Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I1 R1 | 1548 | 369.5 | 20095359 | 96.9% | 19472402 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,139,669 | +C | coding (233/330 nt) coding (132/159 nt) |
yijI → b4558 ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,667 | 1 | . | C | 99.8% | 1334.3 / ‑5.4 | 413 | L77F (TTG→TTC) A45G (GCA→GGA) | yijI b4558 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base C (203/208); minor base T (0/1); total (203/210) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 467 total aligned reads displayed.
GCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT > NC_000913/4139575‑4139754 | gcTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTg < 2:3311931/93‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑c > 1:7849407/1‑93 (MQ=255) cTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑c > 2:8805514/1‑93 (MQ=255) cTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑c < 1:9273718/93‑1 (MQ=255) tCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccc < 2:2386367/93‑2 (MQ=255) ccTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccct > 1:7491273/1‑91 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt > 2:5873656/1‑90 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt < 1:430357/93‑4 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt < 1:9875555/93‑4 (MQ=255) tGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑cccttg > 2:5006228/1‑89 (MQ=255) ttCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCg > 2:5424293/1‑93 (MQ=255) ttCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCg > 1:955738/1‑93 (MQ=255) tcgtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCgg < 2:1668848/93‑1 (MQ=255) tcggcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCgg < 1:5113825/93‑1 (MQ=255) gtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTc > 2:2133635/1‑93 (MQ=255) gtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTc < 1:4853451/93‑1 (MQ=255) tcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCa > 2:3063951/1‑93 (MQ=255) tcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCa < 1:8298564/93‑1 (MQ=255) gcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCa < 1:4835907/92‑1 (MQ=255) cgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAg < 2:6314283/93‑1 (MQ=255) ggCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGt < 1:1972638/93‑1 (MQ=255) ccccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTgc < 1:681398/93‑1 (MQ=255) ccccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTgc > 1:4081078/1‑93 (MQ=255) cGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCa > 2:9581950/1‑93 (MQ=255) cGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCa < 2:1071191/93‑1 (MQ=255) accAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTa < 2:2478962/91‑1 (MQ=255) aTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTa > 2:510113/1‑93 (MQ=255) aTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTa > 1:7678080/1‑93 (MQ=255) aTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTa < 1:5977840/93‑1 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAt > 2:9747165/1‑93 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAt < 2:3671128/93‑1 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGCTAt > 2:6089174/1‑93 (MQ=255) cAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATg < 1:4953287/93‑1 (MQ=255) aGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGc > 2:2071511/1‑93 (MQ=255) aGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGc < 1:821184/93‑1 (MQ=255) gTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGcc > 1:3414286/1‑93 (MQ=255) aaCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAc > 2:2812251/1‑93 (MQ=255) aaCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAc < 1:3067012/93‑1 (MQ=255) aaCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAc > 2:6964751/1‑93 (MQ=255) aCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACt > 1:1167451/1‑93 (MQ=255) cTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc < 2:9026746/93‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc < 2:1348248/93‑1 (MQ=255) cAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTGTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTTAAtt < 2:7066627/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAttt < 1:1410529/93‑1 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtg > 2:4835050/1‑93 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtg > 1:8484178/1‑93 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtg > 2:4639810/1‑93 (MQ=255) ttATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgt > 1:70921/1‑93 (MQ=255) ttATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgt < 1:906743/93‑1 (MQ=255) tATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGACACTCAATTtgtg > 2:8256323/1‑93 (MQ=255) gcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatga < 1:805970/93‑1 (MQ=255) gcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGACACTCAATTTGtgatga > 2:116962/1‑93 (MQ=255) ccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaa > 1:5441617/1‑93 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa > 2:9536492/1‑93 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa > 1:3917472/1‑93 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa > 1:8616035/1‑93 (MQ=255) gccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGTAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa < 1:9769157/93‑1 (MQ=255) gccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa > 1:2135932/1‑93 (MQ=255) ccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAg > 1:6940732/1‑93 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt < 1:5722878/93‑1 (MQ=255) cGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAtt < 2:2176444/93‑1 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTac < 2:7406780/93‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTaca > 1:231194/1‑93 (MQ=255) aTCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTaca > 1:3323959/1‑93 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac < 2:2979916/93‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac < 2:5602904/93‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac < 1:1667993/93‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac > 1:3586106/1‑93 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 2:658353/93‑1 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 1:6409515/93‑1 (MQ=255) gTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAgg > 2:5208370/1‑92 (MQ=255) gTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc < 1:2021555/93‑1 (MQ=255) tGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCg > 2:3542600/1‑93 (MQ=255) gCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt < 1:2705464/93‑1 (MQ=255) ccAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGtt > 1:8847565/1‑93 (MQ=255) cAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGttt > 2:946471/1‑93 (MQ=255) aaTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc < 1:10016290/93‑1 (MQ=255) aaTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc < 1:3176239/93‑1 (MQ=255) aTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCa < 2:8617579/93‑1 (MQ=255) tCAGCGCAAGGGCTCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCaa < 2:4133018/93‑1 (MQ=255) tCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCTCTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCaa < 2:9220945/93‑1 (MQ=255) tCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCaa > 1:2938043/1‑93 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAc > 1:4422707/1‑93 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAc < 2:805852/93‑1 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAc < 1:6502460/93‑1 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAc > 1:2578081/1‑93 (MQ=255) gcgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGt < 2:5685642/93‑1 (MQ=255) gcgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGt > 1:5555654/1‑93 (MQ=255) cgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTg < 2:7176620/93‑1 (MQ=255) cgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGCTTCAACGTg < 2:7570342/93‑1 (MQ=255) cAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGc < 2:1939792/93‑1 (MQ=255) aaGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCt > 1:8941398/1‑93 (MQ=255) aaGGGCGCTTTGGGCGTGGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCt < 2:3930936/93‑1 (MQ=255) aGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt < 1:383424/93‑1 (MQ=255) ggCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAATGTGGCTTGc > 1:8342046/1‑93 (MQ=255) cTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGa > 2:3156097/1‑93 (MQ=255) ttttGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGGGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAc < 1:150881/93‑1 (MQ=255) ttGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAcgc > 1:2785848/1‑93 (MQ=255) tGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAcgcg > 2:6815513/1‑93 (MQ=255) cGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAGAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAt < 2:6672080/93‑1 (MQ=255) | GCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT > NC_000913/4139575‑4139754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > NC_000913/4139576‑4139762 | TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCC > SRR4302540.2958617/1‑94 (MQ=60) TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCC > SRR4302540.2769308/1‑94 (MQ=60) TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCC > SRR4302540.4077261/1‑94 (MQ=60) TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCC > SRR4302540.9020008/1‑94 (MQ=60) TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCC > SRR4302540.8672724/1‑94 (MQ=60) TCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCCT > SRR4302540.7574912/1‑94 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTG > SRR4302540.3883485/1‑94 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTG < SRR4302540.2674344/94‑1 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTG > SRR4302540.4921486/1‑94 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTG < SRR4302540.434905/94‑1 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATAAGTAATTGGCAGTTATCGCCCGCCCGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGTGGCATTTGGCGTTGCCCTTG > SRR4302540.3158996/1‑94 (MQ=60) TGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGC < SRR4302540.5392139/94‑1 (MQ=60) TTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGG < SRR4302540.4069782/94‑1 (MQ=60) TCGGCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGT < SRR4302540.5169179/94‑1 (MQ=60) GTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCA > SRR4302540.8359298/1‑94 (MQ=60) GTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCA < SRR4302540.4905471/94‑1 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAG < SRR4302540.420195/94‑1 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAG < SRR4302540.8394922/94‑1 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAG < SRR4302540.8394921/94‑1 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAG < SRR4302540.2241556/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302540.2769549/94‑1 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTG > SRR4302540.6687551/1‑94 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTG > SRR4302540.3231763/1‑94 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTG < SRR4302540.1994053/94‑1 (MQ=60) GCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGC > SRR4302540.4125080/1‑94 (MQ=60) CCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCG < SRR4302540.6949941/94‑1 (MQ=60) CCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCG < SRR4302540.688697/94‑1 (MQ=60) CCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGGGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGCCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGAG > SRR4302540.2852114/1‑94 (MQ=60) CCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGC < SRR4302540.919495/94‑1 (MQ=60) CCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCA < SRR4302540.309044/94‑1 (MQ=60) CGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAG > SRR4302540.5619743/1‑94 (MQ=60) GGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGG > SRR4302540.787361/1‑94 (MQ=60) GGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGAGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGG < SRR4302540.9323676/94‑1 (MQ=60) GAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGT > SRR4302540.9594076/1‑94 (MQ=60) GAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGT > SRR4302540.1239576/1‑94 (MQ=60) GAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGT > SRR4302540.1441595/1‑94 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT > SRR4302540.989386/1‑94 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT > SRR4302540.4899425/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302540.7764911/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302540.7764910/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA < SRR4302540.2200773/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCTTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.1616658/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.3149549/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.4939475/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT > SRR4302540.4894773/1‑94 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT > SRR4302540.4894772/1‑94 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.6044015/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.6405642/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302540.7599086/94‑1 (MQ=60) TCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCGATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATG < SRR4302540.3628681/94‑1 (MQ=60) TCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATG > SRR4302540.2371757/1‑94 (MQ=60) TCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATG < SRR4302540.7377348/94‑1 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC < SRR4302540.5006807/94‑1 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC < SRR4302540.3254275/94‑1 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC > SRR4302540.5506624/1‑94 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC > SRR4302540.3451453/1‑94 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGACCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC < SRR4302540.6244936/94‑1 (MQ=60) GTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCA > SRR4302540.8971052/1‑94 (MQ=60) GTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCA > SRR4302540.8929561/1‑94 (MQ=60) tacgTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAC < SRR4302540.6498221/90‑1 (MQ=60) TAACTGGCAGTTAGCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAC < SRR4302540.6498220/94‑1 (MQ=60) AACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACT > SRR4302540.1179551/1‑94 (MQ=60) AACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACT < SRR4302540.3100661/94‑1 (MQ=60) ACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCCGTGCGCAGGTTATGCCACTC > SRR4302540.4564584/1‑94 (MQ=60) ACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTC > SRR4302540.3754730/1‑94 (MQ=60) CTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCA > SRR4302540.3571402/1‑94 (MQ=60) TGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAT > SRR4302540.3431945/1‑94 (MQ=60) GGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAT < SRR4302540.9115033/94‑1 (MQ=60) CAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTT > SRR4302540.5194788/1‑94 (MQ=60) CAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTT > SRR4302540.3318648/1‑94 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG > SRR4302540.8582738/1‑94 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG > SRR4302540.5036572/1‑94 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG > SRR4302540.994628/1‑94 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG < SRR4302540.1425733/94‑1 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG < SRR4302540.278425/94‑1 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGACACTCAATTTG > SRR4302540.8417379/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT > SRR4302540.71644/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT > SRR4302540.4454260/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT > SRR4302540.444172/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT > SRR4302540.7986602/1‑94 (MQ=60) TTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTG < SRR4302540.8377386/94‑1 (MQ=60) ATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGAT < SRR4302540.1370178/94‑1 (MQ=60) TCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATG > SRR4302540.9698212/1‑94 (MQ=60) GCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAA < SRR4302540.814531/94‑1 (MQ=60) GCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAA > SRR4302540.2001462/1‑94 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA > SRR4302540.5501491/1‑94 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA > SRR4302540.5501490/1‑94 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAATCAATTTGTGATGAAA < SRR4302540.1497337/94‑1 (MQ=60) CCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAA < SRR4302540.729135/94‑1 (MQ=60) CCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAA > SRR4302540.8884073/1‑94 (MQ=60) CCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAA > SRR4302540.3959885/1‑94 (MQ=60) CGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCTCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGGGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAA < SRR4302540.9790067/94‑1 (MQ=60) CGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAA < SRR4302540.4650263/94‑1 (MQ=60) GCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGTAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAG < SRR4302540.9883706/94‑1 (MQ=60) GCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAG > SRR4302540.7017994/1‑94 (MQ=60) CCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGT < SRR4302540.2024225/94‑1 (MQ=60) CCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGT > SRR4302540.3916199/1‑94 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGGCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA < SRR4302540.3205180/94‑1 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA > SRR4302540.3408124/1‑94 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA < SRR4302540.5786140/94‑1 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA < SRR4302540.5785874/94‑1 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA > SRR4302540.5704692/1‑94 (MQ=60) CAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTA < SRR4302540.3228906/94‑1 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT > SRR4302540.1321781/1‑94 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT < SRR4302540.9648410/94‑1 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT < SRR4302540.7959328/94‑1 (MQ=60) GCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCTCTTTTGGCTTTGCCCCTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATT < SRR4302540.8513484/94‑1 (MQ=60) CGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTA < SRR4302540.7956185/94‑1 (MQ=60) CGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTA > SRR4302540.10106430/1‑94 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA < SRR4302540.2411261/94‑1 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA > SRR4302540.7910922/1‑94 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA > SRR4302540.233429/1‑94 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA > SRR4302540.3360422/1‑94 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA < SRR4302540.6744511/94‑1 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC < SRR4302540.7121050/94‑1 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC < SRR4302540.8690721/94‑1 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC > SRR4302540.9123236/1‑94 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC > SRR4302540.3625270/1‑94 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC < SRR4302540.7121049/94‑1 (MQ=60) TCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACA < SRR4302540.4755049/94‑1 (MQ=60) TCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACA < SRR4302540.9520183/94‑1 (MQ=60) TCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACA < SRR4302540.1686143/94‑1 (MQ=60) CGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAG < SRR4302540.6026628/94‑1 (MQ=60) CGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAG < SRR4302540.6480850/94‑1 (MQ=60) GGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGC > SRR4302540.2970355/1‑94 (MQ=60) GGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGC < SRR4302540.4329544/94‑1 (MQ=60) GTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCG < SRR4302540.2039520/94‑1 (MQ=60) GTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCG < SRR4302540.7497400/94‑1 (MQ=60) TGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATCCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGT > SRR4302540.7712231/1‑94 (MQ=60) GCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTT > SRR4302540.8949914/1‑94 (MQ=60) GCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTT > SRR4302540.367596/1‑94 (MQ=60) CCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTT < SRR4302540.195097/94‑1 (MQ=60) CCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTT < SRR4302540.8163760/94‑1 (MQ=60) CCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTT < SRR4302540.6928382/94‑1 (MQ=60) CCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTT > SRR4302540.8578093/1‑94 (MQ=60) CAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTC > SRR4302540.8715832/1‑94 (MQ=60) CAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTC > SRR4302540.2066389/1‑94 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302540.10132883/94‑1 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302540.1583685/94‑1 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302540.3210767/94‑1 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302540.4215347/94‑1 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302540.2679383/94‑1 (MQ=60) ATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAA > SRR4302540.2970292/1‑94 (MQ=60) ATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAA > SRR4302540.8382318/1‑94 (MQ=60) ATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAA > SRR4302540.9381208/1‑94 (MQ=60) TCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAC < SRR4302540.655704/94‑1 (MQ=60) TCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAC > SRR4302540.2605876/1‑94 (MQ=60) CAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAACAGCATTACACAGCGTTTCAACG > SRR4302540.8405301/1‑94 (MQ=60) CAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACG < SRR4302540.6574742/94‑1 (MQ=60) AGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGT > SRR4302540.1830600/1‑94 (MQ=60) AGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGT > SRR4302540.8246560/1‑94 (MQ=60) AGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGT > SRR4302540.5616844/1‑94 (MQ=60) GCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTG < SRR4302540.5055437/94‑1 (MQ=60) GCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTG < SRR4302540.5744365/94‑1 (MQ=60) GCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTG < SRR4302540.6398115/94‑1 (MQ=60) CGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGG < SRR4302540.6724060/94‑1 (MQ=60) CGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGG > SRR4302540.9728663/1‑94 (MQ=60) CGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGG > SRR4302540.1913243/1‑94 (MQ=60) GCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGC > SRR4302540.5895264/1‑94 (MQ=60) CAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCT > SRR4302540.9046353/1‑94 (MQ=60) CAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCT > SRR4302540.1112326/1‑94 (MQ=60) AAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTT > SRR4302540.4202187/1‑94 (MQ=60) AGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTG < SRR4302540.2106288/94‑1 (MQ=60) AGGGCGCTTTTGGCGTAGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTG > SRR4302540.9912274/1‑94 (MQ=60) GGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAATGTGGCTTGC > SRR4302540.8438870/1‑94 (MQ=60) GGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCC < SRR4302540.8759515/94‑1 (MQ=60) GGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCC > SRR4302540.2892094/1‑94 (MQ=60) CGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGG < SRR4302540.4425579/94‑1 (MQ=60) CGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGG > SRR4302540.4767733/1‑94 (MQ=60) GCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGA > SRR4302540.2464618/1‑94 (MQ=60) CTTTTGGCGTTGCCCTTGCTGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAC < SRR4302540.5315309/94‑1 (MQ=60) CTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAC > SRR4302540.2117969/1‑94 (MQ=60) TTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGGGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACG < SRR4302540.152434/94‑1 (MQ=60) TTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACG < SRR4302540.152198/94‑1 (MQ=60) TTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGC > SRR4302540.2815937/1‑94 (MQ=60) TTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCG < SRR4302540.3585158/94‑1 (MQ=60) GGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCA < SRR4302540.5607232/94‑1 (MQ=60) GCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT < SRR4302540.2178280/94‑1 (MQ=60) GCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT < SRR4302540.4055131/94‑1 (MQ=60) GCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT < SRR4302540.3875143/94‑1 (MQ=60) GCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT < SRR4302540.9106765/94‑1 (MQ=60) CGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATG < SRR4302540.1101950/94‑1 (MQ=60) GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT < SRR4302540.5205455/94‑1 (MQ=60) GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT > SRR4302540.457124/1‑94 (MQ=60) GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT > SRR4302540.1167613/1‑94 (MQ=60) TTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTA > SRR4302540.4013268/1‑94 (MQ=60) TTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTA > SRR4302540.7902008/1‑94 (MQ=60) TTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTA > SRR4302540.533708/1‑94 (MQ=60) tgcCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTAC < SRR4302540.3406019/91‑1 (MQ=60) tgcCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTAC < SRR4302540.8760922/91‑1 (MQ=60) gcCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACG > SRR4302540.826261/3‑94 (MQ=60) gcCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACG > SRR4302540.9944313/3‑94 (MQ=60) C‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGC > SRR4302540.3492776/1‑94 (MQ=60) C‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGC < SRR4302540.1983864/94‑1 (MQ=60) C‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGC < SRR4302540.5073074/94‑1 (MQ=60) CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCC > SRR4302540.9269735/1‑94 (MQ=60) CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCC < SRR4302540.7943757/94‑1 (MQ=60) CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCC > SRR4302540.4982429/1‑94 (MQ=60) CTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > SRR4302540.9250203/1‑94 (MQ=60) CTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > SRR4302540.257459/1‑94 (MQ=60) | CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > NC_000913/4139576‑4139762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |