Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAAT > NC_000913/1030499‑1030685
|
GGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGA < SRR4302540.4427519/94‑1 (MQ=60)
GCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGT < SRR4302540.6849737/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAG > SRR4302540.5424110/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAA > SRR4302540.776753/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGGATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAA > SRR4302540.1983544/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCA > SRR4302540.7971084/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCA > SRR4302540.754049/1‑94 (MQ=60)
AGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCA > SRR4302540.7249183/1‑94 (MQ=60)
GCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAG < SRR4302540.6288814/94‑1 (MQ=60)
CACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGT > SRR4302540.6750320/1‑94 (MQ=60)
ACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTG < SRR4302540.261471/94‑1 (MQ=60)
CCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCAGCTTATGGGTGCTAAGCAGTGA > SRR4302540.7656074/1‑94 (MQ=60)
CCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGA > SRR4302540.4738605/1‑94 (MQ=60)
CCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGA < SRR4302540.5100933/94‑1 (MQ=60)
CCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGA > SRR4302540.614212/1‑94 (MQ=60)
CGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGAT < SRR4302540.7464471/94‑1 (MQ=60)
CGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGAT < SRR4302540.4092240/94‑1 (MQ=60)
ctacgGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATG < SRR4302540.5620899/89‑1 (MQ=60)
GTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGGCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGAAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGGGATG > SRR4302540.4371126/1‑94 (MQ=60)
GTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATG < SRR4302540.3187009/94‑1 (MQ=60)
GTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATG > SRR4302540.4371127/1‑94 (MQ=60)
GTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGCGATG > SRR4302540.455864/1‑94 (MQ=60)
TACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGT > SRR4302540.9183027/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTA > SRR4302540.6458756/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTA < SRR4302540.6523909/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTAC < SRR4302540.6504984/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTAC > SRR4302540.182623/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTAC > SRR4302540.3277039/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACG > SRR4302540.7599713/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGG > SRR4302540.3986252/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGGCAGGCGCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGGGAGGTACGG > SRR4302540.898382/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTC > SRR4302540.4826776/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTC > SRR4302540.4093698/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCA > SRR4302540.4493474/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCA > SRR4302540.1240211/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCA > SRR4302540.2190089/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCA > SRR4302540.1194667/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCAT > SRR4302540.8041635/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCAT < SRR4302540.9485250/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCAT < SRR4302540.646161/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGT > SRR4302540.8475228/1‑94 (MQ=60)
TGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGT < SRR4302540.4014915/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGT < SRR4302540.5594920/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTG < SRR4302540.3303097/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTG < SRR4302540.6933390/94‑1 (MQ=60)
GTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAG > SRR4302540.6566575/1‑94 (MQ=60)
GTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAG < SRR4302540.3788480/94‑1 (MQ=60)
GTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATACGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAG > SRR4302540.8263128/1‑94 (MQ=60)
TAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGA < SRR4302540.2154701/94‑1 (MQ=60)
TAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGA < SRR4302540.1644717/94‑1 (MQ=60)
TAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGA < SRR4302540.2581279/94‑1 (MQ=60)
AATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAA > SRR4302540.6161130/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAAC > SRR4302540.193399/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAAC > SRR4302540.4375903/1‑94 (MQ=60)
CGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTA < SRR4302540.8296021/94‑1 (MQ=60)
CGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTA > SRR4302540.7069177/1‑94 (MQ=60)
CGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTA > SRR4302540.8611641/1‑94 (MQ=60)
GCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAA > SRR4302540.9957578/1‑94 (MQ=60)
GCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAA > SRR4302540.1152843/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAAC < SRR4302540.5123186/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACA > SRR4302540.1234833/1‑94 (MQ=60)
CGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACA > SRR4302540.407703/1‑94 (MQ=60)
GAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAA < SRR4302540.7470364/94‑1 (MQ=60)
GAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAA < SRR4302540.838570/94‑1 (MQ=60)
GAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAA > SRR4302540.5675282/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAAT < SRR4302540.7817887/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATA > SRR4302540.9873793/1‑94 (MQ=60)
AAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATAC < SRR4302540.828427/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACG < SRR4302540.6037007/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACG < SRR4302540.6037008/94‑1 (MQ=60)
AGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACG > SRR4302540.8802455/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGA > SRR4302540.5428598/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCGTCAGGCTCAGAAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGAT < SRR4302540.9079049/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATC > SRR4302540.7799290/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATC > SRR4302540.905826/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCC > SRR4302540.8612912/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCA > SRR4302540.515680/1‑94 (MQ=60)
GCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCAT < SRR4302540.5173388/94‑1 (MQ=60)
GCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCAT > SRR4302540.8466870/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATT < SRR4302540.8548629/94‑1 (MQ=60)
CGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATT > SRR4302540.4654810/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG < SRR4302540.7320950/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG > SRR4302540.297248/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG > SRR4302540.7994862/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG < SRR4302540.8948971/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG > SRR4302540.6996996/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTG > SRR4302540.5060943/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGACGCACATTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACACTACGATACATTG > SRR4302540.5060942/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGA < SRR4302540.841957/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGA < SRR4302540.2005642/94‑1 (MQ=60)
CAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAG < SRR4302540.3568319/94‑1 (MQ=60)
AGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGT > SRR4302540.5377758/1‑94 (MQ=60)
AGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGGCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGATT > SRR4302540.5377759/1‑94 (MQ=60)
GGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTC < SRR4302540.3046542/94‑1 (MQ=60)
GGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTC > SRR4302540.4288294/1‑94 (MQ=60)
GGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTC < SRR4302540.8660859/94‑1 (MQ=60)
GCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCA > SRR4302540.6066755/1‑94 (MQ=60)
GCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCA > SRR4302540.6944507/1‑94 (MQ=60)
CTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCAC > SRR4302540.8587370/1‑94 (MQ=60)
TCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACT > SRR4302540.3536460/1‑94 (MQ=60)
TCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACT < SRR4302540.6155671/94‑1 (MQ=60)
TAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTTATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTC < SRR4302540.6033838/94‑1 (MQ=60)
AGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCT < SRR4302540.5044442/94‑1 (MQ=60)
AGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCT < SRR4302540.647020/94‑1 (MQ=60)
AGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCT < SRR4302540.5822638/94‑1 (MQ=60)
CAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCT > SRR4302540.8580037/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTA > SRR4302540.10074507/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTA > SRR4302540.1540696/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTA > SRR4302540.1540697/1‑94 (MQ=60)
AGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTA > SRR4302540.4191902/1‑94 (MQ=60)
GAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTAT > SRR4302540.3387413/1‑94 (MQ=60)
GAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTAT < SRR4302540.1535769/94‑1 (MQ=60)
GAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGACATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTAT > SRR4302540.9205892/1‑94 (MQ=60)
GAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTAT < SRR4302540.234935/94‑1 (MQ=60)
AAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAATAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGA > SRR4302540.1725039/1‑94 (MQ=60)
AATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGAC > SRR4302540.633021/1‑94 (MQ=60)
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ATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACA < SRR4302540.7185401/94‑1 (MQ=60)
ATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACA > SRR4302540.9192601/1‑94 (MQ=60)
ATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGATGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACA < SRR4302540.4623660/94‑1 (MQ=60)
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|
GGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAAT > NC_000913/1030499‑1030685
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
