Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
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20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 557 total aligned reads displayed.
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|
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ttaatCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAT > SRR4302540.139368/6‑94 (MQ=60)
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CCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCG > SRR4302540.8078330/1‑94 (MQ=60)
CGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGG > SRR4302540.1533871/1‑94 (MQ=60)
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CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTT < SRR4302540.1033873/94‑1 (MQ=60)
CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTT < SRR4302540.7367439/94‑1 (MQ=60)
CGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTG > SRR4302540.3310825/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG > SRR4302540.2918723/1‑94 (MQ=60)
GCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTG < SRR4302540.9265489/94‑1 (MQ=60)
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CATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGG < SRR4302540.6492129/94‑1 (MQ=60)
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ATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGG > SRR4302540.9656248/1‑94 (MQ=60)
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GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTAT > SRR4302540.8015418/1‑94 (MQ=60)
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GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAT < SRR4302540.9291125/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAT < SRR4302540.4574232/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAT > SRR4302540.7490231/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCA > SRR4302540.8559369/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCA > SRR4302540.7274870/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCA > SRR4302540.4629388/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAC > SRR4302540.8877183/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302540.4892176/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302540.7213035/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC > SRR4302540.1686698/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC < SRR4302540.3851883/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACC > SRR4302540.2467796/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGCGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACC < SRR4302540.7587271/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCA > SRR4302540.9172444/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAG < SRR4302540.3378587/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAG < SRR4302540.5560000/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAG > SRR4302540.9197832/1‑94 (MQ=60)
TGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGC > SRR4302540.552969/1‑94 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCC < SRR4302540.4394034/94‑1 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCACCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGCTGGGTATCACCAGCC > SRR4302540.1931628/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCAGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT < SRR4302540.6108647/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT < SRR4302540.9010176/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCT > SRR4302540.9433371/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT > SRR4302540.7361131/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT < SRR4302540.673433/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT > SRR4302540.1854228/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTT < SRR4302540.3666763/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAA < SRR4302540.2283660/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAG < SRR4302540.6262458/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302540.6900121/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAG > SRR4302540.8201065/1‑94 (MQ=60)
GGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302540.2651399/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTA > SRR4302540.3744219/1‑94 (MQ=60)
AAGATATCCTTCACGCGTTATGATATACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.6184664/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTATATCGGTCTGCGGCAAAGGTCGCATCCTAACTGGGTGTGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.5206629/94‑1 (MQ=53)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.8928733/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.10069025/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.2034317/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302540.4723213/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302540.3410054/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGTTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.4966912/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302540.1010302/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302540.2951344/1‑94 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302540.603393/1‑94 (MQ=60)
GAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTACATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGC > SRR4302540.5391330/1‑94 (MQ=60)
agatccttcgCGCGTTAGGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGGCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC < SRR4302540.6829331/84‑1 (MQ=60)
AGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC > SRR4302540.187260/1‑94 (MQ=60)
GATCCTTCACTCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302540.947847/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302540.3952878/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC > SRR4302540.3527386/1‑94 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC > SRR4302540.3152432/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG < SRR4302540.6505264/94‑1 (MQ=60)
tcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT > SRR4302540.4814059/3‑94 (MQ=60)
CAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT > SRR4302540.9551496/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT > SRR4302540.7089895/1‑94 (MQ=60)
AACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTT > SRR4302540.5946323/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTTATGATTGACATCGGTCCCCCGCAAGGATCGCATCCAAAATGGGTCCGGTTGGGTATCACCAGCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.3532462/94‑1 (MQ=50)
ACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.7924038/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT > SRR4302540.2578378/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTTATCATTTACCGCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.2785130/94‑1 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC > SRR4302540.207309/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCTCGCCACTATAACG > SRR4302540.701775/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302540.4256674/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302540.4050652/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302540.5957268/1‑94 (MQ=60)
GTTATAATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCGTAAATGGGGGCGTTTGGGTATCCCCAGCTTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302540.706946/94‑1 (MQ=53)
TTATTATTTACATCGTTCTACCGCAATGGTCGCATCTTAAAGGGGTGCGGTTGGGGTTCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG < SRR4302540.3203878/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.8936669/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.5453687/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTC > SRR4302540.4748440/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGCGGTTGGGTATCACCATCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAGCTG > SRR4302540.7732091/1‑94 (MQ=60)
TATGTTTTACTTGGGTCTCCCGAAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC < SRR4302540.5658573/94‑1 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTTAATGGGGGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302540.1604227/1‑94 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC < SRR4302540.4425349/94‑1 (MQ=60)
TATGATATACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAATAGTATGCCCGCCACTTTAACTGG > SRR4302540.1950421/1‑94 (MQ=60)
TTGATTTACAGCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302540.5019256/94‑1 (MQ=60)
ATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG > SRR4302540.4528301/1‑94 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT < SRR4302540.3105886/94‑1 (MQ=60)
GTTTTACATCGGTCTGCCGAAATGGTCGCACCCTAAAGGGGTGCGTTTGGGTATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302540.3874113/94‑1 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302540.10152284/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302540.148916/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302540.2273750/94‑1 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302540.598725/1‑94 (MQ=60)
ttccatggtTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAG < SRR4302540.4487421/85‑1 (MQ=60)
TTACATCGTCCTGCCGCAATGGTCGCCTCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTACCCCCAGCCTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302540.9926750/94‑4 (MQ=52)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg > SRR4302540.825577/1‑91 (MQ=60)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg > SRR4302540.3170887/1‑91 (MQ=60)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTAAAGAGTTTGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302540.3430883/94‑4 (MQ=60)
TACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgc > SRR4302540.5914844/1‑90 (MQ=60)
ccacCGGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGTTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcg < SRR4302540.1127420/90‑6 (MQ=60)
ACATCGTTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTGGGGTATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcg < SRR4302540.3008793/94‑6 (MQ=60)
ATCGGTCCACCGCATTGGTCGCACCCAAAAGGGGTGTTGTTGGGGACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCA < SRR4302540.8423718/94‑1 (MQ=60)
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GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGCAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTcacgcgggcct > SRR4302540.7027780/1‑83 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302540.2180750/1‑84 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302540.908154/1‑84 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302540.8977584/1‑81 (MQ=60)
CTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA > SRR4302540.9669461/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302540.2547823/1‑80 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302540.6968688/1‑80 (MQ=60)
TACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTGGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302540.5305806/94‑1 (MQ=60)
TACCCCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGGCGTTGGGGACCACCACCCTGGAAGCGTCTGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302540.6638326/94‑1 (MQ=60)
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AGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACG > NC_000913/1949343‑1949529
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
