Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,989,898 |
A→G |
Q378R (CAG→CGG) |
cyaA → |
adenylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,989,898 | 0 | A | G | 100.0%
| 681.6
/ NA
| 212 | Q378R (CAG→CGG) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (94/118); total (94/118) |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989808‑3989987
|
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg > 2:3386584/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg < 1:4691442/93‑1 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg < 2:2655719/93‑1 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg < 2:4944449/93‑1 (MQ=255)
gcgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCggg > 2:5139628/1‑93 (MQ=255)
gcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTg > 1:3790604/1‑93 (MQ=255)
gcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTg < 2:1816661/93‑1 (MQ=255)
gcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGGGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTg > 2:2947455/1‑93 (MQ=255)
cAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGc > 2:2136527/1‑93 (MQ=255)
cAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGc < 2:3572240/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGt < 2:1084823/93‑1 (MQ=255)
tgtTGAGCCAGCTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTg > 2:5863708/1‑93 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 1:1123422/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 2:408178/93‑1 (MQ=255)
gtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGa < 1:348762/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAg < 1:4238395/93‑1 (MQ=255)
ttGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAg < 1:5391678/93‑1 (MQ=255)
gAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTTCGTGAGgc < 2:6156779/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAGCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGgcgc < 1:6112415/93‑1 (MQ=255)
cAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcac > 2:5203808/1‑93 (MQ=255)
aGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcaca < 1:4377613/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACaa > 2:2517222/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACaa > 1:5547411/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACaa > 2:843972/1‑93 (MQ=255)
ttAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAc < 2:4512538/93‑1 (MQ=255)
ttAGTGAGCGAGCGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGcaccac > 1:550894/1‑93 (MQ=255)
gTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAg < 2:4393656/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGt < 2:432127/93‑1 (MQ=255)
gCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGc < 2:5675130/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCg > 1:924568/1‑93 (MQ=255)
atGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGa > 1:5943708/2‑93 (MQ=255)
ggggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg < 2:5591759/93‑1 (MQ=255)
gggTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgc < 1:5588434/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 2:1915165/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:2946014/93‑1 (MQ=255)
ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgat > 1:3659089/1‑93 (MQ=255)
tGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatg < 1:5111195/93‑1 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga < 2:1293653/93‑1 (MQ=255)
gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatga < 1:1360329/93‑1 (MQ=255)
ggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCgatgat < 1:2507402/93‑1 (MQ=255)
gACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGatgatg < 2:4107912/93‑1 (MQ=255)
gACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGatgatg < 1:5644868/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa < 2:2854273/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa < 2:3041020/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa < 1:1045416/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa > 1:3096443/1‑93 (MQ=255)
aGCTCGTCTGGCAATGCTCGCTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGAGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag > 2:2701899/1‑93 (MQ=255)
aGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag > 2:1446755/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTa > 2:5051272/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTa > 1:1448231/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTa > 2:4710243/1‑93 (MQ=255)
tCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTa < 1:1661432/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGCCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATGGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAc < 1:1106513/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAcc > 2:5779439/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCg > 1:3754296/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGt > 1:5126519/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGt < 2:1437937/93‑1 (MQ=255)
tGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCCGAGCTACCGTa > 2:5473921/1‑93 (MQ=255)
tGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTa > 1:3020249/1‑93 (MQ=255)
gCAATGCTCGACAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAAt < 1:975888/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCt > 1:4077908/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTg < 1:4026349/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTg < 1:774394/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGa > 1:2039488/1‑93 (MQ=255)
gCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAt < 2:883921/93‑1 (MQ=255)
cTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATc > 1:178059/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc > 1:1734167/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc < 1:1859119/93‑1 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc > 1:1580383/1‑93 (MQ=255)
tCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATcc < 2:721190/93‑1 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt > 1:6287885/1‑93 (MQ=255)
aTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCt > 2:3980434/1‑93 (MQ=255)
tAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCtt < 2:5406758/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCttt < 2:6039789/93‑1 (MQ=255)
ccGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgc < 1:5237215/93‑1 (MQ=255)
ccGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgc < 1:3261504/93‑1 (MQ=255)
cgcgCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcg < 1:2717152/93‑1 (MQ=255)
cgcgCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcg < 1:2353667/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcgc < 2:1511470/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcgc > 2:1583310/1‑93 (MQ=255)
gcgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGAGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTgcgc > 2:3783961/1‑93 (MQ=255)
cgcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg < 2:316678/93‑1 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 1:5758033/1‑93 (MQ=255)
gcTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGt > 1:4601707/1‑93 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc > 1:4203138/1‑93 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc < 1:395183/93‑1 (MQ=255)
cTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTc < 2:4234265/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCaa < 2:5017268/93‑1 (MQ=255)
ggAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATa > 1:3413614/1‑93 (MQ=255)
gAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa < 2:2326725/93‑1 (MQ=255)
gAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGCAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa > 2:4802944/1‑93 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc < 2:2176534/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc < 1:4955426/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAcc > 1:1023349/1‑93 (MQ=255)
aTTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCtt < 1:4303832/93‑1 (MQ=255)
aTTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCtt < 1:4746691/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAGCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTa < 2:2890333/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTa > 2:2933436/1‑93 (MQ=255)
tGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAg < 1:821421/93‑1 (MQ=255)
gATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTATCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGc < 1:4510204/93‑1 (MQ=255)
|
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > NC_000913/3989808‑3989987
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > NC_000913/3989805‑3989991
|
GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG > SRR4302533.750499/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCG < SRR4302533.1133512/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGG < SRR4302533.1595402/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGT < SRR4302533.4265243/94‑1 (MQ=60)
GCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGT < SRR4302533.4719877/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302533.1822430/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTG > SRR4302533.3813815/1‑94 (MQ=60)
GCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGG > SRR4302533.4758713/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGT > SRR4302533.1726728/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302533.3891827/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302533.1130087/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAG < SRR4302533.350890/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302533.4263993/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGG < SRR4302533.5424072/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAGCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCA < SRR4302533.6149307/94‑1 (MQ=60)
CAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACA > SRR4302533.2326674/1‑94 (MQ=60)
CAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACA < SRR4302533.5983727/94‑1 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAC > SRR4302533.5293882/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA > SRR4302533.5580914/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAA < SRR4302533.4404041/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAC < SRR4302533.5226114/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAC > SRR4302533.4513627/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAAC > SRR4302533.421833/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTGAGCGAGCGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACCAC > SRR4302533.554161/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGGTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG < SRR4302533.1788708/94‑1 (MQ=60)
TTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACG > SRR4302533.4814577/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT > SRR4302533.6186338/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGT < SRR4302533.5883795/94‑1 (MQ=60)
GAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCG > SRR4302533.929998/1‑94 (MQ=60)
GAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCG < SRR4302533.5522364/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGA < SRR4302533.5390757/94‑1 (MQ=60)
AATGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGA > SRR4302533.5979655/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC < SRR4302533.988434/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC < SRR4302533.3484456/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAC < SRR4302533.795099/94‑1 (MQ=60)
GGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCG < SRR4302533.5622198/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGA > SRR4302533.3043954/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGA > SRR4302533.2569406/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT > SRR4302533.5555266/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT < SRR4302533.2964030/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAT > SRR4302533.3681586/1‑94 (MQ=60)
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TTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATG < SRR4302533.3478988/94‑1 (MQ=60)
TGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGA < SRR4302533.5142087/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302533.4195879/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302533.3798201/94‑1 (MQ=60)
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGAT < SRR4302533.1368502/94‑1 (MQ=60)
GGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG < SRR4302533.2522857/94‑1 (MQ=60)
GAACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTCCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATG < SRR4302533.1440139/94‑1 (MQ=60)
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GACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGC < SRR4302533.5678993/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCA > SRR4302533.3115476/1‑94 (MQ=60)
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GAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGA > SRR4302533.881007/1‑94 (MQ=60)
AAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAG > SRR4302533.460035/1‑94 (MQ=60)
AGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGC > SRR4302533.1120074/1‑94 (MQ=60)
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CTCGTCTGGCAATGCTCGATAGCCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTA < SRR4302533.4234160/94‑1 (MQ=60)
CTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTA > SRR4302533.1456969/1‑94 (MQ=60)
TCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAC < SRR4302533.1671477/94‑1 (MQ=60)
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CGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACC < SRR4302533.4003124/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGCCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATGGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACC < SRR4302533.1113075/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG < SRR4302533.710812/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCG > SRR4302533.3777307/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGT > SRR4302533.5157489/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTA > SRR4302533.4080249/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTA > SRR4302533.3038736/1‑94 (MQ=60)
GCAATGCTCGACAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATC < SRR4302533.981611/94‑1 (MQ=60)
CAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCT > SRR4302533.4102732/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA > SRR4302533.2052063/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA < SRR4302533.4050859/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGA < SRR4302533.778946/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT < SRR4302533.560846/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGAT < SRR4302533.342550/94‑1 (MQ=60)
GCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATC > SRR4302533.179174/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC > SRR4302533.1589901/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC > SRR4302533.1744691/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCC < SRR4302533.5147871/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302533.849724/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302533.1228897/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302533.3006253/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG < SRR4302533.1870457/94‑1 (MQ=60)
TCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCG > SRR4302533.4359344/1‑94 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC > SRR4302533.3767705/1‑94 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC < SRR4302533.4968616/94‑1 (MQ=60)
CGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGC > SRR4302533.246961/1‑94 (MQ=60)
GATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCT > SRR4302533.6325395/1‑94 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTT > SRR4302533.5790065/1‑94 (MQ=60)
ATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAAAGCTACCGTAATCTGATCCGCTT < SRR4302533.5641756/94‑1 (MQ=60)
TAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTT > SRR4302533.6290795/1‑94 (MQ=60)
AACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTgc > SRR4302533.3632017/1‑92 (MQ=60)
AACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTG < SRR4302533.1044420/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC < SRR4302533.1268861/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGC > SRR4302533.954441/1‑94 (MQ=60)
CCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCG < SRR4302533.5268703/94‑1 (MQ=60)
CCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCG < SRR4302533.3281623/94‑1 (MQ=60)
CCGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCG > SRR4302533.2265715/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGC < SRR4302533.2733834/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGC < SRR4302533.2368222/94‑1 (MQ=60)
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CGCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGT > SRR4302533.4629587/1‑94 (MQ=60)
GCTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTC > SRR4302533.4228566/1‑94 (MQ=60)
CTAACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCG < SRR4302533.397578/94‑1 (MQ=60)
ACTGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAA > SRR4302533.5671415/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATA > SRR4302533.4424320/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATA > SRR4302533.3434704/1‑94 (MQ=60)
GAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAC < SRR4302533.505871/94‑1 (MQ=60)
GAAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAAC > SRR4302533.4717526/1‑94 (MQ=60)
AAGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACC > SRR4302533.1029363/1‑94 (MQ=60)
AGATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCT < SRR4302533.4985442/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCGGGTGCGTGAGGAGCACAACTAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTT < SRR4302533.1693894/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302533.4775469/94‑1 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA > SRR4302533.1488969/1‑94 (MQ=60)
ATTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTA < SRR4302533.4329725/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAG < SRR4302533.1640524/94‑1 (MQ=60)
TGATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGC < SRR4302533.826242/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTATCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG < SRR4302533.4537518/94‑1 (MQ=60)
GATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCG > SRR4302533.2865185/1‑94 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT < SRR4302533.3253560/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGT > SRR4302533.4029249/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCT > SRR4302533.1268465/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > SRR4302533.4185296/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > SRR4302533.2189800/1‑94 (MQ=60)
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GTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTC > NC_000913/3989805‑3989991
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
