GAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCGCAACGAGTTGCTCG < SRR4302540.1399356/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC > SRR4302540.10024082/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC > SRR4302540.6831238/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTCAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC < SRR4302540.505894/94‑1 (MQ=60)
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TGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACG < SRR4302540.7357057/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACG < SRR4302540.3124898/94‑1 (MQ=60)
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GGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGC > SRR4302540.773442/1‑94 (MQ=60)
GGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGC < SRR4302540.9797780/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGC < SRR4302540.6708107/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGC > SRR4302540.5493162/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCG < SRR4302540.7511228/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT < SRR4302540.7798257/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT < SRR4302540.8357876/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT < SRR4302540.1900395/94‑1 (MQ=60)
TTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATG < SRR4302540.5694678/94‑1 (MQ=60)
TGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGA > SRR4302540.8491812/1‑94 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT > SRR4302540.4461401/1‑94 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302540.8725410/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302540.3289910/94‑1 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACACCGAGTTGCTCGACGCGATGATG > SRR4302540.6896609/1‑94 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG < SRR4302540.8769551/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCA < SRR4302540.9687686/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCA > SRR4302540.42358/1‑94 (MQ=60)
cgcgtCTCGTCTGGCAGTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAGGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACCGCGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG < SRR4302540.8602301/89‑1 (MQ=60)
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CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG < SRR4302540.10119069/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG > SRR4302540.6461128/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG < SRR4302540.8602636/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAG > SRR4302540.6194537/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302540.4470982/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302540.7339299/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302540.2837714/1‑94 (MQ=60)
AGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGC > SRR4302540.3517275/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAATATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCT < SRR4302540.8967610/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCT > SRR4302540.9637840/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCT < SRR4302540.3186864/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCT < SRR4302540.4405386/94‑1 (MQ=60)
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CTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTA > SRR4302540.3138007/1‑94 (MQ=60)
CTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTA > SRR4302540.4625352/1‑94 (MQ=60)
CTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGGGCGTGAGGCGCACAACGAGGTGCTCGACGCGCTGATGCCGCGCTA > SRR4302540.4822292/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACC < SRR4302540.2647278/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTGACTGGAAGATTGATCGGGCGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTCCCG > SRR4302540.5530406/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG > SRR4302540.6359679/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG < SRR4302540.126949/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGT < SRR4302540.5105588/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGT > SRR4302540.9128488/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTA < SRR4302540.3127112/94‑1 (MQ=60)
TGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGGGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAA > SRR4302540.1254371/1‑94 (MQ=60)
TGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAA > SRR4302540.5298413/1‑94 (MQ=60)
TGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAA > SRR4302540.620531/1‑94 (MQ=60)
TGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAA < SRR4302540.5064406/94‑1 (MQ=60)
GGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAAT < SRR4302540.3793982/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302540.5262283/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302540.2517612/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT < SRR4302540.6253614/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT > SRR4302540.3868613/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG > SRR4302540.3605603/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG > SRR4302540.763593/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTG < SRR4302540.4786412/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGACGATTGATCGGGTGCGAGAGGGCCAAAACGAGTTGCGCGCCGCGATCATGCAcatccaccggaaacagc > SRR4302540.5266351/1‑77 (MQ=23)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302540.770517/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302540.5266352/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302540.9889346/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302540.4941977/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT > SRR4302540.8660964/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT < SRR4302540.6270335/94‑1 (MQ=60)
GCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATC > SRR4302540.8162296/1‑94 (MQ=60)
GCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATC > SRR4302540.201046/1‑94 (MQ=60)
GCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATC > SRR4302540.9137772/1‑94 (MQ=60)
GCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATC < SRR4302540.9458925/94‑1 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC < SRR4302540.6126546/94‑1 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC < SRR4302540.6126545/94‑1 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC < SRR4302540.10067630/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302540.5632804/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302540.10052803/94‑1 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC < SRR4302540.8459711/94‑1 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGGGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC > SRR4302540.1837173/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT > SRR4302540.1573078/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT > SRR4302540.6696717/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT < SRR4302540.2086649/94‑1 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT < SRR4302540.8790517/94‑1 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT > SRR4302540.7632364/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT < SRR4302540.2596411/94‑1 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTT < SRR4302540.5453104/94‑1 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTT > SRR4302540.2493013/1‑94 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGGGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCGGATCCGCTT > SRR4302540.245841/1‑94 (MQ=60)
TAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTT < SRR4302540.367438/94‑1 (MQ=60)
AACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATTCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTG < SRR4302540.8269839/94‑1 (MQ=60)
AACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTG < SRR4302540.4374190/94‑1 (MQ=60)
AACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTG < SRR4302540.8269840/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC > SRR4302540.3441796/1‑94 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC > SRR4302540.680140/1‑94 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATACGCTTTGG > SRR4302540.680141/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGT > SRR4302540.178594/1‑94 (MQ=60)
CGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGT > SRR4302540.4307945/1‑94 (MQ=60)
GCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTC > SRR4302540.8663691/1‑94 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCG < SRR4302540.1813586/94‑1 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCG < SRR4302540.1868283/94‑1 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCG < SRR4302540.2140895/94‑1 (MQ=60)
ACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAA > SRR4302540.1270814/1‑94 (MQ=60)
ACTGGAAGATGGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAA < SRR4302540.7992853/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT < SRR4302540.9423006/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT < SRR4302540.856232/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT > SRR4302540.2267701/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAGATTGAGCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAAT < SRR4302540.2813647/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATA < SRR4302540.1664367/94‑1 (MQ=60)
GGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAA < SRR4302540.1152937/94‑1 (MQ=60)
GAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAC < SRR4302540.6434907/94‑1 (MQ=60)
AAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACC < SRR4302540.3923886/94‑1 (MQ=60)
AAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACC > SRR4302540.8429636/1‑94 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT > SRR4302540.3630414/1‑94 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT < SRR4302540.7068166/94‑1 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT < SRR4302540.633658/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT > SRR4302540.838108/1‑94 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302540.10108851/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302540.3000475/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT > SRR4302540.5256718/1‑94 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302540.3000476/94‑1 (MQ=60)
AATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGGTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302540.7584876/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302540.5557198/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302540.7071084/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302540.4214469/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG > SRR4302540.2076732/1‑94 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG < SRR4302540.5734428/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG < SRR4302540.4261822/94‑1 (MQ=60)
TGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGC < SRR4302540.7433630/94‑1 (MQ=60)
TGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGC < SRR4302540.3450333/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG < SRR4302540.9238982/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > SRR4302540.9663618/1‑94 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG < SRR4302540.5086167/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT < SRR4302540.7217636/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT < SRR4302540.4986051/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT < SRR4302540.6762869/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTC > SRR4302540.10136277/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > SRR4302540.2217438/1‑94 (MQ=60)
|
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > NC_000913/3989805‑3989991
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
