Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A1 F1 I1 R1 1548 369.5 20095359 96.9% 19472402 93.0

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,004,812 T→C R448R (CGT→CGC)  recQ → ATP‑dependent DNA helicase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,004,8120TC99.5% 1357.7 / ‑5.5 425R448R (CGT→CGC) recQATP‑dependent DNA helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (2/0);  new base C (207/216);  total (209/216)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 444 total aligned reads displayed.

TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901
                                                                                          |                                                                                         
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt                                                                                         >  2:9632022/1‑93 (MQ=255)
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt                                                                                         >  2:7103363/1‑93 (MQ=255)
   gATCGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcg                                                                                      <  2:5139844/93‑1 (MQ=255)
    aTTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgc                                                                                     >  1:8385359/1‑93 (MQ=255)
     ttGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgcg                                                                                    <  1:6541928/93‑1 (MQ=255)
     ttGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgcg                                                                                    <  2:6661735/93‑1 (MQ=255)
      tGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGa                                                                                   <  1:8936165/93‑1 (MQ=255)
        cccTTTCCACCATTGGTCTTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATGACCAGCGCATCCGCGACt                                                                                 <  2:6978937/93‑1 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa                                                                                <  1:7159753/93‑1 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa                                                                                <  2:6048525/93‑1 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGGGCTATTAACCAGCGCATCTGCGAcct                                                                                >  2:2513376/1‑91 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATTTGGAGGAAGTGATCCGGGGTGCTAATAACCAGCGAATCCGCGACTag                                                                               >  1:3401642/1‑92 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               >  1:2968185/1‑93 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGGGATTCGGGGTGCTAATAACCAGCGCACCCGCGACTAt                                                                               >  1:7390398/1‑93 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              >  2:4127389/1‑93 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              >  2:3647751/1‑93 (MQ=255)
           cttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTGTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              <  1:3617132/92‑1 (MQ=255)
             tCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGTATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCTTCCGCGACTATGGt                                                                            <  2:1828266/93‑1 (MQ=255)
                 ccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATg                                                                        <  1:8669863/93‑1 (MQ=255)
                 ccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTAATg                                                                        >  1:8500597/1‑93 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       <  2:927509/93‑1 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       <  1:9627027/93‑1 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       >  2:4643155/1‑93 (MQ=255)
                   aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc                                                                      >  2:1233399/1‑93 (MQ=255)
                     tGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaa                                                                    <  1:2755737/93‑1 (MQ=255)
                     tGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaa                                                                    <  2:9080195/93‑1 (MQ=255)
                      ggTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaaa                                                                   <  1:6398604/93‑1 (MQ=255)
                        tCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACt                                                                 >  1:949266/1‑93 (MQ=255)
                          gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa                                                               >  2:8110992/1‑93 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGTGGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              <  2:7675831/93‑1 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  2:5385285/1‑93 (MQ=255)
                              gAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGt                                                           <  2:2093700/93‑1 (MQ=255)
                               aaTCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTc                                                          <  2:6238203/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  1:7702716/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  2:8955851/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        >  1:1245182/1‑93 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  1:3359104/93‑1 (MQ=255)
                                  cAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAt                                                       <  2:3096464/93‑1 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      >  1:3894067/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      >  1:1301104/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      <  2:8523051/93‑1 (MQ=255)
                                    gCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATgg                                                     <  2:9047789/93‑1 (MQ=255)
                                    gCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATgg                                                     <  2:2439996/93‑1 (MQ=255)
                                     cGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGc                                                    <  2:2781155/93‑1 (MQ=255)
                                      ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCa                                                   <  1:6349222/93‑1 (MQ=255)
                                      ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCa                                                   <  2:7908371/93‑1 (MQ=255)
                                      ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCa                                                   <  1:5666077/93‑1 (MQ=255)
                                        tttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATg                                                 <  1:1803380/93‑1 (MQ=255)
                                          tGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATggg                                               <  1:4876016/93‑1 (MQ=255)
                                           gggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAtcgcc                                              >  1:5479037/1‑89 (MQ=255)
                                            ggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGcc                                             >  1:4947076/1‑93 (MQ=255)
                                             gATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCg                                            >  2:4884940/1‑93 (MQ=255)
                                               tGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTg                                          <  1:3061816/93‑1 (MQ=255)
                                               tGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTg                                          <  1:5634123/93‑1 (MQ=255)
                                                gggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGa                                         >  1:9843871/1‑93 (MQ=255)
                                                gggTTAGGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATCACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGa                                         <  1:9287014/93‑1 (MQ=255)
                                                  gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa                                       <  1:8242494/93‑1 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCTTGATaaa                                     <  1:10045762/93‑1 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     >  1:912582/1‑93 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  1:6754124/93‑1 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  2:4375031/93‑1 (MQ=255)
                                                      tgtgGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGAGACTACGGTGATGAAACACTGCAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAg                                   >  1:7089333/1‑93 (MQ=255)
                                                        tggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGcc                                 >  1:4015076/1‑93 (MQ=255)
                                                         ggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCa                                <  1:1602078/93‑1 (MQ=255)
                                                         ggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCa                                <  2:7167356/93‑1 (MQ=255)
                                                           tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              >  1:2315539/1‑93 (MQ=255)
                                                           gggAAGTGATTCGTGGTGATAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAACCTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              <  2:3356683/92‑1 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATTaa                            >  2:8172418/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            >  2:7369304/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            <  2:3967675/93‑1 (MQ=255)
                                                              aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc                           <  1:7011965/93‑1 (MQ=255)
                                                               aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa                          >  2:10012152/1‑93 (MQ=255)
                                                               aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa                          <  2:1607445/93‑1 (MQ=255)
                                                               aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa                          <  1:430586/93‑1 (MQ=255)
                                                               aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa                          <  2:6388744/93‑1 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        <  1:6045917/93‑1 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  1:1672096/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        <  1:28219/93‑1 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  1:530355/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       >  1:2462/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       <  1:222733/93‑1 (MQ=255)
                                                                    ttCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg                     >  2:8297521/1‑93 (MQ=255)
                                                                     tCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGt                    >  2:5048702/1‑93 (MQ=255)
                                                                      cGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTg                   >  2:9371348/1‑93 (MQ=255)
                                                                        tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg                 <  1:7861937/93‑1 (MQ=255)
                                                                        tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg                 >  2:5095551/1‑93 (MQ=255)
                                                                         ggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGc                >  1:1987192/1‑93 (MQ=255)
                                                                          gtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg               >  2:9839924/1‑93 (MQ=255)
                                                                          gtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg               >  2:6857852/1‑93 (MQ=255)
                                                                             cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa            <  2:5602848/93‑1 (MQ=255)
                                                                             cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa            >  1:9000843/1‑93 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          <  2:5949943/93‑1 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          <  1:4129485/93‑1 (MQ=255)
                                                                                ataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATcc         <  1:6002604/93‑1 (MQ=255)
                                                                                 taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCg        >  2:327652/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  aaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGc       <  2:5782341/93‑1 (MQ=255)
                                                                                   aCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGcc      >  2:3320960/1‑93 (MQ=255)
                                                                                      aGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc   <  1:5836822/93‑1 (MQ=255)
                                                                                      aGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc   >  1:9394848/1‑93 (MQ=255)
                                                                                       gcgcATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCt  >  2:8386707/1‑93 (MQ=255)
                                                                                          |                                                                                         
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑

GATK/CNVnator alignment

BRESEQ :: bam2aln output Only 200 of 242 total aligned reads displayed.
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  >  NC_000913/4004719‑4004904
                                                                                             |                                                                                            
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGC                                                                                              >  SRR4302540.8970655/1‑94 (MQ=60)
  CTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAT                                                                                            >  SRR4302540.4535654/1‑94 (MQ=60)
  CTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAACGCAT                                                                                            >  SRR4302540.6880327/1‑94 (MQ=60)
   TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATC                                                                                           <  SRR4302540.173269/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                          >  SRR4302540.2978921/1‑94 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                          <  SRR4302540.3019128/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                          <  SRR4302540.3918314/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                          >  SRR4302540.5358355/1‑94 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                          <  SRR4302540.4985387/94‑1 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                         >  SRR4302540.7838139/1‑94 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                         <  SRR4302540.7238689/94‑1 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGCTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                         >  SRR4302540.7010603/1‑94 (MQ=60)
      GATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATCACCAGAGCATCCGC                                                                                        >  SRR4302540.2310629/1‑94 (MQ=60)
      GATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGC                                                                                        >  SRR4302540.8482652/1‑94 (MQ=60)
       ATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCG                                                                                       >  SRR4302540.1282533/1‑94 (MQ=60)
       ATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCG                                                                                       >  SRR4302540.3327924/1‑94 (MQ=60)
       ATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCG                                                                                       >  SRR4302540.10074932/1‑94 (MQ=60)
        TTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGggc                                                                                      >  SRR4302540.1393639/1‑91 (MQ=60)
        TTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGA                                                                                      >  SRR4302540.1393638/1‑94 (MQ=60)
        TTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGA                                                                                      <  SRR4302540.9131598/94‑1 (MQ=60)
        TTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGA                                                                                      >  SRR4302540.10045776/1‑94 (MQ=60)
         TGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC                                                                                     >  SRR4302540.7941400/1‑94 (MQ=60)
         TGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC                                                                                     <  SRR4302540.9040775/94‑1 (MQ=60)
         TGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC                                                                                     <  SRR4302540.6571673/94‑1 (MQ=60)
         TGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC                                                                                     >  SRR4302540.8778688/1‑94 (MQ=60)
          GCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACT                                                                                    <  SRR4302540.1245255/94‑1 (MQ=60)
           CCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTA                                                                                   >  SRR4302540.3582182/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATTTGGAGGAAGTGATCCGGGGTGCTAATAACCAGCGAATCCGCGACTAG                                                                                  >  SRR4302540.3438725/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                  >  SRR4302540.3438719/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                  >  SRR4302540.3000966/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                  <  SRR4302540.8574037/94‑1 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                  >  SRR4302540.5773551/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                  <  SRR4302540.7239559/94‑1 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGGGATTCGGGGTGCTAATAACCAGCGCACCCGCGACTAT                                                                                  >  SRR4302540.7472743/1‑94 (MQ=60)
             CTTTCCACCTTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                 >  SRR4302540.7159303/1‑94 (MQ=60)
             CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                 >  SRR4302540.7317433/1‑94 (MQ=60)
             CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                 <  SRR4302540.6468996/94‑1 (MQ=60)
             CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                 >  SRR4302540.3438967/1‑94 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                >  SRR4302540.9470507/1‑94 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                >  SRR4302540.9470506/1‑94 (MQ=60)
              CTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTGTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                <  SRR4302540.3656694/94‑1 (MQ=60)
                TCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTC                                                                              >  SRR4302540.5479292/1‑94 (MQ=60)
                TCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTC                                                                              >  SRR4302540.348781/1‑94 (MQ=60)
                 CCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA                                                                             >  SRR4302540.2392477/1‑94 (MQ=60)
                 CCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA                                                                             >  SRR4302540.839776/1‑94 (MQ=60)
                   ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG                                                                           >  SRR4302540.2288298/1‑94 (MQ=60)
                   ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG                                                                           <  SRR4302540.655938/94‑1 (MQ=60)
                   ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG                                                                           <  SRR4302540.3841518/94‑1 (MQ=60)
                   ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTAATG                                                                           >  SRR4302540.8599371/1‑94 (MQ=60)
                    CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA                                                                          >  SRR4302540.397695/1‑94 (MQ=60)
                    CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA                                                                          >  SRR4302540.5434519/1‑94 (MQ=60)
                    CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA                                                                          >  SRR4302540.2084846/1‑94 (MQ=60)
                    CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA                                                                          <  SRR4302540.8770569/94‑1 (MQ=60)
                     CATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAC                                                                         <  SRR4302540.9740474/94‑1 (MQ=60)
                      ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATGCGCGACTATGGTCATGACA                                                                        >  SRR4302540.8767860/1‑94 (MQ=60)
                      ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACA                                                                        >  SRR4302540.5328424/1‑94 (MQ=60)
                      ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGCTCATGACA                                                                        >  SRR4302540.2812231/1‑94 (MQ=60)
                        TGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAA                                                                      <  SRR4302540.2785520/94‑1 (MQ=60)
                        TGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAA                                                                      <  SRR4302540.8168796/94‑1 (MQ=60)
                         GGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAC                                                                     >  SRR4302540.5632359/1‑94 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                    >  SRR4302540.959142/1‑94 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                    >  SRR4302540.3056006/1‑94 (MQ=60)
                           TCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTG                                                                   <  SRR4302540.6802418/94‑1 (MQ=60)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGCTGGGTTATGTGGTGAAAGCGATTCGCGGTGGTCATCACCAGCCAATCCGGGACTATGGTCATGAAAAACTGA                                                                  >  SRR4302540.8022184/1‑94 (MQ=32)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA                                                                  >  SRR4302540.9690404/1‑94 (MQ=60)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA                                                                  >  SRR4302540.5717659/1‑94 (MQ=60)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA                                                                  >  SRR4302540.2333752/1‑94 (MQ=60)
                             GTGTGAATCAGGGGTTTGGGATGGGTGATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA                                                                 <  SRR4302540.5795271/94‑1 (MQ=60)
                              TGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAA                                                                <  SRR4302540.3695979/94‑1 (MQ=60)
                               GTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG                                                               <  SRR4302540.2362559/94‑1 (MQ=60)
                               GTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG                                                               <  SRR4302540.1267620/94‑1 (MQ=60)
                               GTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG                                                               <  SRR4302540.9273230/94‑1 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                              <  SRR4302540.1751078/94‑1 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                           <  SRR4302540.5751147/94‑1 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                           >  SRR4302540.3235992/1‑94 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                           >  SRR4302540.1257885/1‑94 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                           <  SRR4302540.9175879/94‑1 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                           <  SRR4302540.9579288/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                          <  SRR4302540.7790800/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                          <  SRR4302540.2885707/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                          <  SRR4302540.3395888/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                          <  SRR4302540.728293/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                          <  SRR4302540.8401573/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                         <  SRR4302540.4634821/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                         <  SRR4302540.6578387/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                         <  SRR4302540.1641966/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGGAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                        <  SRR4302540.9750360/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                        >  SRR4302540.8393570/1‑94 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                        <  SRR4302540.7713697/94‑1 (MQ=60)
                                       GCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGC                                                       <  SRR4302540.9063499/94‑1 (MQ=60)
                                       GCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGC                                                       >  SRR4302540.5931604/1‑94 (MQ=60)
                                        CGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCA                                                      <  SRR4302540.6323958/94‑1 (MQ=60)
                                        CGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCA                                                      <  SRR4302540.16881/94‑1 (MQ=60)
                                        CGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCA                                                      >  SRR4302540.6070958/1‑94 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                     <  SRR4302540.5728475/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                     <  SRR4302540.6419928/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                     <  SRR4302540.6434392/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                     <  SRR4302540.9264832/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                     <  SRR4302540.183105/94‑1 (MQ=60)
                                          GTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG                                                    <  SRR4302540.206292/94‑1 (MQ=60)
                                           ggTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                   <  SRR4302540.1823020/92‑1 (MQ=60)
                                           TTTTGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                   >  SRR4302540.5654567/1‑94 (MQ=60)
                                           TTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                   >  SRR4302540.4968598/1‑94 (MQ=60)
                                           TTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                   <  SRR4302540.9619354/94‑1 (MQ=60)
                                           TTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                   <  SRR4302540.1823021/94‑1 (MQ=60)
                                            TTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGG                                                  >  SRR4302540.203348/1‑94 (MQ=60)
                                            TTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGG                                                  <  SRR4302540.9529942/94‑1 (MQ=60)
                                             TGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATcgcc                                                 >  SRR4302540.5539350/1‑90 (MQ=60)
                                             TGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGC                                                 <  SRR4302540.4928351/94‑1 (MQ=60)
                                              GGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCC                                                >  SRR4302540.5145444/1‑94 (MQ=60)
                                              GGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCC                                                <  SRR4302540.9120626/94‑1 (MQ=60)
                                              GGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCC                                                <  SRR4302540.7266915/94‑1 (MQ=60)
                                              GGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCC                                                <  SRR4302540.5719150/94‑1 (MQ=60)
                                               GGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCG                                               >  SRR4302540.5258789/1‑94 (MQ=60)
                                                GATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGT                                              >  SRR4302540.5957321/1‑94 (MQ=60)
                                                  TGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGA                                            >  SRR4302540.9958942/1‑94 (MQ=60)
                                                  TGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGA                                            <  SRR4302540.5696134/94‑1 (MQ=60)
                                                  TGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGA                                            <  SRR4302540.3095408/94‑1 (MQ=60)
                                                   GGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGAT                                           <  SRR4302540.2498826/94‑1 (MQ=60)
                                                   GGGTTAGGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATCACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGAT                                           <  SRR4302540.9397994/94‑1 (MQ=60)
                                                     GTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAA                                         <  SRR4302540.8338287/94‑1 (MQ=60)
                                                      TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA                                        >  SRR4302540.922236/1‑94 (MQ=60)
                                                       TATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCTTGATAAAA                                       <  SRR4302540.10162545/94‑1 (MQ=60)
                                                       TATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAA                                       <  SRR4302540.2697320/94‑1 (MQ=60)
                                                       TATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAA                                       <  SRR4302540.222025/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATACAAG                                      >  SRR4302540.7168220/1‑94 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                      >  SRR4302540.2486202/1‑94 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                      >  SRR4302540.8856014/1‑94 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGAGACTACGGTGATGAAACACTGCAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                      >  SRR4302540.7168222/1‑94 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    >  SRR4302540.3970006/1‑94 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    >  SRR4302540.2037511/1‑94 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    >  SRR4302540.4058322/1‑94 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    <  SRR4302540.4122939/94‑1 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    <  SRR4302540.4275731/94‑1 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                    >  SRR4302540.4906383/1‑94 (MQ=60)
                                                           TGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCA                                   <  SRR4302540.4290860/94‑1 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATTACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                  >  SRR4302540.6424872/1‑94 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAGGCCAT                                  <  SRR4302540.128810/94‑1 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                  <  SRR4302540.1619603/94‑1 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                  <  SRR4302540.96916/94‑1 (MQ=60)
                                                              TGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGA                                >  SRR4302540.1359596/1‑94 (MQ=60)
                                                                GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC                              <  SRR4302540.8511737/94‑1 (MQ=60)
                                                                 AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA                             <  SRR4302540.7089806/94‑1 (MQ=60)
                                                                 AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA                             <  SRR4302540.7089805/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                            <  SRR4302540.5612122/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                            >  SRR4302540.3956755/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                            <  SRR4302540.435137/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                            >  SRR4302540.4134557/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTAGTGCTAATATCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                            <  SRR4302540.2845187/94‑1 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGgcggggataaaaaccagaacaat                           >  SRR4302540.6367039/1‑71 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                           >  SRR4302540.7233995/1‑94 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                           >  SRR4302540.1690275/1‑94 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                           >  SRR4302540.536087/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                          <  SRR4302540.28520/94‑1 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                          >  SRR4302540.7352137/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                          >  SRR4302540.2485/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                          <  SRR4302540.6113086/94‑1 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                          <  SRR4302540.6487923/94‑1 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGACATGAACATTG                          >  SRR4302540.7821740/1‑94 (MQ=60)
                                                                     GATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGG                         <  SRR4302540.224889/94‑1 (MQ=60)
                                                                      ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGG                        <  SRR4302540.2761250/94‑1 (MQ=60)
                                                                        TCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTG                      >  SRR4302540.340238/1‑94 (MQ=60)
                                                                         CGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGA                     <  SRR4302540.1048205/94‑1 (MQ=60)
                                                                          GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG                    >  SRR4302540.1922409/1‑94 (MQ=60)
                                                                          GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATAGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG                    >  SRR4302540.1492968/1‑94 (MQ=60)
                                                                           TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATATAATCCATGAACATTGGGTGtgt                   >  SRR4302540.9061018/1‑91 (MQ=60)
                                                                           TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC                   >  SRR4302540.2008735/1‑94 (MQ=60)
                                                                           TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC                   <  SRR4302540.7953794/94‑1 (MQ=60)
                                                                            GGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCG                  >  SRR4302540.40714/1‑94 (MQ=60)
                                                                            GGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCG                  >  SRR4302540.6956206/1‑94 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                 <  SRR4302540.2915478/94‑1 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                 >  SRR4302540.6814645/1‑94 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                 >  SRR4302540.6814644/1‑94 (MQ=60)
                                                                               GCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGA               >  SRR4302540.4952980/1‑94 (MQ=60)
                                                                               GCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGA               >  SRR4302540.9108832/1‑94 (MQ=60)
                                                                                CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT              >  SRR4302540.628711/1‑94 (MQ=60)
                                                                                CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAC              >  SRR4302540.5950331/1‑94 (MQ=60)
                                                                                 TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC             <  SRR4302540.8289001/94‑1 (MQ=60)
                                                                                 TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC             <  SRR4302540.332350/94‑1 (MQ=60)
                                                                                 TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC             <  SRR4302540.6094139/94‑1 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC            <  SRR4302540.10072446/94‑1 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC            <  SRR4302540.4174125/94‑1 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC            >  SRR4302540.305620/1‑94 (MQ=60)
                                                                                   ATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCG           <  SRR4302540.6069135/94‑1 (MQ=60)
                                                                                    TAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCTTGATATAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGC          >  SRR4302540.6970313/1‑94 (MQ=60)
                                                                                      ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA        >  SRR4302540.850415/1‑94 (MQ=60)
                                                                                      ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA        >  SRR4302540.974604/1‑94 (MQ=60)
                                                                                      ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA        >  SRR4302540.7734517/1‑94 (MQ=60)
                                                                                      ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA        <  SRR4302540.8981294/94‑1 (MQ=60)
                                                                                       CCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAG       <  SRR4302540.9441312/94‑1 (MQ=60)
                                                                                       CCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAG       >  SRR4302540.875527/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        CAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGC      >  SRR4302540.9258373/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        CAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGC      >  SRR4302540.9506641/1‑94 (MQ=60)
                                                                                         AGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT     <  SRR4302540.5901355/94‑1 (MQ=60)
                                                                                           CGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGA   >  SRR4302540.4145141/1‑94 (MQ=60)
                                                                                           CGAATCCTCGACTATGGTCATGACAAACTGAACGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGA   <  SRR4302540.7088272/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            GCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  <  SRR4302540.5909427/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            GCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  >  SRR4302540.6655513/1‑94 (MQ=60)
                                                                                            GCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  <  SRR4302540.6813478/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            GCATCAGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTATATGGAATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  <  SRR4302540.6926474/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             |                                                                                            
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT  >  NC_000913/4004719‑4004904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑